; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Chy3G065720 (gene) of Cucumber (hystrix) v1 genome

Gene IDChy3G065720
OrganismCucumis hystrix (Cucumber (hystrix) v1)
DescriptionDNA excision repair protein ERCC-8-like isoform X2
Genome locationchrH03:17931761..17936273
RNA-Seq ExpressionChy3G065720
SyntenyChy3G065720
Gene Ontology termsGO:0000209 - protein polyubiquitination (biological process)
GO:0006283 - transcription-coupled nucleotide-excision repair (biological process)
GO:0043161 - proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process (biological process)
GO:0000109 - nucleotide-excision repair complex (cellular component)
GO:0031464 - Cul4A-RING E3 ubiquitin ligase complex (cellular component)
GO:0005515 - protein binding (molecular function)
InterPro domainsIPR001680 - WD40 repeat
IPR015943 - WD40/YVTN repeat-like-containing domain superfamily
IPR019775 - WD40 repeat, conserved site
IPR020472 - G-protein beta WD-40 repeat
IPR036322 - WD40-repeat-containing domain superfamily
IPR042238 - DNA excision repair protein Rad28/ERCC8/Ckn1/ATCSA-1


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004142893.1 WD repeat-containing protein ATCSA-1 isoform X2 [Cucumis sativus]1.46e-30589.73Show/hide
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XP_008444557.1 PREDICTED: DNA excision repair protein ERCC-8-like isoform X4 [Cucumis melo]3.27e-30288.89Show/hide
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A0A1S3BA40 DNA excision repair protein ERCC-8-like isoform X45.0e-23988.89Show/hide
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A0A1S3BAM3 DNA excision repair protein ERCC-8-like isoform X11.3e-23498.54Show/hide
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A0A1S3BBB8 DNA excision repair protein ERCC-8-like isoform X21.3e-23498.54Show/hide
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Subjt:  SGQDRAVSHYGAVTGLKVTGDGMYLLSAGSDSRLKLWDVESGCNTLVNFETMRLQTNKPLQLATSQDSSLVFAPCMATVKAFDMWTGKTSLTFGGHYEGV

Query:  NCCWYNFPDQ
        NCCWYNFPDQ
Subjt:  NCCWYNFPDQ

A0A1S3BBE7 DNA excision repair protein ERCC-8-like isoform X31.3e-23988.66Show/hide
Query:  MWKNIRDREAGKLRPNSFANRVKSDRTSSLQLSNHKDIVSPHRGSVNSLQVDLTEGRYLLSGASDASAAVFDIQRATHSEGLIAKHQCIFAVDKQHEHGH
        MWK+IRDREAGKLRPNSFANRVKSDRTSSLQLSNHKDIVSPHRGSVNSLQVDLTEGRYLLSGASDASAAVFDIQRATHSEGLIAKHQCIFAVDKQHEHGH
Subjt:  MWKNIRDREAGKLRPNSFANRVKSDRTSSLQLSNHKDIVSPHRGSVNSLQVDLTEGRYLLSGASDASAAVFDIQRATHSEGLIAKHQCIFAVDKQHEHGH

Query:  KYAISSAIWYPVDTGLFVTGSFDHHINVWDTNTTQVVVNFKLPGKVYRTAMSSLATSHMLIAAGTEDVQVRLCDISSGAFSHTLSGHRDGVMSVEWSASS
        KYAISSAIWYPVDTGLFVTGSFDHHINVWDTNTTQVVVNFKLPGKVYRTAMSSLATSHMLIAAGTEDVQVRLCDISSGAFSHTLSGHRDGVMSVEWSASS
Subjt:  KYAISSAIWYPVDTGLFVTGSFDHHINVWDTNTTQVVVNFKLPGKVYRTAMSSLATSHMLIAAGTEDVQVRLCDISSGAFSHTLSGHRDGVMSVEWSASS

Query:  EWVLITGGCDGAIRFWDIRRAGCFRVLDQSQSQLGRRPPISGWTANKLSTSKSLLASQGSNMKSRIPHKKLTNGNATKPSSTGKLPAKGSTRQRLHPGLL
        EWVLITGGCDGAIRFWDIRRAGCFRVLDQSQSQLGRRPPISGWTANKLSTSKSLLASQG NMKSRIPHKKL NGNATKPSSTGKLPAKGSTRQRLHPGLL
Subjt:  EWVLITGGCDGAIRFWDIRRAGCFRVLDQSQSQLGRRPPISGWTANKLSTSKSLLASQGSNMKSRIPHKKLTNGNATKPSSTGKLPAKGSTRQRLHPGLL

Query:  SGQDRAVSHYGAVTGLKVTGDGMYLLSAGSDSRLKLWDVESGCNTLVNFETMRLQTNKPLQLATSQDSSLVFAPCMATVKAFDMWTGKTSLTFGGHYEGV
        SGQDR+VSHYGAVTGLKVTGDGMYLLSAGSDSRLKLWDVESGCNTLVNFETMRLQTNKPLQLATSQDSSLVFAPCMATVKAFDMWTGKTSLT  GHYEGV
Subjt:  SGQDRAVSHYGAVTGLKVTGDGMYLLSAGSDSRLKLWDVESGCNTLVNFETMRLQTNKPLQLATSQDSSLVFAPCMATVKAFDMWTGKTSLTFGGHYEGV

Query:  NCCWYNFPDQADSCLVTIPKLYRTGTPSKLMPIPGINLTLLAYFSINTIEVTLVAYSISVDSQDWESTADKDNWSD
        NCCWYNFPDQ       +P+   TG                     N  ++ + + S +    DWESTADKDNWSD
Subjt:  NCCWYNFPDQADSCLVTIPKLYRTGTPSKLMPIPGINLTLLAYFSINTIEVTLVAYSISVDSQDWESTADKDNWSD

SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q13216 DNA excision repair protein ERCC-82.3e-5529.86Show/hide
Query:  REAGKLRPNSFANRVKSDRTSSLQLSNHKDIVSPHRGSVNSLQVDLTEGRYLLSGASDASAAVFDIQRATHSEGLIAKHQCIFAVDKQHEHGHKYAISSA
        R+ G   P        + R   L+L+  +D+   H G +N+L ++  EGRY+LSG SD    ++D++ ++       K  C  ++ + H   H+Y++ + 
Subjt:  REAGKLRPNSFANRVKSDRTSSLQLSNHKDIVSPHRGSVNSLQVDLTEGRYLLSGASDASAAVFDIQRATHSEGLIAKHQCIFAVDKQHEHGHKYAISSA

Query:  IWYPVDTGLFVTGSFDHHINVWDTNTTQVVVNFKLPGKVYRTAMSSLATSHMLIAAGTEDVQVRLCDISSGAFSHTLSGHRDGVMSVEWSASSEWVLITG
         WYP DTG+F + SFD  + VWDTNT Q    F     VY   MS ++T H L+A GT   +V+LCD+ SG+ SH L GHR  +++V WS   +++L T 
Subjt:  IWYPVDTGLFVTGSFDHHINVWDTNTTQVVVNFKLPGKVYRTAMSSLATSHMLIAAGTEDVQVRLCDISSGAFSHTLSGHRDGVMSVEWSASSEWVLITG

Query:  GCDGAIRFWDIRRA-GCFRVLDQSQSQLGRRPPISGWTANKLSTSKSLLASQGSNMKSRIPHKKLTNGNATKPSSTGKLPAKGSTRQRLHPGLLSGQDRA
          D  ++ WD+RRA GC   LDQ                      K   A + +N                                             
Subjt:  GCDGAIRFWDIRRA-GCFRVLDQSQSQLGRRPPISGWTANKLSTSKSLLASQGSNMKSRIPHKKLTNGNATKPSSTGKLPAKGSTRQRLHPGLLSGQDRA

Query:  VSHYGAVTGLKVTGDGMYLLSAGSDSRLKLWDVESGCNTLVNFETMRLQTNKPLQLATS--QDSSLVFAPCMATVKAFDMWTGKTSLTFGGHYEGVNCCW
         +H G V GL  T DG++LL+ G+D+R++LW+  +G NTLVN+  +   + K L+   S    S  VF P  +T+  + +++G+      GHY+ V+CC 
Subjt:  VSHYGAVTGLKVTGDGMYLLSAGSDSRLKLWDVESGCNTLVNFETMRLQTNKPLQLATS--QDSSLVFAPCMATVKAFDMWTGKTSLTFGGHYEGVNCCW

Query:  Y--NFPD-----QADSCLVTIPKLY-------RTGTPSKLMP
        +  NF +     +  + L  +P LY        T T S+L P
Subjt:  Y--NFPD-----QADSCLVTIPKLY-------RTGTPSKLMP

Q5BIM8 DNA excision repair protein ERCC-83.5e-5631.58Show/hide
Query:  REAGKLRPNSFANRVKSDRTSSLQLSNHKDIVSPHRGSVNSLQVDLTEGRYLLSGASDASAAVFDIQRATHSEGLIAKHQCIFAVDKQHEHGHKYAISSA
        R+AG   P        + R   L+L+  +D+   H   VN+L ++  EGRY+LSG SD    ++D++ ++       K  C  +V + H   HKY++ + 
Subjt:  REAGKLRPNSFANRVKSDRTSSLQLSNHKDIVSPHRGSVNSLQVDLTEGRYLLSGASDASAAVFDIQRATHSEGLIAKHQCIFAVDKQHEHGHKYAISSA

Query:  IWYPVDTGLFVTGSFDHHINVWDTNTTQVVVNFKLPGKVYRTAMSSLATSHMLIAAGTEDVQVRLCDISSGAFSHTLSGHRDGVMSVEWSASSEWVLITG
         WYP DTG+F + SFD  + VWDTNT Q+   F     VY   MS +AT H L+A GT   +V+LCD+ SG+ SH L GHR  +++V WS   E++L T 
Subjt:  IWYPVDTGLFVTGSFDHHINVWDTNTTQVVVNFKLPGKVYRTAMSSLATSHMLIAAGTEDVQVRLCDISSGAFSHTLSGHRDGVMSVEWSASSEWVLITG

Query:  GCDGAIRFWDIRRA-GCFRVLDQSQSQLGRRPPISGWTANKLSTSKSLLASQGSNMKSRIPHKKLTNGNATKPSSTGKLPAKGSTRQRLHPGLLSGQDRA
          D   + WD+RRA GC   LDQ                      K   A++ +N                                             
Subjt:  GCDGAIRFWDIRRA-GCFRVLDQSQSQLGRRPPISGWTANKLSTSKSLLASQGSNMKSRIPHKKLTNGNATKPSSTGKLPAKGSTRQRLHPGLLSGQDRA

Query:  VSHYGAVTGLKVTGDGMYLLSAGSDSRLKLWDVESGCNTLVNFETMRLQTNKPLQLATSQ--DSSLVFAPCMATVKAFDMWTGKTSLTFGGHYEGVNCC
         +H G V GL  T DG++LL+ G+D+R++LW+  +G NTLVN+  +   + K L+   S    S  VF P  +T+  + +++G+      GHY+ V+CC
Subjt:  VSHYGAVTGLKVTGDGMYLLSAGSDSRLKLWDVESGCNTLVNFETMRLQTNKPLQLATSQ--DSSLVFAPCMATVKAFDMWTGKTSLTFGGHYEGVNCC

Q8CFD5 DNA excision repair protein ERCC-82.1e-5632.08Show/hide
Query:  REAGKLRPNSFANRVKSDRTSSLQLSNHKDIVSPHRGSVNSLQVDLTEGRYLLSGASDASAAVFDIQRATHSEGLIAKHQCIFAVDKQHEHGHKYAISSA
        R++G   P        + R   L+L+  +D+   H   VN+L ++  EGRY+LSG SD    ++D++ A+       K  C  +V + H   HKY++ + 
Subjt:  REAGKLRPNSFANRVKSDRTSSLQLSNHKDIVSPHRGSVNSLQVDLTEGRYLLSGASDASAAVFDIQRATHSEGLIAKHQCIFAVDKQHEHGHKYAISSA

Query:  IWYPVDTGLFVTGSFDHHINVWDTNTTQVVVNFKLPGKVYRTAMSSLATSHMLIAAGTEDVQVRLCDISSGAFSHTLSGHRDGVMSVEWSASSEWVLITG
         WYP DTG+F + SFD  + VWDTNT Q    F     VY   MS  AT H L+A GT   +V+LCD+ SG+ SH L GHR  +++V WS   +++L T 
Subjt:  IWYPVDTGLFVTGSFDHHINVWDTNTTQVVVNFKLPGKVYRTAMSSLATSHMLIAAGTEDVQVRLCDISSGAFSHTLSGHRDGVMSVEWSASSEWVLITG

Query:  GCDGAIRFWDIRRA-GCFRVLDQSQSQLGRRPPISGWTANKLSTSKSLLASQGSNMKSRIPHKKLTNGNATKPSSTGKLPAKGSTRQRLHPGLLSGQDRA
          D  ++ WD+RRA GC   LDQ                      K   A++ +N                                             
Subjt:  GCDGAIRFWDIRRA-GCFRVLDQSQSQLGRRPPISGWTANKLSTSKSLLASQGSNMKSRIPHKKLTNGNATKPSSTGKLPAKGSTRQRLHPGLLSGQDRA

Query:  VSHYGAVTGLKVTGDGMYLLSAGSDSRLKLWDVESGCNTLVNFETMRLQTNKPLQLATS--QDSSLVFAPCMATVKAFDMWTGKTSLTFGGHYEGVNCC
         +H G V GL  T DG++LL+ G+D+R++LW+  SG NTLVN+  +   + K LQ A S    S  VF P  +T+  + + +G+      GHY+ V+CC
Subjt:  VSHYGAVTGLKVTGDGMYLLSAGSDSRLKLWDVESGCNTLVNFETMRLQTNKPLQLATS--QDSSLVFAPCMATVKAFDMWTGKTSLTFGGHYEGVNCC

Q93ZG3 WD repeat-containing protein ATCSA-11.3e-17065.48Show/hide
Query:  MWKNIRDREAGKLRPNSFANRVKSDRTSSLQLSNHKDIVSPHRGSVNSLQVDLTEGRYLLSGASDASAAVFDIQRATHSE--GLIAKHQCIFAVDKQHEH
        MW+ I+DRE G++R NSFANR KS R  SLQLSN KD VSPHRGSVNSLQVDLTEGRYLLSGA+D SAAVFD+QRAT  E  GLIAKH+CIF VDKQHE+
Subjt:  MWKNIRDREAGKLRPNSFANRVKSDRTSSLQLSNHKDIVSPHRGSVNSLQVDLTEGRYLLSGASDASAAVFDIQRATHSE--GLIAKHQCIFAVDKQHEH

Query:  GHKYAISSAIWYPVDTGLFVTGSFDHHINVWDTNTTQVVVNFKLPGKVYRTAMSSLATSHMLIAAGTEDVQVRLCDISSGAFSHTLSGHRDGVMSVEWSA
        GHKYAISSAIWYP+DTGLF+TGSFDH++ VWDTNT Q VV+FK+PGKVYRTAMSS+A SH LIAAGTEDVQVRLCDI+SGAFSHTLSGHRDGVMSVEWS 
Subjt:  GHKYAISSAIWYPVDTGLFVTGSFDHHINVWDTNTTQVVVNFKLPGKVYRTAMSSLATSHMLIAAGTEDVQVRLCDISSGAFSHTLSGHRDGVMSVEWSA

Query:  SSEWVLITGGCDGAIRFWDIRRAGCFRVLDQSQSQLGRRPPISGWTANKLSTSKSLLASQGSNMKSRIPHKKLTNGNATKPSSTGKLPAKGSTRQRLHPG
        SSEWVL TGGCDGAIRFWDIRRAGCFRVLDQSQ+QLG RPPI   TA     S    +S G   + +    K T   + K SS+ K   + S ++R+HPG
Subjt:  SSEWVLITGGCDGAIRFWDIRRAGCFRVLDQSQSQLGRRPPISGWTANKLSTSKSLLASQGSNMKSRIPHKKLTNGNATKPSSTGKLPAKGSTRQRLHPG

Query:  LLSGQDRAVSHYGAVTGLKVTGDGMYLLSAGSDSRLKLWDVESGCNTLVNFETMRLQTNKPLQLATSQDSSLVFAPCMATVKAFDMWTGKTSLTFGGHYE
        +LS  DRA +HYGAVTGLK T DGMYLLSAGSDSR++LWD+ESG NTLVNFET R+QTNK +QL TS D +LVF PCM TVKAF MW+G+T+L   GHYE
Subjt:  LLSGQDRAVSHYGAVTGLKVTGDGMYLLSAGSDSRLKLWDVESGCNTLVNFETMRLQTNKPLQLATSQDSSLVFAPCMATVKAFDMWTGKTSLTFGGHYE

Query:  GVNCCWYNFPDQADSCLVTIPKLYRTGTPSKLMPIPGINLTLLAYFSINTIEVTLVAYSISVDSQDWESTADKDNWSD
         VN C +N  DQ         +LY +G+  +          +L +    T+E  +V        QD E   DKDNWSD
Subjt:  GVNCCWYNFPDQADSCLVTIPKLYRTGTPSKLMPIPGINLTLLAYFSINTIEVTLVAYSISVDSQDWESTADKDNWSD

Q9USR0 DNA excision repair protein ckn15.1e-3930.03Show/hide
Query:  REAGKLRPNSFANRVKSDRTSSLQLSNHKDIVSPH----RGSVNSLQVDLTEGRYLLSGASDASAAVFDIQRATHSEGLIAKHQCIFAVDKQHEHGHKYA
        RE G+   +SF  ++   R   L L+    I   H     GSVN+L +D T  + ++SG +++S  V+D+Q     E        + AV  +    HK+ 
Subjt:  REAGKLRPNSFANRVKSDRTSSLQLSNHKDIVSPH----RGSVNSLQVDLTEGRYLLSGASDASAAVFDIQRATHSEGLIAKHQCIFAVDKQHEHGHKYA

Query:  ISSAIWYPVDTGLFVTGSFDHHINVWDTNTTQVVVNFKLPGKVYRTAMSSLATSHMLIAAGTEDVQVRLCDISSGAFSHTLSGHRDGVMSVEWSASSEWV
        I+   W+P D G+F + SFDH + VWD +T Q    F +   +Y  A S +A SH LIA       +RLCD+ SG+++H+LSGH   V++V+W   +E+V
Subjt:  ISSAIWYPVDTGLFVTGSFDHHINVWDTNTTQVVVNFKLPGKVYRTAMSSLATSHMLIAAGTEDVQVRLCDISSGAFSHTLSGHRDGVMSVEWSASSEWV

Query:  LITGGCDGAIRFWDIRRAGCFRVLDQSQSQLGRRPPISGWTANKLSTSKSLLASQGSNMKSRIPHKKLTNGNATKPSSTGKLPAKGSTRQRLHPGLLSGQ
        L +G  DG  R WDIR                           K+S+S + +                                       LH   L   
Subjt:  LITGGCDGAIRFWDIRRAGCFRVLDQSQSQLGRRPPISGWTANKLSTSKSLLASQGSNMKSRIPHKKLTNGNATKPSSTGKLPAKGSTRQRLHPGLLSGQ

Query:  DRAVSHYGAVTGLKVTGDGMYLLSAGSDSRLKLWDVESGCNTLVNFETMRLQTNKPLQLATSQDSSLVFAPCM
           +SHYG V GL  T D  YL S G+D R+++W++ESG NTL  F            +  +Q +S    PCM
Subjt:  DRAVSHYGAVTGLKVTGDGMYLLSAGSDSRLKLWDVESGCNTLVNFETMRLQTNKPLQLATSQDSSLVFAPCM

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G19750.1 Transducin/WD40 repeat-like superfamily protein4.0e-16462.34Show/hide
Query:  MWKNIRDREAGKLRPNSFANRVKSDRTSSLQLSNHKDIVSPHRGSVNSLQVDLTEGRYLLSGASDASAAVFDIQRATHSE--GLIAKHQCIFAVDKQHEH
        MWK  +DRE G+ R NSFANR KS R  SLQLSN KD VSPHRGSVNSLQVDLTEGRYLLSGA+D SAAVFD++RAT  E  GLIAKH+CIF V KQHE+
Subjt:  MWKNIRDREAGKLRPNSFANRVKSDRTSSLQLSNHKDIVSPHRGSVNSLQVDLTEGRYLLSGASDASAAVFDIQRATHSE--GLIAKHQCIFAVDKQHEH

Query:  GHKYAISSAIWYPVDTGLFVTGSFDHHINVWDTNTTQVVVNFKLPGKVYRTAMSSLATSHMLIAAGTEDVQVRLCDISSGAFSHTLSGHRDGVMSVEWSA
        GHKYAISSAIWYP+DTG+F+TGSFDH++ VWDTNT+QVVV+FK+PGKVYRTAMSS+A SH LIAAGT+DVQVRLCDI+SGAFSHTLSGHRDGVMSVEWS 
Subjt:  GHKYAISSAIWYPVDTGLFVTGSFDHHINVWDTNTTQVVVNFKLPGKVYRTAMSSLATSHMLIAAGTEDVQVRLCDISSGAFSHTLSGHRDGVMSVEWSA

Query:  SSEWVLITGGCDGAIRFWDIRRAGCFRVLDQSQSQLGRRPPISGWTANKLSTSKSLLASQGSNMKSRIPHKKLTNGNATKPSSTGKLPAKGSTRQRLHPG
        SSEWVL TGGCDGAIRFWDIRRAGCFRVLD SQ+QLG RPPI    A       +  +S G     +    K T   + K SS+ K   + S ++R+HPG
Subjt:  SSEWVLITGGCDGAIRFWDIRRAGCFRVLDQSQSQLGRRPPISGWTANKLSTSKSLLASQGSNMKSRIPHKKLTNGNATKPSSTGKLPAKGSTRQRLHPG

Query:  LLSGQDRAVSHYGAVTGLKVTGDGMYLLSAGSDSRLKLWDVESGCNTLVNFETMRLQTNKPLQLATSQDSSLVFAPCMATVKAFDMWTGKTSLTFGGHYE
        +LS  DRA +HYG VTGLK T DGMYLLSAGS SR++LWD+ESG NTLVNFET R+QT++ +QL TS D +LVF PCM TVK F MW+G+T+L   GHYE
Subjt:  LLSGQDRAVSHYGAVTGLKVTGDGMYLLSAGSDSRLKLWDVESGCNTLVNFETMRLQTNKPLQLATSQDSSLVFAPCMATVKAFDMWTGKTSLTFGGHYE

Query:  GVNCCWYNFPDQADSCLVTIPKLYRTGTPSKLMPIPGINLTLLAYFSINTIEVTLVAYSISVDSQDWESTADKDNWSD
         VN C +N  DQ         +LY +G   +++                   V     S+  +    E   DKDNWSD
Subjt:  GVNCCWYNFPDQADSCLVTIPKLYRTGTPSKLMPIPGINLTLLAYFSINTIEVTLVAYSISVDSQDWESTADKDNWSD

AT1G27840.1 Transducin/WD40 repeat-like superfamily protein8.9e-17265.48Show/hide
Query:  MWKNIRDREAGKLRPNSFANRVKSDRTSSLQLSNHKDIVSPHRGSVNSLQVDLTEGRYLLSGASDASAAVFDIQRATHSE--GLIAKHQCIFAVDKQHEH
        MW+ I+DRE G++R NSFANR KS R  SLQLSN KD VSPHRGSVNSLQVDLTEGRYLLSGA+D SAAVFD+QRAT  E  GLIAKH+CIF VDKQHE+
Subjt:  MWKNIRDREAGKLRPNSFANRVKSDRTSSLQLSNHKDIVSPHRGSVNSLQVDLTEGRYLLSGASDASAAVFDIQRATHSE--GLIAKHQCIFAVDKQHEH

Query:  GHKYAISSAIWYPVDTGLFVTGSFDHHINVWDTNTTQVVVNFKLPGKVYRTAMSSLATSHMLIAAGTEDVQVRLCDISSGAFSHTLSGHRDGVMSVEWSA
        GHKYAISSAIWYP+DTGLF+TGSFDH++ VWDTNT Q VV+FK+PGKVYRTAMSS+A SH LIAAGTEDVQVRLCDI+SGAFSHTLSGHRDGVMSVEWS 
Subjt:  GHKYAISSAIWYPVDTGLFVTGSFDHHINVWDTNTTQVVVNFKLPGKVYRTAMSSLATSHMLIAAGTEDVQVRLCDISSGAFSHTLSGHRDGVMSVEWSA

Query:  SSEWVLITGGCDGAIRFWDIRRAGCFRVLDQSQSQLGRRPPISGWTANKLSTSKSLLASQGSNMKSRIPHKKLTNGNATKPSSTGKLPAKGSTRQRLHPG
        SSEWVL TGGCDGAIRFWDIRRAGCFRVLDQSQ+QLG RPPI   TA     S    +S G   + +    K T   + K SS+ K   + S ++R+HPG
Subjt:  SSEWVLITGGCDGAIRFWDIRRAGCFRVLDQSQSQLGRRPPISGWTANKLSTSKSLLASQGSNMKSRIPHKKLTNGNATKPSSTGKLPAKGSTRQRLHPG

Query:  LLSGQDRAVSHYGAVTGLKVTGDGMYLLSAGSDSRLKLWDVESGCNTLVNFETMRLQTNKPLQLATSQDSSLVFAPCMATVKAFDMWTGKTSLTFGGHYE
        +LS  DRA +HYGAVTGLK T DGMYLLSAGSDSR++LWD+ESG NTLVNFET R+QTNK +QL TS D +LVF PCM TVKAF MW+G+T+L   GHYE
Subjt:  LLSGQDRAVSHYGAVTGLKVTGDGMYLLSAGSDSRLKLWDVESGCNTLVNFETMRLQTNKPLQLATSQDSSLVFAPCMATVKAFDMWTGKTSLTFGGHYE

Query:  GVNCCWYNFPDQADSCLVTIPKLYRTGTPSKLMPIPGINLTLLAYFSINTIEVTLVAYSISVDSQDWESTADKDNWSD
         VN C +N  DQ         +LY +G+  +          +L +    T+E  +V        QD E   DKDNWSD
Subjt:  GVNCCWYNFPDQADSCLVTIPKLYRTGTPSKLMPIPGINLTLLAYFSINTIEVTLVAYSISVDSQDWESTADKDNWSD

AT1G27840.2 Transducin/WD40 repeat-like superfamily protein7.4e-13456.09Show/hide
Query:  MWKNIRDREAGKLRPNSFANRVKSDRTSSLQLSNHKDIVSPHRGSVNSLQVDLTEGRYLLSGASDASAAVFDIQRATHSEGLIAKHQCIFAVDKQHEHGH
        MW+ I+DRE G++R NSFANR KS R  SLQLSN KD VSPHRGSVNSLQVDLTEGRYLLSGA+D SAAVFD+QRAT  E                    
Subjt:  MWKNIRDREAGKLRPNSFANRVKSDRTSSLQLSNHKDIVSPHRGSVNSLQVDLTEGRYLLSGASDASAAVFDIQRATHSEGLIAKHQCIFAVDKQHEHGH

Query:  KYAISSAIWYPVDTGLFVTGSFDHHINVWDTNTTQVVVNFKLPGKVYRTAMSSLATSHMLIAAGTEDVQVRLCDISSGAFSHTLSGHRDGVMSVEWSASS
                                            VV+FK+PGKVYRTAMSS+A SH LIAAGTEDVQVRLCDI+SGAFSHTLSGHRDGVMSVEWS SS
Subjt:  KYAISSAIWYPVDTGLFVTGSFDHHINVWDTNTTQVVVNFKLPGKVYRTAMSSLATSHMLIAAGTEDVQVRLCDISSGAFSHTLSGHRDGVMSVEWSASS

Query:  EWVLITGGCDGAIRFWDIRRAGCFRVLDQSQSQLGRRPPISGWTANKLSTSKSLLASQGSNMKSRIPHKKLTNGNATKPSSTGKLPAKGSTRQRLHPGLL
        EWVL TGGCDGAIRFWDIRRAGCFRVLDQSQ+QLG RPPI   TA     S    +S G   + +    K T   + K SS+ K   + S ++R+HPG+L
Subjt:  EWVLITGGCDGAIRFWDIRRAGCFRVLDQSQSQLGRRPPISGWTANKLSTSKSLLASQGSNMKSRIPHKKLTNGNATKPSSTGKLPAKGSTRQRLHPGLL

Query:  SGQDRAVSHYGAVTGLKVTGDGMYLLSAGSDSRLKLWDVESGCNTLVNFETMRLQTNKPLQLATSQDSSLVFAPCMATVKAFDMWTGKTSLTFGGHYEGV
        S  DRA +HYGAVTGLK T DGMYLLSAGSDSR++LWD+ESG NTLVNFET R+QTNK +QL TS D +LVF PCM TVKAF MW+G+T+L   GHYE V
Subjt:  SGQDRAVSHYGAVTGLKVTGDGMYLLSAGSDSRLKLWDVESGCNTLVNFETMRLQTNKPLQLATSQDSSLVFAPCMATVKAFDMWTGKTSLTFGGHYEGV

Query:  NCCWYNFPDQADSCLVTIPKLYRTGTPSKLMPIPGINLTLLAYFSINTIEVTLVAYSISVDSQDWESTADKDNWSD
        N C +N  DQ         +LY +G+  +          +L +    T+E  +V        QD E   DKDNWSD
Subjt:  NCCWYNFPDQADSCLVTIPKLYRTGTPSKLMPIPGINLTLLAYFSINTIEVTLVAYSISVDSQDWESTADKDNWSD

AT1G27840.3 Transducin/WD40 repeat-like superfamily protein2.2e-17065.34Show/hide
Query:  MWKNIRDREAGKLRPNSFANRVKSDRTSSLQLSNHKDIVSPHRGSVNSLQVDLTEGRYLLSGASDASAAVFDIQRATHSE--GLIAKHQCIFAVDKQHEH
        MW+ I+DRE G++R NSFANR KS R  SLQLSN KD VSPHRGSVNSLQVDLTEGRYLLSGA+D SAAVFD+QRAT  E  GLIAKH+CIF VDKQHE+
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Query:  GHKYAISSAIWYPVDTGLFVTGSFDHHINVWDTNTTQVVVNFKLPGKVYRTAMSSLATSHMLIAAGTEDVQVRLCDISSGAFSHTLSGHRDGVMSVEWSA
        GHKYAISSAIWYP+DTGLF+TGSFDH++ VWDTNT Q VV+FK+PGKVYRTAMSS+A SH LIAAGTEDVQVRLCDI+SGAFSHTLSGHRDGVMSVEWS 
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        SSEWVL TGGCDGAIRFWDIRRAGCFRVLDQSQ+QLG RPPI   TA     S    +S G   + +    K T   + K SS+ K   + S ++R+HPG
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Query:  LLSGQDRAVSHYGAVTGLKVTGDGMYLLSAGSDSRLKLWDVESGCNTLVNFETMRLQTNKPLQLATSQDSSLVFAPCMATVK-AFDMWTGKTSLTFGGHY
        +LS  DRA +HYGAVTGLK T DGMYLLSAGSDSR++LWD+ESG NTLVNFET R+QTNK +QL TS D +LVF PCM TVK AF MW+G+T+L   GHY
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Query:  EGVNCCWYNFPDQADSCLVTIPKLYRTGTPSKLMPIPGINLTLLAYFSINTIEVTLVAYSISVDSQDWESTADKDNWSD
        E VN C +N  DQ         +LY +G+  +          +L +    T+E  +V        QD E   DKDNWSD
Subjt:  EGVNCCWYNFPDQADSCLVTIPKLYRTGTPSKLMPIPGINLTLLAYFSINTIEVTLVAYSISVDSQDWESTADKDNWSD

AT5G50230.1 Transducin/WD40 repeat-like superfamily protein8.8e-1026.98Show/hide
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        H H+    S + +  ++G   TG  D  + +WDTN+  ++ +  L G +      ++   +  + A T    + + D+SSG   HTL+GH D V +V+ S
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Query:  ASSEWVLITGGCDGAIRFWDIRRAGC
          S   +++   D  I+ WD+ +  C
Subjt:  ASSEWVLITGGCDGAIRFWDIRRAGC


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTGGAAGAATATTAGAGATAGAGAAGCGGGAAAACTCCGCCCAAATTCTTTCGCAAATCGTGTTAAATCCGATCGAACCAGCTCTCTGCAACTTTCCAATCATAAGGA
TATTGTCTCTCCCCATAGAGGTTCCGTCAACTCACTTCAGGTTGATTTGACAGAGGGGAGATATTTGTTATCTGGAGCATCAGATGCATCAGCTGCTGTTTTTGATATTC
AACGTGCAACTCATTCCGAGGGTCTCATTGCAAAGCACCAATGCATTTTTGCAGTTGATAAGCAGCATGAACATGGACATAAATATGCAATATCCTCAGCCATATGGTAT
CCTGTCGATACTGGATTGTTTGTCACCGGCTCATTTGATCATCACATTAATGTCTGGGATACAAATACAACTCAGGTGGTGGTGAATTTTAAATTGCCTGGAAAAGTTTA
TAGGACAGCCATGTCCTCTTTGGCAACATCGCACATGCTGATTGCTGCTGGAACAGAAGATGTCCAAGTTCGCCTTTGTGATATTTCTTCCGGAGCATTCTCTCACACAT
TATCTGGACATCGTGATGGTGTAATGAGTGTGGAATGGTCAGCATCTAGCGAGTGGGTTTTGATTACTGGAGGATGTGATGGAGCTATACGCTTTTGGGACATCAGACGA
GCTGGATGCTTTCGTGTTCTAGATCAGTCTCAATCCCAGCTTGGGAGACGCCCCCCCATTTCAGGATGGACTGCAAATAAGCTCTCAACATCTAAGTCTCTCTTGGCCAG
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GGTTACACCCAGGGCTTTTGTCTGGTCAGGATCGAGCAGTTTCTCACTATGGTGCTGTCACTGGATTAAAAGTAACCGGAGATGGCATGTACCTACTCAGTGCAGGTTCT
GATTCAAGGTTAAAGTTGTGGGATGTTGAATCCGGGTGCAATACACTTGTGAATTTTGAAACCATGCGGTTACAGACCAATAAACCATTGCAACTAGCCACATCTCAGGA
TTCATCCCTTGTATTTGCCCCATGCATGGCGACTGTTAAAGCATTTGATATGTGGACAGGGAAGACATCCCTGACATTCGGCGGCCACTATGAAGGTGTGAACTGTTGCT
GGTATAATTTCCCAGATCAGGCAGATTCTTGTCTGGTCACCATCCCAAAACTCTACCGAACTGGTACACCTTCTAAACTCATGCCTATTCCTGGAATTAATTTGACTCTG
CTGGCATATTTTTCCATTAATACCATTGAAGTTACCCTGGTAGCTTATTCCATTTCAGTGGACTCGCAGGATTGGGAATCAACTGCAGACAAGGATAACTGGAGCGACTG
A
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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CCTGTCGATACTGGATTGTTTGTCACCGGCTCATTTGATCATCACATTAATGTCTGGGATACAAATACAACTCAGGTGGTGGTGAATTTTAAATTGCCTGGAAAAGTTTA
TAGGACAGCCATGTCCTCTTTGGCAACATCGCACATGCTGATTGCTGCTGGAACAGAAGATGTCCAAGTTCGCCTTTGTGATATTTCTTCCGGAGCATTCTCTCACACAT
TATCTGGACATCGTGATGGTGTAATGAGTGTGGAATGGTCAGCATCTAGCGAGTGGGTTTTGATTACTGGAGGATGTGATGGAGCTATACGCTTTTGGGACATCAGACGA
GCTGGATGCTTTCGTGTTCTAGATCAGTCTCAATCCCAGCTTGGGAGACGCCCCCCCATTTCAGGATGGACTGCAAATAAGCTCTCAACATCTAAGTCTCTCTTGGCCAG
TCAGGGTTCAAATATGAAATCTCGTATACCTCATAAGAAACTAACCAATGGAAATGCAACAAAGCCATCATCGACAGGTAAACTGCCAGCTAAGGGATCCACAAGGCAGA
GGTTACACCCAGGGCTTTTGTCTGGTCAGGATCGAGCAGTTTCTCACTATGGTGCTGTCACTGGATTAAAAGTAACCGGAGATGGCATGTACCTACTCAGTGCAGGTTCT
GATTCAAGGTTAAAGTTGTGGGATGTTGAATCCGGGTGCAATACACTTGTGAATTTTGAAACCATGCGGTTACAGACCAATAAACCATTGCAACTAGCCACATCTCAGGA
TTCATCCCTTGTATTTGCCCCATGCATGGCGACTGTTAAAGCATTTGATATGTGGACAGGGAAGACATCCCTGACATTCGGCGGCCACTATGAAGGTGTGAACTGTTGCT
GGTATAATTTCCCAGATCAGGCAGATTCTTGTCTGGTCACCATCCCAAAACTCTACCGAACTGGTACACCTTCTAAACTCATGCCTATTCCTGGAATTAATTTGACTCTG
CTGGCATATTTTTCCATTAATACCATTGAAGTTACCCTGGTAGCTTATTCCATTTCAGTGGACTCGCAGGATTGGGAATCAACTGCAGACAAGGATAACTGGAGCGACTG
A
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MWKNIRDREAGKLRPNSFANRVKSDRTSSLQLSNHKDIVSPHRGSVNSLQVDLTEGRYLLSGASDASAAVFDIQRATHSEGLIAKHQCIFAVDKQHEHGHKYAISSAIWY
PVDTGLFVTGSFDHHINVWDTNTTQVVVNFKLPGKVYRTAMSSLATSHMLIAAGTEDVQVRLCDISSGAFSHTLSGHRDGVMSVEWSASSEWVLITGGCDGAIRFWDIRR
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DSRLKLWDVESGCNTLVNFETMRLQTNKPLQLATSQDSSLVFAPCMATVKAFDMWTGKTSLTFGGHYEGVNCCWYNFPDQADSCLVTIPKLYRTGTPSKLMPIPGINLTL
LAYFSINTIEVTLVAYSISVDSQDWESTADKDNWSD