; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Chy2G044850 (gene) of Cucumber (hystrix) v1 genome

Gene IDChy2G044850
OrganismCucumis hystrix (Cucumber (hystrix) v1)
Descriptiontwo-component response regulator ARR10-like
Genome locationchrH02:26279573..26280069
RNA-Seq ExpressionChy2G044850
SyntenyChy2G044850
Gene Ontology termsGO:0000160 - phosphorelay signal transduction system (biological process)
GO:0016310 - phosphorylation (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0003677 - DNA binding (molecular function)
GO:0016301 - kinase activity (molecular function)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0058289.1 two-component response regulator ARR10-like [Cucumis melo var. makuwa]1.25e-7084.33Show/hide
Query:  MNHMNKVSNLGPQFLISNGQGNQTWTAARSCYPVPECKQFNFPSNNSTSRTCDDD--NPYYSGGFDEAINNSSYYRNSLETNCDFNSTSQIFVGHYAIEN
        MNHMNKVSNLGPQFLISNGQG+QTWT A SCYPVPE KQFNFPS  STS+  DDD  N Y+ GGFDE INNSSYY  SL+TNCDFNSTSQIFVGHYAIEN
Subjt:  MNHMNKVSNLGPQFLISNGQGNQTWTAARSCYPVPECKQFNFPSNNSTSRTCDDD--NPYYSGGFDEAINNSSYYRNSLETNCDFNSTSQIFVGHYAIEN

Query:  HTDGGAGQCYQMQFNAGNPVESLLMDGELSDIFK
        HTD GAGQCYQMQFNAGN  ESLLMDGELSDIFK
Subjt:  HTDGGAGQCYQMQFNAGNPVESLLMDGELSDIFK

KAE8653163.1 hypothetical protein Csa_019720, partial [Cucumis sativus]1.00e-6091.35Show/hide
Query:  MNHMNKVSNLGPQFLISNGQGNQTWTAARSCYPVPECKQFNFPSNNSTSRTCDDDNPYYSGGFDEAINNSSYYRNSLETNCDFNSTSQIFVGHYAIENHT
        MNHMNKVSNLG QFLISNGQGNQTWTAARSCYPVPE K FNFP NNSTSRTCDDDNPYYSGGFDE INNSSYY NSLETNC FNSTSQI VG YAIENHT
Subjt:  MNHMNKVSNLGPQFLISNGQGNQTWTAARSCYPVPECKQFNFPSNNSTSRTCDDDNPYYSGGFDEAINNSSYYRNSLETNCDFNSTSQIFVGHYAIENHT

Query:  DGGA
        DGGA
Subjt:  DGGA

TYK11845.1 two-component response regulator ARR10-like [Cucumis melo var. makuwa]5.01e-7083.58Show/hide
Query:  MNHMNKVSNLGPQFLISNGQGNQTWTAARSCYPVPECKQFNFPSNNSTSRTCDDD--NPYYSGGFDEAINNSSYYRNSLETNCDFNSTSQIFVGHYAIEN
        MNHMNKVSNLGPQFLISNGQG+QTWT A SCYPVPE KQFNFPS  STS+  DDD  N Y+ GGFDE INNSSYY  SL+TNCDFNSTSQIFVGHYAIEN
Subjt:  MNHMNKVSNLGPQFLISNGQGNQTWTAARSCYPVPECKQFNFPSNNSTSRTCDDD--NPYYSGGFDEAINNSSYYRNSLETNCDFNSTSQIFVGHYAIEN

Query:  HTDGGAGQCYQMQFNAGNPVESLLMDGELSDIFK
        HTD GAGQCYQMQFN GN  ESLLMDGELSDIFK
Subjt:  HTDGGAGQCYQMQFNAGNPVESLLMDGELSDIFK

XP_008453705.1 PREDICTED: two-component response regulator ARR10-like [Cucumis melo]1.07e-7084.33Show/hide
Query:  MNHMNKVSNLGPQFLISNGQGNQTWTAARSCYPVPECKQFNFPSNNSTSRTCDDD--NPYYSGGFDEAINNSSYYRNSLETNCDFNSTSQIFVGHYAIEN
        MNHMNKVSNLGPQFLISNGQG+QTWT A SCYPVPE KQFNFPS  STS+  DDD  N Y+ GGFDE INNSSYY  SL+TNCDFNSTSQIFVGHYAIEN
Subjt:  MNHMNKVSNLGPQFLISNGQGNQTWTAARSCYPVPECKQFNFPSNNSTSRTCDDD--NPYYSGGFDEAINNSSYYRNSLETNCDFNSTSQIFVGHYAIEN

Query:  HTDGGAGQCYQMQFNAGNPVESLLMDGELSDIFK
        HTD GAGQCYQMQFNAGN  ESLLMDGELSDIFK
Subjt:  HTDGGAGQCYQMQFNAGNPVESLLMDGELSDIFK

XP_011648495.1 two-component response regulator ARR10 [Cucumis sativus]1.24e-6091.35Show/hide
Query:  MNHMNKVSNLGPQFLISNGQGNQTWTAARSCYPVPECKQFNFPSNNSTSRTCDDDNPYYSGGFDEAINNSSYYRNSLETNCDFNSTSQIFVGHYAIENHT
        MNHMNKVSNLG QFLISNGQGNQTWTAARSCYPVPE K FNFP NNSTSRTCDDDNPYYSGGFDE INNSSYY NSLETNC FNSTSQI VG YAIENHT
Subjt:  MNHMNKVSNLGPQFLISNGQGNQTWTAARSCYPVPECKQFNFPSNNSTSRTCDDDNPYYSGGFDEAINNSSYYRNSLETNCDFNSTSQIFVGHYAIENHT

Query:  DGGA
        DGGA
Subjt:  DGGA

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LU42 Uncharacterized protein1.3e-6491.67Show/hide
Query:  MNHMNKVSNLGPQFLISNGQGNQTWTAARSCYPVPECKQFNFPSNNSTSRTCDDDNPYYSGGFDEAINNSSYYRNSLETNCDFNSTSQIFVGHYAIENHT
        MNHMNKVSNLG QFLISNGQGNQTWTAARSCYPVPE K FNFP NNSTSRTCDDDNPYYSGGFDE INNSSYY NSLETNC FNSTSQI VG YAIENHT
Subjt:  MNHMNKVSNLGPQFLISNGQGNQTWTAARSCYPVPECKQFNFPSNNSTSRTCDDDNPYYSGGFDEAINNSSYYRNSLETNCDFNSTSQIFVGHYAIENHT

Query:  DGGAGQCYQMQFNAGNPVESLLMDGELSDIFK
        DGGAGQCYQMQFNAGN +ESLLMDGELSDIFK
Subjt:  DGGAGQCYQMQFNAGNPVESLLMDGELSDIFK

A0A0A0LX87 Uncharacterized protein2.1e-3864.96Show/hide
Query:  MNHMNKVSNLGPQF-LISNGQGNQ----TWTAARSCYPVPECKQFNFPSNNSTSRTCDDDNPYYSGGFDEAINNSSYYRNSLETNCDFNSTSQIFVGHYA
        MN +NKV NLGPQF +ISNGQGNQ    TWTAA SC+P+PE K FNFPSNN  S+ CDDDN  Y G   E  N++  Y   L+TNC+FNSTSQ FVG+YA
Subjt:  MNHMNKVSNLGPQF-LISNGQGNQ----TWTAARSCYPVPECKQFNFPSNNSTSRTCDDDNPYYSGGFDEAINNSSYYRNSLETNCDFNSTSQIFVGHYA

Query:  IENHTDGGAGQCYQMQFNAGNPVESLLMDGELSDIFK
        IE+H   G+GQCYQMQF A N +ES LMD ELSDIFK
Subjt:  IENHTDGGAGQCYQMQFNAGNPVESLLMDGELSDIFK

A0A1S3BWW6 two-component response regulator ARR10-like3.9e-5684.33Show/hide
Query:  MNHMNKVSNLGPQFLISNGQGNQTWTAARSCYPVPECKQFNFPSNNSTSRTCDDD--NPYYSGGFDEAINNSSYYRNSLETNCDFNSTSQIFVGHYAIEN
        MNHMNKVSNLGPQFLISNGQG+QTWT A SCYPVPE KQFNFPS  STS+  DDD  N Y+ GGFDE INNSSYY  SL+TNCDFNSTSQIFVGHYAIEN
Subjt:  MNHMNKVSNLGPQFLISNGQGNQTWTAARSCYPVPECKQFNFPSNNSTSRTCDDD--NPYYSGGFDEAINNSSYYRNSLETNCDFNSTSQIFVGHYAIEN

Query:  HTDGGAGQCYQMQFNAGNPVESLLMDGELSDIFK
        HTD GAGQCYQMQFNAGN  ESLLMDGELSDIFK
Subjt:  HTDGGAGQCYQMQFNAGNPVESLLMDGELSDIFK

A0A5A7UXN8 Two-component response regulator ARR10-like3.9e-5684.33Show/hide
Query:  MNHMNKVSNLGPQFLISNGQGNQTWTAARSCYPVPECKQFNFPSNNSTSRTCDDD--NPYYSGGFDEAINNSSYYRNSLETNCDFNSTSQIFVGHYAIEN
        MNHMNKVSNLGPQFLISNGQG+QTWT A SCYPVPE KQFNFPS  STS+  DDD  N Y+ GGFDE INNSSYY  SL+TNCDFNSTSQIFVGHYAIEN
Subjt:  MNHMNKVSNLGPQFLISNGQGNQTWTAARSCYPVPECKQFNFPSNNSTSRTCDDD--NPYYSGGFDEAINNSSYYRNSLETNCDFNSTSQIFVGHYAIEN

Query:  HTDGGAGQCYQMQFNAGNPVESLLMDGELSDIFK
        HTD GAGQCYQMQFNAGN  ESLLMDGELSDIFK
Subjt:  HTDGGAGQCYQMQFNAGNPVESLLMDGELSDIFK

A0A5D3CJY2 Two-component response regulator ARR10-like1.1e-5583.58Show/hide
Query:  MNHMNKVSNLGPQFLISNGQGNQTWTAARSCYPVPECKQFNFPSNNSTSRTCDDD--NPYYSGGFDEAINNSSYYRNSLETNCDFNSTSQIFVGHYAIEN
        MNHMNKVSNLGPQFLISNGQG+QTWT A SCYPVPE KQFNFPS  STS+  DDD  N Y+ GGFDE INNSSYY  SL+TNCDFNSTSQIFVGHYAIEN
Subjt:  MNHMNKVSNLGPQFLISNGQGNQTWTAARSCYPVPECKQFNFPSNNSTSRTCDDD--NPYYSGGFDEAINNSSYYRNSLETNCDFNSTSQIFVGHYAIEN

Query:  HTDGGAGQCYQMQFNAGNPVESLLMDGELSDIFK
        HTD GAGQCYQMQFN GN  ESLLMDGELSDIFK
Subjt:  HTDGGAGQCYQMQFNAGNPVESLLMDGELSDIFK

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAACCATATGAACAAAGTTTCAAATTTGGGGCCTCAATTTCTAATAAGCAATGGCCAAGGGAATCAGACGTGGACGGCGGCCAGAAGTTGCTATCCGGTGCCGGAATG
CAAACAGTTTAATTTTCCATCCAATAATTCAACTTCAAGAACATGTGATGATGATAATCCGTATTACTCGGGAGGATTTGATGAAGCAATCAACAATAGTTCTTATTATC
GTAATTCCTTGGAAACTAATTGCGATTTCAATTCAACTTCTCAAATTTTTGTTGGACATTATGCGATTGAAAATCATACTGATGGTGGTGCAGGACAATGTTATCAAATG
CAATTTAATGCTGGAAATCCCGTGGAAAGCTTATTAATGGATGGCGAGCTTTCTGACATTTTCAAATAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGAACCATATGAACAAAGTTTCAAATTTGGGGCCTCAATTTCTAATAAGCAATGGCCAAGGGAATCAGACGTGGACGGCGGCCAGAAGTTGCTATCCGGTGCCGGAATG
CAAACAGTTTAATTTTCCATCCAATAATTCAACTTCAAGAACATGTGATGATGATAATCCGTATTACTCGGGAGGATTTGATGAAGCAATCAACAATAGTTCTTATTATC
GTAATTCCTTGGAAACTAATTGCGATTTCAATTCAACTTCTCAAATTTTTGTTGGACATTATGCGATTGAAAATCATACTGATGGTGGTGCAGGACAATGTTATCAAATG
CAATTTAATGCTGGAAATCCCGTGGAAAGCTTATTAATGGATGGCGAGCTTTCTGACATTTTCAAATAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MNHMNKVSNLGPQFLISNGQGNQTWTAARSCYPVPECKQFNFPSNNSTSRTCDDDNPYYSGGFDEAINNSSYYRNSLETNCDFNSTSQIFVGHYAIENHTDGGAGQCYQM
QFNAGNPVESLLMDGELSDIFK