; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Chy4G086280 (gene) of Cucumber (hystrix) v1 genome

Gene IDChy4G086280
OrganismCucumis hystrix (Cucumber (hystrix) v1)
Description40S ribosomal protein S14
Genome locationchrH04:25110423..25114961
RNA-Seq ExpressionChy4G086280
SyntenyChy4G086280
Gene Ontology termsGO:0000028 - ribosomal small subunit assembly (biological process)
GO:0000462 - maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) (biological process)
GO:0006412 - translation (biological process)
GO:0022627 - cytosolic small ribosomal subunit (cellular component)
GO:0003735 - structural constituent of ribosome (molecular function)
GO:0048027 - mRNA 5'-UTR binding (molecular function)
GO:0070181 - small ribosomal subunit rRNA binding (molecular function)
InterPro domainsIPR001971 - Ribosomal protein S11
IPR018102 - Ribosomal S11, conserved site
IPR036967 - Ribosomal protein S11 superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7017469.1 40S ribosomal protein S14-2, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]3.41e-9385.23Show/hide
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KAG7017470.1 40S ribosomal protein S14-2, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]4.36e-9385.14Show/hide
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XP_004149195.1 40S ribosomal protein S14-2 [Cucumis sativus]7.81e-9485.23Show/hide
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XP_022946789.1 40S ribosomal protein S14-2-like [Cucurbita moschata]1.11e-9384.66Show/hide
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XP_038903512.1 40S ribosomal protein S14-2-like isoform X2 [Benincasa hispida]2.24e-9384.66Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LGP6 Uncharacterized protein4.4e-7285.23Show/hide
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A0A1S3B682 40S ribosomal protein S14-24.4e-7285.23Show/hide
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A0A5D3DNR5 40S ribosomal protein S14-2-like4.4e-7285.23Show/hide
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A0A6J1F6L2 40S ribosomal protein S14-24.4e-7285.23Show/hide
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A0A6J1J4Y9 40S ribosomal protein S14-24.4e-7285.23Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
P19950 40S ribosomal protein S148.9e-7081.25Show/hide
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P19951 40S ribosomal protein S141.5e-6981.03Show/hide
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P42036 40S ribosomal protein S14-35.2e-7078.98Show/hide
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Q9CAX6 40S ribosomal protein S14-22.3e-7079.55Show/hide
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Q9SIH0 40S ribosomal protein S14-12.0e-6978.41Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G36160.1 Ribosomal protein S11 family protein1.4e-7078.41Show/hide
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AT3G11510.1 Ribosomal protein S11 family protein1.7e-7179.55Show/hide
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AT3G52580.1 Ribosomal protein S11 family protein3.7e-7178.98Show/hide
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ATCG00750.1 ribosomal protein S114.5e-0827.49Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
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