; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Chy2G041700 (gene) of Cucumber (hystrix) v1 genome

Gene IDChy2G041700
OrganismCucumis hystrix (Cucumber (hystrix) v1)
DescriptionPlant transposase
Genome locationchrH02:22054997..22055323
RNA-Seq ExpressionChy2G041700
SyntenyChy2G041700
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0051969.1 hypothetical protein E6C27_scaffold60G004490 [Cucumis melo var. makuwa]8.60e-1660.27Show/hide
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KAA0055646.1 hypothetical protein E6C27_scaffold181G00110 [Cucumis melo var. makuwa]8.69e-1454.17Show/hide
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        MD+TQ G DDE NEGE +               EREIRETS  P+PLHH+NV+CEE  TP PSS+VN + HP
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KGN44082.1 hypothetical protein Csa_016717 [Cucumis sativus]1.92e-2784.85Show/hide
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        MDLTQ  SDDEANE EAMMRIVND +NVANPSIEREIRETSP  +PLHHNNVN EEATTPLPSS V
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TYK04585.1 hypothetical protein E5676_scaffold409G002220 [Cucumis melo var. makuwa]2.47e-3266.67Show/hide
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        +VN   HP
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TYK17066.1 Plant transposase [Cucumis melo var. makuwa]4.40e-1156.16Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0K715 Uncharacterized protein8.2e-2084.85Show/hide
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A0A5A7SN98 Plant transposase1.9e-0856.16Show/hide
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A0A5A7UEP1 Uncharacterized protein1.6e-1060.27Show/hide
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A0A5A7UMZ2 Uncharacterized protein2.9e-0954.17Show/hide
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A0A5D3BZI8 Uncharacterized protein5.5e-2466.67Show/hide
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Query:  NVNTMSHP
        +VN   HP
Subjt:  NVNTMSHP

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAAGAAAACAAAAAGACCTCGTTCTACAATAAAAAATACATTAGAACGACAACAATCAGATAGAACATCTGTAAAAACATCATGGAGATTCGCAAAGTCCTTCAGTAT
GGACTTAACTCAACTTGGTAGTGATGATGAGGCAAACGAGGGAGAAGCGATGATGAGGATTGTAAATGATACAGAAAATGTTGCTAACCCTAGTATAGAGAGAGAGATTA
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mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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