; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Chy4G085540 (gene) of Cucumber (hystrix) v1 genome

Gene IDChy4G085540
OrganismCucumis hystrix (Cucumber (hystrix) v1)
DescriptionFra a 1-associated protein
Genome locationchrH04:24578066..24581302
RNA-Seq ExpressionChy4G085540
SyntenyChy4G085540
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004136529.1 fra a 1-associated protein [Cucumis sativus]2.63e-14198.48Show/hide
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XP_008442953.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103486704 [Cucumis melo]1.90e-12290.86Show/hide
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        S  EHRP DFPGLRSDIDAIEQSLFGSMKGFFEAAEEIKNGFFGSLRDPPLFNRDSSS  SMRRGIPIE DHDP FF NPKEPDSGHVDLSGLARDV
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XP_022151462.1 uncharacterized protein LOC111019393 [Momordica charantia]1.16e-8972.08Show/hide
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        MGWVWRD+  +SD  A D       +  SS D CSTR VV+S C+TEEVEPGKFVRKCERTEEILRDC+GRP EVI+SNKEFTEEDV DQ+VNRSFS G+
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        S   H+P  FPGLRSDI+AIE++LFGSMKGFFEAAEEIKNGFFG LRDP  F  +SSS  SMRRGIPIE DH+   F  P EPDSGHVDLSGLARDV
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XP_023539788.1 uncharacterized protein LOC111800367 [Cucurbita pepo subsp. pepo]8.18e-8469.19Show/hide
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        MG VWR  + + DS A DG   NN ++ SS D CSTR VV+S CKTEEVEPGKFVRKCERTEEILRDCIGRP EVI+SN+EFTEEDVT+++VN RSFS G
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        SS  E++P +FPGLRSDI+AIE SLFGSMKGFF+AAEEI+NGFFGS RDPPLFNR+ SSS SMR+                 EPDSGHVDLSGLARDV
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XP_038905970.1 fra a 1-associated protein [Benincasa hispida]1.37e-11586.29Show/hide
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        MGWVWRDDT + DS AVD  K NNS +PS SD CSTR VV+S CKTEEVEPGKFVRKCERTEEILRDCIGRP EVI+SNKEFTEEDVTDQMVNRSFS GS
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        S  EHRP DFPGLRSDIDAIEQSLFGSMKGFFEAAEEIKNGFFGSLRDPPLFNR+SSSS SMRRGIPIE DH+P FF N KEPDSGHVDLSGLARDV
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LGU7 Uncharacterized protein3.8e-10898.48Show/hide
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A0A1S3B6X7 uncharacterized protein LOC1034867049.1e-9490.86Show/hide
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          SEHRP DFPGLRSDIDAIEQSLFGSMKGFFEAAEEIKNGFFGSLRDPPLFNRDSSS  SMRRGIPI EDHDP FF NPKEPDSGHVDLSGLARDV
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A0A6J1DDK9 uncharacterized protein LOC1110193931.3e-6872.08Show/hide
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        MGWVWRD+  +SD  A D       +  SS D CSTR VV+S C+TEEVEPGKFVRKCERTEEILRDC+GRP EVI+SNKEFTEEDV DQ+VNRSFS G+
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          S H+P  FPGLRSDI+AIE++LFGSMKGFFEAAEEIKNGFFG LRDP  F  + SSS SMRRGIPI EDH+   F  P EPDSGHVDLSGLARDV
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A0A6J1FHK7 uncharacterized protein LOC1114458451.3e-6368.69Show/hide
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        MG VWR  + + DS A DG   NN ++ SS D CSTR VV+S CKTEEVEPGKFVRKCERTEEILRDCIGRP EVI+SN+EFTEEDVT+++V NRSFS G
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        S  SE++P +FPGLRSDI+AIE SLFGSMKGFF+AAEEI+NGFFGS RDPPLF+R+ SSS SMR+                 EPDSGHVDLSGLARDV
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A0A6J1KVN4 uncharacterized protein LOC1114986069.9e-6468.69Show/hide
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        MG VWR  + + DS A DG   NN ++ SS D CSTR VV+S CKTEEVEPGKFVRKCERTEEILRDCIGRP EVI+SN+EFTEEDVT+++V NRSFS G
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        S  SE++P +FPGLRSDI+AIE SLFGSMKGFF+AAEEI+NGFFGS RDPP+FNR+ SSS SMR+                 EPDSGHVDLSGLARDV
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
W5X2N3 Fra a 1-associated protein5.1e-4952.48Show/hide
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        MGWVW+DD +        G   N S +  S     D CSTR VVR+ CKTEEVEPGKF+RKCE+TEE+LRDC+GRP EV++SNKE+TE+DVTDQ++  S 
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        S GS  +++   +FPGL+ DID IE +  G +  FFEAAE++KNGFF S   P +F+   S+S  S RR IPI+       F       SG VDLSGLAR
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Query:  DV
        DV
Subjt:  DV

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G35900.1 unknown protein1.9e-4349.5Show/hide
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        MGW+W DD+  S + A   DK     S ++++ CST  VVRS CKTEEVEPGKFVRKC++TEEILR C G+P+EV++SN E TEEDVTDQMV RS +L +
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Query:  SPSEHRPLDFPGLRSDIDAIEQSLFGSMKGFFEAAEEIKNGFFGSLRDPPLFNRDSSSSASMRRGIPIE-----EDHDPVFFYNPKEPDSGHVDLSGLAR
           +  PL+FPGLR D+DAIE+     MK FF+AAEE+ +  F  + D           ++ R GIPIE     E+H        +   SG +DLSGLA+
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Query:  DV
        DV
Subjt:  DV


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGGATGGGTCTGGAGAGACGACACCGACGATTCGGATTCATTTGCTGTCGATGGCGATAAGTTCAATAATTCCACCTCTCCGTCCTCCAGCGATTGGTGTTCG
ACAAGAAATGTGGTGAGGTCGCACTGCAAGACCGAGGAGGTTGAGCCCGGAAAATTCGTCAGGAAGTGTGAGAGAACCGAGGAGATTCTCAGAGACTGCATTGGA
AGGCCAACCGAAGTGATAAAGTCCAACAAGGAATTTACGGAAGAGGATGTAACAGATCAGATGGTCAATAGGTCATTCTCGTTGGGATCGTCACCATCAGAACAT
CGACCCCTTGATTTCCCTGGGCTCCGTAGCGATATTGATGCCATTGAACAGAGTCTCTTTGGTAGCATGAAAGGGTTCTTTGAAGCAGCTGAAGAGATTAAGAAT
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TTCTTCTACAACCCAAAAGAGCCCGATTCTGGTCACGTTGACCTATCTGGATTGGCCAGGGATGTCTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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