; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Chy4G080170 (gene) of Cucumber (hystrix) v1 genome

Gene IDChy4G080170
OrganismCucumis hystrix (Cucumber (hystrix) v1)
Description60S ribosomal protein L6
Genome locationchrH04:19505428..19507545
RNA-Seq ExpressionChy4G080170
SyntenyChy4G080170
Gene Ontology termsGO:0000027 - ribosomal large subunit assembly (biological process)
GO:0002181 - cytoplasmic translation (biological process)
GO:0022625 - cytosolic large ribosomal subunit (cellular component)
GO:0003723 - RNA binding (molecular function)
GO:0003735 - structural constituent of ribosome (molecular function)
InterPro domainsIPR000915 - 60S ribosomal protein L6E
IPR005568 - Ribosomal protein L6, N-terminal
IPR008991 - Translation protein SH3-like domain superfamily
IPR014722 - Ribosomal protein L2, domain 2
IPR041997 - Ribosomal Protein L6, KOW domain


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004149609.1 60S ribosomal protein L6-2 [Cucumis sativus]1.52e-15096.1Show/hide
Query:  MAPKTARVSRNPDLIRGVGKYSRAKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAKPKPEAPAEKPPKFYPADDVKKPLVNKRKAKPTKLRSSITPGTVLIILTGRF
        MAPKTARVSRNPDLIRGVGKYSR+KMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAKPK EAPAEKPPKFYPADDVKKP+VNKRKAKPTKLRSSITPGTVLIILTGRF
Subjt:  MAPKTARVSRNPDLIRGVGKYSRAKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAKPKPEAPAEKPPKFYPADDVKKPLVNKRKAKPTKLRSSITPGTVLIILTGRF

Query:  KGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATSTKVDIIGVNVEKFDDKYFSKEVQKKEKKGEGEFFESEKEEKSALPQDKKDDQKTVDSAL
        KGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATSTKVDI GV+VEKFDDKYFSKEVQKK+KKGEGEFFE+EKEEKSALPQDKKDDQK VDSAL
Subjt:  KGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATSTKVDIIGVNVEKFDDKYFSKEVQKKEKKGEGEFFESEKEEKSALPQDKKDDQKTVDSAL

Query:  LKSIEAVSELKTYLAARFSLKAGMKPHELVF
        LKSIEAVS+LKTYLAARFSLKAGMKPHELVF
Subjt:  LKSIEAVSELKTYLAARFSLKAGMKPHELVF

XP_008461779.1 PREDICTED: 60S ribosomal protein L6-1-like [Cucumis melo]3.90e-15397.4Show/hide
Query:  MAPKTARVSRNPDLIRGVGKYSRAKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAKPKPEAPAEKPPKFYPADDVKKPLVNKRKAKPTKLRSSITPGTVLIILTGRF
        MAPKTARVSRNPDLIRGVGKYSR+KMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAKPKPEAPAEKPPKFYPADDVKKPLVNKRKAKPTKLR+SITPGTVLIILTGRF
Subjt:  MAPKTARVSRNPDLIRGVGKYSRAKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAKPKPEAPAEKPPKFYPADDVKKPLVNKRKAKPTKLRSSITPGTVLIILTGRF

Query:  KGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATSTKVDIIGVNVEKFDDKYFSKEVQKKEKKGEGEFFESEKEEKSALPQDKKDDQKTVDSAL
        KGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATSTKVDI GVNVEKFDDKYFSKEVQKK+KKGEGEFFE+EKEEKSALPQDKKDDQKTVDSAL
Subjt:  KGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATSTKVDIIGVNVEKFDDKYFSKEVQKKEKKGEGEFFESEKEEKSALPQDKKDDQKTVDSAL

Query:  LKSIEAVSELKTYLAARFSLKAGMKPHELVF
        LKSIEAVS+LKTYLAARFSLKAGMKPHELVF
Subjt:  LKSIEAVSELKTYLAARFSLKAGMKPHELVF

XP_022935449.1 60S ribosomal protein L6-1-like [Cucurbita moschata]8.81e-15095.24Show/hide
Query:  MAPKTARVSRNPDLIRGVGKYSRAKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAKPKPEAPAEKPPKFYPADDVKKPLVNKRKAKPTKLRSSITPGTVLIILTGRF
        MAPKTARVSRNPDLIRGVGKYSR+KMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDA+PK +APAEKPPKFYPADDVKKPLVNKRKAKPTKLRSSITPGTVLIILTGRF
Subjt:  MAPKTARVSRNPDLIRGVGKYSRAKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAKPKPEAPAEKPPKFYPADDVKKPLVNKRKAKPTKLRSSITPGTVLIILTGRF

Query:  KGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATSTKVDIIGVNVEKFDDKYFSKEVQKKEKKGEGEFFESEKEEKSALPQDKKDDQKTVDSAL
        KGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATSTKVD+ GVNVEKFDDKYFSKEVQKK+KKGEGEFFE+EKEEKSALPQDKKDDQK VDSAL
Subjt:  KGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATSTKVDIIGVNVEKFDDKYFSKEVQKKEKKGEGEFFESEKEEKSALPQDKKDDQKTVDSAL

Query:  LKSIEAVSELKTYLAARFSLKAGMKPHELVF
        LKSIEAVS+LKTYLAARFSLK+GMKPHELVF
Subjt:  LKSIEAVSELKTYLAARFSLKAGMKPHELVF

XP_022983464.1 60S ribosomal protein L6-1-like [Cucurbita maxima]3.59e-14995.24Show/hide
Query:  MAPKTARVSRNPDLIRGVGKYSRAKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAKPKPEAPAEKPPKFYPADDVKKPLVNKRKAKPTKLRSSITPGTVLIILTGRF
        MAPKTARVSRNPDLIRGVGKYSR+KMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDA+PK +APAEKPPKFYPADDVKKPLVNKRKAKPTKLRSSITPGTVLIILTGRF
Subjt:  MAPKTARVSRNPDLIRGVGKYSRAKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAKPKPEAPAEKPPKFYPADDVKKPLVNKRKAKPTKLRSSITPGTVLIILTGRF

Query:  KGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATSTKVDIIGVNVEKFDDKYFSKEVQKKEKKGEGEFFESEKEEKSALPQDKKDDQKTVDSAL
        KGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATSTKVD+ GVNVEKFDDKYFSKEVQKK+KKGEGEFFE+EKEEKSALPQDKKDDQK VDSAL
Subjt:  KGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATSTKVDIIGVNVEKFDDKYFSKEVQKKEKKGEGEFFESEKEEKSALPQDKKDDQKTVDSAL

Query:  LKSIEAVSELKTYLAARFSLKAGMKPHELVF
        LKSIEAVS LKTYLAARFSLK+GMKPHELVF
Subjt:  LKSIEAVSELKTYLAARFSLKAGMKPHELVF

XP_038906099.1 60S ribosomal protein L6-1-like [Benincasa hispida]7.55e-15196.1Show/hide
Query:  MAPKTARVSRNPDLIRGVGKYSRAKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAKPKPEAPAEKPPKFYPADDVKKPLVNKRKAKPTKLRSSITPGTVLIILTGRF
        MAPK  RVSRNPDLIRGVGKYSR+KMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAKPKP+APAEKPPKFYPADDVKKPLVNKRKAKPTKLRSSITPGTVLIILTGRF
Subjt:  MAPKTARVSRNPDLIRGVGKYSRAKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAKPKPEAPAEKPPKFYPADDVKKPLVNKRKAKPTKLRSSITPGTVLIILTGRF

Query:  KGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATSTKVDIIGVNVEKFDDKYFSKEVQKKEKKGEGEFFESEKEEKSALPQDKKDDQKTVDSAL
        KGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATSTKVD+ GVNVEKFDDKYFSKEVQKK+KKGEGEFFE EKEEKSALPQDKKDDQK VDSAL
Subjt:  KGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATSTKVDIIGVNVEKFDDKYFSKEVQKKEKKGEGEFFESEKEEKSALPQDKKDDQKTVDSAL

Query:  LKSIEAVSELKTYLAARFSLKAGMKPHELVF
        LKSIEAVSELKTYLAARFSLKAGMKPHELVF
Subjt:  LKSIEAVSELKTYLAARFSLKAGMKPHELVF

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0L9J7 60S ribosomal protein L69.0e-11796.1Show/hide
Query:  MAPKTARVSRNPDLIRGVGKYSRAKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAKPKPEAPAEKPPKFYPADDVKKPLVNKRKAKPTKLRSSITPGTVLIILTGRF
        MAPKTARVSRNPDLIRGVGKYSR+KMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAKPK EAPAEKPPKFYPADDVKKP+VNKRKAKPTKLRSSITPGTVLIILTGRF
Subjt:  MAPKTARVSRNPDLIRGVGKYSRAKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAKPKPEAPAEKPPKFYPADDVKKPLVNKRKAKPTKLRSSITPGTVLIILTGRF

Query:  KGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATSTKVDIIGVNVEKFDDKYFSKEVQKKEKKGEGEFFESEKEEKSALPQDKKDDQKTVDSAL
        KGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATSTKVDI GV+VEKFDDKYFSKEVQKK+KKGEGEFFE+EKEEKSALPQDKKDDQK VDSAL
Subjt:  KGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATSTKVDIIGVNVEKFDDKYFSKEVQKKEKKGEGEFFESEKEEKSALPQDKKDDQKTVDSAL

Query:  LKSIEAVSELKTYLAARFSLKAGMKPHELVF
        LKSIEAVS+LKTYLAARFSLKAGMKPHELVF
Subjt:  LKSIEAVSELKTYLAARFSLKAGMKPHELVF

A0A1S3CFY6 60S ribosomal protein L69.6e-11997.4Show/hide
Query:  MAPKTARVSRNPDLIRGVGKYSRAKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAKPKPEAPAEKPPKFYPADDVKKPLVNKRKAKPTKLRSSITPGTVLIILTGRF
        MAPKTARVSRNPDLIRGVGKYSR+KMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAKPKPEAPAEKPPKFYPADDVKKPLVNKRKAKPTKLR+SITPGTVLIILTGRF
Subjt:  MAPKTARVSRNPDLIRGVGKYSRAKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAKPKPEAPAEKPPKFYPADDVKKPLVNKRKAKPTKLRSSITPGTVLIILTGRF

Query:  KGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATSTKVDIIGVNVEKFDDKYFSKEVQKKEKKGEGEFFESEKEEKSALPQDKKDDQKTVDSAL
        KGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATSTKVDI GVNVEKFDDKYFSKEVQKK+KKGEGEFFE+EKEEKSALPQDKKDDQKTVDSAL
Subjt:  KGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATSTKVDIIGVNVEKFDDKYFSKEVQKKEKKGEGEFFESEKEEKSALPQDKKDDQKTVDSAL

Query:  LKSIEAVSELKTYLAARFSLKAGMKPHELVF
        LKSIEAVS+LKTYLAARFSLKAGMKPHELVF
Subjt:  LKSIEAVSELKTYLAARFSLKAGMKPHELVF

A0A5D3CKB9 60S ribosomal protein L69.6e-11997.4Show/hide
Query:  MAPKTARVSRNPDLIRGVGKYSRAKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAKPKPEAPAEKPPKFYPADDVKKPLVNKRKAKPTKLRSSITPGTVLIILTGRF
        MAPKTARVSRNPDLIRGVGKYSR+KMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAKPKPEAPAEKPPKFYPADDVKKPLVNKRKAKPTKLR+SITPGTVLIILTGRF
Subjt:  MAPKTARVSRNPDLIRGVGKYSRAKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAKPKPEAPAEKPPKFYPADDVKKPLVNKRKAKPTKLRSSITPGTVLIILTGRF

Query:  KGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATSTKVDIIGVNVEKFDDKYFSKEVQKKEKKGEGEFFESEKEEKSALPQDKKDDQKTVDSAL
        KGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATSTKVDI GVNVEKFDDKYFSKEVQKK+KKGEGEFFE+EKEEKSALPQDKKDDQKTVDSAL
Subjt:  KGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATSTKVDIIGVNVEKFDDKYFSKEVQKKEKKGEGEFFESEKEEKSALPQDKKDDQKTVDSAL

Query:  LKSIEAVSELKTYLAARFSLKAGMKPHELVF
        LKSIEAVS+LKTYLAARFSLKAGMKPHELVF
Subjt:  LKSIEAVSELKTYLAARFSLKAGMKPHELVF

A0A6J1F5G0 60S ribosomal protein L63.4e-11695.24Show/hide
Query:  MAPKTARVSRNPDLIRGVGKYSRAKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAKPKPEAPAEKPPKFYPADDVKKPLVNKRKAKPTKLRSSITPGTVLIILTGRF
        MAPKTARVSRNPDLIRGVGKYSR+KMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDA+PK +APAEKPPKFYPADDVKKPLVNKRKAKPTKLRSSITPGTVLIILTGRF
Subjt:  MAPKTARVSRNPDLIRGVGKYSRAKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAKPKPEAPAEKPPKFYPADDVKKPLVNKRKAKPTKLRSSITPGTVLIILTGRF

Query:  KGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATSTKVDIIGVNVEKFDDKYFSKEVQKKEKKGEGEFFESEKEEKSALPQDKKDDQKTVDSAL
        KGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATSTKVD+ GVNVEKFDDKYFSKEVQKK+KKGEGEFFE+EKEEKSALPQDKKDDQK VDSAL
Subjt:  KGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATSTKVDIIGVNVEKFDDKYFSKEVQKKEKKGEGEFFESEKEEKSALPQDKKDDQKTVDSAL

Query:  LKSIEAVSELKTYLAARFSLKAGMKPHELVF
        LKSIEAVS+LKTYLAARFSLK+GMKPHELVF
Subjt:  LKSIEAVSELKTYLAARFSLKAGMKPHELVF

A0A6J1J7G9 60S ribosomal protein L61.0e-11595.24Show/hide
Query:  MAPKTARVSRNPDLIRGVGKYSRAKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAKPKPEAPAEKPPKFYPADDVKKPLVNKRKAKPTKLRSSITPGTVLIILTGRF
        MAPKTARVSRNPDLIRGVGKYSR+KMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDA+PK +APAEKPPKFYPADDVKKPLVNKRKAKPTKLRSSITPGTVLIILTGRF
Subjt:  MAPKTARVSRNPDLIRGVGKYSRAKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAKPKPEAPAEKPPKFYPADDVKKPLVNKRKAKPTKLRSSITPGTVLIILTGRF

Query:  KGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATSTKVDIIGVNVEKFDDKYFSKEVQKKEKKGEGEFFESEKEEKSALPQDKKDDQKTVDSAL
        KGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATSTKVD+ GVNVEKFDDKYFSKEVQKK+KKGEGEFFE+EKEEKSALPQDKKDDQK VDSAL
Subjt:  KGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATSTKVDIIGVNVEKFDDKYFSKEVQKKEKKGEGEFFESEKEEKSALPQDKKDDQKTVDSAL

Query:  LKSIEAVSELKTYLAARFSLKAGMKPHELVF
        LKSIEAVS LKTYLAARFSLK+GMKPHELVF
Subjt:  LKSIEAVSELKTYLAARFSLKAGMKPHELVF

SwissProt top hitse value%identityAlignment
P34091 60S ribosomal protein L63.7e-9982.59Show/hide
Query:  VSRNPDLIRGVGKYSRAKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAKPKPEAPAEKPPKFYPADDVKKPLVNKRKAKPTKLRSSITPGTVLIILTGRFKGKRVVF
        VSRNP+L+RG+GKYSR+KMYHKRGLWAIKAKNGGVFP+H  K       EKPPKFYPADDVKKPL+NKRK KPTKLR+SITPGTVLIIL GRFKGKRVVF
Subjt:  VSRNPDLIRGVGKYSRAKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAKPKPEAPAEKPPKFYPADDVKKPLVNKRKAKPTKLRSSITPGTVLIILTGRFKGKRVVF

Query:  LKQLPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATSTKVDIIGVNVEKFDDKYFSKEVQKKEKKGEGEFFESEKEEKSALPQDKKDDQKTVDSALLKSIEAV
        LKQL SGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQ+YVIATSTKVDI GVNVEKFDDKYF K+ +KK KKGEGEFFE+EK+E + LPQ+KKDDQK VD ALLK+IE V
Subjt:  LKQLPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATSTKVDIIGVNVEKFDDKYFSKEVQKKEKKGEGEFFESEKEEKSALPQDKKDDQKTVDSALLKSIEAV

Query:  SELKTYLAARFSLKAGMKPHELVF
         ELK YL ARFSLKAGMKPHELVF
Subjt:  SELKTYLAARFSLKAGMKPHELVF

P47911 60S ribosomal protein L62.1e-4647.86Show/hide
Query:  PKTAR--VSRNPDLIRGVGKYSRAKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAKPKPE--------------------APAEKPPKFYPADDVKKPLVNKRKAKP
        PK A+   SRNP L+RG+G+YSR+ MY ++ L+  K K      + + K K E                        K P++YP +DV + L++  K KP
Subjt:  PKTAR--VSRNPDLIRGVGKYSRAKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAKPKPE--------------------APAEKPPKFYPADDVKKPLVNKRKAKP

Query:  -----TKLRSSITPGTVLIILTGRFKGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATSTKVDIIGVNVEK-FDDKYFSKEVQKKEKKGEGEF
              +LRSSITPGTVLIILTGR +GKRVVFLKQL SGLLLVTGP  +N VPLRR +Q +VIATSTKVDI  V + K   D YF K+  +K +  EGE 
Subjt:  -----TKLRSSITPGTVLIILTGRFKGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATSTKVDIIGVNVEK-FDDKYFSKEVQKKEKKGEGEF

Query:  FESEKEEKSALPQDKKDDQKTVDSALLKSIEAVSELKTYLAARFSLKAGMKPHELVF
        F++EK EK  + + +K DQK VD  +L  I+AV +L+ YL ++FSL  GM PH+LVF
Subjt:  FESEKEEKSALPQDKKDDQKTVDSALLKSIEAVSELKTYLAARFSLKAGMKPHELVF

Q9C9C5 60S ribosomal protein L6-32.5e-10081.58Show/hide
Query:  KTARVSRNPDLIRGVGKYSRAKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAKPKPEAPAEKPPKFYPADDVKKPLVNKRKAKPTKLRSSITPGTVLIILTGRFKGK
        +T +V+RNPDLIRGVGKYSR++MYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAK K +AP EKPPKFYPA+DVKKPL N+R AKPTKLR+SITPGTVLIIL GRFKGK
Subjt:  KTARVSRNPDLIRGVGKYSRAKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAKPKPEAPAEKPPKFYPADDVKKPLVNKRKAKPTKLRSSITPGTVLIILTGRFKGK

Query:  RVVFLKQLPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATSTKVDIIGVNVEKFDDKYFSKEVQKKEKKGEGEFFESEKEEKSALPQDKKDDQKTVDSALLKS
        RVVFLKQL SGLLLVTGPFK+NGVPLRRVNQ+YVI TSTKVDI GV ++KFDDKYF K  +KK+KK EGEFFE+EKEEK  +PQ KKDDQK VD+AL+K+
Subjt:  RVVFLKQLPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATSTKVDIIGVNVEKFDDKYFSKEVQKKEKKGEGEFFESEKEEKSALPQDKKDDQKTVDSALLKS

Query:  IEAVSELKTYLAARFSLKAGMKPHELVF
        IEAV ELKTYL ARFSLK GMKPHELVF
Subjt:  IEAVSELKTYLAARFSLKAGMKPHELVF

Q9C9C6 60S ribosomal protein L6-21.5e-10081.58Show/hide
Query:  KTARVSRNPDLIRGVGKYSRAKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAKPKPEAPAEKPPKFYPADDVKKPLVNKRKAKPTKLRSSITPGTVLIILTGRFKGK
        +TA+V+RNPDLIRGVGKYSR++MYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAK K +AP EKPPKFYPA+DVKKPL N+R AKP KLR+SITPGTVLIIL GRFKGK
Subjt:  KTARVSRNPDLIRGVGKYSRAKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAKPKPEAPAEKPPKFYPADDVKKPLVNKRKAKPTKLRSSITPGTVLIILTGRFKGK

Query:  RVVFLKQLPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATSTKVDIIGVNVEKFDDKYFSKEVQKKEKKGEGEFFESEKEEKSALPQDKKDDQKTVDSALLKS
        RVVFLKQL SGLLLVTGPFK+NGVPLRRVNQ+YVI TSTKVDI GV ++KFDDKYF K  +KK+KK EGEFFE+EKEEK  +PQ KKDDQK VD+AL+K+
Subjt:  RVVFLKQLPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATSTKVDIIGVNVEKFDDKYFSKEVQKKEKKGEGEFFESEKEEKSALPQDKKDDQKTVDSALLKS

Query:  IEAVSELKTYLAARFSLKAGMKPHELVF
        IEAV ELKTYL ARFSLK GMKPHELVF
Subjt:  IEAVSELKTYLAARFSLKAGMKPHELVF

Q9FZ76 60S ribosomal protein L6-12.3e-10180.87Show/hide
Query:  APKTARVSRNPDLIRGVGKYSRAKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAKPKPEAPAEKPPKFYPADDVKKPLVNKRKAKPTKLRSSITPGTVLIILTGRFK
        A +T +V+RNPDLIRGVGKYSR++MYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDA+PK +AP EKP KFYPA+DVKKPLVN+RK KPTKL++SITPGTVLIIL GRFK
Subjt:  APKTARVSRNPDLIRGVGKYSRAKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAKPKPEAPAEKPPKFYPADDVKKPLVNKRKAKPTKLRSSITPGTVLIILTGRFK

Query:  GKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATSTKVDIIGVNVEKFDDKYFSKEVQKKEKKGEGEFFESEKEEKSALPQDKKDDQKTVDSALL
        GKRVVFLKQL SGLLLVTGPFK+NGVPLRRVNQ+YVI TSTK+DI GVN EKFDDKYF K  +KK+KK EGEFFE+EKEEK  +PQ+KK+DQKTVD+AL+
Subjt:  GKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATSTKVDIIGVNVEKFDDKYFSKEVQKKEKKGEGEFFESEKEEKSALPQDKKDDQKTVDSALL

Query:  KSIEAVSELKTYLAARFSLKAGMKPHELVF
        KSIEAV ELK YL ARFSL  GMKPHELVF
Subjt:  KSIEAVSELKTYLAARFSLKAGMKPHELVF

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G18540.1 Ribosomal protein L6 family protein1.6e-10280.87Show/hide
Query:  APKTARVSRNPDLIRGVGKYSRAKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAKPKPEAPAEKPPKFYPADDVKKPLVNKRKAKPTKLRSSITPGTVLIILTGRFK
        A +T +V+RNPDLIRGVGKYSR++MYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDA+PK +AP EKP KFYPA+DVKKPLVN+RK KPTKL++SITPGTVLIIL GRFK
Subjt:  APKTARVSRNPDLIRGVGKYSRAKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAKPKPEAPAEKPPKFYPADDVKKPLVNKRKAKPTKLRSSITPGTVLIILTGRFK

Query:  GKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATSTKVDIIGVNVEKFDDKYFSKEVQKKEKKGEGEFFESEKEEKSALPQDKKDDQKTVDSALL
        GKRVVFLKQL SGLLLVTGPFK+NGVPLRRVNQ+YVI TSTK+DI GVN EKFDDKYF K  +KK+KK EGEFFE+EKEEK  +PQ+KK+DQKTVD+AL+
Subjt:  GKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATSTKVDIIGVNVEKFDDKYFSKEVQKKEKKGEGEFFESEKEEKSALPQDKKDDQKTVDSALL

Query:  KSIEAVSELKTYLAARFSLKAGMKPHELVF
        KSIEAV ELK YL ARFSL  GMKPHELVF
Subjt:  KSIEAVSELKTYLAARFSLKAGMKPHELVF

AT1G74050.1 Ribosomal protein L6 family protein1.8e-10181.58Show/hide
Query:  KTARVSRNPDLIRGVGKYSRAKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAKPKPEAPAEKPPKFYPADDVKKPLVNKRKAKPTKLRSSITPGTVLIILTGRFKGK
        +T +V+RNPDLIRGVGKYSR++MYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAK K +AP EKPPKFYPA+DVKKPL N+R AKPTKLR+SITPGTVLIIL GRFKGK
Subjt:  KTARVSRNPDLIRGVGKYSRAKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAKPKPEAPAEKPPKFYPADDVKKPLVNKRKAKPTKLRSSITPGTVLIILTGRFKGK

Query:  RVVFLKQLPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATSTKVDIIGVNVEKFDDKYFSKEVQKKEKKGEGEFFESEKEEKSALPQDKKDDQKTVDSALLKS
        RVVFLKQL SGLLLVTGPFK+NGVPLRRVNQ+YVI TSTKVDI GV ++KFDDKYF K  +KK+KK EGEFFE+EKEEK  +PQ KKDDQK VD+AL+K+
Subjt:  RVVFLKQLPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATSTKVDIIGVNVEKFDDKYFSKEVQKKEKKGEGEFFESEKEEKSALPQDKKDDQKTVDSALLKS

Query:  IEAVSELKTYLAARFSLKAGMKPHELVF
        IEAV ELKTYL ARFSLK GMKPHELVF
Subjt:  IEAVSELKTYLAARFSLKAGMKPHELVF

AT1G74060.1 Ribosomal protein L6 family protein1.1e-10181.58Show/hide
Query:  KTARVSRNPDLIRGVGKYSRAKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAKPKPEAPAEKPPKFYPADDVKKPLVNKRKAKPTKLRSSITPGTVLIILTGRFKGK
        +TA+V+RNPDLIRGVGKYSR++MYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAK K +AP EKPPKFYPA+DVKKPL N+R AKP KLR+SITPGTVLIIL GRFKGK
Subjt:  KTARVSRNPDLIRGVGKYSRAKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAKPKPEAPAEKPPKFYPADDVKKPLVNKRKAKPTKLRSSITPGTVLIILTGRFKGK

Query:  RVVFLKQLPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATSTKVDIIGVNVEKFDDKYFSKEVQKKEKKGEGEFFESEKEEKSALPQDKKDDQKTVDSALLKS
        RVVFLKQL SGLLLVTGPFK+NGVPLRRVNQ+YVI TSTKVDI GV ++KFDDKYF K  +KK+KK EGEFFE+EKEEK  +PQ KKDDQK VD+AL+K+
Subjt:  RVVFLKQLPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATSTKVDIIGVNVEKFDDKYFSKEVQKKEKKGEGEFFESEKEEKSALPQDKKDDQKTVDSALLKS

Query:  IEAVSELKTYLAARFSLKAGMKPHELVF
        IEAV ELKTYL ARFSLK GMKPHELVF
Subjt:  IEAVSELKTYLAARFSLKAGMKPHELVF


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCGCCGAAGACAGCAAGAGTTAGCCGAAACCCCGATCTCATTCGAGGGGTTGGCAAATACTCGAGGGCCAAGATGTACCACAAGCGAGGTCTCTGGGCAATC
AAGGCCAAAAATGGAGGTGTCTTCCCTCGCCACGATGCCAAGCCTAAGCCCGAAGCTCCAGCTGAAAAGCCCCCGAAATTTTACCCTGCCGACGATGTTAAGAAA
CCCCTTGTCAACAAACGCAAAGCTAAGCCCACCAAACTTAGGTCTAGTATTACTCCTGGAACTGTGCTTATCATTCTTACTGGAAGATTCAAGGGAAAGAGAGTT
GTGTTCTTGAAGCAACTTCCATCTGGGTTGCTTTTAGTGACTGGTCCATTCAAAGTCAATGGCGTTCCTTTGAGACGTGTGAATCAGTCATACGTGATTGCAACC
TCCACCAAGGTGGACATTATAGGGGTCAATGTGGAGAAGTTTGATGACAAATATTTCTCCAAGGAAGTTCAAAAGAAGGAAAAGAAGGGAGAAGGAGAATTTTTT
GAGTCAGAGAAGGAGGAAAAAAGTGCACTTCCACAGGACAAAAAAGATGACCAGAAGACCGTGGACTCAGCTCTGCTGAAGTCCATCGAGGCAGTCTCAGAATTA
AAGACCTACTTAGCTGCAAGGTTTTCTCTAAAGGCAGGCATGAAACCACATGAACTTGTTTTCTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCGCCGAAGACAGCAAGAGTTAGCCGAAACCCCGATCTCATTCGAGGGGTTGGCAAATACTCGAGGGCCAAGATGTACCACAAGCGAGGTCTCTGGGCAATC
AAGGCCAAAAATGGAGGTGTCTTCCCTCGCCACGATGCCAAGCCTAAGCCCGAAGCTCCAGCTGAAAAGCCCCCGAAATTTTACCCTGCCGACGATGTTAAGAAA
CCCCTTGTCAACAAACGCAAAGCTAAGCCCACCAAACTTAGGTCTAGTATTACTCCTGGAACTGTGCTTATCATTCTTACTGGAAGATTCAAGGGAAAGAGAGTT
GTGTTCTTGAAGCAACTTCCATCTGGGTTGCTTTTAGTGACTGGTCCATTCAAAGTCAATGGCGTTCCTTTGAGACGTGTGAATCAGTCATACGTGATTGCAACC
TCCACCAAGGTGGACATTATAGGGGTCAATGTGGAGAAGTTTGATGACAAATATTTCTCCAAGGAAGTTCAAAAGAAGGAAAAGAAGGGAGAAGGAGAATTTTTT
GAGTCAGAGAAGGAGGAAAAAAGTGCACTTCCACAGGACAAAAAAGATGACCAGAAGACCGTGGACTCAGCTCTGCTGAAGTCCATCGAGGCAGTCTCAGAATTA
AAGACCTACTTAGCTGCAAGGTTTTCTCTAAAGGCAGGCATGAAACCACATGAACTTGTTTTCTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAPKTARVSRNPDLIRGVGKYSRAKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAKPKPEAPAEKPPKFYPADDVKKPLVNKRKAKPTKLRSSITPGTVLIILTGRFKGKRV
VFLKQLPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATSTKVDIIGVNVEKFDDKYFSKEVQKKEKKGEGEFFESEKEEKSALPQDKKDDQKTVDSALLKSIEAVSEL
KTYLAARFSLKAGMKPHELVF