; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Chy3G059680 (gene) of Cucumber (hystrix) v1 genome

Gene IDChy3G059680
OrganismCucumis hystrix (Cucumber (hystrix) v1)
Descriptiontranscription factor bHLH79
Genome locationchrH03:13411240..13413467
RNA-Seq ExpressionChy3G059680
SyntenyChy3G059680
Gene Ontology termsGO:0006355 - regulation of transcription, DNA-templated (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0003700 - DNA-binding transcription factor activity (molecular function)
GO:0046983 - protein dimerization activity (molecular function)
InterPro domainsIPR011598 - Myc-type, basic helix-loop-helix (bHLH) domain
IPR024097 - Basic helix-loop-helix leucine zipper transcription factor
IPR036638 - Helix-loop-helix DNA-binding domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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XP_038884167.1 transcription factor BHLH089-like [Benincasa hispida]1.51e-18889.26Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KG05 BHLH domain-containing protein7.4e-16498.66Show/hide
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A0A1S3CNW1 transcription factor bHLH791.5e-16196.98Show/hide
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A0A5A7TTF0 Transcription factor bHLH791.5e-16196.98Show/hide
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A0A6J1G465 transcription factor BHLH094-like3.4e-13282.21Show/hide
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A0A6J1KBN0 transcription factor BHLH094-like7.0e-13080.87Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q0JXE7 Transcription factor BPE1.1e-5051.17Show/hide
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        MDP  ++N+              PFNL+EIW FP++G ++  DS      R + +  N   FGD  +          +   L Q +  G   + KRR  +
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          S K+ ST             ++   KR K     D+  + K EAE    +TEQ  Q    +P +DYIHVRARRGQATDSHSLAERARREKISERMKIL
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        QDLVPGCNKVIGKALVLDEIINYIQSLQRQVEFLSMKLEAVNSR+ PGIEVFPPK+
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Q69WS3 Transcription factor BHLH0941.3e-5652.61Show/hide
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        D  P+LA  +    H+  HF   ++   + S +             G G S +RR        D D  KV STS  +         +DA   KR+K    
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         D N   + EA   SG +    ++N+ P PE PKQDYIHVRARRGQATDSHSLAERARREKISERMKILQDLVPGCNKVIGKA VLDEIINYIQSLQ QV
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        EFLSMKLEAVNS +  GI  FP KD+G Q ++T  G+ F  Q TRE+++GS+ EWLHMQIG  +ER T
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Q84T08 Transcription factor BHLH0893.7e-5960.27Show/hide
Query:  GHGVSKKRRHS----DQDSPKVSSTSNGNNANANSSAGNDAGGKRVKTAACRDDNHESKIEAEPRS---GKTEQNSQPTPEQPKQDYIHVRARRGQATDS
        G G  ++R+      + DS ++ STS G     + +   D+  KR K +    DN   + EAE  S    K+   + P PE PKQDYIHVRARRGQATDS
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Query:  HSLAERARREKISERMKILQDLVPGCNKVIGKALVLDEIINYIQSLQRQVEFLSMKLEAVNSRIGPGIEVFPPKDYGQQTFDTT-GVAFGSQATREYSRG
        HSLAERARREKISERMKILQDLVPGCNKVIGKA VLDEIINYIQ+LQRQVEFLSMKLEAVN+ +  GIE FPPKD+G Q ++T  G+ F  Q  REY++G
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Query:  SSP-EWLHMQIGGGFERTT
        S+P EWLHMQIGG +ER T
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Q9FJL4 Transcription factor bHLH781.7e-3552.85Show/hide
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        A+ +PEV+P        ++R     G SK+   S    SP  S T+  N     S +  + GGKR +     +D+ E + E E   G    N++P PE P
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        K DYIHVRARRGQATDSHSLAER RREKI ERMK+LQDLVPGCNKV GKAL+LDEIINY+QSLQRQVEFLSMKL +VN +R+   ++    KD
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Q9LV17 Transcription factor bHLH791.1e-5247.9Show/hide
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        MDPP L+N  SF     ANP  + + LSEIW FP++       SG  LA+    +     H G+  +   E S    L          G G  K R  +S
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Query:  DQDSPK-VSSTSNGNNANANSSAGNDAGGKRVKTAACRDDNHESKI--EAEPRSG-----KTEQNSQPTPEQPKQDYIHVRARRGQATDSHSLAERARRE
        + DS K VSS+S+GN          ++G K+ K       N +  +  E E  SG      TEQ ++P   +P +DYIHVRARRGQATD HSLAERARRE
Subjt:  DQDSPK-VSSTSNGNNANANSSAGNDAGGKRVKTAACRDDNHESKI--EAEPRSG-----KTEQNSQPTPEQPKQDYIHVRARRGQATDSHSLAERARRE

Query:  KISERMKILQDLVPGCNKVIGKALVLDEIINYIQSLQRQVEFLSMKLEAVNS--RIGPGIEVFPPKDYGQQTFDTTGVAFGSQATREYSRGSSPEWLHMQ
        KISE+M  LQD++PGCNK+IGKALVLDEIINYIQSLQRQVEFLSMKLE VNS    GP I VFP  D G    D     +  Q   E +R S PEWLHMQ
Subjt:  KISERMKILQDLVPGCNKVIGKALVLDEIINYIQSLQRQVEFLSMKLEAVNS--RIGPGIEVFPPKDYGQQTFDTTGVAFGSQATREYSRGSSPEWLHMQ

Query:  IGGGFERTT
        + G F RTT
Subjt:  IGGGFERTT

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G59640.1 BIG PETAL P1.5e-7154.18Show/hide
Query:  MDPPTLINQPSFPTTPNANPNITPFNLSEIWHFPIHGGTSVDDSGPALALRMAHLAHNLTHFGDIAIGNPEVSPTDSLPLQLQQRLPHGHGVSKKRRHSD
        MDP  ++N+              PFNL+EIW FP++G ++  DS      R + +  N   FGD  +          +   L Q +  G   + KRR  +
Subjt:  MDPPTLINQPSFPTTPNANPNITPFNLSEIWHFPIHGGTSVDDSGPALALRMAHLAHNLTHFGDIAIGNPEVSPTDSLPLQLQQRLPHGHGVSKKRRHSD

Query:  QDSPKVSSTSNGNNANANSSAGNDAGGKRVKTAACRDDNHESKIEAEPRSGKTEQNSQPTPEQPKQDYIHVRARRGQATDSHSLAERARREKISERMKIL
          S K+ ST             ++   KR K     D+  + K EAE    +TEQ  Q    +P +DYIHVRARRGQATDSHSLAERARREKISERMKIL
Subjt:  QDSPKVSSTSNGNNANANSSAGNDAGGKRVKTAACRDDNHESKIEAEPRSGKTEQNSQPTPEQPKQDYIHVRARRGQATDSHSLAERARREKISERMKIL

Query:  QDLVPGCNKVIGKALVLDEIINYIQSLQRQVEFLSMKLEAVNSRIGPGIEVFPPKDYGQQTFDTTGVAFGSQATREYSRGSSPEWLHMQIG-GGFERTT
        QDLVPGCNKVIGKALVLDEIINYIQSLQRQVEFLSMKLEAVNSR+ PGIEVFPPK++GQQ F+   + FGSQ+TREYSRG+SPEWLHMQIG GGFERT+
Subjt:  QDLVPGCNKVIGKALVLDEIINYIQSLQRQVEFLSMKLEAVNSRIGPGIEVFPPKDYGQQTFDTTGVAFGSQATREYSRGSSPEWLHMQIG-GGFERTT

AT1G59640.2 BIG PETAL P7.6e-5251.17Show/hide
Query:  MDPPTLINQPSFPTTPNANPNITPFNLSEIWHFPIHGGTSVDDSGPALALRMAHLAHNLTHFGDIAIGNPEVSPTDSLPLQLQQRLPHGHGVSKKRRHSD
        MDP  ++N+              PFNL+EIW FP++G ++  DS      R + +  N   FGD  +          +   L Q +  G   + KRR  +
Subjt:  MDPPTLINQPSFPTTPNANPNITPFNLSEIWHFPIHGGTSVDDSGPALALRMAHLAHNLTHFGDIAIGNPEVSPTDSLPLQLQQRLPHGHGVSKKRRHSD

Query:  QDSPKVSSTSNGNNANANSSAGNDAGGKRVKTAACRDDNHESKIEAEPRSGKTEQNSQPTPEQPKQDYIHVRARRGQATDSHSLAERARREKISERMKIL
          S K+ ST             ++   KR K     D+  + K EAE    +TEQ  Q    +P +DYIHVRARRGQATDSHSLAERARREKISERMKIL
Subjt:  QDSPKVSSTSNGNNANANSSAGNDAGGKRVKTAACRDDNHESKIEAEPRSGKTEQNSQPTPEQPKQDYIHVRARRGQATDSHSLAERARREKISERMKIL

Query:  QDLVPGCNKVIGKALVLDEIINYIQSLQRQVEFLSMKLEAVNSRIGPGIEVFPPKD
        QDLVPGCNKVIGKALVLDEIINYIQSLQRQVEFLSMKLEAVNSR+ PGIEVFPPK+
Subjt:  QDLVPGCNKVIGKALVLDEIINYIQSLQRQVEFLSMKLEAVNSRIGPGIEVFPPKD

AT3G07340.1 basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein1.6e-3353.53Show/hide
Query:  SDQDSPKVSSTSNGNNANANSSAGNDAG--GKRVKT--------AACRDDNHESKIEAEP-RSGKTEQNSQPTPE-QPKQDYIHVRARRGQATDSHSLAE
        +++  P+VSS+       ++  AG  +G   ++ KT        A       E K +++P R  K+E+N   T    P +DYIHVRARRGQATDSHSLAE
Subjt:  SDQDSPKVSSTSNGNNANANSSAGNDAG--GKRVKT--------AACRDDNHESKIEAEP-RSGKTEQNSQPTPE-QPKQDYIHVRARRGQATDSHSLAE

Query:  RARREKISERMKILQDLVPGCNKVIGKALVLDEIINYIQSLQRQVEFLSMKLEAVNSRIGPGIEVFPPKD
        R RREKISERMK+LQDLVPGCNKV GKAL+LDEIINY+QSLQRQVEFLSMKL +VN+R+   ++    KD
Subjt:  RARREKISERMKILQDLVPGCNKVIGKALVLDEIINYIQSLQRQVEFLSMKLEAVNSRIGPGIEVFPPKD

AT5G48560.1 basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein1.2e-3652.85Show/hide
Query:  AIGNPEVSPTDSLPLQLQQRLPHGHGVSKKRRHSD-QDSPKVSSTSNGNNANANSSAGNDAGGKRVKTAACRDDNHESKIEAEPRSGKTEQNSQPTPEQP
        A+ +PEV+P        ++R     G SK+   S    SP  S T+  N     S +  + GGKR +     +D+ E + E E   G    N++P PE P
Subjt:  AIGNPEVSPTDSLPLQLQQRLPHGHGVSKKRRHSD-QDSPKVSSTSNGNNANANSSAGNDAGGKRVKTAACRDDNHESKIEAEPRSGKTEQNSQPTPEQP

Query:  KQDYIHVRARRGQATDSHSLAERARREKISERMKILQDLVPGCNKVIGKALVLDEIINYIQSLQRQVEFLSMKLEAVN-SRIGPGIEVFPPKD
        K DYIHVRARRGQATDSHSLAER RREKI ERMK+LQDLVPGCNKV GKAL+LDEIINY+QSLQRQVEFLSMKL +VN +R+   ++    KD
Subjt:  KQDYIHVRARRGQATDSHSLAERARREKISERMKILQDLVPGCNKVIGKALVLDEIINYIQSLQRQVEFLSMKLEAVN-SRIGPGIEVFPPKD

AT5G62610.1 basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein8.1e-5447.9Show/hide
Query:  MDPPTLINQPSFPTTPNANPNITPFNLSEIWHFPIHGGTSVDDSGPALALRMAHLAHNLTHFGDIAIGNPEVSPTDSLPLQLQQRLPHGHGVSKKR-RHS
        MDPP L+N  SF     ANP  + + LSEIW FP++       SG  LA+    +     H G+  +   E S    L          G G  K R  +S
Subjt:  MDPPTLINQPSFPTTPNANPNITPFNLSEIWHFPIHGGTSVDDSGPALALRMAHLAHNLTHFGDIAIGNPEVSPTDSLPLQLQQRLPHGHGVSKKR-RHS

Query:  DQDSPK-VSSTSNGNNANANSSAGNDAGGKRVKTAACRDDNHESKI--EAEPRSG-----KTEQNSQPTPEQPKQDYIHVRARRGQATDSHSLAERARRE
        + DS K VSS+S+GN          ++G K+ K       N +  +  E E  SG      TEQ ++P   +P +DYIHVRARRGQATD HSLAERARRE
Subjt:  DQDSPK-VSSTSNGNNANANSSAGNDAGGKRVKTAACRDDNHESKI--EAEPRSG-----KTEQNSQPTPEQPKQDYIHVRARRGQATDSHSLAERARRE

Query:  KISERMKILQDLVPGCNKVIGKALVLDEIINYIQSLQRQVEFLSMKLEAVNS--RIGPGIEVFPPKDYGQQTFDTTGVAFGSQATREYSRGSSPEWLHMQ
        KISE+M  LQD++PGCNK+IGKALVLDEIINYIQSLQRQVEFLSMKLE VNS    GP I VFP  D G    D     +  Q   E +R S PEWLHMQ
Subjt:  KISERMKILQDLVPGCNKVIGKALVLDEIINYIQSLQRQVEFLSMKLEAVNS--RIGPGIEVFPPKDYGQQTFDTTGVAFGSQATREYSRGSSPEWLHMQ

Query:  IGGGFERTT
        + G F RTT
Subjt:  IGGGFERTT


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGATCCACCTACTCTCATCAACCAACCTTCATTTCCAACTACCCCTAATGCCAATCCCAATATCACCCCTTTCAATCTTTCTGAGATCTGGCACTTCCCAATTCATGG
CGGAACCTCCGTTGACGATTCTGGTCCTGCTCTTGCCCTCAGGATGGCTCATCTCGCTCATAATTTGACCCACTTTGGAGACATTGCCATTGGGAATCCAGAGGTTTCCC
CTACTGACTCACTTCCCTTGCAATTGCAGCAGAGACTACCTCATGGTCATGGCGTTTCCAAGAAGCGCCGTCATTCAGACCAAGATTCGCCTAAAGTCAGTTCCACCAGT
AATGGCAACAATGCCAATGCCAATAGCAGCGCTGGGAATGATGCTGGTGGAAAACGCGTTAAAACAGCGGCGTGTAGAGATGATAATCACGAATCCAAAATAGAAGCGGA
ACCCAGATCTGGGAAGACCGAACAGAACTCCCAGCCTACTCCAGAACAACCCAAACAGGATTACATCCATGTGCGAGCGAGAAGGGGCCAAGCAACTGATAGCCATAGTC
TGGCCGAAAGGGCTAGAAGGGAAAAGATAAGTGAGAGAATGAAAATTCTACAAGATTTGGTCCCTGGGTGCAATAAGGTGATTGGAAAAGCGCTTGTACTTGATGAGATA
ATAAATTACATTCAATCTCTTCAGCGTCAGGTTGAGTTTTTGTCAATGAAACTCGAAGCAGTTAATTCGAGAATTGGCCCTGGCATTGAAGTGTTTCCTCCAAAAGATTA
TGGTCAACAAACATTCGATACAACCGGCGTTGCGTTTGGTTCACAAGCAACAAGAGAATACAGCCGTGGCTCATCACCAGAATGGTTGCATATGCAGATTGGTGGTGGTT
TCGAAAGAACGACGTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGATCCACCTACTCTCATCAACCAACCTTCATTTCCAACTACCCCTAATGCCAATCCCAATATCACCCCTTTCAATCTTTCTGAGATCTGGCACTTCCCAATTCATGG
CGGAACCTCCGTTGACGATTCTGGTCCTGCTCTTGCCCTCAGGATGGCTCATCTCGCTCATAATTTGACCCACTTTGGAGACATTGCCATTGGGAATCCAGAGGTTTCCC
CTACTGACTCACTTCCCTTGCAATTGCAGCAGAGACTACCTCATGGTCATGGCGTTTCCAAGAAGCGCCGTCATTCAGACCAAGATTCGCCTAAAGTCAGTTCCACCAGT
AATGGCAACAATGCCAATGCCAATAGCAGCGCTGGGAATGATGCTGGTGGAAAACGCGTTAAAACAGCGGCGTGTAGAGATGATAATCACGAATCCAAAATAGAAGCGGA
ACCCAGATCTGGGAAGACCGAACAGAACTCCCAGCCTACTCCAGAACAACCCAAACAGGATTACATCCATGTGCGAGCGAGAAGGGGCCAAGCAACTGATAGCCATAGTC
TGGCCGAAAGGGCTAGAAGGGAAAAGATAAGTGAGAGAATGAAAATTCTACAAGATTTGGTCCCTGGGTGCAATAAGGTGATTGGAAAAGCGCTTGTACTTGATGAGATA
ATAAATTACATTCAATCTCTTCAGCGTCAGGTTGAGTTTTTGTCAATGAAACTCGAAGCAGTTAATTCGAGAATTGGCCCTGGCATTGAAGTGTTTCCTCCAAAAGATTA
TGGTCAACAAACATTCGATACAACCGGCGTTGCGTTTGGTTCACAAGCAACAAGAGAATACAGCCGTGGCTCATCACCAGAATGGTTGCATATGCAGATTGGTGGTGGTT
TCGAAAGAACGACGTAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MDPPTLINQPSFPTTPNANPNITPFNLSEIWHFPIHGGTSVDDSGPALALRMAHLAHNLTHFGDIAIGNPEVSPTDSLPLQLQQRLPHGHGVSKKRRHSDQDSPKVSSTS
NGNNANANSSAGNDAGGKRVKTAACRDDNHESKIEAEPRSGKTEQNSQPTPEQPKQDYIHVRARRGQATDSHSLAERARREKISERMKILQDLVPGCNKVIGKALVLDEI
INYIQSLQRQVEFLSMKLEAVNSRIGPGIEVFPPKDYGQQTFDTTGVAFGSQATREYSRGSSPEWLHMQIGGGFERTT