| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| KAA0064834.1 serine/arginine-rich splicing factor SC35-like [Cucumis melo var. makuwa] | 5.05e-160 | 97.61 | Show/hide |
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| XP_011649457.1 serine/arginine-rich splicing factor SC35 isoform X2 [Cucumis sativus] | 3.58e-162 | 99.2 | Show/hide |
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| XP_031736561.1 serine/arginine-rich splicing factor SC35 isoform X1 [Cucumis sativus] | 1.73e-159 | 96.88 | Show/hide |
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| XP_038884086.1 serine/arginine-rich splicing factor SC35-like [Benincasa hispida] | 6.34e-156 | 96.8 | Show/hide |
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| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A0A0LQG4 RRM domain-containing protein | 5.2e-126 | 99.2 | Show/hide |
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| A0A1S3BCG4 serine/arginine-rich splicing factor SC35-like | 3.8e-124 | 98 | Show/hide |
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PDTRRSISPR+TPPSRGRS++E SPKGDNGSPDDKPVDSRSPSPARSDAD
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| A0A5A7VC44 Serine/arginine-rich splicing factor SC35-like | 2.2e-124 | 97.61 | Show/hide |
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| A0A6J1K4H2 serine/arginine-rich splicing factor SC35-like isoform X2 | 2.1e-119 | 94.02 | Show/hide |
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IRKG+VMESSSK RGRSRSRSPR RHRDD+RDRDYRRRSRSRSRER+DRDRPHRSERERYRSRSRSASPDR KDRRRGRDD ERRSASHSDRSMSP RHS
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PDTRRSISPR+TPPSRGRS++EHSP+ DNGSPDDKPVDSRSPSPA+SDAD+
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|
| A0A6J1K6Z8 serine/arginine-rich splicing factor SC35-like isoform X1 | 3.6e-119 | 94.4 | Show/hide |
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IRKG+VMESSSK RGRSRSRSPR RHRDD+RDRDYRRRSRSRSRER+DRDRPHRSERERYRSRSRSASPDR KDRRRGRDD ERRSASHSDRSMSP RHS
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PDTRRSISPR+TPPSRGRS++EHSP+ DNGSPDDKPVDSRSPSPA+SDAD
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| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| P30352 Serine/arginine-rich splicing factor 2 | 3.1e-27 | 45.74 | Show/hide |
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+GR PPD+ SL V N+T+RT+ D L +F+KYG+V DV+IPRDR T +SRGFAFVR+ +A+ A+D +DG +LDGRE+ VQ A+YG P++
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R+G + RSRSPR R R R R RSRSRSR RY R + R R RSRSRS S RS R + + RS S S RS SP
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R S RS SP K+P G
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|
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| Q01130 Serine/arginine-rich splicing factor 2 | 9.2e-27 | 45.74 | Show/hide |
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+GR PPD+ SL V N+T+RT+ D L +F+KYG+V DV+IPRDR T +SRGFAFVR+ +A+ A+D +DG +LDGRE+ VQ A+YG P++
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R+G RSRSPR R R R R RSRSRSR RY R + R R RSRSRS S RS R + + RS S S RS SP
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R S RS SP K+P G
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|
|
| Q3MHR5 Serine/arginine-rich splicing factor 2 | 9.2e-27 | 45.74 | Show/hide |
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+GR PPD+ SL V N+T+RT+ D L +F+KYG+V DV+IPRDR T +SRGFAFVR+ +A+ A+D +DG +LDGRE+ VQ A+YG P++
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R+G RSRSPR R R R R RSRSRSR RY R + R R RSRSRS S RS R + + RS S S RS SP
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R S RS SP K+P G
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|
|
| Q62093 Serine/arginine-rich splicing factor 2 | 9.2e-27 | 45.74 | Show/hide |
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+GR PPD+ SL V N+T+RT+ D L +F+KYG+V DV+IPRDR T +SRGFAFVR+ +A+ A+D +DG +LDGRE+ VQ A+YG P++
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R+G RSRSPR R R R R RSRSRSR RY R + R R RSRSRS S RS R + + RS S S RS SP
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Query: --TRHSPDTRRSISPRKTPPSRG
R S RS SP K+P G
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|
|
| Q9FMG4 Serine/arginine-rich splicing factor SC35 | 1.1e-64 | 63.1 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
MSHFGRSGPPDI DTYSLLVLNITFRTTADDLYPLF KYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKY DEA KA+++LDGR++DGREI VQFAKYGPNAEK
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Query: IRKGRVME---SSSKTRGRS--------------------RSRSPRSRHRDDHRDRDYRRRSRSRSRERYDRDRPHRSERE-RYRSRSRSASPDRSKDRR
I KGRV+E S ++R RS RSRSPR R RDD+R++DYR+RSRSRS +R R+R +R+ R R+RSRSASPD K R
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Query: RGRDDDERRSASHSDRSMSPTRHSPDTRRSISPRKTPPSRGRSEDEHSPKGDNGSPDDKPVDSRSPSPARS
RGR D+E RS S S S SP R SP RS SP+KT P+R E SP DK + RSPSP RS
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|
|
| Arabidopsis top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| AT1G55310.1 SC35-like splicing factor 33 | 1.6e-10 | 37.55 | Show/hide |
Query: SLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEKIRKGRVMESSSKTRGR
SLLV N+ +DL F+++G V D+++PRD TGD RGF FV++ +A A +DG +L GRE+ V FA+ E +K M + + GR
Subjt: SLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEKIRKGRVMESSSKTRGR
Query: ------------SRSRSPRSRH-RDDHRDRDY-----RR---RSRSRSRERYDRDRPHRSERERYRSRSRSASPDRSKDRRRGRDDDERRSASHSD-RSM
SRSRSP R R R DY RR RS S ERYD R + SR RS +P R K R RRS S S RS
Subjt: ------------SRSRSPRSRH-RDDHRDRDY-----RR---RSRSRSRERYDRDRPHRSERERYRSRSRSASPDRSKDRRRGRDDDERRSASHSD-RSM
Query: SPTRHSPDTRRSISPRKT---PPSRGRSEDEHSPKGDNGSPDDKPVDSRSPSP
SP SP RS+SPR++ P R R SP+ S +P SRS SP
Subjt: SPTRHSPDTRRSISPRKT---PPSRGRSEDEHSPKGDNGSPDDKPVDSRSPSP
|
|
| AT3G13570.1 SC35-like splicing factor 30A | 3.6e-10 | 33.99 | Show/hide |
Query: FGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEKIRK
FG S D+ SLLV N+ +DL F+++G V D+++PRD TGD RGF F+++ +A +A ++DG +L GRE+ V FA+ N +K +
Subjt: FGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEKIRK
Query: GRVMESSSKT-RGRSRSRSPRSRHRDDHRDRDYRRRSRSRSRERYDRDRPHRSERERYRSRSRSASPDRSKDRRRGRDDDERRSASHSD---RSMSPTR-
R + ++ R + R RSP R RR RSRSR R P + R +SRS SP +DRR ++ RS H+ RS SP R
Subjt: GRVMESSSKT-RGRSRSRSPRSRHRDDHRDRDYRRRSRSRSRERYDRDRPHRSERERYRSRSRSASPDRSKDRRRGRDDDERRSASHSD---RSMSPTR-
Query: --HSPDTRRSISPRKT---PPSRGRSEDEHSPKGDNGSPDDKPVDSRSPSPAR
HS RRS+SPRK P + RS+ + + +P + + SP++
Subjt: --HSPDTRRSISPRKT---PPSRGRSEDEHSPKGDNGSPDDKPVDSRSPSPAR
|
|
| AT5G18810.1 SC35-like splicing factor 28 | 2.2e-12 | 32.16 | Show/hide |
Query: LLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEKIRKGRVMESSSKTRGRS
LL+ N+ +DL F+++G + D+++PR+ TG+ RGF FV+Y+YA++A +A+ +++ +++ GREI + FA+ E + + M +++ T G
Subjt: LLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEKIRKGRVMESSSKTRGRS
Query: RSRSPRSRHRDDHRDRDYRRRSRSRSRERYDRDRPHRSERERYRSRSRSASPDRSKDRR-RGRDDD----ERRSASHSDRSMSPTRHSPDTRRSISPRK
R DY+R S HRS R RYRS SRS SP R + R + R+DD RRS S S + +R SPR+
Subjt: RSRSPRSRHRDDHRDRDYRRRSRSRSRERYDRDRPHRSERERYRSRSRSASPDRSKDRR-RGRDDD----ERRSASHSDRSMSPTRHSPDTRRSISPRK
|
|
| AT5G64200.1 ortholog of human splicing factor SC35 | 7.9e-66 | 63.1 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
MSHFGRSGPPDI DTYSLLVLNITFRTTADDLYPLF KYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKY DEA KA+++LDGR++DGREI VQFAKYGPNAEK
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Query: IRKGRVME---SSSKTRGRS--------------------RSRSPRSRHRDDHRDRDYRRRSRSRSRERYDRDRPHRSERE-RYRSRSRSASPDRSKDRR
I KGRV+E S ++R RS RSRSPR R RDD+R++DYR+RSRSRS +R R+R +R+ R R+RSRSASPD K R
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RGR D+E RS S S S SP R SP RS SP+KT P+R E SP DK + RSPSP RS
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| AT5G64200.2 ortholog of human splicing factor SC35 | 7.9e-66 | 63.1 | Show/hide |
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MSHFGRSGPPDI DTYSLLVLNITFRTTADDLYPLF KYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKY DEA KA+++LDGR++DGREI VQFAKYGPNAEK
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I KGRV+E S ++R RS RSRSPR R RDD+R++DYR+RSRSRS +R R+R +R+ R R+RSRSASPD K R
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RGR D+E RS S S S SP R SP RS SP+KT P+R E SP DK + RSPSP RS
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