; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Chy4G068740 (gene) of Cucumber (hystrix) v1 genome

Gene IDChy4G068740
OrganismCucumis hystrix (Cucumber (hystrix) v1)
Descriptionthioredoxin-related transmembrane protein 2
Genome locationchrH04:1378666..1383452
RNA-Seq ExpressionChy4G068740
SyntenyChy4G068740
Gene Ontology termsGO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsIPR036249 - Thioredoxin-like superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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XP_031738425.1 thioredoxin-related transmembrane protein 2 isoform X2 [Cucumis sativus]3.18e-16797.94Show/hide
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XP_038897990.1 thioredoxin-related transmembrane protein 2 [Benincasa hispida]3.59e-17493.92Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LEV3 Uncharacterized protein1.3e-14398.1Show/hide
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A0A1S3CQP7 thioredoxin-related transmembrane protein 21.6e-14196.96Show/hide
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A0A6J1DXS7 thioredoxin-related transmembrane protein 2 isoform X26.8e-12990.35Show/hide
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A0A6J1F6Q2 thioredoxin-related transmembrane protein 24.6e-12587.64Show/hide
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A0A6J1IGK9 thioredoxin-related transmembrane protein 22.7e-12587.64Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q2TBU2 Thioredoxin-related transmembrane protein 21.0e-1225.71Show/hide
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        RE++ ++      M K  R  T E  + ++ +F K+    L   +D  + + Y+ +     +  + P++ G       +   ++  L    +K   W+VE
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        F  ++S+DC   +    +LS+ Y+   L+FG VD+G + +V+ ++ +S      QLPT ILF+   E+ R P +D
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Q58E26 Thioredoxin-related transmembrane protein 22.7e-1326.12Show/hide
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        +++PYYL   L   S+ ++R    A  +L         C    RE++ ++      M K  R  T E  I ++ +F K+    L   +D  + + Y+ + 
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            +  + P++ G       +   LE  +      S  W+VEF  ++S++C   +    ELS+ Y+   L FG VD+G +P V+ ++ IS      QLP
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Query:  TYILFENAAEIARLPDLDFEIKPYP-PITKRLLCRHFDLDRRLLE
        T ILF+   E+ R P +D + +      T+  + R F+L+   L+
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Q6DFS0 Thioredoxin-related transmembrane protein 21.0e-1227.06Show/hide
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        +++PYYL   L   S+ ++R       +L         C    RE++ ++      M K  R  T E  I ++ +F K+    L   +D  + + Y+ + 
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            +  + P++ G       +   LE  L      S  W++EF  ++S++C   +    ELS+ Y+   L FG VD+G +P V++++ IS      QLP
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        T ILF+   EI R P +D
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Q6IQC7 Thioredoxin-related transmembrane protein 2-B7.8e-1324.87Show/hide
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        RE++ ++      M K  R  T E  + +++LF K+  V L   +D  L + Y+ +     +  + P++ G       +   ++  L + +  +  W+VE
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Query:  FRVSFSADCIRSSRCLPELSVTYSNKHLSFGVVDLGLFPNVAAKFGISLGGSMNQLPTYILFENAAEIARLPDLDFEIKPYP-PITKRLLCRHFDLD
        F  ++S +C   +    +LS+ Y+   L FG VD+G +  V+ K+ +S      QLP+ +LF+   E+ R P +D + +      T+  + R F+L+
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Q7JW12 Thioredoxin-related transmembrane protein 2 homolog1.9e-1124.56Show/hide
Query:  MMTEPYYLSHFLAFFSYFVIRSSANHILFYNITHLLL-----------CRELQAILVFLIFYMFKTVR--RETPEAFIADMLLFVKIFLVALASMMDYHL
        ++ +PYY  + L   SY + + +      +  T L +            RE++ +   LI  M ++ +    T   ++A   L+ K+    L +  D+  
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Query:  AIWYVIVFTGIYVFTQQPVFQGSGTCSKLTPLQLESLLTE--GNNKSRFWLVEFRVSFSADCIRSSRCLPELSVTYSNKHLSFGVVDLGLFPNVAAKFGI
         + ++++   + +   +P ++G      +T  +   +  E    +K   WL+ F   ++  C+  +    ELS  Y+  HL FG +D+G FP+VA K+ I
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        S      QLPT ILF+   E  R P +D
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT5G11640.1 Thioredoxin superfamily protein7.3e-7556.45Show/hide
Query:  EWLNLMMTEPYYLSHFLAFFSYFVIRSSANHILFYNITHLLLCRELQAILVFLIFYMFKTVRRETPEAFIADMLLFVKIFLVALASMMDYHLAIWYVIVF
        E ++ ++++PYY  HF+AFFSY  IRSSA        +H L  RE+QA L FL+F   K VR ET EAF+AD LL+ KIFL+A++ +MDY +A+W+ I+F
Subjt:  EWLNLMMTEPYYLSHFLAFFSYFVIRSSANHILFYNITHLLLCRELQAILVFLIFYMFKTVRRETPEAFIADMLLFVKIFLVALASMMDYHLAIWYVIVF

Query:  TGIYVFTQQPVFQGSGTCSKLTPLQLESLLTEGNNKSRFWLVEFRVSFSADCIRSSRCLPELSVTYSNKHLSFGVVDLGLFPNVAAKFGISLGGSMNQLP
        + IY+  QQP F   GT  KLTP+QLE LL++GN  +++WL+EF    S+ C+RSSRC PELS+TYSN  LSFG VDLGLFPN AAKFGISL G M+QLP
Subjt:  TGIYVFTQQPVFQGSGTCSKLTPLQLESLLTEGNNKSRFWLVEFRVSFSADCIRSSRCLPELSVTYSNKHLSFGVVDLGLFPNVAAKFGISLGGSMNQLP

Query:  TYILFENAAEIARLPDLDFEIKPYPPITKRLLCRHFDLDRRLLEYAYG
        TYILFE   E++R PD   +  P  PITK+LLC+HF+LDR LL+Y  G
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGTGGATTGGAGGCAGGAGTGGAGCAACTTCCGACCGGGGGAGTGGCTGAATCTAATGATGACAGAGCCGTACTATCTTTCTCATTTTCTAGCCTTCTTTTCCTATTT
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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