| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| KAG7029202.1 RNA-binding protein 48 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma] | 1.87e-56 | 85.32 | Show/hide |
Query: RFAKRKLDEFVFLGNRLQVSYALEFESLLDTKEKLEVRKQEVLARLDFGRPRGFAVSSTTAKLTNPSRSHYTLEQKNSLEKRIYGDATVISNPYVSQITR
RFAKRKLDEFVFLGNRLQVSYA +FESLLDTKEKLEVR++EVLARLD GRPRG AV+S T K TNPS SHYTLEQKNSLEKR YGDA + SNP+VSQITR
Subjt: RFAKRKLDEFVFLGNRLQVSYALEFESLLDTKEKLEVRKQEVLARLDFGRPRGFAVSSTTAKLTNPSRSHYTLEQKNSLEKRIYGDATVISNPYVSQITR
Query: VSSDQVCYH
VSSDQVCYH
Subjt: VSSDQVCYH
|
|
| XP_004142975.1 RNA-binding protein 48 isoform X2 [Cucumis sativus] | 5.52e-54 | 89.52 | Show/hide |
Query: RFAKRKLDEFVFLGNRLQVSYALEFESLLDTKEKLEVRKQEVLARLDFGRPRGFAVSSTTAKLTNPSRSHYTLEQKNSLEKRIYGDATVISNPYVSQITR
RFAKRKLDEFVFLGNRLQVSYA EFESLLDTKEKLEVR++EVLARLD GRPRG AVSSTTAKLTN SRSHYTL+QKNSLEKR YGDA +ISNP+VSQITR
Subjt: RFAKRKLDEFVFLGNRLQVSYALEFESLLDTKEKLEVRKQEVLARLDFGRPRGFAVSSTTAKLTNPSRSHYTLEQKNSLEKRIYGDATVISNPYVSQITR
Query: VSSDQ
VSSDQ
Subjt: VSSDQ
|
|
| XP_031736619.1 RNA-binding protein 48 isoform X4 [Cucumis sativus] | 1.52e-54 | 89.52 | Show/hide |
Query: RFAKRKLDEFVFLGNRLQVSYALEFESLLDTKEKLEVRKQEVLARLDFGRPRGFAVSSTTAKLTNPSRSHYTLEQKNSLEKRIYGDATVISNPYVSQITR
RFAKRKLDEFVFLGNRLQVSYA EFESLLDTKEKLEVR++EVLARLD GRPRG AVSSTTAKLTN SRSHYTL+QKNSLEKR YGDA +ISNP+VSQITR
Subjt: RFAKRKLDEFVFLGNRLQVSYALEFESLLDTKEKLEVRKQEVLARLDFGRPRGFAVSSTTAKLTNPSRSHYTLEQKNSLEKRIYGDATVISNPYVSQITR
Query: VSSDQ
VSSDQ
Subjt: VSSDQ
|
|
| XP_038884636.1 RNA-binding protein 48 isoform X2 [Benincasa hispida] | 4.08e-54 | 88.57 | Show/hide |
Query: RFAKRKLDEFVFLGNRLQVSYALEFESLLDTKEKLEVRKQEVLARLDFGRPRGFAVSSTTAKLTNPSRSHYTLEQKNSLEKRIYGDATVISNPYVSQITR
RFAKRKLDEFVFLGNRLQVSYA EFESLLDT+EKLEVR++EVLARLD GRPRG AVSSTTAK TNPSRSHYTLEQKNSLE R YGD T+ISNP+VSQITR
Subjt: RFAKRKLDEFVFLGNRLQVSYALEFESLLDTKEKLEVRKQEVLARLDFGRPRGFAVSSTTAKLTNPSRSHYTLEQKNSLEKRIYGDATVISNPYVSQITR
Query: VSSDQ
VSSDQ
Subjt: VSSDQ
|
|
| XP_038884637.1 RNA-binding protein 48 isoform X3 [Benincasa hispida] | 4.09e-55 | 88.68 | Show/hide |
Query: RFAKRKLDEFVFLGNRLQVSYALEFESLLDTKEKLEVRKQEVLARLDFGRPRGFAVSSTTAKLTNPSRSHYTLEQKNSLEKRIYGDATVISNPYVSQITR
RFAKRKLDEFVFLGNRLQVSYA EFESLLDT+EKLEVR++EVLARLD GRPRG AVSSTTAK TNPSRSHYTLEQKNSLE R YGD T+ISNP+VSQITR
Subjt: RFAKRKLDEFVFLGNRLQVSYALEFESLLDTKEKLEVRKQEVLARLDFGRPRGFAVSSTTAKLTNPSRSHYTLEQKNSLEKRIYGDATVISNPYVSQITR
Query: VSSDQV
VSSDQV
Subjt: VSSDQV
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A0A0LQL2 RNA-binding protein 48 | 3.5e-42 | 89.52 | Show/hide |
Query: RFAKRKLDEFVFLGNRLQVSYALEFESLLDTKEKLEVRKQEVLARLDFGRPRGFAVSSTTAKLTNPSRSHYTLEQKNSLEKRIYGDATVISNPYVSQITR
RFAKRKLDEFVFLGNRLQVSYA EFESLLDTKEKLEVR++EVLARLD GRPRG AVSSTTAKLTN SRSHYTL+QKNSLEKR YGDA +ISNP+VSQITR
Subjt: RFAKRKLDEFVFLGNRLQVSYALEFESLLDTKEKLEVRKQEVLARLDFGRPRGFAVSSTTAKLTNPSRSHYTLEQKNSLEKRIYGDATVISNPYVSQITR
Query: VSSDQ
VSSDQ
Subjt: VSSDQ
|
|
| A0A1S3BA34 RNA-binding protein 48 | 2.3e-41 | 82.88 | Show/hide |
Query: HNNLTFRFAKRKLDEFVFLGNRLQVSYALEFESLLDTKEKLEVRKQEVLARLDFGRPRGFAVSSTTAKLTNPSRSHYTLEQKNSLEKRIYGDATVISNPY
H+ RFAKRKLDEFVFLGNRLQVSYA EFESL+DTKEKLEVR++EVLARLD GRPRG AVSSTTAKLTNPSRS+YTLEQKNSLE R YGDA +IS+P+
Subjt: HNNLTFRFAKRKLDEFVFLGNRLQVSYALEFESLLDTKEKLEVRKQEVLARLDFGRPRGFAVSSTTAKLTNPSRSHYTLEQKNSLEKRIYGDATVISNPY
Query: VSQITRVSSDQ
VSQ+TRVSSDQ
Subjt: VSQITRVSSDQ
|
|
| A0A1S3BAX9 RNA-binding protein 48 isoform X2 | 2.3e-41 | 82.88 | Show/hide |
Query: HNNLTFRFAKRKLDEFVFLGNRLQVSYALEFESLLDTKEKLEVRKQEVLARLDFGRPRGFAVSSTTAKLTNPSRSHYTLEQKNSLEKRIYGDATVISNPY
H+ RFAKRKLDEFVFLGNRLQVSYA EFESL+DTKEKLEVR++EVLARLD GRPRG AVSSTTAKLTNPSRS+YTLEQKNSLE R YGDA +IS+P+
Subjt: HNNLTFRFAKRKLDEFVFLGNRLQVSYALEFESLLDTKEKLEVRKQEVLARLDFGRPRGFAVSSTTAKLTNPSRSHYTLEQKNSLEKRIYGDATVISNPY
Query: VSQITRVSSDQ
VSQ+TRVSSDQ
Subjt: VSQITRVSSDQ
|
|
| A0A5A7V5K4 RNA-binding protein 48 | 2.3e-41 | 82.88 | Show/hide |
Query: HNNLTFRFAKRKLDEFVFLGNRLQVSYALEFESLLDTKEKLEVRKQEVLARLDFGRPRGFAVSSTTAKLTNPSRSHYTLEQKNSLEKRIYGDATVISNPY
H+ RFAKRKLDEFVFLGNRLQVSYA EFESL+DTKEKLEVR++EVLARLD GRPRG AVSSTTAKLTNPSRS+YTLEQKNSLE R YGDA +IS+P+
Subjt: HNNLTFRFAKRKLDEFVFLGNRLQVSYALEFESLLDTKEKLEVRKQEVLARLDFGRPRGFAVSSTTAKLTNPSRSHYTLEQKNSLEKRIYGDATVISNPY
Query: VSQITRVSSDQ
VSQ+TRVSSDQ
Subjt: VSQITRVSSDQ
|
|
| A0A6J1KEG7 RNA-binding protein 48 | 1.9e-40 | 83.33 | Show/hide |
Query: RFAKRKLDEFVFLGNRLQVSYALEFESLLDTKEKLEVRKQEVLARLDFGRPRGFAVSSTTAKLTNPSRSHYTLEQKNSLEKRIYGDATVISNPYVSQITR
RFAKRKLDEFVFLGNRLQVSYA +FESLLDTKEKLEVR++EVLARLD GRPRG AV+S T K TNPS SHYTLEQKNSLEKR YGDA + SNP+VSQITR
Subjt: RFAKRKLDEFVFLGNRLQVSYALEFESLLDTKEKLEVRKQEVLARLDFGRPRGFAVSSTTAKLTNPSRSHYTLEQKNSLEKRIYGDATVISNPYVSQITR
Query: VSSDQVCY
VSSDQ Y
Subjt: VSSDQVCY
|
|
| Arabidopsis top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| AT2G27790.1 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 1.4e-14 | 47.22 | Show/hide |
Query: RFAKRKLDEFVFLGNRLQVSYALEFESLLDTKEKLEVRKQEVLARLDFGRPRGFAVSSTTAKLTNP--SRSHYTLEQKNSLEKRIY-GDATVISNPYVSQ
RFAKRKLDE FLGNRLQ+SYA E+E++ DTK+KLE R++EVLARL+ P+ +S KL P +++ Q+ +E + + G+A V
Subjt: RFAKRKLDEFVFLGNRLQVSYALEFESLLDTKEKLEVRKQEVLARLDFGRPRGFAVSSTTAKLTNP--SRSHYTLEQKNSLEKRIY-GDATVISNPYVSQ
Query: ITRVSSDQ
TRVSSDQ
Subjt: ITRVSSDQ
|
|
| AT2G27790.2 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 1.4e-14 | 47.22 | Show/hide |
Query: RFAKRKLDEFVFLGNRLQVSYALEFESLLDTKEKLEVRKQEVLARLDFGRPRGFAVSSTTAKLTNP--SRSHYTLEQKNSLEKRIY-GDATVISNPYVSQ
RFAKRKLDE FLGNRLQ+SYA E+E++ DTK+KLE R++EVLARL+ P+ +S KL P +++ Q+ +E + + G+A V
Subjt: RFAKRKLDEFVFLGNRLQVSYALEFESLLDTKEKLEVRKQEVLARLDFGRPRGFAVSSTTAKLTNP--SRSHYTLEQKNSLEKRIY-GDATVISNPYVSQ
Query: ITRVSSDQ
TRVSSDQ
Subjt: ITRVSSDQ
|
|
| AT5G27300.1 pentatricopeptide (PPR) repeat-containing protein | 1.1e-11 | 58.73 | Show/hide |
Query: RKLDEFVFLGNRLQVSYALEFESLLDTKEKLEVRKQEVLARLDFGRPRGFAVSSTTAKLTNPS
RKLDE FLGNRLQ+SYA E+ES+ DTKEKLE R++EVLARL+ P +S KL P+
Subjt: RKLDEFVFLGNRLQVSYALEFESLLDTKEKLEVRKQEVLARLDFGRPRGFAVSSTTAKLTNPS
|
|
| AT5G27300.2 pentatricopeptide (PPR) repeat-containing protein | 1.1e-11 | 58.73 | Show/hide |
Query: RKLDEFVFLGNRLQVSYALEFESLLDTKEKLEVRKQEVLARLDFGRPRGFAVSSTTAKLTNPS
RKLDE FLGNRLQ+SYA E+ES+ DTKEKLE R++EVLARL+ P +S KL P+
Subjt: RKLDEFVFLGNRLQVSYALEFESLLDTKEKLEVRKQEVLARLDFGRPRGFAVSSTTAKLTNPS
|
|
