CuGenDBv2

Gene ID	Chy2G041710
Organism	Cucumis hystrix (Cucumber (hystrix) v1)
Description	Plant transposase
Genome location	chrH02:22055342..22055696
RNA-Seq Expression	Chy2G041710
Synteny	Chy2G041710
Gene Ontology terms	NA
InterPro domains	NA

Homology

Show/hide homology

GenBank top hits

e value

%identity

Alignment

KAA0032201.1 Plant transposase [Cucumis melo var. makuwa]

1.29e-54

81.74

Show/hide

Query:  LDSPAARTRSAMCKLTIEEVQPKQEENENVDCEEVHTKEVGPKKTRGRTKMKTIAMEPEMKVNVRYKKYGQPIGETSVGLSSFLGTLVREVVPMNVEIWK
        LDSPA RTRSA+ KL +EEV+ + EENENVDCEEVHTKE  PKKTRGRTKM+TIAMEPEMK+++RY  YGQPIGETSVGLSSFLGTLVREVVP+NVE WK
Subjt:  LDSPAARTRSAMCKLTIEEVQPKQEENENVDCEEVHTKEVGPKKTRGRTKMKTIAMEPEMKVNVRYKKYGQPIGETSVGLSSFLGTLVREVVPMNVEIWK

Query:  KLSIRQKEILWHSIQ
        K+S RQKEILWHSIQ
Subjt:  KLSIRQKEILWHSIQ

KAA0041269.1 Plant transposase [Cucumis melo var. makuwa]

9.70e-56

Show/hide

Query:  LDSPAARTRSAMCKLTIEEVQPKQEENENVDCEEVHTKEVGPKKTRGRTKMKTIAMEPEMKVNVRYKKYGQPIGETSVGLSSFLGTLVREVVPMNVEIWK
        LDSPA  TRSA+ KL +EEV+ + EENENVDCEEVHTKE  PKKTRGRTKM+TIAMEPEMK+++RY  YGQPIGETSVGLSSFLGTLVREVVP+N+E WK
Subjt:  LDSPAARTRSAMCKLTIEEVQPKQEENENVDCEEVHTKEVGPKKTRGRTKMKTIAMEPEMKVNVRYKKYGQPIGETSVGLSSFLGTLVREVVPMNVEIWK

Query:  KLSIRQKEILWHSIQ
        K+S RQKEILWHSIQ
Subjt:  KLSIRQKEILWHSIQ

KAA0051001.1 Plant transposase [Cucumis melo var. makuwa]

6.55e-55

81.74

Show/hide

Query:  LDSPAARTRSAMCKLTIEEVQPKQEENENVDCEEVHTKEVGPKKTRGRTKMKTIAMEPEMKVNVRYKKYGQPIGETSVGLSSFLGTLVREVVPMNVEIWK
        LDSPA RTRSA+ KL +EEV+ + EENENVDCEEVHTKE  PKKTRGRTKM+TIAMEPEMK+++RY  YGQPIGETSVGLSSFLGTLVREVVP+NVE WK
Subjt:  LDSPAARTRSAMCKLTIEEVQPKQEENENVDCEEVHTKEVGPKKTRGRTKMKTIAMEPEMKVNVRYKKYGQPIGETSVGLSSFLGTLVREVVPMNVEIWK

Query:  KLSIRQKEILWHSIQ
        K+S RQKEILWHSIQ
Subjt:  KLSIRQKEILWHSIQ

KAA0053956.1 Plant transposase [Cucumis melo var. makuwa]

9.84e-55

79.13

Show/hide

Query:  LDSPAARTRSAMCKLTIEEVQPKQEENENVDCEEVHTKEVGPKKTRGRTKMKTIAMEPEMKVNVRYKKYGQPIGETSVGLSSFLGTLVREVVPMNVEIWK
        LDSPA RTRSA+ KL +E+V+ + EENENVDCEEVHTKE  PKKTRG  KM+TIAMEPEMK+++RY  YGQPIGETSVGLSSFLGTLVREVVP+NVE WK
Subjt:  LDSPAARTRSAMCKLTIEEVQPKQEENENVDCEEVHTKEVGPKKTRGRTKMKTIAMEPEMKVNVRYKKYGQPIGETSVGLSSFLGTLVREVVPMNVEIWK

Query:  KLSIRQKEILWHSIQ
        K+S RQKEILWHSIQ
Subjt:  KLSIRQKEILWHSIQ

KAA0056267.1 uncharacterized protein E6C27_scaffold226G00350 [Cucumis melo var. makuwa]

5.55e-54

79.31

Show/hide

Query:  LDSPAARTRSAMCKLTIEEVQPKQEENENVDCEEVHTKEVGPKKTRGRTKMKTIAMEPEMKVNVRYKKYGQPIGETSVGLSSFLGTLVREVVPMNVEIWK
        LDSPA RTRSA+ KL +EEV+ + EENENVDCEEVHTKE  PKKTRGRTKM+TIAMEPEMK+++RY  YGQPIGETSVGLSSFLGTL REVVP+NV  WK
Subjt:  LDSPAARTRSAMCKLTIEEVQPKQEENENVDCEEVHTKEVGPKKTRGRTKMKTIAMEPEMKVNVRYKKYGQPIGETSVGLSSFLGTLVREVVPMNVEIWK

Query:  KLSIRQKEILWHSIQI
        K+S RQKEILWHSIQ+
Subjt:  KLSIRQKEILWHSIQI

TrEMBL top hits

e value

%identity

Alignment

A0A5A7SRN7 Plant transposase

1.1e-44

81.74

Show/hide

Query:  LDSPAARTRSAMCKLTIEEVQPKQEENENVDCEEVHTKEVGPKKTRGRTKMKTIAMEPEMKVNVRYKKYGQPIGETSVGLSSFLGTLVREVVPMNVEIWK
        LDSPA RTRSA+ KL +EEV+ + EENENVDCEEVHTKE  PKKTRGRTKM+TIAMEPEMK+++RY  YGQPIGETSVGLSSFLGTLVREVVP+NVE WK
Subjt:  LDSPAARTRSAMCKLTIEEVQPKQEENENVDCEEVHTKEVGPKKTRGRTKMKTIAMEPEMKVNVRYKKYGQPIGETSVGLSSFLGTLVREVVPMNVEIWK

Query:  KLSIRQKEILWHSIQ
        K+S RQKEILWHSIQ
Subjt:  KLSIRQKEILWHSIQ

A0A5A7TIU1 Plant transposase

1.2e-43

Show/hide

Query:  LDSPAARTRSAMCKLTIEEVQPKQEENENVDCEEVHTKEVGPKKTRGRTKMKTIAMEPEMKVNVRYKKYGQPIGETSVGLSSFLGTLVREVVPMNVEIWK
        LDSPA  TRSA+ KL +EEV+ + EENENVDCEEVHTKE  PKKTRGRTKM+TIAMEPEMK+++RY  YGQPIGETSVGLSSFLGTLVREVVP+N+E WK
Subjt:  LDSPAARTRSAMCKLTIEEVQPKQEENENVDCEEVHTKEVGPKKTRGRTKMKTIAMEPEMKVNVRYKKYGQPIGETSVGLSSFLGTLVREVVPMNVEIWK

Query:  KLSIRQKEILWHSIQ
        K+S RQKEILWHSIQ
Subjt:  KLSIRQKEILWHSIQ

A0A5A7TLJ2 Plant transposase

1.5e-43

Show/hide

Query:  LDSPAARTRSAMCKLTIEEVQPKQEENENVDCEEVHTKEVGPKKTRGRTKMKTIAMEPEMKVNVRYKKYGQPIGETSVGLSSFLGTLVREVVPMNVEIWK
        LDSPA RTR  + KL +EEV+ + EENENVDCEEVHTKE  PKKTRGRTKM+TIAMEPEMK+++RY  YGQPIGETSVGLSSFLGTLVREVVP+NVE WK
Subjt:  LDSPAARTRSAMCKLTIEEVQPKQEENENVDCEEVHTKEVGPKKTRGRTKMKTIAMEPEMKVNVRYKKYGQPIGETSVGLSSFLGTLVREVVPMNVEIWK

Query:  KLSIRQKEILWHSIQ
        K+S RQKEILWHSIQ
Subjt:  KLSIRQKEILWHSIQ

A0A5A7UBP2 Plant transposase

1.1e-44

81.74

Show/hide

Query:  LDSPAARTRSAMCKLTIEEVQPKQEENENVDCEEVHTKEVGPKKTRGRTKMKTIAMEPEMKVNVRYKKYGQPIGETSVGLSSFLGTLVREVVPMNVEIWK
        LDSPA RTRSA+ KL +EEV+ + EENENVDCEEVHTKE  PKKTRGRTKM+TIAMEPEMK+++RY  YGQPIGETSVGLSSFLGTLVREVVP+NVE WK
Subjt:  LDSPAARTRSAMCKLTIEEVQPKQEENENVDCEEVHTKEVGPKKTRGRTKMKTIAMEPEMKVNVRYKKYGQPIGETSVGLSSFLGTLVREVVPMNVEIWK

Query:  KLSIRQKEILWHSIQ
        K+S RQKEILWHSIQ
Subjt:  KLSIRQKEILWHSIQ

A0A5A7UNU1 Transposase_23 domain-containing protein

2.0e-43

79.31

Show/hide

Query:  LDSPAARTRSAMCKLTIEEVQPKQEENENVDCEEVHTKEVGPKKTRGRTKMKTIAMEPEMKVNVRYKKYGQPIGETSVGLSSFLGTLVREVVPMNVEIWK
        LDSPA RTRSA+ KL +EEV+ + EENENVDCEEVHTKE  PKKTRGRTKM+TIAMEPEMK+++RY  YGQPIGETSVGLSSFLGTL REVVP+NV  WK
Subjt:  LDSPAARTRSAMCKLTIEEVQPKQEENENVDCEEVHTKEVGPKKTRGRTKMKTIAMEPEMKVNVRYKKYGQPIGETSVGLSSFLGTLVREVVPMNVEIWK

Query:  KLSIRQKEILWHSIQI
        K+S RQKEILWHSIQ+
Subjt:  KLSIRQKEILWHSIQI

SwissProt top hits	e value	%identity	Alignment
No hits found

Arabidopsis top hits	e value	%identity	Alignment
No hits found

Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGTTATTAGACTCACCTGCTGCTCGTACTAGATCAGCAATGTGTAAATTAACCATTGAAGAGGTTCAACCTAAGCAGGAGGAAAATGAAAATGTGGATTGTGAGGAAGT
TCATACCAAGGAAGTAGGTCCTAAAAAGACAAGAGGTAGGACAAAGATGAAAACAATAGCGATGGAGCCTGAAATGAAAGTAAATGTAAGGTACAAAAAATATGGACAAC
CTATTGGAGAAACATCAGTTGGGTTGTCCTCATTTTTGGGTACACTGGTTAGAGAAGTGGTGCCAATGAATGTTGAAATTTGGAAGAAACTTTCTATTCGACAAAAAGAA
ATATTGTGGCATTCTATTCAAATAT

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MLLDSPAARTRSAMCKLTIEEVQPKQEENENVDCEEVHTKEVGPKKTRGRTKMKTIAMEPEMKVNVRYKKYGQPIGETSVGLSSFLGTLVREVVPMNVEIWKKLSIRQKE
ILWHSIQIX

Chy2G041710 (gene) of Cucumber (hystrix) v1 genome