; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Chy4G079990 (gene) of Cucumber (hystrix) v1 genome

Gene IDChy4G079990
OrganismCucumis hystrix (Cucumber (hystrix) v1)
DescriptionLate embryogenesis abundant protein, group 2
Genome locationchrH04:19360035..19365631
RNA-Seq ExpressionChy4G079990
SyntenyChy4G079990
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0048351.1 putative Group 2 [Cucumis melo var. makuwa]3.37e-14686.27Show/hide
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XP_004149613.1 uncharacterized protein LOC101209149 [Cucumis sativus]1.93e-17798.82Show/hide
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XP_008461795.2 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103500312 [Cucumis melo]3.03e-17195.29Show/hide
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XP_022934269.1 uncharacterized protein LOC111441481 [Cucurbita moschata]5.56e-14183.82Show/hide
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XP_038905771.1 uncharacterized protein LOC120091726 [Benincasa hispida]2.70e-15990.66Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LD21 Uncharacterized protein1.2e-13998.82Show/hide
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A0A1S3CFE9 uncharacterized protein LOC1035003125.2e-13595.29Show/hide
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A0A5A7U466 Putative Group 29.2e-11686.27Show/hide
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A0A6J1F239 uncharacterized protein LOC1114414818.1e-11283.82Show/hide
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         G+G   EE++E+ E  EE YYG+++RGCWK YFTYRNSDSNAWICLQLSWRA+FSMG+ALLVFYIVTNPP P+ISVKV E++EFMLGEGVDKTGVGTKI
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A0A6J1J6W9 uncharacterized protein LOC1114819095.8e-11083.4Show/hide
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         G+G   EE+ E+ E  EE YYGK++RGCWK YFTYRNSD+NAWICLQLSWRA+FSMG+ALLVFYIVTNPP PIISV+V E++EFMLGEGVDKTGVGTKI
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G45688.1 unknown protein3.8e-0526.43Show/hide
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Query:  EEGEGNEEGYYGKRKRGCWKRYFTYRNSDSNAWICLQLSWRAIFSMGIALLVFYIVTNPPSPIISVKVGEIEEFMLGEGVDKTGVGTKILTCNCTMDVIV
        EEG  ++    G   R C+   F              + +  +F  G   L+ Y    P  P I+VK    E   +  G D  GVGT ++T N T+ ++ 
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         N    FG+H+    + +SF  + I +
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AT1G45688.2 unknown protein2.6e-0626.69Show/hide
Query:  YYVQSPSTLSH---ANSSDIRNPAEVSTCHSPLPSDTFPNAHHHHHHRNPTQEASRFTLSHYSSSRGSNHGAGTDNGEARLIVGRGNGG-----DCEEEE
        YYVQSPS  SH     ++   +   +S   SP      P++H      +    +SRF+ S    SR  N   G+          +G+GG     +C   E
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Query:  EEGEGNEEGYYGKRKRGCWKRYFTYRNSDSNAWICLQLSWRAIFSMGIALLVFYIVTNPPSPIISVKVGEIEEFMLGEGVDKTGVGTKILTCNCTMDVIV
        EEG  ++    G   R C+   F              + +  +F  G   L+ Y    P  P I+VK    E   +  G D  GVGT ++T N T+ ++ 
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Query:  DNHSKLFGLHILPPSLHMSFGPLPIATSQGCLEIHK
         N    FG+H+    + +SF  + I +    L I K
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AT3G08490.1 BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Late embryogenesis abundant protein, group 2 (TAIR:AT3G24600.1)7.6e-3054.95Show/hide
Query:  KRYFTYRNSDSNAWICLQLSWRAIFSMGIALLVFYIVTNPPSPIISVKVGEIEEFMLGEGVDKTGVGTKILTCNCTMDVIVDNHSKLFGLHILPPSLHMS
        KR      S+S+ WI LQ+ WR +FS+G+ALLVFYI T PP P IS ++G   +FML EGVD  GV TK LT NC+  +I+DN S +FGLHI PPS+   
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Query:  FGPLPIATSQG
        FGPL  A +QG
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AT3G24600.1 Late embryogenesis abundant protein, group 25.5e-1241.03Show/hide
Query:  VFYIVTNPPSPIISVKVGEIEEFMLGEGVDKTGVGTKILTCNCTMDVIVDNHSKLFGLHILPPSLHMSFGPLPIATSQ
        V +  ++P SPI+SVK  +I  F  GEG+D+TGV TKIL+ N ++ V +D+ +  FG+H+   +  ++F  L +AT Q
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AT5G42860.1 unknown protein5.5e-0427.48Show/hide
Query:  AYYVQSPSTLSHANSSDIRNPAEVSTCHSPLPSDTFPNAHHHHHHRNPTQEASRFTLSHYSSSRGSNHGAGTDNGEARLIVGRGNGGDCEEEEEEGEGNE
        AY+VQSPS  SH       +  + +T     P  T P     H              SH SSSR S       NG  R    +G+ G+ +    E EG  
Subjt:  AYYVQSPSTLSHANSSDIRNPAEVSTCHSPLPSDTFPNAHHHHHHRNPTQEASRFTLSHYSSSRGSNHGAGTDNGEARLIVGRGNGGDCEEEEEEGEGNE

Query:  EGYYGKRKRGCWKRYFTYRNSDSNAWICLQLSWRAIFSMGIAL--LVFYIVTNPPSPIISVKVGEIEEFMLGEGVDKTGVGTKILTCNCTMDVIVDNHSK
        +   G R++    R             C  L++   FS+  A   L+ Y    P  P ISVK    E+  +  G D  G+GT ++T N T+ ++  N   
Subjt:  EGYYGKRKRGCWKRYFTYRNSDSNAWICLQLSWRAIFSMGIAL--LVFYIVTNPPSPIISVKVGEIEEFMLGEGVDKTGVGTKILTCNCTMDVIVDNHSK

Query:  LFGLHILPPSLHMSFGPLPIAT
         FG+H+    + +SF  + I +
Subjt:  LFGLHILPPSLHMSFGPLPIAT


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTCAGAGAGAAATCATCTCTCCGCCACTCTGTCCGCCGCCGTGATGGAGACTGCCGAAGAGCAAGAAGCCGTTCTCTTCCACTCTTATCCATGTGCTTATTAC
GTACAAAGCCCCTCCACTCTCTCCCACGCCAACAGCTCCGACATTCGGAACCCTGCCGAGGTCTCCACTTGCCACTCCCCTCTCCCTTCCGACACTTTTCCCAAC
GCCCATCACCACCACCACCACCGGAACCCGACGCAGGAAGCCTCTCGCTTTACTCTCTCCCACTACTCGTCCTCCCGTGGCTCAAACCATGGGGCTGGGACAGAC
AATGGCGAGGCTCGGCTGATTGTGGGTCGTGGCAATGGTGGAGATTGCGAGGAGGAAGAGGAGGAGGGGGAGGGAAACGAGGAAGGATATTATGGGAAGAGAAAA
AGAGGTTGTTGGAAGAGGTATTTTACGTATAGGAATTCGGATTCTAATGCATGGATTTGCTTGCAATTGAGTTGGAGGGCAATTTTCAGCATGGGAATTGCTTTG
CTTGTGTTTTACATTGTCACTAATCCTCCTTCACCAATCATTTCTGTTAAGGTGGGAGAAATAGAAGAGTTTATGTTAGGGGAAGGAGTGGACAAAACAGGGGTT
GGAACTAAGATTCTAACATGCAATTGCACAATGGATGTAATTGTGGACAATCACTCTAAGCTTTTTGGCCTTCACATCCTTCCTCCATCTCTTCATATGTCTTTT
GGCCCTCTTCCCATTGCAACTTCACAAGGTTGTTTGGAAATTCATAAGGCCACACTTTCATCGTCATGTCCAATGCTTATTGCTCCTTCGGAAAGCTTACAATAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
MSERNHLSATLSAAVMETAEEQEAVLFHSYPCAYYVQSPSTLSHANSSDIRNPAEVSTCHSPLPSDTFPNAHHHHHHRNPTQEASRFTLSHYSSSRGSNHGAGTD
NGEARLIVGRGNGGDCEEEEEEGEGNEEGYYGKRKRGCWKRYFTYRNSDSNAWICLQLSWRAIFSMGIALLVFYIVTNPPSPIISVKVGEIEEFMLGEGVDKTGV
GTKILTCNCTMDVIVDNHSKLFGLHILPPSLHMSFGPLPIATSQGCLEIHKATLSSSCPMLIAPSESLQ