; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Chy2G044030 (gene) of Cucumber (hystrix) v1 genome

Gene IDChy2G044030
OrganismCucumis hystrix (Cucumber (hystrix) v1)
Descriptionnucleolar protein 56-like
Genome locationchrH02:25613205..25613996
RNA-Seq ExpressionChy2G044030
SyntenyChy2G044030
Gene Ontology termsGO:0016310 - phosphorylation (biological process)
GO:0042254 - ribosome biogenesis (biological process)
GO:0046940 - nucleoside monophosphate phosphorylation (biological process)
GO:0005730 - nucleolus (cellular component)
GO:0031428 - box C/D snoRNP complex (cellular component)
GO:0032040 - small-subunit processome (cellular component)
GO:0004017 - adenylate kinase activity (molecular function)
GO:0005524 - ATP binding (molecular function)
GO:0030515 - snoRNA binding (molecular function)
InterPro domainsIPR012974 - NOP5, N-terminal
IPR045056 - Nucleolar protein Nop56/Nop58


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6589395.1 Nucleolar protein 56, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.56e-4890.53Show/hide
Query:  MTSTYLLYESASGYALFHAHGLDEIGQNTEVVRSSVSDLNRFGKVLKLAAFHPFESALDALKQCNSVSEGLMTDELRSFLEINLPKAKVKRLSSF
        MTSTYLLYESASGYALFHAHGLDEIGQNTE VRSSVSDLNRFGKV+KLAAFHPFESALDALKQCNSVSEGLMTDELRSFLEINLPK K  + + F
Subjt:  MTSTYLLYESASGYALFHAHGLDEIGQNTEVVRSSVSDLNRFGKVLKLAAFHPFESALDALKQCNSVSEGLMTDELRSFLEINLPKAKVKRLSSF

XP_004138057.1 nucleolar protein 56 [Cucumis sativus]4.06e-4991.58Show/hide
Query:  MTSTYLLYESASGYALFHAHGLDEIGQNTEVVRSSVSDLNRFGKVLKLAAFHPFESALDALKQCNSVSEGLMTDELRSFLEINLPKAKVKRLSSF
        MTSTYLLYESASGYALFHAHGLDEIGQNTE VRSSVSDLNRFGKV+KLAAFHPFESALDALKQCNSVSEGLMTDELRSFLEINLPKAK  + + F
Subjt:  MTSTYLLYESASGYALFHAHGLDEIGQNTEVVRSSVSDLNRFGKVLKLAAFHPFESALDALKQCNSVSEGLMTDELRSFLEINLPKAKVKRLSSF

XP_008464470.1 PREDICTED: nucleolar protein 56-like [Cucumis melo]4.06e-4991.58Show/hide
Query:  MTSTYLLYESASGYALFHAHGLDEIGQNTEVVRSSVSDLNRFGKVLKLAAFHPFESALDALKQCNSVSEGLMTDELRSFLEINLPKAKVKRLSSF
        MTSTYLLYESASGYALFHAHGLDEIGQNTE VRSSVSDLNRFGKV+KLAAFHPFESALDALKQCNSVSEGLMTDELRSFLEINLPKAK  + + F
Subjt:  MTSTYLLYESASGYALFHAHGLDEIGQNTEVVRSSVSDLNRFGKVLKLAAFHPFESALDALKQCNSVSEGLMTDELRSFLEINLPKAKVKRLSSF

XP_022921711.1 nucleolar protein 56-like [Cucurbita moschata]1.53e-4890.53Show/hide
Query:  MTSTYLLYESASGYALFHAHGLDEIGQNTEVVRSSVSDLNRFGKVLKLAAFHPFESALDALKQCNSVSEGLMTDELRSFLEINLPKAKVKRLSSF
        MTSTYLLYESASGYALFHAHGLDEIGQNTE VRSSVSDLNRFGKV+KLAAFHPFESALDALKQCNSVSEGLMTDELRSFLEINLPK K  + + F
Subjt:  MTSTYLLYESASGYALFHAHGLDEIGQNTEVVRSSVSDLNRFGKVLKLAAFHPFESALDALKQCNSVSEGLMTDELRSFLEINLPKAKVKRLSSF

XP_022987378.1 nucleolar protein 56-like [Cucurbita maxima]1.51e-4890.53Show/hide
Query:  MTSTYLLYESASGYALFHAHGLDEIGQNTEVVRSSVSDLNRFGKVLKLAAFHPFESALDALKQCNSVSEGLMTDELRSFLEINLPKAKVKRLSSF
        MTSTYLLYESASGYALFHAHGLDEIGQNTE VRSSVSDLNRFGKV+KLAAFHPFESALDALKQCNSVSEGLMTDELRSFLEINLPK K  + + F
Subjt:  MTSTYLLYESASGYALFHAHGLDEIGQNTEVVRSSVSDLNRFGKVLKLAAFHPFESALDALKQCNSVSEGLMTDELRSFLEINLPKAKVKRLSSF

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LRA6 Nop domain-containing protein7.6e-4191.58Show/hide
Query:  MTSTYLLYESASGYALFHAHGLDEIGQNTEVVRSSVSDLNRFGKVLKLAAFHPFESALDALKQCNSVSEGLMTDELRSFLEINLPKAKVKRLSSF
        MTSTYLLYESASGYALFHAHGLDEIGQNTE VRSSVSDLNRFGKV+KLAAFHPFESALDALKQCNSVSEGLMTDELRSFLEINLPKAK  + + F
Subjt:  MTSTYLLYESASGYALFHAHGLDEIGQNTEVVRSSVSDLNRFGKVLKLAAFHPFESALDALKQCNSVSEGLMTDELRSFLEINLPKAKVKRLSSF

A0A1S3CLP0 nucleolar protein 56-like7.6e-4191.58Show/hide
Query:  MTSTYLLYESASGYALFHAHGLDEIGQNTEVVRSSVSDLNRFGKVLKLAAFHPFESALDALKQCNSVSEGLMTDELRSFLEINLPKAKVKRLSSF
        MTSTYLLYESASGYALFHAHGLDEIGQNTE VRSSVSDLNRFGKV+KLAAFHPFESALDALKQCNSVSEGLMTDELRSFLEINLPKAK  + + F
Subjt:  MTSTYLLYESASGYALFHAHGLDEIGQNTEVVRSSVSDLNRFGKVLKLAAFHPFESALDALKQCNSVSEGLMTDELRSFLEINLPKAKVKRLSSF

A0A5A7UW47 ATP:AMP phosphotransferase7.6e-4191.58Show/hide
Query:  MTSTYLLYESASGYALFHAHGLDEIGQNTEVVRSSVSDLNRFGKVLKLAAFHPFESALDALKQCNSVSEGLMTDELRSFLEINLPKAKVKRLSSF
        MTSTYLLYESASGYALFHAHGLDEIGQNTE VRSSVSDLNRFGKV+KLAAFHPFESALDALKQCNSVSEGLMTDELRSFLEINLPKAK  + + F
Subjt:  MTSTYLLYESASGYALFHAHGLDEIGQNTEVVRSSVSDLNRFGKVLKLAAFHPFESALDALKQCNSVSEGLMTDELRSFLEINLPKAKVKRLSSF

A0A6J1C032 nucleolar protein 56-like2.2e-4090.53Show/hide
Query:  MTSTYLLYESASGYALFHAHGLDEIGQNTEVVRSSVSDLNRFGKVLKLAAFHPFESALDALKQCNSVSEGLMTDELRSFLEINLPKAKVKRLSSF
        MTSTYLLYESASGYALFHAHGLDEIGQNTE VRSSVSDLNRFGKV+KLAAFHPFESALDALKQCNSVSEGLMTDELRSFLEINLPK K  + + F
Subjt:  MTSTYLLYESASGYALFHAHGLDEIGQNTEVVRSSVSDLNRFGKVLKLAAFHPFESALDALKQCNSVSEGLMTDELRSFLEINLPKAKVKRLSSF

A0A6J1JJA2 nucleolar protein 56-like2.2e-4090.53Show/hide
Query:  MTSTYLLYESASGYALFHAHGLDEIGQNTEVVRSSVSDLNRFGKVLKLAAFHPFESALDALKQCNSVSEGLMTDELRSFLEINLPKAKVKRLSSF
        MTSTYLLYESASGYALFHAHGLDEIGQNTE VRSSVSDLNRFGKV+KLAAFHPFESALDALKQCNSVSEGLMTDELRSFLEINLPK K  + + F
Subjt:  MTSTYLLYESASGYALFHAHGLDEIGQNTEVVRSSVSDLNRFGKVLKLAAFHPFESALDALKQCNSVSEGLMTDELRSFLEINLPKAKVKRLSSF

SwissProt top hitse value%identityAlignment
O00567 Nucleolar protein 564.6e-1140.22Show/hide
Query:  MTSTYLLYESASGYALFHAHGLDEIGQNTEVVRSSVSDLNRFGKVLKLAAFHPFESALDALKQCNSVSEGLMTDELRSFLEINLPKAKVKRL
        M   ++L+E A GYAL     ++EI      V  SV +L +F  +++L AF PF S+  AL+  N+VSEG++ ++LR  LE +LP  K K L
Subjt:  MTSTYLLYESASGYALFHAHGLDEIGQNTEVVRSSVSDLNRFGKVLKLAAFHPFESALDALKQCNSVSEGLMTDELRSFLEINLPKAKVKRL

O94514 Nucleolar protein 569.3e-2050.57Show/hide
Query:  YLLYESASGYALFHAHGLDEIGQNTEVVRSSVSDLNRFGKVLKLAAFHPFESALDALKQCNSVSEGLMTDELRSFLEINLPKAKVKR
        YLLYESA+GY+LF   G D+I   T+ V+ S+ D+++FGKV++L +F PF++A  AL+  N +SEG++ D L++FLE+NLPKA  K+
Subjt:  YLLYESASGYALFHAHGLDEIGQNTEVVRSSVSDLNRFGKVLKLAAFHPFESALDALKQCNSVSEGLMTDELRSFLEINLPKAKVKR

Q12460 Nucleolar protein 564.5e-1439.77Show/hide
Query:  YLLYESASGYALFHAH-GLDEIGQNTEVVRSSVSDLNRFGKVLKLAAFHPFESALDALKQCNSVSEGLMTDELRSFLEINLPKAKVKR
        YLL+E  +GYA+F      D+IG   + V+  ++D   F K+++L +F PF+ A +AL+  N +SEGL+++ L++ L++NLPKA  K+
Subjt:  YLLYESASGYALFHAH-GLDEIGQNTEVVRSSVSDLNRFGKVLKLAAFHPFESALDALKQCNSVSEGLMTDELRSFLEINLPKAKVKR

Q21276 Nucleolar protein 565.5e-1240.48Show/hide
Query:  YLLYESASGYALFHAHGLDEIGQNTEVVRSSVSDLNRFGKVLKLAAFHPFESALDALKQCNSVSEGLMTDELRSFLEINLPKAK
        ++LYE A+GYAL      D+ G   + V ++ +D  +F ++++LA+F PF++   AL+ CNS+SEGL   +L +FL+ +LPK K
Subjt:  YLLYESASGYALFHAHGLDEIGQNTEVVRSSVSDLNRFGKVLKLAAFHPFESALDALKQCNSVSEGLMTDELRSFLEINLPKAK

Q54MT2 Nucleolar protein 561.4e-1238.1Show/hide
Query:  STYLLYESASGYALFHAHGLDEIGQNTEVVRSSVSDLNRFGKVLKLAAFHPFESALDALKQCNSVSEGLMTDELRSFLEINLPK
        +T++L+E+A+G+ +F   G++ I + T+ V+ S+ D ++F KV K+    PF SA +AL+  NS+SEG++T+ L  FL+    K
Subjt:  STYLLYESASGYALFHAHGLDEIGQNTEVVRSSVSDLNRFGKVLKLAAFHPFESALDALKQCNSVSEGLMTDELRSFLEINLPK

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G56110.1 homolog of nucleolar protein NOP565.2e-3472.53Show/hide
Query:  YLLYESASGYALFHAHGLDEIGQNTEVVRSSVSDLNRFGKVLKLAAFHPFESALDALKQCNSVSEGLMTDELRSFLEINLPKAKVKRLSSF
        Y++YES+SGY LF  HGLDEIGQNTE VR+SVSDL+RFG+V++L AFHPFESALDAL Q N+VSEG+MTDELRSFLE+NLPK K  +   F
Subjt:  YLLYESASGYALFHAHGLDEIGQNTEVVRSSVSDLNRFGKVLKLAAFHPFESALDALKQCNSVSEGLMTDELRSFLEINLPKAKVKRLSSF

AT3G12860.1 NOP56-like pre RNA processing ribonucleoprotein6.4e-3271.43Show/hide
Query:  YLLYESASGYALFHAHGLDEIGQNTEVVRSSVSDLNRFGKVLKLAAFHPFESALDALKQCNSVSEGLMTDELRSFLEINLPKAKVKRLSSF
        YLL ES SGY LF  HG DEIGQNTE VRSSVSDL+RFG+V++L AFHPF+SALDAL Q N+VSEG M+DELRSFLE+NLPK K  +   F
Subjt:  YLLYESASGYALFHAHGLDEIGQNTEVVRSSVSDLNRFGKVLKLAAFHPFESALDALKQCNSVSEGLMTDELRSFLEINLPKAKVKRLSSF


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGACGTCCACGTATCTTCTCTATGAATCTGCTTCTGGTTATGCACTGTTTCATGCCCATGGCCTTGACGAAATTGGTCAGAACACCGAAGTCGTTAGGAGCTCTGTTTC
CGACCTCAACCGCTTCGGCAAGGTCTTGAAGCTTGCTGCTTTTCACCCCTTTGAGTCGGCTCTCGATGCTCTCAAACAGTGCAACTCTGTCTCCGAAGGGCTTATGACCG
ATGAGTTGAGGAGTTTTCTGGAAATTAACCTTCCGAAAGCTAAGGTAAAAAGGCTAAGTTCGTTTTGGGGCTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGACGTCCACGTATCTTCTCTATGAATCTGCTTCTGGTTATGCACTGTTTCATGCCCATGGCCTTGACGAAATTGGTCAGAACACCGAAGTCGTTAGGAGCTCTGTTTC
CGACCTCAACCGCTTCGGCAAGGTCTTGAAGCTTGCTGCTTTTCACCCCTTTGAGTCGGCTCTCGATGCTCTCAAACAGTGCAACTCTGTCTCCGAAGGGCTTATGACCG
ATGAGTTGAGGAGTTTTCTGGAAATTAACCTTCCGAAAGCTAAGGTAAAAAGGCTAAGTTCGTTTTGGGGCTAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MTSTYLLYESASGYALFHAHGLDEIGQNTEVVRSSVSDLNRFGKVLKLAAFHPFESALDALKQCNSVSEGLMTDELRSFLEINLPKAKVKRLSSFWG