; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Chy2G045240 (gene) of Cucumber (hystrix) v1 genome

Gene IDChy2G045240
OrganismCucumis hystrix (Cucumber (hystrix) v1)
DescriptionBasic helix-loop-helix (BHLH) DNA-binding superfamily protein
Genome locationchrH02:26656731..26660237
RNA-Seq ExpressionChy2G045240
SyntenyChy2G045240
Gene Ontology termsGO:0006355 - regulation of transcription, DNA-templated (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0003700 - DNA-binding transcription factor activity (molecular function)
GO:0043565 - sequence-specific DNA binding (molecular function)
GO:0046983 - protein dimerization activity (molecular function)
InterPro domainsIPR011598 - Myc-type, basic helix-loop-helix (bHLH) domain
IPR036638 - Helix-loop-helix DNA-binding domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0058209.1 transcription factor bHLH35 [Cucumis melo var. makuwa]5.78e-12991.55Show/hide
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XP_008453552.1 PREDICTED: transcription factor bHLH35 [Cucumis melo]2.14e-15092.95Show/hide
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XP_022922024.1 transcription factor bHLH35-like [Cucurbita moschata]2.58e-12782.11Show/hide
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XP_038878728.1 transcription factor bHLH35-like isoform X1 [Benincasa hispida]9.40e-13986.83Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LU95 BHLH domain-containing protein5.9e-12799.17Show/hide
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A0A1S3BWL7 transcription factor bHLH355.0e-11892.95Show/hide
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A0A5A7UXG0 Transcription factor bHLH351.2e-10091.55Show/hide
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A0A6J1E262 transcription factor bHLH35-like6.1e-10082.11Show/hide
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        ANI+AVSGRLLKTVFIEAE+EERDYLKIKIETAIAGLNDPHSPMSI
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A0A6J1JJ79 transcription factor bHLH35-like2.3e-9981.71Show/hide
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        M+  G+D +N FG++IFI  EELDSWG +EP SG YDSSSP+G    S+A+KN+ASERNRRRKLNERLFALRSVVPNI+KMDKASIIKDAIDYI DLH+Q
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        ANI+AVSGRLLKTVFIEAE+EERDYLKIKIETAIAGLNDPHSPMSI
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
A0A060KY90 Transcription factor MYC19.3e-1329.19Show/hide
Query:  NVASERNRRRKLNERLFALRSVVPNISKMDKASIIKDAIDYIHDLHDQERRIQAEIYELESGKLKKITGYEFDQDQLPLLLRSKRKKTEQYFSYDSPVSR
        +V +ER RR KLN+R +ALR+VVPN+SKMDKAS++ DAI YI++L  + +    +  EL S              Q+  L +    K    +S   P+++
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Query:  ISPIEVLDLSVTYMGDRTIVVSMTCCKRADSMVKLCEVFESLNLKIITANITAVSGRLLK--TVFIEAEQEERDYLKIKIETAIA
           I  +D+ V  +G    ++ + C K+     +L    + L+L +  A+++ V+  +++  TV + +    ++ L+I + + IA
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Q0JEB7 Transcription factor BHLH65.1e-3536.04Show/hide
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        EELDS  L      +Y+SSSPDGS                                           A+KN+  ER+RRRKLNE+L+ALRSVVPNI+KMD
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Query:  KASIIKDAIDYIHDLHDQERRIQAEIYELES--------GKLKKITGYEFDQD-----QLPLLLRSKRKKTEQYFSYDS-------PVSRISPIEVLDLS
        KASIIKDAI+YI  L  +E+++  E+  LES               G   D++       P     + KK ++  S  S         +   P+E+ +L 
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Query:  VTYMGDRTIVVSMTCCKRADSMVKLCEVFESLNLKIITANITAVSGRLLKTVFIEAEQEERDYLKIKIETAIAGLNDPHSPMS
        V+ +GDR +VVS+TC KR D+M ++C   E L L++ITANIT+V+G L+ T+F+E +  +   +K  +E A++ L    SP+S
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Q2HIV9 Transcription factor bHLH355.0e-5959.82Show/hide
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        SW LEE  SG YDSSSPDG+A   ASKN+ SERNRR+KLN+RLFALRSVVPNI+KMDKASIIKDAI YI  L  +E++++AEI ELES     ++   +F
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Query:  DQDQLPLLLRSKRKKTEQYFSYDSPVSRISPIEVLDLSVTYMGDRTIVVSMTCCKRADSMVKLCEVFESLNLKIITANITAVSGRLLKTVFIEAEQEERD
        D+D   LL+    KK +Q  S  S     S IEVL+L VT+MG+RT+VVS+TC KR D+MVKLCEVFESLNLKI+T+N+T+ SG +  TVFIEA++EE++
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Query:  YLKIKIETAIAGLNDPHSP
         L++KIET I   N+  SP
Subjt:  YLKIKIETAIAGLNDPHSP

Q700E3 Transcription factor bHLH277.8e-4447.16Show/hide
Query:  MNIIGDDYLNPFGNEIFIGE---ELDSWGLEEPFSGDYDSSSPDGS----AASKNVASERNRRRKLNERLFALRSVVPNISKMDKASIIKDAIDYIHDLH
        M  +  +Y N +   +F      E DSW +EE FSG  +SSSPDG+    A+SKNV SERNRR+KLN+RLFALRSVVPNISK+DKAS+IKD+IDY+ +L 
Subjt:  MNIIGDDYLNPFGNEIFIGE---ELDSWGLEEPFSGDYDSSSPDGS----AASKNVASERNRRRKLNERLFALRSVVPNISKMDKASIIKDAIDYIHDLH

Query:  DQERRIQAEIYELESGKL---KKITGYEFDQDQLPLL-------LRSKRKKTEQYFSYDSPVSRISPIEVLDLSVTYMGDRTIVVSMTCCKRADSMVKLC
        DQE+ ++AEI ELES        +  Y+ +  +  L        +RSK+ K   Y    S   +  PIEVL++ VT+MG++T+VV +TC K+ ++MV+LC
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Query:  EVFESLNLKIITANITAVSGRLLKTVFIE
        +V ESLNL I+T N ++ + RL  T+F++
Subjt:  EVFESLNLKIITANITAVSGRLLKTVFIE

Q9LSE2 Transcription factor ICE12.5e-1330.98Show/hide
Query:  SKNVASERNRRRKLNERLFALRSVVPNISKMDKASIIKDAIDYIHDLHDQERRIQAEIYELESGKLKKITGYEFDQDQLPLLLRSKRKKTEQYFSYDSPV
        +KN+ +ER RR+KLN+RL+ LRSVVP ISKMD+ASI+ DAIDY+ +L  +   +  E+     G L   +         P  L  + K+     S  SP 
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Query:  SRISPIEVLDLSVTYMGDRTIVVSMTCCKRADSMVKLCEVFESLNLKIITANITAVSGRLLKTVFIEAEQEERDYLKIKIETAI
         + + +E     V     R + + M C +R   ++   +  ++L L +  A I+  +G  L     E  QE ++ L  +I+  +
Subjt:  SRISPIEVLDLSVTYMGDRTIVVSMTCCKRADSMVKLCEVFESLNLKIITANITAVSGRLLKTVFIEAEQEERDYLKIKIETAI

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT4G29930.1 basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein8.0e-5247.04Show/hide
Query:  MNIIGDDYLNPFGNEIFIGE---ELDSWGLEEPFSGDYDSSSPDGS----AASKNVASERNRRRKLNERLFALRSVVPNISKMDKASIIKDAIDYIHDLH
        M  +  +Y N +   +F      E DSW +EE FSG  +SSSPDG+    A+SKNV SERNRR+KLN+RLFALRSVVPNISK+DKAS+IKD+IDY+ +L 
Subjt:  MNIIGDDYLNPFGNEIFIGE---ELDSWGLEEPFSGDYDSSSPDGS----AASKNVASERNRRRKLNERLFALRSVVPNISKMDKASIIKDAIDYIHDLH

Query:  DQERRIQAEIYELESGKL---KKITGYEFDQDQLPLL-------LRSKRKKTEQYFSYDSPVSRISPIEVLDLSVTYMGDRTIVVSMTCCKRADSMVKLC
        DQE+ ++AEI ELES        +  Y+ +  +  L        +RSK+ K   Y    S   +  PIEVL++ VT+MG++T+VV +TC K+ ++MV+LC
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Query:  EVFESLNLKIITANITAVSGRLLKTVFIEAEQEERDYLKIKIETAIAGLNDPH
        +V ESLNL I+T N ++ + RL  T+F++A++EE   ++ KI+ AIA  NDP+
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AT5G57150.1 basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein2.5e-6159.91Show/hide
Query:  ELDSWGLEEPFSGDYDSSSPDGSA---ASKNVASERNRRRKLNERLFALRSVVPNISKMDKASIIKDAIDYIHDLHDQERRIQAEIYELESGKLKKIT-G
        E DSW LEE  SG YDSSSPDG+A   ASKN+ SERNRR+KLN+RLFALRSVVPNI+KMDKASIIKDAI YI  L  +E++++AEI ELES     ++  
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Query:  YEFDQDQLPLLLRSKRKKTEQYFSYDSPVSRISPIEVLDLSVTYMGDRTIVVSMTCCKRADSMVKLCEVFESLNLKIITANITAVSGRLLKTVFIEAEQE
         +FD+D   LL+    KK +Q  S  S     S IEVL+L VT+MG+RT+VVS+TC KR D+MVKLCEVFESLNLKI+T+N+T+ SG +  TVFIEA++E
Subjt:  YEFDQDQLPLLLRSKRKKTEQYFSYDSPVSRISPIEVLDLSVTYMGDRTIVVSMTCCKRADSMVKLCEVFESLNLKIITANITAVSGRLLKTVFIEAEQE

Query:  ERDYLKIKIETAIAGLNDPHSP
        E++ L++KIET I   N+  SP
Subjt:  ERDYLKIKIETAIAGLNDPHSP

AT5G57150.2 basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein6.1e-5261.66Show/hide
Query:  SWGLEEPFSGDYDSSSPDGSA---ASKNVASERNRRRKLNERLFALRSVVPNISKMDKASIIKDAIDYIHDLHDQERRIQAEIYELESGKLKKIT-GYEF
        SW LEE  SG YDSSSPDG+A   ASKN+ SERNRR+KLN+RLFALRSVVPNI+KMDKASIIKDAI YI  L  +E++++AEI ELES     ++   +F
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AT5G57150.3 basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein6.1e-5261.66Show/hide
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AT5G57150.4 basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein6.1e-5261.66Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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