; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Chy3G063280 (gene) of Cucumber (hystrix) v1 genome

Gene IDChy3G063280
OrganismCucumis hystrix (Cucumber (hystrix) v1)
DescriptionUnknown protein
Genome locationchrH03:16414134..16414715
RNA-Seq ExpressionChy3G063280
SyntenyChy3G063280
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR008004 - Protein OCTOPUS-like


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6598702.1 hypothetical protein SDJN03_08480, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]2.30e-2650.88Show/hide
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        MPKN   LK H AA  A +             SS CRKHPKHKQSPGVCS+CLREKL NLTITK   ++ ++    S SSSSLSSLSSYYSSS PSSS+S
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        PY    K S+SS    LFKRR      S+ T  TN                    GFWSKLMMNRR K+++
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KAG7029644.1 hypothetical protein SDJN02_07984, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]6.47e-2650.88Show/hide
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        PY    K S+SS    LFKRR      S+ T  TN                    GFWSKLMMNRR K+++
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XP_008444863.1 PREDICTED: uncharacterized serine-rich protein C215.13-like [Cucumis melo]3.66e-9185.5Show/hide
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        PSSSSSPY STKKPS+SSMSSLLFKRRWSSS SSS+TATTNTNFF      HHR NNKS HDGFWSKLMMNRRGKEI VEEITLRCSSTSTTTDHQTITT
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XP_022131967.1 uncharacterized protein LOC111004952 [Momordica charantia]5.90e-2049.22Show/hide
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        M KN   LK HAAA MAR+      ++ +GG    CRKHPKH+QSPGVCS+CLREKL  L  T    S++  KI  S SSSSLSS+SS YSS+S +SS S
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          P    +K S+S MSSL FKRR S++   SSS + A                      DG WSKL++NRRGKE      TLR S+ STTTDH
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XP_031736533.1 uncharacterized serine-rich protein C215.13-like [Cucumis sativus]1.75e-11193.88Show/hide
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        SSSPYSSTKKPSVSSMSSLLFKRRWSSSSSSSTTATTNTNFFTAADA HHRINNKSH GFWSKLMMNRRGKEIIVE+ITLRCSSTSTTTDHQTITT
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LPJ0 Uncharacterized protein1.2e-8593.43Show/hide
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        SSSPYSSTKKPSVSSMSSLLFKRRWSSSSSSSTTATTNTNFFTAADA HHRINNKSH GFWSKLMMNRRGKEIIVE+ITLRCSSTSTTTDHQTITT T
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A0A1S3BC83 uncharacterized serine-rich protein C215.13-like4.1e-7085.5Show/hide
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        MPKNN      LKYHAAAPMARSSN G CR   GG  S CRKHPKHKQSPGVCSVCLREKLCNLTITKTP  SSSSSSKILPSFSSSSLSSLSSYYSSSS
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        PSSSSSPY STKKPS+SSMSSLLFKRRWSSS SSS+TATTNTNFF      HHR NNKS HDGFWSKLMMNRRGKE IVEEITLRCSSTSTTTDHQTITT
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A0A6J1BSJ2 uncharacterized protein LOC1110049521.1e-1448.42Show/hide
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        M KN   LK HAAA MAR+      ++ +GG    CRKHPKH+QSPGVCS+CLREKL  L  T     S++ KI  S SSSSLSS+SS YSS+S +S  S
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Query:  SSPYSSTKKPSVSSMSSLLFKRRWSSSSSSSTTATTNTNFFTAADADHHRINNKSHDGFWSKLMMNRRGKEIIVEEITLRCSSTSTTTDH
        S P    +K S+S MSS LFKRR S+++  S++ +                     DG WSKL++NRRGK     E TLR  S STTTDH
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A5AXC1 Uncharacterized protein5.8e-0843.21Show/hide
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        R R  +GG S     CRKHPKH+QSPGVCS+CLRE+L  L+   T S S+S+ +  + SSSSLSS SS+YSSS  SS SSP    +    +  S S LL 
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         +   + S S    T           D  + N KS  GFWSKL+  R  R +E++V   T+R
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F6H0X5 Uncharacterized protein2.6e-0844.44Show/hide
Query:  RCRAGVGGASSH---CRKHPKHKQSPGVCSVCLREKLCNLTITKTPSSSSSSKILPSFSSSSLSSLSSYYSSSSPSSSSSPYSSTK--KPSVSSMSSLLF
        R R  +GG S     CRKHPKH+QSPGVCS+CLRE+L  L+   T S S+S+ +  + SSSSLSS SS+YSSS  SS SSP    +    +  S S LL 
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Query:  KRRWSSSSSSSTTATTNTNFFTAADADHHRINNKSHDGFWSKLMMNR--RGKEIIVEEITLR
         +   + S S    T       A DA     N KS  GFWSKL+  R  R +E++V   T+R
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G72240.1 unknown protein5.9e-0544.94Show/hide
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        C+KH KH+QSPG+CS+CL E+L  L++     T  +  ++    S S+SS SS+SS YSSSS SS SSP  Y   +K       S LF+
Subjt:  CRKHPKHKQSPGVCSVCLREKLCNLTI---TKTPSSSSSSKILPSFSSSSLSSLSSYYSSSSPSSSSSP--YSSTKKPSVSSMSSLLFK


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGCCAAAGAACAACTTGAAATATCATGCGGCGGCGCCAATGGCTAGATCCTCCAACCCCGGCCGCTGTAGAGCCGGCGTCGGCGGCGCCAGCTCTCATTGCCGGAAACA
CCCAAAACACAAACAATCACCTGGGGTTTGCTCTGTTTGTCTAAGAGAAAAGCTCTGTAATTTGACCATTACTAAAACACCCTCTTCCTCTTCCTCTTCGAAAATATTAC
CTTCTTTTTCATCTTCTTCCTTGTCATCTTTATCCTCTTATTACTCATCTTCATCTCCTTCTTCTTCTTCTTCACCCTATTCTTCAACAAAAAAACCTTCAGTTTCTTCC
ATGTCCAGCTTGTTATTCAAGAGAAGATGGTCATCCTCCTCGTCCTCATCAACAACAGCAACAACAAACACTAATTTCTTTACAGCCGCTGATGCTGATCATCATCGTAT
AAACAACAAATCCCATGATGGGTTTTGGTCTAAATTGATGATGAATCGAAGAGGAAAAGAAATTATTGTTGAAGAAATTACTTTGAGGTGCTCTTCAACTTCTACAACAA
CAGATCATCAAACAATTACTACTACTACCTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGCCAAAGAACAACTTGAAATATCATGCGGCGGCGCCAATGGCTAGATCCTCCAACCCCGGCCGCTGTAGAGCCGGCGTCGGCGGCGCCAGCTCTCATTGCCGGAAACA
CCCAAAACACAAACAATCACCTGGGGTTTGCTCTGTTTGTCTAAGAGAAAAGCTCTGTAATTTGACCATTACTAAAACACCCTCTTCCTCTTCCTCTTCGAAAATATTAC
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CAGATCATCAAACAATTACTACTACTACCTAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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