; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Chy2G035800 (gene) of Cucumber (hystrix) v1 genome

Gene IDChy2G035800
OrganismCucumis hystrix (Cucumber (hystrix) v1)
Descriptiontranscription factor Pur-alpha 1
Genome locationchrH02:9700961..9705281
RNA-Seq ExpressionChy2G035800
SyntenyChy2G035800
Gene Ontology termsGO:0006357 - regulation of transcription by RNA polymerase II (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
GO:0000977 - RNA polymerase II regulatory region sequence-specific DNA binding (molecular function)
GO:0000981 - DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific (molecular function)
GO:0003729 - mRNA binding (molecular function)
GO:0032422 - purine-rich negative regulatory element binding (molecular function)
InterPro domainsIPR006628 - Purine-rich element binding protein family


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7022000.1 Transcription factor Pur-alpha 1, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]9.35e-20289.64Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LZP1 Uncharacterized protein1.1e-16090.18Show/hide
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A0A1S3BPW8 transcription factor Pur-alpha 1 isoform X21.3e-15989.58Show/hide
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A0A1S4DZ49 transcription factor Pur-alpha 1 isoform X12.0e-18198.81Show/hide
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A0A5A7UN79 Transcription factor Pur-alpha 1 isoform X22.0e-18198.81Show/hide
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A0A5D3CEN1 Transcription factor Pur-alpha 1 isoform X21.1e-18299.11Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
P42669 Transcriptional activator protein Pur-alpha2.6e-1328.71Show/hide
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        SG GG G GG   GG   GGGA GG  ++  EL  K + +++K FY D+K+N +GR+LKI+E      +S + +  S    F D    +I        S 
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         P++   + Q + + +L   FL                        + +Y D+ EN+RGRFL++        R T+      NR  G  + +        
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          +   LP Q   E  + LA L DD G                           ++E   L     +  D KRFFFD+GSN  G F+R+SEV    R+SI
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         +P
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Q00577 Transcriptional activator protein Pur-alpha9.9e-1328.85Show/hide
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        G+ GGGG G GG  +GG   GGGA GG  ++  EL  K + +++K FY D+K+N +GR+LKI+E      +S + +  S    F D    +I        
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Query:  SDDPEVFSKELQLDTKASLFLFFLFCLLVYLFVLVGQLLPFLCTHCAFQVFYFDIGENRRGRFLKVSEASVSRNRSTIIVPAGSNRDEGWSAFRNILAEI
        S  P++   + Q + + +L   FL                        + +Y D+ EN+RGRFL++        R T+      NR  G  + +      
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            +   LP Q   E  + LA L DD G                           ++E   L     +  D KRFFFD+GSN  G F+R+SEV    R+
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        SI +P
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Q6PAC9 Transcriptional activator protein Pur-beta-A5.3e-1428.21Show/hide
Query:  GVAAGGGAGGGGG---------NDVELMCKTLQVEHKLFYFDLKENPRGRYLKISEKTSATRSTIIVPFSGI-----PWFLDLFNYY--INSDDPEVFSK
        G   GG +GG GG            EL  K L +++K FY D+K+N +GR++KI+E  +    + +    G+      +  D   +Y  +    PE  ++
Subjt:  GVAAGGGAGGGGG---------NDVELMCKTLQVEHKLFYFDLKENPRGRYLKISEKTSATRSTIIVPFSGI-----PWFLDLFNYY--INSDDPEVFSK

Query:  ELQLDTKASLFLFFLFCLLVYLFVLVGQLLPFLCTHCAFQV-----FYFDIGENRRGRFLKVSEASVSRNRSTIIVPAGSNRDEGWSAFRNILAEINEAS
            D                     G   P       F V     +Y D+ EN+RGRFL++        R TI      NR  G+S      A + ++ 
Subjt:  ELQLDTKASLFLFFLFCLLVYLFVLVGQLLPFLCTHCAFQV-----FYFDIGENRRGRFLKVSEASVSRNRSTIIVPAGSNRDEGWSAFRNILAEINEAS

Query:  RLFILPNQENSEHSERLAGLSDDVGA----GFISGHSSQSGPTSDLNVDRQVDLSAQDEMGNLGVSKVIRADQKRFFFDLGSNNRGHFLRISEVAGADRS
        +   LP Q   E  + LA L DD G     G   G +   G                   G L     I  D KRFFFD+GSN  G FLR+SEV  + R+
Subjt:  RLFILPNQENSEHSERLAGLSDDVGA----GFISGHSSQSGPTSDLNVDRQVDLSAQDEMGNLGVSKVIRADQKRFFFDLGSNNRGHFLRISEVAGADRS

Query:  SIILPLSGLKQF
        SI +PL    +F
Subjt:  SIILPLSGLKQF

Q8AVS4 Transcriptional activator protein Pur-beta-B4.0e-1428.25Show/hide
Query:  GVAAGGGAGGGGG---------NDVELMCKTLQVEHKLFYFDLKENPRGRYLKISE-KTSATRSTIIVPFSGIPWFLDLFNYYI------NSDDPEVFSK
        G   GG +GG  G            EL  K L +++K FY D+K+N +GR++KI+E     ++S + +  +    F D    +I          PE  ++
Subjt:  GVAAGGGAGGGGG---------NDVELMCKTLQVEHKLFYFDLKENPRGRYLKISE-KTSATRSTIIVPFSGIPWFLDLFNYYI------NSDDPEVFSK

Query:  ELQLDTKASLFLFFLFCLLVYLFVLVGQLLPFLCTHCAFQV-----FYFDIGENRRGRFLKVSEASVSRNRSTIIVPAGSNRDEGWSAFRNILAEINEAS
            D                     G   P       F V     +Y D+ EN+RGRFL++        R TI      NR  G+S        + ++ 
Subjt:  ELQLDTKASLFLFFLFCLLVYLFVLVGQLLPFLCTHCAFQV-----FYFDIGENRRGRFLKVSEASVSRNRSTIIVPAGSNRDEGWSAFRNILAEINEAS

Query:  RLFILPNQENSEHSERLAGLSDDVGAGFISGHSSQSGPTSDLNVDRQVDLSAQDEMGNLGVSKVIRADQKRFFFDLGSNNRGHFLRISEVAGADRSSIIL
        +   LP Q   E  + LA L DD G     G    SG +                 G L     I  D KRFFFD+GSN  G FLR+SEV  + R+SI +
Subjt:  RLFILPNQENSEHSERLAGLSDDVGAGFISGHSSQSGPTSDLNVDRQVDLSAQDEMGNLGVSKVIRADQKRFFFDLGSNNRGHFLRISEVAGADRSSIIL

Query:  PLSGLKQF
        PL    +F
Subjt:  PLSGLKQF

Q9SKZ1 Transcription factor Pur-alpha 13.4e-12270.62Show/hide
Query:  MEGNSGGGGVGIGGTTAGGVAAGGGAGGGGGNDVELMCKTLQVEHKLFYFDLKENPRGRYLKISEKTSATRSTIIVPFSGIPWFLDLFNYYINSDDPEVF
        ME NSGG     GG   GG A  GG GGGGG+DVEL+ KTLQVEHKLFYFDLKENPRGRYLKISEKTSATRSTIIVP SGI WFLDLFNYY+NS++ E+F
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Query:  SKELQLDTKASLFLFFLFCLLVYLFVLVGQLLPFLCTHCAFQVFYFDIGENRRGRFLKVSEASVSRNRSTIIVPAGSNRDEGWSAFRNILAEINEASRLF
        SKELQLD+K                                 VFYFDIGENRRGRFLKVSEASVSRNRSTIIVPAGS+ DEGW+AFRNILAEI+EAS LF
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Query:  ILPNQ-ENSEHSERLAGLSDDVGAGFISGHSSQSGPTSDLNVDRQVDLSAQDEMGNLGVSKVIRADQKRFFFDLGSNNRGHFLRISEVAGADRSSIILPL
        ++PNQ + S+  E L    DDVGAGFI GH SQ   +S+ NVDR +D   Q+E G  GVSKVIRADQKRFFFDLG+NNRGHFLRISEVAG+DRSSIILPL
Subjt:  ILPNQ-ENSEHSERLAGLSDDVGAGFISGHSSQSGPTSDLNVDRQVDLSAQDEMGNLGVSKVIRADQKRFFFDLGSNNRGHFLRISEVAGADRSSIILPL

Query:  SGLKQFYEIVGHFVEITKDRIEGMTGVNVRTVDPPQR
        SGLKQF+E++GHFVEITKD+IEGMTG NVRTVDPPQR
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G32080.1 purin-rich alpha 12.4e-12370.62Show/hide
Query:  MEGNSGGGGVGIGGTTAGGVAAGGGAGGGGGNDVELMCKTLQVEHKLFYFDLKENPRGRYLKISEKTSATRSTIIVPFSGIPWFLDLFNYYINSDDPEVF
        ME NSGG     GG   GG A  GG GGGGG+DVEL+ KTLQVEHKLFYFDLKENPRGRYLKISEKTSATRSTIIVP SGI WFLDLFNYY+NS++ E+F
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Query:  SKELQLDTKASLFLFFLFCLLVYLFVLVGQLLPFLCTHCAFQVFYFDIGENRRGRFLKVSEASVSRNRSTIIVPAGSNRDEGWSAFRNILAEINEASRLF
        SKELQLD+K                                 VFYFDIGENRRGRFLKVSEASVSRNRSTIIVPAGS+ DEGW+AFRNILAEI+EAS LF
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Query:  ILPNQ-ENSEHSERLAGLSDDVGAGFISGHSSQSGPTSDLNVDRQVDLSAQDEMGNLGVSKVIRADQKRFFFDLGSNNRGHFLRISEVAGADRSSIILPL
        ++PNQ + S+  E L    DDVGAGFI GH SQ   +S+ NVDR +D   Q+E G  GVSKVIRADQKRFFFDLG+NNRGHFLRISEVAG+DRSSIILPL
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Query:  SGLKQFYEIVGHFVEITKDRIEGMTGVNVRTVDPPQR
        SGLKQF+E++GHFVEITKD+IEGMTG NVRTVDPPQR
Subjt:  SGLKQFYEIVGHFVEITKDRIEGMTGVNVRTVDPPQR

AT2G32080.2 purin-rich alpha 19.9e-12570.83Show/hide
Query:  MEGNSGGGGVGIGGTTAGGVAAGGGAGGGGGNDVELMCKTLQVEHKLFYFDLKENPRGRYLKISEKTSATRSTIIVPFSGIPWFLDLFNYYINSDDPEVF
        ME NSGG     GG   GG A  GG GGGGG+DVEL+ KTLQVEHKLFYFDLKENPRGRYLKISEKTSATRSTIIVP SGI WFLDLFNYY+NS++ E+F
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Query:  SKELQLDTKASLFLFFLFCLLVYLFVLVGQLLPFLCTHCAFQVFYFDIGENRRGRFLKVSEASVSRNRSTIIVPAGSNRDEGWSAFRNILAEINEASRLF
        SKELQLD+K                                 VFYFDIGENRRGRFLKVSEASVSRNRSTIIVPAGS+ DEGW+AFRNILAEI+EAS LF
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Query:  ILPNQENSEHSERLAGLSDDVGAGFISGHSSQSGPTSDLNVDRQVDLSAQDEMGNLGVSKVIRADQKRFFFDLGSNNRGHFLRISEVAGADRSSIILPLS
        ++PNQ+ S+  E L    DDVGAGFI GH SQ   +S+ NVDR +D   Q+E G  GVSKVIRADQKRFFFDLG+NNRGHFLRISEVAG+DRSSIILPLS
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Query:  GLKQFYEIVGHFVEITKDRIEGMTGVNVRTVDPPQR
        GLKQF+E++GHFVEITKD+IEGMTG NVRTVDPPQR
Subjt:  GLKQFYEIVGHFVEITKDRIEGMTGVNVRTVDPPQR


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAGGGAAATTCCGGCGGGGGTGGAGTGGGAATTGGGGGAACGACGGCGGGTGGCGTGGCGGCGGGAGGAGGGGCTGGTGGTGGCGGAGGGAATGACGTGGAGTTGAT
GTGCAAAACACTGCAGGTGGAACACAAGCTGTTTTACTTCGATCTGAAGGAGAATCCCAGAGGTCGATATCTGAAGATTTCAGAGAAAACATCGGCTACAAGGTCAACGA
TCATTGTTCCTTTCTCTGGGATTCCATGGTTCTTAGATCTCTTCAATTACTATATCAATTCTGATGATCCGGAAGTTTTTAGCAAGGAATTGCAGCTGGACACAAAGGCA
TCTTTGTTTCTCTTCTTTCTCTTTTGCCTTTTAGTTTATCTCTTTGTTCTTGTTGGTCAACTTTTACCTTTTTTGTGTACTCATTGTGCCTTTCAGGTGTTTTACTTTGA
CATTGGCGAGAATAGGAGGGGTCGTTTCTTGAAGGTATCTGAAGCTTCAGTTAGTAGAAACCGCAGCACCATTATCGTTCCTGCCGGAAGCAACCGGGATGAGGGATGGT
CTGCATTTAGAAACATCTTGGCAGAGATCAATGAAGCATCTAGGCTTTTCATACTGCCCAATCAGGAAAATTCTGAACATTCAGAGCGTCTCGCCGGACTTTCGGATGAT
GTAGGAGCAGGCTTCATATCAGGTCATAGTAGTCAATCTGGGCCAACCTCTGACTTGAATGTAGATAGACAAGTAGACTTGTCAGCTCAAGATGAAATGGGGAATCTGGG
TGTTTCAAAGGTTATCCGAGCTGATCAAAAGAGATTTTTTTTCGATCTCGGAAGTAACAACCGGGGTCATTTCTTGAGGATTTCTGAGGTTGCAGGGGCAGATCGTTCTT
CAATCATTCTCCCATTGTCAGGTCTTAAGCAGTTCTATGAAATAGTAGGACATTTTGTGGAGATCACCAAAGACAGGATTGAAGGAATGACAGGTGTGAATGTCCGAACT
GTGGATCCACCTCAGAGATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGAGGGAAATTCCGGCGGGGGTGGAGTGGGAATTGGGGGAACGACGGCGGGTGGCGTGGCGGCGGGAGGAGGGGCTGGTGGTGGCGGAGGGAATGACGTGGAGTTGAT
GTGCAAAACACTGCAGGTGGAACACAAGCTGTTTTACTTCGATCTGAAGGAGAATCCCAGAGGTCGATATCTGAAGATTTCAGAGAAAACATCGGCTACAAGGTCAACGA
TCATTGTTCCTTTCTCTGGGATTCCATGGTTCTTAGATCTCTTCAATTACTATATCAATTCTGATGATCCGGAAGTTTTTAGCAAGGAATTGCAGCTGGACACAAAGGCA
TCTTTGTTTCTCTTCTTTCTCTTTTGCCTTTTAGTTTATCTCTTTGTTCTTGTTGGTCAACTTTTACCTTTTTTGTGTACTCATTGTGCCTTTCAGGTGTTTTACTTTGA
CATTGGCGAGAATAGGAGGGGTCGTTTCTTGAAGGTATCTGAAGCTTCAGTTAGTAGAAACCGCAGCACCATTATCGTTCCTGCCGGAAGCAACCGGGATGAGGGATGGT
CTGCATTTAGAAACATCTTGGCAGAGATCAATGAAGCATCTAGGCTTTTCATACTGCCCAATCAGGAAAATTCTGAACATTCAGAGCGTCTCGCCGGACTTTCGGATGAT
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CAATCATTCTCCCATTGTCAGGTCTTAAGCAGTTCTATGAAATAGTAGGACATTTTGTGGAGATCACCAAAGACAGGATTGAAGGAATGACAGGTGTGAATGTCCGAACT
GTGGATCCACCTCAGAGATGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MEGNSGGGGVGIGGTTAGGVAAGGGAGGGGGNDVELMCKTLQVEHKLFYFDLKENPRGRYLKISEKTSATRSTIIVPFSGIPWFLDLFNYYINSDDPEVFSKELQLDTKA
SLFLFFLFCLLVYLFVLVGQLLPFLCTHCAFQVFYFDIGENRRGRFLKVSEASVSRNRSTIIVPAGSNRDEGWSAFRNILAEINEASRLFILPNQENSEHSERLAGLSDD
VGAGFISGHSSQSGPTSDLNVDRQVDLSAQDEMGNLGVSKVIRADQKRFFFDLGSNNRGHFLRISEVAGADRSSIILPLSGLKQFYEIVGHFVEITKDRIEGMTGVNVRT
VDPPQR