; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Chy4G080970 (gene) of Cucumber (hystrix) v1 genome

Gene IDChy4G080970
OrganismCucumis hystrix (Cucumber (hystrix) v1)
DescriptionTryptophan synthase
Genome locationchrH04:20420121..20424622
RNA-Seq ExpressionChy4G080970
SyntenyChy4G080970
Gene Ontology termsGO:0000162 - tryptophan biosynthetic process (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0005829 - cytosol (cellular component)
GO:0009507 - chloroplast (cellular component)
GO:0004834 - tryptophan synthase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR002028 - Tryptophan synthase, alpha chain
IPR011060 - Ribulose-phosphate binding barrel
IPR013785 - Aldolase-type TIM barrel
IPR018204 - Tryptophan synthase, alpha chain, active site


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004141207.1 tryptophan synthase alpha chain [Cucumis sativus]3.70e-21298.72Show/hide
Query:  MDIAFKSSRILPLNKIPNTLIFSPRPCKISVSQSKRFAPMAALAAYPVVGLSETFKNLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSKCGSDIIELGVP
        MDIAFKSSRILPLNKIPNTLIFSPRPCKISVSQSKRFAPMAALAAYPVVGLSETFKNLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSKCGSDIIELGVP
Subjt:  MDIAFKSSRILPLNKIPNTLIFSPRPCKISVSQSKRFAPMAALAAYPVVGLSETFKNLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSKCGSDIIELGVP

Query:  YSDPLADGPVIQAAATRSLARETNFNAIISMLKGVIPELSCPISLFTYYNPILKRGVENFMMIIKDTGVRGLVVPDVPLEETEVLRKEAVKHNIELVLLT
        YSDPLADGPVIQAAATRSLARETNFNAIISMLKGVIPELS PISLFTYYNPILKRGVENFMMIIKDTGVRGLVVPDVPLEETEVLRKEAVKHNIELVLLT
Subjt:  YSDPLADGPVIQAAATRSLARETNFNAIISMLKGVIPELSCPISLFTYYNPILKRGVENFMMIIKDTGVRGLVVPDVPLEETEVLRKEAVKHNIELVLLT

Query:  TPTTPKERMKNIVEASEGFVYLVSSIGVTGTRTSVSSRVQTLLAEVKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAEWGADGIIIGSAMVKLLGEAQSPVEGLKEL
        TPTTPKERMKNIVEASEGFVYLVSSIGVTGTRTSVSSRVQTLL EVKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAEWGADGIIIGSAMVKLLGEAQSP EGLKEL
Subjt:  TPTTPKERMKNIVEASEGFVYLVSSIGVTGTRTSVSSRVQTLLAEVKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAEWGADGIIIGSAMVKLLGEAQSPVEGLKEL

Query:  ENFTKSLKSALS
        ENFT+SLKSALS
Subjt:  ENFTKSLKSALS

XP_008465320.1 PREDICTED: tryptophan synthase alpha chain-like isoform X1 [Cucumis melo]7.16e-21097.44Show/hide
Query:  MDIAFKSSRILPLNKIPNTLIFSPRPCKISVSQSKRFAPMAALAAYPVVGLSETFKNLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSKCGSDIIELGVP
        MDIAFK SRILPLNKIPNTLIFSPRPCKISVSQ+KRFAPMAALAAYPVVGLSETFK LREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLS CGSDIIELGVP
Subjt:  MDIAFKSSRILPLNKIPNTLIFSPRPCKISVSQSKRFAPMAALAAYPVVGLSETFKNLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSKCGSDIIELGVP

Query:  YSDPLADGPVIQAAATRSLARETNFNAIISMLKGVIPELSCPISLFTYYNPILKRGVENFMMIIKDTGVRGLVVPDVPLEETEVLRKEAVKHNIELVLLT
        YSDPLADGPVIQAAATRSLARETNFNAIISMLKGVIPELSCPISLFTYYNPILKRGVENFMMIIKDTGVRGLVVPDVPLEETEVLRKEAVKHNIELVLLT
Subjt:  YSDPLADGPVIQAAATRSLARETNFNAIISMLKGVIPELSCPISLFTYYNPILKRGVENFMMIIKDTGVRGLVVPDVPLEETEVLRKEAVKHNIELVLLT

Query:  TPTTPKERMKNIVEASEGFVYLVSSIGVTGTRTSVSSRVQTLLAEVKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAEWGADGIIIGSAMVKLLGEAQSPVEGLKEL
        TPTTPKERMK IVEASEGFVYLVSSIGVTGTRTSVS RVQTLL EVKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAEWGADGIIIGSAMVKLLGEAQSP EGLKEL
Subjt:  TPTTPKERMKNIVEASEGFVYLVSSIGVTGTRTSVSSRVQTLLAEVKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAEWGADGIIIGSAMVKLLGEAQSPVEGLKEL

Query:  ENFTKSLKSALS
        ENFTKSLKSALS
Subjt:  ENFTKSLKSALS

XP_016903364.1 PREDICTED: tryptophan synthase alpha chain-like isoform X2 [Cucumis melo]2.39e-20596.47Show/hide
Query:  MDIAFKSSRILPLNKIPNTLIFSPRPCKISVSQSKRFAPMAALAAYPVVGLSETFKNLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSKCGSDIIELGVP
        MDIAFK SRILPLNKIPNTLIFSPRPCKISVSQ+KRFAPMAALAAYPVVGLSETFK LREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLS CGSDIIELGVP
Subjt:  MDIAFKSSRILPLNKIPNTLIFSPRPCKISVSQSKRFAPMAALAAYPVVGLSETFKNLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSKCGSDIIELGVP

Query:  YSDPLADGPVIQAAATRSLARETNFNAIISMLKGVIPELSCPISLFTYYNPILKRGVENFMMIIKDTGVRGLVVPDVPLEETEVLRKEAVKHNIELVLLT
        YSDPLADGPVIQAAATRSLARETNFNAIISMLKGVIPELSCPISLFTYYNPILKRGVENFMMIIKDTG   LVVPDVPLEETEVLRKEAVKHNIELVLLT
Subjt:  YSDPLADGPVIQAAATRSLARETNFNAIISMLKGVIPELSCPISLFTYYNPILKRGVENFMMIIKDTGVRGLVVPDVPLEETEVLRKEAVKHNIELVLLT

Query:  TPTTPKERMKNIVEASEGFVYLVSSIGVTGTRTSVSSRVQTLLAEVKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAEWGADGIIIGSAMVKLLGEAQSPVEGLKEL
        TPTTPKERMK IVEASEGFVYLVSSIGVTGTRTSVS RVQTLL EVKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAEWGADGIIIGSAMVKLLGEAQSP EGLKEL
Subjt:  TPTTPKERMKNIVEASEGFVYLVSSIGVTGTRTSVSSRVQTLLAEVKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAEWGADGIIIGSAMVKLLGEAQSPVEGLKEL

Query:  ENFTKSLKSALS
        ENFTKSLKSALS
Subjt:  ENFTKSLKSALS

XP_022932801.1 tryptophan synthase alpha chain-like [Cucurbita moschata]1.96e-19188.14Show/hide
Query:  MDIAFKSSRILPLNKIPNTLIFSPRPCKISVSQSKRFAPMAALAAYPVVGLSETFKNLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSKCGSDIIELGVP
        MDIAFKSSR LPLNKIP T I SPRPC ISV QSKRFAP+AAL A P  GLSETF  LREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLS CGSDIIELGVP
Subjt:  MDIAFKSSRILPLNKIPNTLIFSPRPCKISVSQSKRFAPMAALAAYPVVGLSETFKNLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSKCGSDIIELGVP

Query:  YSDPLADGPVIQAAATRSLARETNFNAIISMLKGVIPELSCPISLFTYYNPILKRGVENFMMIIKDTGVRGLVVPDVPLEETEVLRKEAVKHNIELVLLT
        YSDPLADGPVIQAAATR+LARETNFNAIISMLKGVIPELSCP+SLF+YYNPILKRG+ENFMM I+D GVRGLVVPDVPLEET VLR+EAVK+NIELVLLT
Subjt:  YSDPLADGPVIQAAATRSLARETNFNAIISMLKGVIPELSCPISLFTYYNPILKRGVENFMMIIKDTGVRGLVVPDVPLEETEVLRKEAVKHNIELVLLT

Query:  TPTTPKERMKNIVEASEGFVYLVSSIGVTGTRTSVSSRVQTLLAEVKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAEWGADGIIIGSAMVKLLGEAQSPVEGLKEL
        TPTTPK+RMKNIVEASEGFVYLVSS+GVTG RTSVS RVQ+LL E+KEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVA WGADG+I+GSAMVKLLGEAQSP EGLKEL
Subjt:  TPTTPKERMKNIVEASEGFVYLVSSIGVTGTRTSVSSRVQTLLAEVKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAEWGADGIIIGSAMVKLLGEAQSPVEGLKEL

Query:  ENFTKSLKSALS
        E FTKSL+SALS
Subjt:  ENFTKSLKSALS

XP_038906368.1 tryptophan synthase alpha chain-like [Benincasa hispida]1.24e-19490.71Show/hide
Query:  MDIAFKSSRILPLNKIPNTLIFSPRPCKISVSQSKRFAPMAALAAYPVVGLSETFKNLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSKCGSDIIELGVP
        M IAFKSS   PLNKIP++ IFSPRPCKISV +SKRFAPMA LAA PVVGLSETF  LREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLS CGSDIIELGVP
Subjt:  MDIAFKSSRILPLNKIPNTLIFSPRPCKISVSQSKRFAPMAALAAYPVVGLSETFKNLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSKCGSDIIELGVP

Query:  YSDPLADGPVIQAAATRSLARETNFNAIISMLKGVIPELSCPISLFTYYNPILKRGVENFMMIIKDTGVRGLVVPDVPLEETEVLRKEAVKHNIELVLLT
        YSDPLADGPVIQAAATRSLARETNFNAIISMLKGVIPELSCPISLFTYYN ILKRG+ENF+MIIKD GVRGLVVPDVPLEETE+LRKEAVK+NIELVLLT
Subjt:  YSDPLADGPVIQAAATRSLARETNFNAIISMLKGVIPELSCPISLFTYYNPILKRGVENFMMIIKDTGVRGLVVPDVPLEETEVLRKEAVKHNIELVLLT

Query:  TPTTPKERMKNIVEASEGFVYLVSSIGVTGTRTSVSSRVQTLLAEVKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAEWGADGIIIGSAMVKLLGEAQSPVEGLKEL
        TPTTPK+RMK+I EASEGFVYLVSS+GVTGTRTSVS RVQTLL EVKEVT+KPVAVGFGISKPEHVKQVA+WGADGIIIGSAMVKLLGEAQSP EGLKEL
Subjt:  TPTTPKERMKNIVEASEGFVYLVSSIGVTGTRTSVSSRVQTLLAEVKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAEWGADGIIIGSAMVKLLGEAQSPVEGLKEL

Query:  ENFTKSLKSALS
        ENFTKSLKSALS
Subjt:  ENFTKSLKSALS

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LD81 Tryptophan synthase4.1e-16598.72Show/hide
Query:  MDIAFKSSRILPLNKIPNTLIFSPRPCKISVSQSKRFAPMAALAAYPVVGLSETFKNLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSKCGSDIIELGVP
        MDIAFKSSRILPLNKIPNTLIFSPRPCKISVSQSKRFAPMAALAAYPVVGLSETFKNLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSKCGSDIIELGVP
Subjt:  MDIAFKSSRILPLNKIPNTLIFSPRPCKISVSQSKRFAPMAALAAYPVVGLSETFKNLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSKCGSDIIELGVP

Query:  YSDPLADGPVIQAAATRSLARETNFNAIISMLKGVIPELSCPISLFTYYNPILKRGVENFMMIIKDTGVRGLVVPDVPLEETEVLRKEAVKHNIELVLLT
        YSDPLADGPVIQAAATRSLARETNFNAIISMLKGVIPELS PISLFTYYNPILKRGVENFMMIIKDTGVRGLVVPDVPLEETEVLRKEAVKHNIELVLLT
Subjt:  YSDPLADGPVIQAAATRSLARETNFNAIISMLKGVIPELSCPISLFTYYNPILKRGVENFMMIIKDTGVRGLVVPDVPLEETEVLRKEAVKHNIELVLLT

Query:  TPTTPKERMKNIVEASEGFVYLVSSIGVTGTRTSVSSRVQTLLAEVKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAEWGADGIIIGSAMVKLLGEAQSPVEGLKEL
        TPTTPKERMKNIVEASEGFVYLVSSIGVTGTRTSVSSRVQTLL EVKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAEWGADGIIIGSAMVKLLGEAQSP EGLKEL
Subjt:  TPTTPKERMKNIVEASEGFVYLVSSIGVTGTRTSVSSRVQTLLAEVKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAEWGADGIIIGSAMVKLLGEAQSPVEGLKEL

Query:  ENFTKSLKSALS
        ENFT+SLKSALS
Subjt:  ENFTKSLKSALS

A0A1S3CNL8 Tryptophan synthase2.3e-16397.44Show/hide
Query:  MDIAFKSSRILPLNKIPNTLIFSPRPCKISVSQSKRFAPMAALAAYPVVGLSETFKNLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSKCGSDIIELGVP
        MDIAFK SRILPLNKIPNTLIFSPRPCKISVSQ+KRFAPMAALAAYPVVGLSETFK LREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLS CGSDIIELGVP
Subjt:  MDIAFKSSRILPLNKIPNTLIFSPRPCKISVSQSKRFAPMAALAAYPVVGLSETFKNLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSKCGSDIIELGVP

Query:  YSDPLADGPVIQAAATRSLARETNFNAIISMLKGVIPELSCPISLFTYYNPILKRGVENFMMIIKDTGVRGLVVPDVPLEETEVLRKEAVKHNIELVLLT
        YSDPLADGPVIQAAATRSLARETNFNAIISMLKGVIPELSCPISLFTYYNPILKRGVENFMMIIKDTGVRGLVVPDVPLEETEVLRKEAVKHNIELVLLT
Subjt:  YSDPLADGPVIQAAATRSLARETNFNAIISMLKGVIPELSCPISLFTYYNPILKRGVENFMMIIKDTGVRGLVVPDVPLEETEVLRKEAVKHNIELVLLT

Query:  TPTTPKERMKNIVEASEGFVYLVSSIGVTGTRTSVSSRVQTLLAEVKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAEWGADGIIIGSAMVKLLGEAQSPVEGLKEL
        TPTTPKERMK IVEASEGFVYLVSSIGVTGTRTSVS RVQTLL EVKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAEWGADGIIIGSAMVKLLGEAQSP EGLKEL
Subjt:  TPTTPKERMKNIVEASEGFVYLVSSIGVTGTRTSVSSRVQTLLAEVKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAEWGADGIIIGSAMVKLLGEAQSPVEGLKEL

Query:  ENFTKSLKSALS
        ENFTKSLKSALS
Subjt:  ENFTKSLKSALS

A0A1S4E560 Tryptophan synthase6.8e-16096.47Show/hide
Query:  MDIAFKSSRILPLNKIPNTLIFSPRPCKISVSQSKRFAPMAALAAYPVVGLSETFKNLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSKCGSDIIELGVP
        MDIAFK SRILPLNKIPNTLIFSPRPCKISVSQ+KRFAPMAALAAYPVVGLSETFK LREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLS CGSDIIELGVP
Subjt:  MDIAFKSSRILPLNKIPNTLIFSPRPCKISVSQSKRFAPMAALAAYPVVGLSETFKNLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSKCGSDIIELGVP

Query:  YSDPLADGPVIQAAATRSLARETNFNAIISMLKGVIPELSCPISLFTYYNPILKRGVENFMMIIKDTGVRGLVVPDVPLEETEVLRKEAVKHNIELVLLT
        YSDPLADGPVIQAAATRSLARETNFNAIISMLKGVIPELSCPISLFTYYNPILKRGVENFMMIIKDT   GLVVPDVPLEETEVLRKEAVKHNIELVLLT
Subjt:  YSDPLADGPVIQAAATRSLARETNFNAIISMLKGVIPELSCPISLFTYYNPILKRGVENFMMIIKDTGVRGLVVPDVPLEETEVLRKEAVKHNIELVLLT

Query:  TPTTPKERMKNIVEASEGFVYLVSSIGVTGTRTSVSSRVQTLLAEVKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAEWGADGIIIGSAMVKLLGEAQSPVEGLKEL
        TPTTPKERMK IVEASEGFVYLVSSIGVTGTRTSVS RVQTLL EVKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAEWGADGIIIGSAMVKLLGEAQSP EGLKEL
Subjt:  TPTTPKERMKNIVEASEGFVYLVSSIGVTGTRTSVSSRVQTLLAEVKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAEWGADGIIIGSAMVKLLGEAQSPVEGLKEL

Query:  ENFTKSLKSALS
        ENFTKSLKSALS
Subjt:  ENFTKSLKSALS

A0A5D3E2H9 Tryptophan synthase2.3e-16397.44Show/hide
Query:  MDIAFKSSRILPLNKIPNTLIFSPRPCKISVSQSKRFAPMAALAAYPVVGLSETFKNLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSKCGSDIIELGVP
        MDIAFK SRILPLNKIPNTLIFSPRPCKISVSQ+KRFAPMAALAAYPVVGLSETFK LREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLS CGSDIIELGVP
Subjt:  MDIAFKSSRILPLNKIPNTLIFSPRPCKISVSQSKRFAPMAALAAYPVVGLSETFKNLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSKCGSDIIELGVP

Query:  YSDPLADGPVIQAAATRSLARETNFNAIISMLKGVIPELSCPISLFTYYNPILKRGVENFMMIIKDTGVRGLVVPDVPLEETEVLRKEAVKHNIELVLLT
        YSDPLADGPVIQAAATRSLARETNFNAIISMLKGVIPELSCPISLFTYYNPILKRGVENFMMIIKDTGVRGLVVPDVPLEETEVLRKEAVKHNIELVLLT
Subjt:  YSDPLADGPVIQAAATRSLARETNFNAIISMLKGVIPELSCPISLFTYYNPILKRGVENFMMIIKDTGVRGLVVPDVPLEETEVLRKEAVKHNIELVLLT

Query:  TPTTPKERMKNIVEASEGFVYLVSSIGVTGTRTSVSSRVQTLLAEVKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAEWGADGIIIGSAMVKLLGEAQSPVEGLKEL
        TPTTPKERMK IVEASEGFVYLVSSIGVTGTRTSVS RVQTLL EVKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAEWGADGIIIGSAMVKLLGEAQSP EGLKEL
Subjt:  TPTTPKERMKNIVEASEGFVYLVSSIGVTGTRTSVSSRVQTLLAEVKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAEWGADGIIIGSAMVKLLGEAQSPVEGLKEL

Query:  ENFTKSLKSALS
        ENFTKSLKSALS
Subjt:  ENFTKSLKSALS

A0A6J1EXE2 Tryptophan synthase2.4e-14988.14Show/hide
Query:  MDIAFKSSRILPLNKIPNTLIFSPRPCKISVSQSKRFAPMAALAAYPVVGLSETFKNLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSKCGSDIIELGVP
        MDIAFKSSR LPLNKIP T I SPRPC ISV QSKRFAP+AAL A P  GLSETF  LREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLS CGSDIIELGVP
Subjt:  MDIAFKSSRILPLNKIPNTLIFSPRPCKISVSQSKRFAPMAALAAYPVVGLSETFKNLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSKCGSDIIELGVP

Query:  YSDPLADGPVIQAAATRSLARETNFNAIISMLKGVIPELSCPISLFTYYNPILKRGVENFMMIIKDTGVRGLVVPDVPLEETEVLRKEAVKHNIELVLLT
        YSDPLADGPVIQAAATR+LARETNFNAIISMLKGVIPELSCP+SLF+YYNPILKRG+ENFMM I+D GVRGLVVPDVPLEET VLR+EAVK+NIELVLLT
Subjt:  YSDPLADGPVIQAAATRSLARETNFNAIISMLKGVIPELSCPISLFTYYNPILKRGVENFMMIIKDTGVRGLVVPDVPLEETEVLRKEAVKHNIELVLLT

Query:  TPTTPKERMKNIVEASEGFVYLVSSIGVTGTRTSVSSRVQTLLAEVKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAEWGADGIIIGSAMVKLLGEAQSPVEGLKEL
        TPTTPK+RMKNIVEASEGFVYLVSS+GVTG RTSVS RVQ+LL E+KEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVA WGADG+I+GSAMVKLLGEAQSP EGLKEL
Subjt:  TPTTPKERMKNIVEASEGFVYLVSSIGVTGTRTSVSSRVQTLLAEVKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAEWGADGIIIGSAMVKLLGEAQSPVEGLKEL

Query:  ENFTKSLKSALS
        E FTKSL+SALS
Subjt:  ENFTKSLKSALS

SwissProt top hitse value%identityAlignment
B0C6F8 Tryptophan synthase alpha chain2.0e-7956.06Show/hide
Query:  VVGLSETFKNLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSKCGSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAAATRSLARETNFNAIISMLKGVIPELSCPISLFT
        +  +S+ F  LR++G+ ALIP++TAGDPDL+TTA AL+ L   G+D+IELGVPYSDPLADGPVIQAAATR+L R T  + ++ M+  + PE+  PI LFT
Subjt:  VVGLSETFKNLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSKCGSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAAATRSLARETNFNAIISMLKGVIPELSCPISLFT

Query:  YYNPILKRGVENFMMIIKDTGVRGLVVPDVPLEETEVLRKEAVKHNIELVLLTTPTTPKERMKNIVEASEGFVYLVSSIGVTGTRTSVSSRVQTLLAEVK
        YYNPI  RGV  F+  I   GVRGLVVPD+PLEE+E L ++A    IE+ LL  PT+ KER++ I   S+GF+YLVS+ GVTG RT V +RVQ L+A+++
Subjt:  YYNPILKRGVENFMMIIKDTGVRGLVVPDVPLEETEVLRKEAVKHNIELVLLTTPTTPKERMKNIVEASEGFVYLVSSIGVTGTRTSVSSRVQTLLAEVK

Query:  EVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAEWGADGIIIGSAMVKLLGEAQSPVEGLKELENFTKSLKSAL
        +VT+KP+ VGFGIS+ EH +QV +WGAD  I+GSA V  L E  SP +GL  +  F +SLKS+L
Subjt:  EVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAEWGADGIIIGSAMVKLLGEAQSPVEGLKELENFTKSLKSAL

O22765 Tryptophan synthase alpha chain3.6e-11880.99Show/hide
Query:  VGLSETFKNLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSKCGSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAAATRSLARETNFNAIISMLKGVIPELSCPISLFTY
        VGLSETF  L+ QGKVALIPYITAGDPDLSTTA+ALKVL  CGSDIIELGVPYSDPLADGP IQAAA RSL + TNFN+IISMLK VIP+LSCPI+LFTY
Subjt:  VGLSETFKNLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSKCGSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAAATRSLARETNFNAIISMLKGVIPELSCPISLFTY

Query:  YNPILKRGVENFMMIIKDTGVRGLVVPDVPLEETEVLRKEAVKHNIELVLLTTPTTPKERMKNIVEASEGFVYLVSSIGVTGTRTSVSSRVQTLLAEVKE
        YNPIL+RGVEN+M +IK+ GV GL+VPDVPLEETE LR EA KH IELVLLTTPTTPKERM  IVEASEGF+YLVSS+GVTGTR SV+ +VQ+LL ++KE
Subjt:  YNPILKRGVENFMMIIKDTGVRGLVVPDVPLEETEVLRKEAVKHNIELVLLTTPTTPKERMKNIVEASEGFVYLVSSIGVTGTRTSVSSRVQTLLAEVKE

Query:  VTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAEWGADGIIIGSAMVKLLGEAQSPVEGLKELENFTKSLKSAL
         T KPVAVGFGISKPEHVKQVAEWGADG+I+GSAMVK+LGE++SP +GLKELE FTKSLKSAL
Subjt:  VTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAEWGADGIIIGSAMVKLLGEAQSPVEGLKELENFTKSLKSAL

P42390 Indole-3-glycerol phosphate lyase, chloroplastic1.5e-8456.06Show/hide
Query:  SPRPCKISVSQSKRFAPMAALAAYPVVGLSETFKNLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSKCGSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAAATRSLARE
        +P P  +   Q+   A  A   + PV   S+T   L  +GK A IPYITAGDPDL+TTAEAL++L  CG+D+IELGVP SDP  DGP+IQA+  R+LA  
Subjt:  SPRPCKISVSQSKRFAPMAALAAYPVVGLSETFKNLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSKCGSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAAATRSLARE

Query:  TNFNAIISMLKGVIPELSCPISLFTYYNPILKRGVENFMMIIKDTGVRGLVVPDVPLEETEVLRKEAVKHNIELVLLTTPTTPKERMKNIVEASEGFVYL
        T  +A++ ML+ V PELSCP+ L +YY PI+ R +      +K+ GV GL+VPD+P      L  EA  +N+ELVLLTTP  P++RMK I +ASEGFVYL
Subjt:  TNFNAIISMLKGVIPELSCPISLFTYYNPILKRGVENFMMIIKDTGVRGLVVPDVPLEETEVLRKEAVKHNIELVLLTTPTTPKERMKNIVEASEGFVYL

Query:  VSSIGVTGTRTSVSSRVQTLLAEVKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAEWGADGIIIGSAMVKLLGEAQSPVEGLKELENFTKSLKSAL
        VS  GVTG R +V+ RV++L+ EVK+VT KPVAVGFGISKPEHVKQ+A+WGADG+IIGSAMV+ LGEA SP +GL+ LE + + +K+AL
Subjt:  VSSIGVTGTRTSVSSRVQTLLAEVKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAEWGADGIIIGSAMVKLLGEAQSPVEGLKELENFTKSLKSAL

Q10W95 Tryptophan synthase alpha chain7.9e-8157.52Show/hide
Query:  VVGLSETFKNLR-EQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSKCGSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAAATRSLARETNFNAIISMLKGVIPELSCPISLF
        ++ +S+ F++LR    + ALIP+ITAGDPDL TTA+AL+VL + G+++IELGVPYSDPLADGPVIQAAATRSL R T   +++ +++ V P+L  PI LF
Subjt:  VVGLSETFKNLR-EQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSKCGSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAAATRSLARETNFNAIISMLKGVIPELSCPISLF

Query:  TYYNPILKRGVENFMMIIKDTGVRGLVVPDVPLEETEVLRKEAVKHNIELVLLTTPTTPKERMKNIVEASEGFVYLVSSIGVTGTRTSVSSRVQTLLAEV
        TYYNPIL RGVENF+  I D G RGLVVPD+PLEE ++L + A    IEL LL  PT+PKER+K I   S+GF+YLVS  GVTG R  + +RV+ LLA++
Subjt:  TYYNPILKRGVENFMMIIKDTGVRGLVVPDVPLEETEVLRKEAVKHNIELVLLTTPTTPKERMKNIVEASEGFVYLVSSIGVTGTRTSVSSRVQTLLAEV

Query:  KEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAEWGADGIIIGSAMVKLLGEAQSPVEGLKELENFTKSLKSALS
        +EVT+KP+ VGFGIS+PE   QV +WG+D +I+GSA+VK L E  SP EGLK +  F ++LK+A++
Subjt:  KEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAEWGADGIIIGSAMVKLLGEAQSPVEGLKELENFTKSLKSALS

Q42529 Tryptophan synthase alpha chain, chloroplastic6.9e-11770.83Show/hide
Query:  MDIAFKSSRILPLNKIPNTLIFSPRPCKISVSQSKRFAPMAALA-AYPVVGLSETFKNLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSKCGSDIIELGV
        M IAFKS  +  L    + + F       S    KRF PMA+L+ + P +GL++TF  L++QGKVA IPYITAGDPDLSTTAEALKVL  CGSDIIELGV
Subjt:  MDIAFKSSRILPLNKIPNTLIFSPRPCKISVSQSKRFAPMAALA-AYPVVGLSETFKNLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSKCGSDIIELGV

Query:  PYSDPLADGPVIQAAATRSLARETNFNAIISMLKGVIPELSCPISLFTYYNPILKRGVENFMMIIKDTGVRGLVVPDVPLEETEVLRKEAVKHNIELVLL
        PYSDPLADGPVIQAAATRSL R TN ++I+ ML  V+P++SCPISLFTYYNPILKRG+  FM  I+  GV+GLVVPDVPLEETE+LRKEA+ ++IELVLL
Subjt:  PYSDPLADGPVIQAAATRSLARETNFNAIISMLKGVIPELSCPISLFTYYNPILKRGVENFMMIIKDTGVRGLVVPDVPLEETEVLRKEAVKHNIELVLL

Query:  TTPTTPKERMKNIVEASEGFVYLVSSIGVTGTRTSVSSRVQTLLAEVKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAEWGADGIIIGSAMVKLLGEAQSPVEGLKE
        TTPTTP ERMK IV+ASEGF+YLVSSIGVTG R+SVS +VQ+LL ++KE T+KPVAVGFGISKPEHVKQ+A WGADG+I+GSAMVKLLG+A+SP EGLKE
Subjt:  TTPTTPKERMKNIVEASEGFVYLVSSIGVTGTRTSVSSRVQTLLAEVKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAEWGADGIIIGSAMVKLLGEAQSPVEGLKE

Query:  LENFTKSLKSAL
        LE  TKSLKSAL
Subjt:  LENFTKSLKSAL

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G54640.1 tryptophan synthase alpha chain4.9e-11870.83Show/hide
Query:  MDIAFKSSRILPLNKIPNTLIFSPRPCKISVSQSKRFAPMAALA-AYPVVGLSETFKNLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSKCGSDIIELGV
        M IAFKS  +  L    + + F       S    KRF PMA+L+ + P +GL++TF  L++QGKVA IPYITAGDPDLSTTAEALKVL  CGSDIIELGV
Subjt:  MDIAFKSSRILPLNKIPNTLIFSPRPCKISVSQSKRFAPMAALA-AYPVVGLSETFKNLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSKCGSDIIELGV

Query:  PYSDPLADGPVIQAAATRSLARETNFNAIISMLKGVIPELSCPISLFTYYNPILKRGVENFMMIIKDTGVRGLVVPDVPLEETEVLRKEAVKHNIELVLL
        PYSDPLADGPVIQAAATRSL R TN ++I+ ML  V+P++SCPISLFTYYNPILKRG+  FM  I+  GV+GLVVPDVPLEETE+LRKEA+ ++IELVLL
Subjt:  PYSDPLADGPVIQAAATRSLARETNFNAIISMLKGVIPELSCPISLFTYYNPILKRGVENFMMIIKDTGVRGLVVPDVPLEETEVLRKEAVKHNIELVLL

Query:  TTPTTPKERMKNIVEASEGFVYLVSSIGVTGTRTSVSSRVQTLLAEVKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAEWGADGIIIGSAMVKLLGEAQSPVEGLKE
        TTPTTP ERMK IV+ASEGF+YLVSSIGVTG R+SVS +VQ+LL ++KE T+KPVAVGFGISKPEHVKQ+A WGADG+I+GSAMVKLLG+A+SP EGLKE
Subjt:  TTPTTPKERMKNIVEASEGFVYLVSSIGVTGTRTSVSSRVQTLLAEVKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAEWGADGIIIGSAMVKLLGEAQSPVEGLKE

Query:  LENFTKSLKSAL
        LE  TKSLKSAL
Subjt:  LENFTKSLKSAL

AT4G02610.1 Aldolase-type TIM barrel family protein2.6e-11980.99Show/hide
Query:  VGLSETFKNLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSKCGSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAAATRSLARETNFNAIISMLKGVIPELSCPISLFTY
        VGLSETF  L+ QGKVALIPYITAGDPDLSTTA+ALKVL  CGSDIIELGVPYSDPLADGP IQAAA RSL + TNFN+IISMLK VIP+LSCPI+LFTY
Subjt:  VGLSETFKNLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSKCGSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAAATRSLARETNFNAIISMLKGVIPELSCPISLFTY

Query:  YNPILKRGVENFMMIIKDTGVRGLVVPDVPLEETEVLRKEAVKHNIELVLLTTPTTPKERMKNIVEASEGFVYLVSSIGVTGTRTSVSSRVQTLLAEVKE
        YNPIL+RGVEN+M +IK+ GV GL+VPDVPLEETE LR EA KH IELVLLTTPTTPKERM  IVEASEGF+YLVSS+GVTGTR SV+ +VQ+LL ++KE
Subjt:  YNPILKRGVENFMMIIKDTGVRGLVVPDVPLEETEVLRKEAVKHNIELVLLTTPTTPKERMKNIVEASEGFVYLVSSIGVTGTRTSVSSRVQTLLAEVKE

Query:  VTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAEWGADGIIIGSAMVKLLGEAQSPVEGLKELENFTKSLKSAL
         T KPVAVGFGISKPEHVKQVAEWGADG+I+GSAMVK+LGE++SP +GLKELE FTKSLKSAL
Subjt:  VTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAEWGADGIIIGSAMVKLLGEAQSPVEGLKELENFTKSLKSAL


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGATATTGCTTTCAAATCTTCGAGGATTCTTCCCCTTAACAAGATACCCAATACCCTCATCTTTTCTCCACGTCCTTGTAAGATTTCAGTTTCCCAGTCCAAGCGGTT
TGCTCCAATGGCTGCTCTTGCAGCCTACCCTGTTGTTGGACTGTCCGAAACATTTAAAAACTTGAGAGAACAAGGCAAGGTTGCATTGATCCCCTACATCACGGCTGGTG
ATCCTGATCTTTCGACCACGGCTGAGGCATTGAAAGTGCTTTCCAAATGTGGATCAGATATAATTGAACTTGGTGTTCCATATTCGGATCCCTTGGCAGATGGTCCTGTT
ATACAGGCTGCAGCCACTCGGTCCTTGGCTAGAGAGACAAACTTCAATGCAATCATTTCTATGCTGAAGGGGGTGATTCCTGAACTATCTTGTCCAATTTCCCTTTTTAC
ATATTACAACCCAATTCTTAAACGTGGCGTCGAGAACTTCATGATGATAATAAAAGATACAGGTGTACGAGGGCTTGTTGTTCCAGATGTTCCTCTTGAGGAGACTGAAG
TTTTGAGAAAAGAAGCAGTAAAGCACAATATCGAACTGGTACTCTTAACTACACCAACCACGCCAAAAGAGAGGATGAAAAACATCGTTGAAGCTTCAGAGGGATTTGTT
TATCTTGTGAGCTCCATTGGAGTTACCGGTACTCGGACATCCGTTAGTAGCAGAGTTCAAACTCTTCTTGCGGAAGTTAAAGAGGTTACGGAAAAACCAGTAGCAGTTGG
TTTTGGTATATCGAAACCCGAGCACGTGAAGCAGGTGGCTGAGTGGGGGGCAGATGGTATTATTATCGGTAGTGCTATGGTGAAGCTGTTAGGTGAAGCCCAATCCCCTG
TGGAAGGATTGAAGGAGCTTGAAAACTTCACCAAATCCTTAAAATCTGCACTCTCTTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGATATTGCTTTCAAATCTTCGAGGATTCTTCCCCTTAACAAGATACCCAATACCCTCATCTTTTCTCCACGTCCTTGTAAGATTTCAGTTTCCCAGTCCAAGCGGTT
TGCTCCAATGGCTGCTCTTGCAGCCTACCCTGTTGTTGGACTGTCCGAAACATTTAAAAACTTGAGAGAACAAGGCAAGGTTGCATTGATCCCCTACATCACGGCTGGTG
ATCCTGATCTTTCGACCACGGCTGAGGCATTGAAAGTGCTTTCCAAATGTGGATCAGATATAATTGAACTTGGTGTTCCATATTCGGATCCCTTGGCAGATGGTCCTGTT
ATACAGGCTGCAGCCACTCGGTCCTTGGCTAGAGAGACAAACTTCAATGCAATCATTTCTATGCTGAAGGGGGTGATTCCTGAACTATCTTGTCCAATTTCCCTTTTTAC
ATATTACAACCCAATTCTTAAACGTGGCGTCGAGAACTTCATGATGATAATAAAAGATACAGGTGTACGAGGGCTTGTTGTTCCAGATGTTCCTCTTGAGGAGACTGAAG
TTTTGAGAAAAGAAGCAGTAAAGCACAATATCGAACTGGTACTCTTAACTACACCAACCACGCCAAAAGAGAGGATGAAAAACATCGTTGAAGCTTCAGAGGGATTTGTT
TATCTTGTGAGCTCCATTGGAGTTACCGGTACTCGGACATCCGTTAGTAGCAGAGTTCAAACTCTTCTTGCGGAAGTTAAAGAGGTTACGGAAAAACCAGTAGCAGTTGG
TTTTGGTATATCGAAACCCGAGCACGTGAAGCAGGTGGCTGAGTGGGGGGCAGATGGTATTATTATCGGTAGTGCTATGGTGAAGCTGTTAGGTGAAGCCCAATCCCCTG
TGGAAGGATTGAAGGAGCTTGAAAACTTCACCAAATCCTTAAAATCTGCACTCTCTTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MDIAFKSSRILPLNKIPNTLIFSPRPCKISVSQSKRFAPMAALAAYPVVGLSETFKNLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSKCGSDIIELGVPYSDPLADGPV
IQAAATRSLARETNFNAIISMLKGVIPELSCPISLFTYYNPILKRGVENFMMIIKDTGVRGLVVPDVPLEETEVLRKEAVKHNIELVLLTTPTTPKERMKNIVEASEGFV
YLVSSIGVTGTRTSVSSRVQTLLAEVKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAEWGADGIIIGSAMVKLLGEAQSPVEGLKELENFTKSLKSALS