; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Chy4G089080 (gene) of Cucumber (hystrix) v1 genome

Gene IDChy4G089080
OrganismCucumis hystrix (Cucumber (hystrix) v1)
DescriptionEncodes a protein involved in salt tolerance, names SIS (Salt Induced Serine rich).
Genome locationchrH04:26910980..26912036
RNA-Seq ExpressionChy4G089080
SyntenyChy4G089080
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004137753.1 uncharacterized protein LOC101220657 isoform X1 [Cucumis sativus]2.45e-9294.44Show/hide
Query:  MSEKKPSDASSFSFTSDLFGIRDTSSLSSNHIFGPVFSSSFKATGQHSEVGGKAPALSYFSKTEGNSKYKECKNGSTSSREMGSFYQEQRTNPCHLSSSI
        MSEKKPSDASSFSFTSDLFGIRDTSSLSSNHIFGPVFSSSFK +GQHSEVGGK+PALSYF KTEGNSKYKECKNGSTSSREMGSFYQEQRTNPCHLSSSI
Subjt:  MSEKKPSDASSFSFTSDLFGIRDTSSLSSNHIFGPVFSSSFKATGQHSEVGGKAPALSYFSKTEGNSKYKECKNGSTSSREMGSFYQEQRTNPCHLSSSI

Query:  YYGGQDVYTQNPATGFNSSLKRDHGGEDDSGGASRGNWWQGATH
        YYGGQDVYTQNPATGFNS LKRDHGGEDDSGGASRGNWWQG+ +
Subjt:  YYGGQDVYTQNPATGFNSSLKRDHGGEDDSGGASRGNWWQGATH

XP_008442495.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103486348 isoform X1 [Cucumis melo]3.78e-7685.14Show/hide
Query:  MSEKKPSDASSFSFTSDLFGIRDTSSLSSNHIFGPVFSSS---FKATGQHSEVGGKAPALSYFSKTEGNSKYKECKNGSTSSREMGSFYQEQRTNPCHLS
        MSEKK SD SSFSFTSDLFGIRDTSSLSSNHIFGPVFSSS   FKA+ Q+SEVGGK+ A+SY  KTEG+SKYKECKNGSTSSRE+GSFYQEQRTNPCHLS
Subjt:  MSEKKPSDASSFSFTSDLFGIRDTSSLSSNHIFGPVFSSS---FKATGQHSEVGGKAPALSYFSKTEGNSKYKECKNGSTSSREMGSFYQEQRTNPCHLS

Query:  SSIYYGGQDVYT-QNPATGFNSSLKRDHGGEDDSGGASRGNWWQGATH
        SSIYYGGQD+YT QNP TGFNSSLKRD GGEDDSGGASRGNWWQG+ +
Subjt:  SSIYYGGQDVYT-QNPATGFNSSLKRDHGGEDDSGGASRGNWWQGATH

XP_008442497.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103486348 isoform X2 [Cucumis melo]1.42e-7384.46Show/hide
Query:  MSEKKPSDASSFSFTSDLFGIRDTSSLSSNHIFGPVFSSS---FKATGQHSEVGGKAPALSYFSKTEGNSKYKECKNGSTSSREMGSFYQEQRTNPCHLS
        MSEKK SD SSFSFTSDLFGIRDTSSLSSNHIFGPVFSSS   FKA+ Q+SEVGGK+ A+SY  KT G+SKYKECKNGSTSSRE+GSFYQEQRTNPCHLS
Subjt:  MSEKKPSDASSFSFTSDLFGIRDTSSLSSNHIFGPVFSSS---FKATGQHSEVGGKAPALSYFSKTEGNSKYKECKNGSTSSREMGSFYQEQRTNPCHLS

Query:  SSIYYGGQDVYT-QNPATGFNSSLKRDHGGEDDSGGASRGNWWQGATH
        SSIYYGGQD+YT QNP TGFNSSLKRD GGEDDSGGASRGNWWQG+ +
Subjt:  SSIYYGGQDVYT-QNPATGFNSSLKRDHGGEDDSGGASRGNWWQGATH

XP_016899678.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103486348 isoform X3 [Cucumis melo]5.67e-7584.14Show/hide
Query:  MSEKKPSDASSFSFTSDLFGIRDTSSLSSNHIFGPVFSSSFKATGQHSEVGGKAPALSYFSKTEGNSKYKECKNGSTSSREMGSFYQEQRTNPCHLSSSI
        MSEKK SD SSFSFTSDLFGIRDTSSLSSNHIFGPVFSSS  ++ ++SEVGGK+ A+SY  KTEG+SKYKECKNGSTSSRE+GSFYQEQRTNPCHLSSSI
Subjt:  MSEKKPSDASSFSFTSDLFGIRDTSSLSSNHIFGPVFSSSFKATGQHSEVGGKAPALSYFSKTEGNSKYKECKNGSTSSREMGSFYQEQRTNPCHLSSSI

Query:  YYGGQDVYT-QNPATGFNSSLKRDHGGEDDSGGASRGNWWQGATH
        YYGGQD+YT QNP TGFNSSLKRD GGEDDSGGASRGNWWQG+ +
Subjt:  YYGGQDVYT-QNPATGFNSSLKRDHGGEDDSGGASRGNWWQGATH

XP_031738650.1 uncharacterized protein LOC101220657 isoform X2 [Cucumis sativus]9.27e-9093.75Show/hide
Query:  MSEKKPSDASSFSFTSDLFGIRDTSSLSSNHIFGPVFSSSFKATGQHSEVGGKAPALSYFSKTEGNSKYKECKNGSTSSREMGSFYQEQRTNPCHLSSSI
        MSEKKPSDASSFSFTSDLFGIRDTSSLSSNHIFGPVFSSSFK +GQHSEVGGK+PALSYF KT GNSKYKECKNGSTSSREMGSFYQEQRTNPCHLSSSI
Subjt:  MSEKKPSDASSFSFTSDLFGIRDTSSLSSNHIFGPVFSSSFKATGQHSEVGGKAPALSYFSKTEGNSKYKECKNGSTSSREMGSFYQEQRTNPCHLSSSI

Query:  YYGGQDVYTQNPATGFNSSLKRDHGGEDDSGGASRGNWWQGATH
        YYGGQDVYTQNPATGFNS LKRDHGGEDDSGGASRGNWWQG+ +
Subjt:  YYGGQDVYTQNPATGFNSSLKRDHGGEDDSGGASRGNWWQGATH

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LD07 Uncharacterized protein8.2e-7194.44Show/hide
Query:  MSEKKPSDASSFSFTSDLFGIRDTSSLSSNHIFGPVFSSSFKATGQHSEVGGKAPALSYFSKTEGNSKYKECKNGSTSSREMGSFYQEQRTNPCHLSSSI
        MSEKKPSDASSFSFTSDLFGIRDTSSLSSNHIFGPVFSSSFK +GQHSEVGGK+PALSYF KTEGNSKYKECKNGSTSSREMGSFYQEQRTNPCHLSSSI
Subjt:  MSEKKPSDASSFSFTSDLFGIRDTSSLSSNHIFGPVFSSSFKATGQHSEVGGKAPALSYFSKTEGNSKYKECKNGSTSSREMGSFYQEQRTNPCHLSSSI

Query:  YYGGQDVYTQNPATGFNSSLKRDHGGEDDSGGASRGNWWQGATH
        YYGGQDVYTQNPATGFNS LKRDHGGEDDSGGASRGNWWQG+ +
Subjt:  YYGGQDVYTQNPATGFNSSLKRDHGGEDDSGGASRGNWWQGATH

A0A1S3B5B7 uncharacterized protein LOC103486348 isoform X11.6e-5885.14Show/hide
Query:  MSEKKPSDASSFSFTSDLFGIRDTSSLSSNHIFGPVF---SSSFKATGQHSEVGGKAPALSYFSKTEGNSKYKECKNGSTSSREMGSFYQEQRTNPCHLS
        MSEKK SD SSFSFTSDLFGIRDTSSLSSNHIFGPVF   SSSFKA+ Q+SEVGGK+ A+SY  KTEG+SKYKECKNGSTSSRE+GSFYQEQRTNPCHLS
Subjt:  MSEKKPSDASSFSFTSDLFGIRDTSSLSSNHIFGPVF---SSSFKATGQHSEVGGKAPALSYFSKTEGNSKYKECKNGSTSSREMGSFYQEQRTNPCHLS

Query:  SSIYYGGQDVYT-QNPATGFNSSLKRDHGGEDDSGGASRGNWWQGATH
        SSIYYGGQD+YT QNP TGFNSSLKRD GGEDDSGGASRGNWWQG+ +
Subjt:  SSIYYGGQDVYT-QNPATGFNSSLKRDHGGEDDSGGASRGNWWQGATH

A0A1S3B5T7 uncharacterized protein LOC103486348 isoform X21.5e-5684.46Show/hide
Query:  MSEKKPSDASSFSFTSDLFGIRDTSSLSSNHIFGPVF---SSSFKATGQHSEVGGKAPALSYFSKTEGNSKYKECKNGSTSSREMGSFYQEQRTNPCHLS
        MSEKK SD SSFSFTSDLFGIRDTSSLSSNHIFGPVF   SSSFKA+ Q+SEVGGK+ A+SY  KT G+SKYKECKNGSTSSRE+GSFYQEQRTNPCHLS
Subjt:  MSEKKPSDASSFSFTSDLFGIRDTSSLSSNHIFGPVF---SSSFKATGQHSEVGGKAPALSYFSKTEGNSKYKECKNGSTSSREMGSFYQEQRTNPCHLS

Query:  SSIYYGGQDVYT-QNPATGFNSSLKRDHGGEDDSGGASRGNWWQGATH
        SSIYYGGQD+YT QNP TGFNSSLKRD GGEDDSGGASRGNWWQG+ +
Subjt:  SSIYYGGQDVYT-QNPATGFNSSLKRDHGGEDDSGGASRGNWWQGATH

A0A1S4DUN5 uncharacterized protein LOC103486348 isoform X31.4e-5784.14Show/hide
Query:  MSEKKPSDASSFSFTSDLFGIRDTSSLSSNHIFGPVFSSSFKATGQHSEVGGKAPALSYFSKTEGNSKYKECKNGSTSSREMGSFYQEQRTNPCHLSSSI
        MSEKK SD SSFSFTSDLFGIRDTSSLSSNHIFGPVFSSS  ++ ++SEVGGK+ A+SY  KTEG+SKYKECKNGSTSSRE+GSFYQEQRTNPCHLSSSI
Subjt:  MSEKKPSDASSFSFTSDLFGIRDTSSLSSNHIFGPVFSSSFKATGQHSEVGGKAPALSYFSKTEGNSKYKECKNGSTSSREMGSFYQEQRTNPCHLSSSI

Query:  YYGGQDVYT-QNPATGFNSSLKRDHGGEDDSGGASRGNWWQGATH
        YYGGQD+YT QNP TGFNSSLKRD GGEDDSGGASRGNWWQG+ +
Subjt:  YYGGQDVYT-QNPATGFNSSLKRDHGGEDDSGGASRGNWWQGATH

A0A5D3DN19 Uncharacterized protein1.6e-5885.14Show/hide
Query:  MSEKKPSDASSFSFTSDLFGIRDTSSLSSNHIFGPVF---SSSFKATGQHSEVGGKAPALSYFSKTEGNSKYKECKNGSTSSREMGSFYQEQRTNPCHLS
        MSEKK SD SSFSFTSDLFGIRDTSSLSSNHIFGPVF   SSSFKA+ Q+SEVGGK+ A+SY  KTEG+SKYKECKNGSTSSRE+GSFYQEQRTNPCHLS
Subjt:  MSEKKPSDASSFSFTSDLFGIRDTSSLSSNHIFGPVF---SSSFKATGQHSEVGGKAPALSYFSKTEGNSKYKECKNGSTSSREMGSFYQEQRTNPCHLS

Query:  SSIYYGGQDVYT-QNPATGFNSSLKRDHGGEDDSGGASRGNWWQGATH
        SSIYYGGQD+YT QNP TGFNSSLKRD GGEDDSGGASRGNWWQG+ +
Subjt:  SSIYYGGQDVYT-QNPATGFNSSLKRDHGGEDDSGGASRGNWWQGATH

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G39855.2 unknown protein1.9e-1135.82Show/hide
Query:  GIRDTSSLSSNHIFGPVFSSSFKA--TGQHSEVGGKAPALSYFSKT--EGNSKYKEC-------KNGSTSSREMGSFYQEQRTNPCHLSSSIYYGGQDVY
        G   +SS S +HIFGP  S S+ +  TG    +     A++  + T   G +KY+         +   + ++E  S+  E+   PC+LSSSIYYGGQD Y
Subjt:  GIRDTSSLSSNHIFGPVFSSSFKA--TGQHSEVGGKAPALSYFSKT--EGNSKYKEC-------KNGSTSSREMGSFYQEQRTNPCHLSSSIYYGGQDVY

Query:  TQNPATGFNSSLKRDHGGEDDSGGASRGNWWQGA
        + +     N    +  G E DS  ASRGNWW+G+
Subjt:  TQNPATGFNSSLKRDHGGEDDSGGASRGNWWQGA

AT3G55646.1 unknown protein7.0e-1441.22Show/hide
Query:  TSSLSS-NHIFGP--VFSSSFKATGQHSEVGGKAPALSY-----FSKTEGNSKYK--ECKNGSTSSREMGSFYQEQRTNPCHLSSSIYYGGQDVYTQNPA
        +SSLSS +HIFGP    SSS  ATG    +     A        F+   G+ KY+    K   ++ +E  S+Y E+   PCHLSSS+YYGGQ+ Y+    
Subjt:  TSSLSS-NHIFGP--VFSSSFKATGQHSEVGGKAPALSY-----FSKTEGNSKYK--ECKNGSTSSREMGSFYQEQRTNPCHLSSSIYYGGQDVYTQNPA

Query:  TGFNSSLKRDHGGEDDSGGASRGNWWQGATH
        T  + + K+D G E DS  ASRGNWW+G+ +
Subjt:  TGFNSSLKRDHGGEDDSGGASRGNWWQGATH

AT5G02020.1 Encodes a protein involved in salt tolerance, names SIS (Salt Induced Serine rich).1.1e-1946.53Show/hide
Query:  SDASSFSFTSDLFGIRDT-SSLSSNHIFGPVFSSSFKATG-----QHSEVGGKAPALSYFSKTEGNSKYKECKNGSTSSREMGSFYQEQRTNPCHLSSSI
        S  SS S TS+LFG R+  SS SS+ I G +F    K  G     Q +  GG     +  SKT GN      +N          + Q+QR  PCHLSSSI
Subjt:  SDASSFSFTSDLFGIRDT-SSLSSNHIFGPVFSSSFKATG-----QHSEVGGKAPALSYFSKTEGNSKYKECKNGSTSSREMGSFYQEQRTNPCHLSSSI

Query:  YYGGQDVYTQNPATGFNSSLKRDHGGEDDSGGASRGNWWQGATH
        YYGG DVY Q   +  NS+ K+D GGEDDSG ASRGNWWQG+ +
Subjt:  YYGGQDVYTQNPATGFNSSLKRDHGGEDDSGGASRGNWWQGATH

AT5G02020.2 Encodes a protein involved in salt tolerance, names SIS (Salt Induced Serine rich).4.0e-0940.83Show/hide
Query:  SDASSFSFTSDLFGIRDT-SSLSSNHIFGPVFSSSFKATG-----QHSEVGGKAPALSYFSKTEGNSKYKECKNGSTSSREMGSFYQEQRTNPCHLSSSI
        S  SS S TS+LFG R+  SS SS+ I G +F    K  G     Q +  GG     +  SKT GN      +N          + Q+QR  PCHLSSSI
Subjt:  SDASSFSFTSDLFGIRDT-SSLSSNHIFGPVFSSSFKATG-----QHSEVGGKAPALSYFSKTEGNSKYKECKNGSTSSREMGSFYQEQRTNPCHLSSSI

Query:  YYGGQDVYTQNPATGFNSSL
        YYGG DVY Q   +  NS++
Subjt:  YYGGQDVYTQNPATGFNSSL

AT5G59080.1 unknown protein2.4e-1438.62Show/hide
Query:  SDASSFSFTSDLFGIRDTSSLSSNHIFGPVFSSSFKATGQHSEVGGKAPALSYFSKTEGNSKYKECKNGSTSSREMGSFYQEQRTNPCHLSSSIYYGGQD
        S ++S SFT++LFG +D S  SS+     +FS+ F             P  S  S  +G++     K+GS + R      QE R  PCHLSSS+YYGGQD
Subjt:  SDASSFSFTSDLFGIRDTSSLSSNHIFGPVFSSSFKATGQHSEVGGKAPALSYFSKTEGNSKYKECKNGSTSSREMGSFYQEQRTNPCHLSSSIYYGGQD

Query:  VYTQNPATGFNSSLKRD--HGGEDDSGG-----ASRGNWWQGATH
        VY ++        +K D    GEDD+ G      SRGNWWQG+ +
Subjt:  VYTQNPATGFNSSLKRD--HGGEDDSGG-----ASRGNWWQGATH


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTCGGAGAAGAAACCATCTGATGCCTCATCTTTTTCCTTCACTTCTGATCTCTTTGGGATCAGAGACACTTCTTCACTCTCTTCTAATCACATTTTTGGCCCGGTTTT
CTCTTCTTCTTTCAAGGCCACCGGCCAGCACTCCGAAGTCGGTGGTAAAGCACCTGCTCTTTCATACTTCTCCAAAACTGAAGGAAATTCCAAATATAAGGAATGCAAGA
ATGGGAGCACATCAAGCAGAGAAATGGGTTCGTTTTATCAAGAACAGAGAACAAACCCATGTCATCTTAGTTCTTCAATCTACTATGGCGGTCAGGATGTCTATACTCAA
AATCCAGCAACTGGGTTCAACTCCTCTTTAAAGAGAGATCATGGGGGAGAAGATGATTCAGGTGGTGCTTCTAGAGGAAATTGGTGGCAAGGTGCAACACACATTCTATT
ACCATAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGTCGGAGAAGAAACCATCTGATGCCTCATCTTTTTCCTTCACTTCTGATCTCTTTGGGATCAGAGACACTTCTTCACTCTCTTCTAATCACATTTTTGGCCCGGTTTT
CTCTTCTTCTTTCAAGGCCACCGGCCAGCACTCCGAAGTCGGTGGTAAAGCACCTGCTCTTTCATACTTCTCCAAAACTGAAGGAAATTCCAAATATAAGGAATGCAAGA
ATGGGAGCACATCAAGCAGAGAAATGGGTTCGTTTTATCAAGAACAGAGAACAAACCCATGTCATCTTAGTTCTTCAATCTACTATGGCGGTCAGGATGTCTATACTCAA
AATCCAGCAACTGGGTTCAACTCCTCTTTAAAGAGAGATCATGGGGGAGAAGATGATTCAGGTGGTGCTTCTAGAGGAAATTGGTGGCAAGGTGCAACACACATTCTATT
ACCATAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MSEKKPSDASSFSFTSDLFGIRDTSSLSSNHIFGPVFSSSFKATGQHSEVGGKAPALSYFSKTEGNSKYKECKNGSTSSREMGSFYQEQRTNPCHLSSSIYYGGQDVYTQ
NPATGFNSSLKRDHGGEDDSGGASRGNWWQGATHILLP