; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Chy4G081490 (gene) of Cucumber (hystrix) v1 genome

Gene IDChy4G081490
OrganismCucumis hystrix (Cucumber (hystrix) v1)
DescriptionLOB domain-containing protein
Genome locationchrH04:20958581..20959551
RNA-Seq ExpressionChy4G081490
SyntenyChy4G081490
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR004883 - Lateral organ boundaries, LOB


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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XP_008443563.1 PREDICTED: LOB domain-containing protein 25-like [Cucumis melo]9.96e-12498.87Show/hide
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XP_011652293.1 LOB domain-containing protein 25 isoform X2 [Cucumis sativus]3.48e-12499.44Show/hide
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XP_022152200.1 LOB domain-containing protein 25-like [Momordica charantia]2.10e-11594.48Show/hide
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XP_038905774.1 LOB domain-containing protein 25-like [Benincasa hispida]1.39e-12297.75Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LI15 LOB domain-containing protein1.1e-9694.3Show/hide
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A0A1S3B938 LOB domain-containing protein 25-like3.6e-9598.87Show/hide
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A0A5D3BPW0 LOB domain-containing protein 25-like3.6e-9598.87Show/hide
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A0A6J1DD95 LOB domain-containing protein 25-like5.0e-8994.48Show/hide
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A0A6J1FAW3 LOB domain-containing protein 25-like1.1e-8892.66Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
A2WXT0 LOB domain-containing protein 67.1e-4063.64Show/hide
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          +L +Y  +   A + S+S+
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O04479 Protein ASYMMETRIC LEAVES 22.6e-4265.85Show/hide
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        L    ++L +Y    I A +  S
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Q8L8Q3 LOB domain-containing protein 251.8e-5184.68Show/hide
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        + TNADL+RYA
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Q8LQH4 LOB domain-containing protein 67.1e-4063.64Show/hide
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Q9FML4 Protein LATERAL ORGAN BOUNDARIES1.9e-4859.14Show/hide
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        ELDA NADL  Y  S   A            P P  S Q    +      G+S + +       G Y T   F PW+N ++   G+
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G27650.1 LOB domain-containing protein 251.3e-5284.68Show/hide
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Query:  DATNADLIRYA
        + TNADL+RYA
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AT5G63090.1 Lateral organ boundaries (LOB) domain family protein1.3e-4959.14Show/hide
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        ELDA NADL  Y  S   A            P P  S Q    +      G+S + +       G Y T   F PW+N ++   G+
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AT5G63090.2 Lateral organ boundaries (LOB) domain family protein1.3e-4959.14Show/hide
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        SSS   NSPCAACKFLRRKC+P C+FAPYFPPEEP KFANVHKIFGASNV+KLLNE+ PHQREDAVNSLAYEAEAR++DPVYGCVGAIS LQRQV +LQK
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Query:  ELDATNADLIRYACSEIPA------------PSPSSSSQYARRSSSTSHEGSSSISSY------GHYYTGLYFSPWSNNNNGPCGD
        ELDA NADL  Y  S   A            P P  S Q    +      G+S + +       G Y T   F PW+N ++   G+
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AT5G63090.3 Lateral organ boundaries (LOB) domain family protein1.3e-4959.14Show/hide
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        SSS   NSPCAACKFLRRKC+P C+FAPYFPPEEP KFANVHKIFGASNV+KLLNE+ PHQREDAVNSLAYEAEAR++DPVYGCVGAIS LQRQV +LQK
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        ELDA NADL  Y  S   A            P P  S Q    +      G+S + +       G Y T   F PW+N ++   G+
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AT5G63090.4 Lateral organ boundaries (LOB) domain family protein1.3e-4959.14Show/hide
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Query:  ELDATNADLIRYACSEIPA------------PSPSSSSQYARRSSSTSHEGSSSISSY------GHYYTGLYFSPWSNNNNGPCGD
        ELDA NADL  Y  S   A            P P  S Q    +      G+S + +       G Y T   F PW+N ++   G+
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGTAAGAAAGACGGCTCTGACAGACCCAAAAGAAAGGAAGATGTCTTCTTCCACCTACTCTAATTCTCCTTGTGCAGCCTGCAAGTTCCTACGTCGAAAATGCCTACC
AGATTGTGTTTTTGCGCCATATTTTCCGCCCGAAGAGCCTCAAAAGTTTGCCAATGTTCACAAGATCTTTGGTGCCAGTAATGTCAGCAAACTGTTGAATGAAGTCCAGC
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GCCATGACAAAGGAGAATACAAGTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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CGCATCAGCGGGAGGATGCTGTGAACTCGCTCGCCTACGAGGCCGAGGCAAGGATGAAAGACCCTGTGTATGGCTGCGTTGGCGCCATCTCTATACTCCAAAGGCAAGTC
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GCCATGACAAAGGAGAATACAAGTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MVRKTALTDPKERKMSSSTYSNSPCAACKFLRRKCLPDCVFAPYFPPEEPQKFANVHKIFGASNVSKLLNEVQPHQREDAVNSLAYEAEARMKDPVYGCVGAISILQRQV
IKLQKELDATNADLIRYACSEIPAPSPSSSSQYARRSSSTSHEGSSSISSYGHYYTGLYFSPWSNNNNGPCGDGHDKGEYK