CuGenDBv2

Gene ID	Chy4G084130
Organism	Cucumis hystrix (Cucumber (hystrix) v1)
Description	40S ribosomal protein s2
Genome location	chrH04:23373503..23375062
RNA-Seq Expression	Chy4G084130
Synteny	Chy4G084130
Gene Ontology terms	GO:0006412 - translation (biological process) GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component) GO:0022627 - cytosolic small ribosomal subunit (cellular component) GO:0003729 - mRNA binding (molecular function) GO:0003735 - structural constituent of ribosome (molecular function)
InterPro domains	IPR000851 - Ribosomal protein S5 IPR005324 - Ribosomal protein S5, C-terminal IPR005711 - Ribosomal protein S5, eukaryotic/archaeal IPR013810 - Ribosomal protein S5, N-terminal IPR014721 - Ribosomal protein S5 domain 2-type fold, subgroup IPR018192 - Ribosomal protein S5, N-terminal, conserved site IPR020568 - Ribosomal protein S5 domain 2-type fold

Homology

Show/hide homology

GenBank top hits

e value

%identity

Alignment

XP_008443195.1 PREDICTED: 40S ribosomal protein S2-3-like [Cucumis melo]

1.61e-128

100

Show/hide

Query:  MKIMPVQKQTRAGQRTRFKAFVVVGDGNGHVGLGVKCSKEVATAIRGSIILAKLSVIPVRRGYWGNKIGKPHTVPCKVTGKCGSVTVRMVPAPRGAGIVA
        MKIMPVQKQTRAGQRTRFKAFVVVGDGNGHVGLGVKCSKEVATAIRGSIILAKLSVIPVRRGYWGNKIGKPHTVPCKVTGKCGSVTVRMVPAPRGAGIVA
Subjt:  MKIMPVQKQTRAGQRTRFKAFVVVGDGNGHVGLGVKCSKEVATAIRGSIILAKLSVIPVRRGYWGNKIGKPHTVPCKVTGKCGSVTVRMVPAPRGAGIVA

Query:  ARVPKKVLQFAGIEDVFTSSRGSTKTLGNFVKATFDCLLKTYGFLTPEFWRETRFTKSPFQEHTDLLAKPTVKALLLEDPDRVTA
        ARVPKKVLQFAGIEDVFTSSRGSTKTLGNFVKATFDCLLKTYGFLTPEFWRETRFTKSPFQEHTDLLAKPTVKALLLEDPDRVTA
Subjt:  ARVPKKVLQFAGIEDVFTSSRGSTKTLGNFVKATFDCLLKTYGFLTPEFWRETRFTKSPFQEHTDLLAKPTVKALLLEDPDRVTA

XP_011652156.1 40S ribosomal protein S2-4 [Cucumis sativus]

4.61e-128

99.46

Show/hide

Query:  MKIMPVQKQTRAGQRTRFKAFVVVGDGNGHVGLGVKCSKEVATAIRGSIILAKLSVIPVRRGYWGNKIGKPHTVPCKVTGKCGSVTVRMVPAPRGAGIVA
        MKIMPVQKQTRAGQRTRFKAFVVVGDGNGHVGLGVKCSKEVATAIRGSIILAKLSVIPVRRGYWGNKIGKPHTVPCKVTGKCGSVTVRMVPAPRGAGIVA
Subjt:  MKIMPVQKQTRAGQRTRFKAFVVVGDGNGHVGLGVKCSKEVATAIRGSIILAKLSVIPVRRGYWGNKIGKPHTVPCKVTGKCGSVTVRMVPAPRGAGIVA

Query:  ARVPKKVLQFAGIEDVFTSSRGSTKTLGNFVKATFDCLLKTYGFLTPEFWRETRFTKSPFQEHTDLLAKPTVKALLLEDPDRVTA
        ARVPKKVLQFAGIEDVFTSSRGSTKTLGNFVKATFDCLL+TYGFLTPEFWRETRFTKSPFQEHTDLLAKPTVKALLLEDPDRVTA
Subjt:  ARVPKKVLQFAGIEDVFTSSRGSTKTLGNFVKATFDCLLKTYGFLTPEFWRETRFTKSPFQEHTDLLAKPTVKALLLEDPDRVTA

XP_022935112.1 40S ribosomal protein S2-4-like [Cucurbita moschata]

7.63e-127

98.38

Show/hide

Query:  MKIMPVQKQTRAGQRTRFKAFVVVGDGNGHVGLGVKCSKEVATAIRGSIILAKLSVIPVRRGYWGNKIGKPHTVPCKVTGKCGSVTVRMVPAPRGAGIVA
        MKIMPVQKQTRAGQRTRFKAFVVVGDGNGHVGLGVKCSKEVATAIRGSIILAKLSVIPVRRGYWGNKIGKPHTVPCKVTGKCGSVTV+MVPAPRGAGIVA
Subjt:  MKIMPVQKQTRAGQRTRFKAFVVVGDGNGHVGLGVKCSKEVATAIRGSIILAKLSVIPVRRGYWGNKIGKPHTVPCKVTGKCGSVTVRMVPAPRGAGIVA

Query:  ARVPKKVLQFAGIEDVFTSSRGSTKTLGNFVKATFDCLLKTYGFLTPEFWRETRFTKSPFQEHTDLLAKPTVKALLLEDPDRVTA
        ARVPKKVLQFAGIEDVFTSSRGSTKTLGNFVKATFDCLLKTYGFLTPEFWRETRFTKSPFQEHTDLLAKPTVKALLLEDPD+V+A
Subjt:  ARVPKKVLQFAGIEDVFTSSRGSTKTLGNFVKATFDCLLKTYGFLTPEFWRETRFTKSPFQEHTDLLAKPTVKALLLEDPDRVTA

XP_023522607.1 40S ribosomal protein S2-4-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]

3.78e-127

98.92

Show/hide

Query:  MKIMPVQKQTRAGQRTRFKAFVVVGDGNGHVGLGVKCSKEVATAIRGSIILAKLSVIPVRRGYWGNKIGKPHTVPCKVTGKCGSVTVRMVPAPRGAGIVA
        MKIMPVQKQTRAGQRTRFKAFVVVGDGNGHVGLGVKCSKEVATAIRGSIILAKLSVIPVRRGYWGNKIGKPHTVPCKVTGKCGSVTVRMVPAPRGAGIVA
Subjt:  MKIMPVQKQTRAGQRTRFKAFVVVGDGNGHVGLGVKCSKEVATAIRGSIILAKLSVIPVRRGYWGNKIGKPHTVPCKVTGKCGSVTVRMVPAPRGAGIVA

Query:  ARVPKKVLQFAGIEDVFTSSRGSTKTLGNFVKATFDCLLKTYGFLTPEFWRETRFTKSPFQEHTDLLAKPTVKALLLEDPDRVTA
        ARVPKKVLQFAGIEDVFTSSRGSTKTLGNFVKATFDCLLKTYGFLTPEFWRETRFTKSPFQEHTDLLAKPTVKALLLEDPD+V A
Subjt:  ARVPKKVLQFAGIEDVFTSSRGSTKTLGNFVKATFDCLLKTYGFLTPEFWRETRFTKSPFQEHTDLLAKPTVKALLLEDPDRVTA

XP_038906344.1 40S ribosomal protein S2-4-like [Benincasa hispida]

1.61e-128

100

Show/hide

Query:  MKIMPVQKQTRAGQRTRFKAFVVVGDGNGHVGLGVKCSKEVATAIRGSIILAKLSVIPVRRGYWGNKIGKPHTVPCKVTGKCGSVTVRMVPAPRGAGIVA
        MKIMPVQKQTRAGQRTRFKAFVVVGDGNGHVGLGVKCSKEVATAIRGSIILAKLSVIPVRRGYWGNKIGKPHTVPCKVTGKCGSVTVRMVPAPRGAGIVA
Subjt:  MKIMPVQKQTRAGQRTRFKAFVVVGDGNGHVGLGVKCSKEVATAIRGSIILAKLSVIPVRRGYWGNKIGKPHTVPCKVTGKCGSVTVRMVPAPRGAGIVA

Query:  ARVPKKVLQFAGIEDVFTSSRGSTKTLGNFVKATFDCLLKTYGFLTPEFWRETRFTKSPFQEHTDLLAKPTVKALLLEDPDRVTA
        ARVPKKVLQFAGIEDVFTSSRGSTKTLGNFVKATFDCLLKTYGFLTPEFWRETRFTKSPFQEHTDLLAKPTVKALLLEDPDRVTA
Subjt:  ARVPKKVLQFAGIEDVFTSSRGSTKTLGNFVKATFDCLLKTYGFLTPEFWRETRFTKSPFQEHTDLLAKPTVKALLLEDPDRVTA

TrEMBL top hits

e value

%identity

Alignment

A0A0A0LFC7 S5 DRBM domain-containing protein

6.1e-100

99.46

Show/hide

Query:  MKIMPVQKQTRAGQRTRFKAFVVVGDGNGHVGLGVKCSKEVATAIRGSIILAKLSVIPVRRGYWGNKIGKPHTVPCKVTGKCGSVTVRMVPAPRGAGIVA
        MKIMPVQKQTRAGQRTRFKAFVVVGDGNGHVGLGVKCSKEVATAIRGSIILAKLSVIPVRRGYWGNKIGKPHTVPCKVTGKCGSVTVRMVPAPRGAGIVA
Subjt:  MKIMPVQKQTRAGQRTRFKAFVVVGDGNGHVGLGVKCSKEVATAIRGSIILAKLSVIPVRRGYWGNKIGKPHTVPCKVTGKCGSVTVRMVPAPRGAGIVA

Query:  ARVPKKVLQFAGIEDVFTSSRGSTKTLGNFVKATFDCLLKTYGFLTPEFWRETRFTKSPFQEHTDLLAKPTVKALLLEDPDRVTA
        ARVPKKVLQFAGIEDVFTSSRGSTKTLGNFVKATFDCLL+TYGFLTPEFWRETRFTKSPFQEHTDLLAKPTVKALLLEDPDRVTA
Subjt:  ARVPKKVLQFAGIEDVFTSSRGSTKTLGNFVKATFDCLLKTYGFLTPEFWRETRFTKSPFQEHTDLLAKPTVKALLLEDPDRVTA

A0A1S3B7F9 40S ribosomal protein S2-3-like

2.8e-100

100

Show/hide

Query:  MKIMPVQKQTRAGQRTRFKAFVVVGDGNGHVGLGVKCSKEVATAIRGSIILAKLSVIPVRRGYWGNKIGKPHTVPCKVTGKCGSVTVRMVPAPRGAGIVA
        MKIMPVQKQTRAGQRTRFKAFVVVGDGNGHVGLGVKCSKEVATAIRGSIILAKLSVIPVRRGYWGNKIGKPHTVPCKVTGKCGSVTVRMVPAPRGAGIVA
Subjt:  MKIMPVQKQTRAGQRTRFKAFVVVGDGNGHVGLGVKCSKEVATAIRGSIILAKLSVIPVRRGYWGNKIGKPHTVPCKVTGKCGSVTVRMVPAPRGAGIVA

Query:  ARVPKKVLQFAGIEDVFTSSRGSTKTLGNFVKATFDCLLKTYGFLTPEFWRETRFTKSPFQEHTDLLAKPTVKALLLEDPDRVTA
        ARVPKKVLQFAGIEDVFTSSRGSTKTLGNFVKATFDCLLKTYGFLTPEFWRETRFTKSPFQEHTDLLAKPTVKALLLEDPDRVTA
Subjt:  ARVPKKVLQFAGIEDVFTSSRGSTKTLGNFVKATFDCLLKTYGFLTPEFWRETRFTKSPFQEHTDLLAKPTVKALLLEDPDRVTA

A0A5D3DPL0 40S ribosomal protein S2-3-like

2.8e-100

100

Show/hide

Query:  MKIMPVQKQTRAGQRTRFKAFVVVGDGNGHVGLGVKCSKEVATAIRGSIILAKLSVIPVRRGYWGNKIGKPHTVPCKVTGKCGSVTVRMVPAPRGAGIVA
        MKIMPVQKQTRAGQRTRFKAFVVVGDGNGHVGLGVKCSKEVATAIRGSIILAKLSVIPVRRGYWGNKIGKPHTVPCKVTGKCGSVTVRMVPAPRGAGIVA
Subjt:  MKIMPVQKQTRAGQRTRFKAFVVVGDGNGHVGLGVKCSKEVATAIRGSIILAKLSVIPVRRGYWGNKIGKPHTVPCKVTGKCGSVTVRMVPAPRGAGIVA

Query:  ARVPKKVLQFAGIEDVFTSSRGSTKTLGNFVKATFDCLLKTYGFLTPEFWRETRFTKSPFQEHTDLLAKPTVKALLLEDPDRVTA
        ARVPKKVLQFAGIEDVFTSSRGSTKTLGNFVKATFDCLLKTYGFLTPEFWRETRFTKSPFQEHTDLLAKPTVKALLLEDPDRVTA
Subjt:  ARVPKKVLQFAGIEDVFTSSRGSTKTLGNFVKATFDCLLKTYGFLTPEFWRETRFTKSPFQEHTDLLAKPTVKALLLEDPDRVTA

A0A6J1F4N7 40S ribosomal protein S2-4-like

5.2e-99

98.38

Show/hide

Query:  MKIMPVQKQTRAGQRTRFKAFVVVGDGNGHVGLGVKCSKEVATAIRGSIILAKLSVIPVRRGYWGNKIGKPHTVPCKVTGKCGSVTVRMVPAPRGAGIVA
        MKIMPVQKQTRAGQRTRFKAFVVVGDGNGHVGLGVKCSKEVATAIRGSIILAKLSVIPVRRGYWGNKIGKPHTVPCKVTGKCGSVTV+MVPAPRGAGIVA
Subjt:  MKIMPVQKQTRAGQRTRFKAFVVVGDGNGHVGLGVKCSKEVATAIRGSIILAKLSVIPVRRGYWGNKIGKPHTVPCKVTGKCGSVTVRMVPAPRGAGIVA

Query:  ARVPKKVLQFAGIEDVFTSSRGSTKTLGNFVKATFDCLLKTYGFLTPEFWRETRFTKSPFQEHTDLLAKPTVKALLLEDPDRVTA
        ARVPKKVLQFAGIEDVFTSSRGSTKTLGNFVKATFDCLLKTYGFLTPEFWRETRFTKSPFQEHTDLLAKPTVKALLLEDPD+V+A
Subjt:  ARVPKKVLQFAGIEDVFTSSRGSTKTLGNFVKATFDCLLKTYGFLTPEFWRETRFTKSPFQEHTDLLAKPTVKALLLEDPDRVTA

E5GBY7 40S ribosomal protein s2

2.8e-100

100

Show/hide

Query:  MKIMPVQKQTRAGQRTRFKAFVVVGDGNGHVGLGVKCSKEVATAIRGSIILAKLSVIPVRRGYWGNKIGKPHTVPCKVTGKCGSVTVRMVPAPRGAGIVA
        MKIMPVQKQTRAGQRTRFKAFVVVGDGNGHVGLGVKCSKEVATAIRGSIILAKLSVIPVRRGYWGNKIGKPHTVPCKVTGKCGSVTVRMVPAPRGAGIVA
Subjt:  MKIMPVQKQTRAGQRTRFKAFVVVGDGNGHVGLGVKCSKEVATAIRGSIILAKLSVIPVRRGYWGNKIGKPHTVPCKVTGKCGSVTVRMVPAPRGAGIVA

Query:  ARVPKKVLQFAGIEDVFTSSRGSTKTLGNFVKATFDCLLKTYGFLTPEFWRETRFTKSPFQEHTDLLAKPTVKALLLEDPDRVTA
        ARVPKKVLQFAGIEDVFTSSRGSTKTLGNFVKATFDCLLKTYGFLTPEFWRETRFTKSPFQEHTDLLAKPTVKALLLEDPDRVTA
Subjt:  ARVPKKVLQFAGIEDVFTSSRGSTKTLGNFVKATFDCLLKTYGFLTPEFWRETRFTKSPFQEHTDLLAKPTVKALLLEDPDRVTA

SwissProt top hits

e value

%identity

Alignment

P49688 40S ribosomal protein S2-3

1.9e-90

89.62

Show/hide

Query:  MKIMPVQKQTRAGQRTRFKAFVVVGDGNGHVGLGVKCSKEVATAIRGSIILAKLSVIPVRRGYWGNKIGKPHTVPCKVTGKCGSVTVRMVPAPRGAGIVA
        MKIMPVQKQTRAGQRTRFKAFVVVGDGNGHVGLGVKCSKEVATAIRG+IILAKLSV+PVRRGYWGNKIGKPHTVPCKVTGKCGSVTVRMVPAPRG+GIVA
Subjt:  MKIMPVQKQTRAGQRTRFKAFVVVGDGNGHVGLGVKCSKEVATAIRGSIILAKLSVIPVRRGYWGNKIGKPHTVPCKVTGKCGSVTVRMVPAPRGAGIVA

Query:  ARVPKKVLQFAGIEDVFTSSRGSTKTLGNFVKATFDCLLKTYGFLTPEFWRETRFTKSPFQEHTDLLAKPTVKALLLEDPDRV
        ARVPKKVLQFAGI+DVFTSSRGSTKTLGNFVKATFDCL KTYGFLTPEFW+ETRF++SP+QEHTD LA    KAL    PD V
Subjt:  ARVPKKVLQFAGIEDVFTSSRGSTKTLGNFVKATFDCLLKTYGFLTPEFWRETRFTKSPFQEHTDLLAKPTVKALLLEDPDRV

Q8L8Y0 40S ribosomal protein S2-1

1.6e-89

91.38

Show/hide

Query:  MKIMPVQKQTRAGQRTRFKAFVVVGDGNGHVGLGVKCSKEVATAIRGSIILAKLSVIPVRRGYWGNKIGKPHTVPCKVTGKCGSVTVRMVPAPRGAGIVA
        MKIMPVQKQTRAGQRTRFKAFVVVGDGNGHVGLGVKCSKEVATAIRG+IILAKLSV+PVRRGYWGNKIGKPHTVPCKVTGKCGSVTVRMVPAPRG+GIVA
Subjt:  MKIMPVQKQTRAGQRTRFKAFVVVGDGNGHVGLGVKCSKEVATAIRGSIILAKLSVIPVRRGYWGNKIGKPHTVPCKVTGKCGSVTVRMVPAPRGAGIVA

Query:  ARVPKKVLQFAGIEDVFTSSRGSTKTLGNFVKATFDCLLKTYGFLTPEFWRETRFTKSPFQEHTDLLAKPTVKA
        ARVPKKVLQFAGI+DVFTSSRGSTKTLGNFVKATFDCL KTYGFLTPEFW+ETRF++SP+QEHTD L+   V A
Subjt:  ARVPKKVLQFAGIEDVFTSSRGSTKTLGNFVKATFDCLLKTYGFLTPEFWRETRFTKSPFQEHTDLLAKPTVKA

Q90YS3 40S ribosomal protein S2

1.7e-75

79.29

Show/hide

Query:  MKIMPVQKQTRAGQRTRFKAFVVVGDGNGHVGLGVKCSKEVATAIRGSIILAKLSVIPVRRGYWGNKIGKPHTVPCKVTGKCGSVTVRMVPAPRGAGIVA
        +KIMPVQKQTRAGQRTRFKAFV +GD NGHVGLGVKCSKEVATAIRG+IILAKLS+IPVRRGYWGNKIGKPHTVPCKVTG+CGSV VR++PAPRG GIV+
Subjt:  MKIMPVQKQTRAGQRTRFKAFVVVGDGNGHVGLGVKCSKEVATAIRGSIILAKLSVIPVRRGYWGNKIGKPHTVPCKVTGKCGSVTVRMVPAPRGAGIVA

Query:  ARVPKKVLQFAGIEDVFTSSRGSTKTLGNFVKATFDCLLKTYGFLTPEFWRETRFTKSPFQEHTDLLAK
        A VPKK+L  AGI+D +TS+RG T TLGNF KATFD + KTY +LTP+ W+ET FTKSP+QE TD LAK
Subjt:  ARVPKKVLQFAGIEDVFTSSRGSTKTLGNFVKATFDCLLKTYGFLTPEFWRETRFTKSPFQEHTDLLAK

Q93VB8 40S ribosomal protein S2-2

1.6e-89

91.38

Show/hide

Query:  MKIMPVQKQTRAGQRTRFKAFVVVGDGNGHVGLGVKCSKEVATAIRGSIILAKLSVIPVRRGYWGNKIGKPHTVPCKVTGKCGSVTVRMVPAPRGAGIVA
        MKIMPVQKQTRAGQRTRFKAFVVVGDGNGHVGLGVKCSKEVATAIRG+IILAKLSV+PVRRGYWGNKIGKPHTVPCKVTGKCGSVTVRMVPAPRG+GIVA
Subjt:  MKIMPVQKQTRAGQRTRFKAFVVVGDGNGHVGLGVKCSKEVATAIRGSIILAKLSVIPVRRGYWGNKIGKPHTVPCKVTGKCGSVTVRMVPAPRGAGIVA

Query:  ARVPKKVLQFAGIEDVFTSSRGSTKTLGNFVKATFDCLLKTYGFLTPEFWRETRFTKSPFQEHTDLLAKPTVKA
        ARVPKKVLQFAGI+DVFTSSRGSTKTLGNFVKATFDCL KTYGFLTPEFW+ETRF++SP+QEHTD L+   V A
Subjt:  ARVPKKVLQFAGIEDVFTSSRGSTKTLGNFVKATFDCLLKTYGFLTPEFWRETRFTKSPFQEHTDLLAKPTVKA

Q9SCM3 40S ribosomal protein S2-4

1.4e-88

91.38

Show/hide

Query:  MKIMPVQKQTRAGQRTRFKAFVVVGDGNGHVGLGVKCSKEVATAIRGSIILAKLSVIPVRRGYWGNKIGKPHTVPCKVTGKCGSVTVRMVPAPRGAGIVA
        MKIMPVQKQTRAGQRTRFKAF+VVGD NGHVGLGVKCSKEVATAIRG+IILAKLSV+P+RRGYWGNKIGKPHTVPCKVTGKCGSVTVRMVPAPRG+GIVA
Subjt:  MKIMPVQKQTRAGQRTRFKAFVVVGDGNGHVGLGVKCSKEVATAIRGSIILAKLSVIPVRRGYWGNKIGKPHTVPCKVTGKCGSVTVRMVPAPRGAGIVA

Query:  ARVPKKVLQFAGIEDVFTSSRGSTKTLGNFVKATFDCLLKTYGFLTPEFWRETRFTKSPFQEHTD-LLAKPTVK
        ARVPKKVLQFAGI+DVFTSSRGSTKTLGNFVKATFDCL KTYGFLTPEFW+ETRF+KSP+QEHTD LL  P VK
Subjt:  ARVPKKVLQFAGIEDVFTSSRGSTKTLGNFVKATFDCLLKTYGFLTPEFWRETRFTKSPFQEHTD-LLAKPTVK

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT1G58380.1 Ribosomal protein S5 family protein

1.1e-90

91.38

Show/hide

Query:  MKIMPVQKQTRAGQRTRFKAFVVVGDGNGHVGLGVKCSKEVATAIRGSIILAKLSVIPVRRGYWGNKIGKPHTVPCKVTGKCGSVTVRMVPAPRGAGIVA
        MKIMPVQKQTRAGQRTRFKAFVVVGDGNGHVGLGVKCSKEVATAIRG+IILAKLSV+PVRRGYWGNKIGKPHTVPCKVTGKCGSVTVRMVPAPRG+GIVA
Subjt:  MKIMPVQKQTRAGQRTRFKAFVVVGDGNGHVGLGVKCSKEVATAIRGSIILAKLSVIPVRRGYWGNKIGKPHTVPCKVTGKCGSVTVRMVPAPRGAGIVA

Query:  ARVPKKVLQFAGIEDVFTSSRGSTKTLGNFVKATFDCLLKTYGFLTPEFWRETRFTKSPFQEHTDLLAKPTVKA
        ARVPKKVLQFAGI+DVFTSSRGSTKTLGNFVKATFDCL KTYGFLTPEFW+ETRF++SP+QEHTD L+   V A
Subjt:  ARVPKKVLQFAGIEDVFTSSRGSTKTLGNFVKATFDCLLKTYGFLTPEFWRETRFTKSPFQEHTDLLAKPTVKA

AT1G58684.1 Ribosomal protein S5 family protein

1.1e-90

91.38

Show/hide

Query:  MKIMPVQKQTRAGQRTRFKAFVVVGDGNGHVGLGVKCSKEVATAIRGSIILAKLSVIPVRRGYWGNKIGKPHTVPCKVTGKCGSVTVRMVPAPRGAGIVA
        MKIMPVQKQTRAGQRTRFKAFVVVGDGNGHVGLGVKCSKEVATAIRG+IILAKLSV+PVRRGYWGNKIGKPHTVPCKVTGKCGSVTVRMVPAPRG+GIVA
Subjt:  MKIMPVQKQTRAGQRTRFKAFVVVGDGNGHVGLGVKCSKEVATAIRGSIILAKLSVIPVRRGYWGNKIGKPHTVPCKVTGKCGSVTVRMVPAPRGAGIVA

Query:  ARVPKKVLQFAGIEDVFTSSRGSTKTLGNFVKATFDCLLKTYGFLTPEFWRETRFTKSPFQEHTDLLAKPTVKA
        ARVPKKVLQFAGI+DVFTSSRGSTKTLGNFVKATFDCL KTYGFLTPEFW+ETRF++SP+QEHTD L+   V A
Subjt:  ARVPKKVLQFAGIEDVFTSSRGSTKTLGNFVKATFDCLLKTYGFLTPEFWRETRFTKSPFQEHTDLLAKPTVKA

AT1G58983.1 Ribosomal protein S5 family protein

1.1e-90

91.38

Show/hide

Query:  MKIMPVQKQTRAGQRTRFKAFVVVGDGNGHVGLGVKCSKEVATAIRGSIILAKLSVIPVRRGYWGNKIGKPHTVPCKVTGKCGSVTVRMVPAPRGAGIVA
        MKIMPVQKQTRAGQRTRFKAFVVVGDGNGHVGLGVKCSKEVATAIRG+IILAKLSV+PVRRGYWGNKIGKPHTVPCKVTGKCGSVTVRMVPAPRG+GIVA
Subjt:  MKIMPVQKQTRAGQRTRFKAFVVVGDGNGHVGLGVKCSKEVATAIRGSIILAKLSVIPVRRGYWGNKIGKPHTVPCKVTGKCGSVTVRMVPAPRGAGIVA

Query:  ARVPKKVLQFAGIEDVFTSSRGSTKTLGNFVKATFDCLLKTYGFLTPEFWRETRFTKSPFQEHTDLLAKPTVKA
        ARVPKKVLQFAGI+DVFTSSRGSTKTLGNFVKATFDCL KTYGFLTPEFW+ETRF++SP+QEHTD L+   V A
Subjt:  ARVPKKVLQFAGIEDVFTSSRGSTKTLGNFVKATFDCLLKTYGFLTPEFWRETRFTKSPFQEHTDLLAKPTVKA

AT1G59359.1 Ribosomal protein S5 family protein

1.1e-90

91.38

Show/hide

Query:  MKIMPVQKQTRAGQRTRFKAFVVVGDGNGHVGLGVKCSKEVATAIRGSIILAKLSVIPVRRGYWGNKIGKPHTVPCKVTGKCGSVTVRMVPAPRGAGIVA
        MKIMPVQKQTRAGQRTRFKAFVVVGDGNGHVGLGVKCSKEVATAIRG+IILAKLSV+PVRRGYWGNKIGKPHTVPCKVTGKCGSVTVRMVPAPRG+GIVA
Subjt:  MKIMPVQKQTRAGQRTRFKAFVVVGDGNGHVGLGVKCSKEVATAIRGSIILAKLSVIPVRRGYWGNKIGKPHTVPCKVTGKCGSVTVRMVPAPRGAGIVA

Query:  ARVPKKVLQFAGIEDVFTSSRGSTKTLGNFVKATFDCLLKTYGFLTPEFWRETRFTKSPFQEHTDLLAKPTVKA
        ARVPKKVLQFAGI+DVFTSSRGSTKTLGNFVKATFDCL KTYGFLTPEFW+ETRF++SP+QEHTD L+   V A
Subjt:  ARVPKKVLQFAGIEDVFTSSRGSTKTLGNFVKATFDCLLKTYGFLTPEFWRETRFTKSPFQEHTDLLAKPTVKA

AT2G41840.1 Ribosomal protein S5 family protein

1.4e-91

89.62

Show/hide

Query:  MKIMPVQKQTRAGQRTRFKAFVVVGDGNGHVGLGVKCSKEVATAIRGSIILAKLSVIPVRRGYWGNKIGKPHTVPCKVTGKCGSVTVRMVPAPRGAGIVA
        MKIMPVQKQTRAGQRTRFKAFVVVGDGNGHVGLGVKCSKEVATAIRG+IILAKLSV+PVRRGYWGNKIGKPHTVPCKVTGKCGSVTVRMVPAPRG+GIVA
Subjt:  MKIMPVQKQTRAGQRTRFKAFVVVGDGNGHVGLGVKCSKEVATAIRGSIILAKLSVIPVRRGYWGNKIGKPHTVPCKVTGKCGSVTVRMVPAPRGAGIVA

Query:  ARVPKKVLQFAGIEDVFTSSRGSTKTLGNFVKATFDCLLKTYGFLTPEFWRETRFTKSPFQEHTDLLAKPTVKALLLEDPDRV
        ARVPKKVLQFAGI+DVFTSSRGSTKTLGNFVKATFDCL KTYGFLTPEFW+ETRF++SP+QEHTD LA    KAL    PD V
Subjt:  ARVPKKVLQFAGIEDVFTSSRGSTKTLGNFVKATFDCLLKTYGFLTPEFWRETRFTKSPFQEHTDLLAKPTVKALLLEDPDRV

Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGAAGATTATGCCAGTCCAGAAGCAGACTCGTGCCGGACAGAGGACCCGTTTCAAGGCGTTCGTCGTCGTCGGCGATGGTAATGGCCATGTGGGTTTGGGAGTTAAGTG
TAGTAAAGAAGTTGCAACAGCGATTCGTGGTTCGATTATTTTGGCTAAGTTGTCTGTGATTCCCGTGAGAAGAGGGTATTGGGGTAACAAGATTGGTAAGCCCCATACGG
TGCCGTGTAAAGTTACTGGAAAATGTGGGTCCGTTACCGTCCGGATGGTTCCGGCGCCGCGAGGTGCTGGGATTGTGGCGGCTAGAGTGCCCAAGAAGGTCTTGCAGTTC
GCGGGGATTGAGGATGTGTTTACATCTTCTAGAGGATCGACCAAAACTCTCGGAAACTTTGTTAAGGCAACATTTGACTGTCTTCTGAAAACATACGGCTTCTTAACACC
TGAATTTTGGAGGGAGACACGCTTCACAAAATCCCCATTCCAAGAACACACAGATTTGTTGGCGAAACCCACAGTGAAGGCATTGTTGTTGGAAGATCCTGACAGGGTTA
CTGCTTGA

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MKIMPVQKQTRAGQRTRFKAFVVVGDGNGHVGLGVKCSKEVATAIRGSIILAKLSVIPVRRGYWGNKIGKPHTVPCKVTGKCGSVTVRMVPAPRGAGIVAARVPKKVLQF
AGIEDVFTSSRGSTKTLGNFVKATFDCLLKTYGFLTPEFWRETRFTKSPFQEHTDLLAKPTVKALLLEDPDRVTA

Chy4G084130 (gene) of Cucumber (hystrix) v1 genome