; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Chy2G043230 (gene) of Cucumber (hystrix) v1 genome

Gene IDChy2G043230
OrganismCucumis hystrix (Cucumber (hystrix) v1)
DescriptionArmadillo-like helical
Genome locationchrH02:24763048..24764223
RNA-Seq ExpressionChy2G043230
SyntenyChy2G043230
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR011989 - Armadillo-like helical
IPR016024 - Armadillo-type fold


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0050093.1 Armadillo-like helical [Cucumis melo var. makuwa]1.62e-26296.68Show/hide
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KAG6589816.1 hypothetical protein SDJN03_15239, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]8.45e-23285.18Show/hide
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KAG7021757.1 hypothetical protein SDJN02_15484, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]2.33e-23185.14Show/hide
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KGN65105.1 hypothetical protein Csa_004579 [Cucumis sativus]1.53e-26998.98Show/hide
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TYK06349.1 Armadillo-like helical [Cucumis melo var. makuwa]4.65e-26296.43Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LT75 Uncharacterized protein4.0e-21098.98Show/hide
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A0A5A7U2F9 Armadillo-like helical8.7e-20596.68Show/hide
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A0A5D3C7L4 Armadillo-like helical1.9e-20496.43Show/hide
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A0A6J1C2L5 uncharacterized protein LOC1110068722.0e-18085.04Show/hide
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Query:  P
        P
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A0A6P6FUS8 uncharacterized protein LOC1124901052.0e-14066.42Show/hide
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        RSELGGDLI LG++++     +E+REV+            + E+RFLE HPFASCVA+F VQLEVGEGLR+RE+RA K +I+ RVR+A  SDAEAATI+A
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Query:  EVLWGSSP
        EVLWG+SP
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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TCTCACTCATTAAAAATCCTCTGCTCTTTAATCAGATTAATTAGGTCTCCGTTAGTGGAGGAAATCGAATCAAACGACGATATACCAAAAATAATAAGCTTATTGAATTG
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TTGTGGAGTTGCAGAGGTCGGAATTGGGTGGGGATTTGATCGGATTGGGGAAACACACTGCAGAGGAGAGTAGAGAGGTCGCTGGTAGCGCCGGAGAGAAGAGGTTCTTG
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mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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