; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Chy5G093060 (gene) of Cucumber (hystrix) v1 genome

Gene IDChy5G093060
OrganismCucumis hystrix (Cucumber (hystrix) v1)
DescriptionLINE-1 retrotransposable element ORF2 protein
Genome locationchrH05:2227664..2241774
RNA-Seq ExpressionChy5G093060
SyntenyChy5G093060
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0047513.1 hypothetical protein E6C27_scaffold498G001420 [Cucumis melo var. makuwa]5.85e-4354.74Show/hide
Query:  MLFMPHPLFVEYSVDRNHISRISLRCFRNALLEGQSYSSMSIHLQEPQNTILFKFEPSRPSALPLHHELTFL-PMEDWSPNQVSLNGKLFSIESEMFSNI
        M+ MP PLF EYSVDRNHIS +SL    NAL++G+++++++I ++E QN I   FE S PS LPL+ ELTF+ PMEDWSP  V  +GK+FSIESE+F++I
Subjt:  MLFMPHPLFVEYSVDRNHISRISLRCFRNALLEGQSYSSMSIHLQEPQNTILFKFEPSRPSALPLHHELTFL-PMEDWSPNQVSLNGKLFSIESEMFSNI

Query:  LTTFSVYNEVDTILITSRGSQITFSAVPREEIIIREE
        +  FS +NE D ILIT+ GS++TFS  P  E  + EE
Subjt:  LTTFSVYNEVDTILITSRGSQITFSAVPREEIIIREE

KGN45637.1 hypothetical protein Csa_005027 [Cucumis sativus]1.37e-6061.49Show/hide
Query:  MFSIKVDNLDPFLDATSLFTEFINDEICLKFSPSTFSMIARYQCPTFFAMLFMPHPLFVEYSVDRNHISRISLRCFRNALLEGQSYSSMSIHLQEPQNTI
        MFSIK+D LDP LDA SLFT+ +ND+ICLKFS STFS+IARYQ P FFAMLF+P PLF EY V R+HI R+SL     AL  GQ+YSS+ IHLQE QN I
Subjt:  MFSIKVDNLDPFLDATSLFTEFINDEICLKFSPSTFSMIARYQCPTFFAMLFMPHPLFVEYSVDRNHISRISLRCFRNALLEGQSYSSMSIHLQEPQNTI

Query:  LFKFEPSRPSALPLHHELTF-LPMEDWSPNQVSLNGKLFSIESEMFSNILTTFSVYNEVDT
           FEPSR S +P+  ++ F +PMEDWS  ++  + K FSIES++F +I+TTF  YNEVDT
Subjt:  LFKFEPSRPSALPLHHELTF-LPMEDWSPNQVSLNGKLFSIESEMFSNILTTFSVYNEVDT

KGN61523.1 hypothetical protein Csa_006491 [Cucumis sativus]4.31e-7670.81Show/hide
Query:  MFSIKVDNLDPFLDATSLFTEFINDEICLKFSPSTFSMIARYQCPTFFAMLFMPHPLFVEYSVDRNHISRISLRCFRNALLEGQSYSSMSIHLQEPQNTI
        MFSIKVDNLDPFLDATSLFTEFINDEICLKFSPSTFSMIARYQCPTFFAMLFMPHPLFVEYSVDRNHISRISLRCFRNALLEGQSYSSMSIHL+EPQNTI
Subjt:  MFSIKVDNLDPFLDATSLFTEFINDEICLKFSPSTFSMIARYQCPTFFAMLFMPHPLFVEYSVDRNHISRISLRCFRNALLEGQSYSSMSIHLQEPQNTI

Query:  LFKFEPSRPSALPLHHELTFLPMEDWSPNQVSLNGKLFSIESEMFSNILTTFSVYNEVDTILITSRGSQITFSAVPREEIIIREE
        LFKFEPS                                                     ILITSRGSQITFSAVPREEIIIREE
Subjt:  LFKFEPSRPSALPLHHELTFLPMEDWSPNQVSLNGKLFSIESEMFSNILTTFSVYNEVDTILITSRGSQITFSAVPREEIIIREE

TYK26483.1 hypothetical protein E5676_scaffold313G00490 [Cucumis melo var. makuwa]2.59e-3954.74Show/hide
Query:  MLFMPHPLFVEYSVDRNHISRISLRCFRNALLEGQSYSSMSIHLQEPQNTILFKFEPSRPSALPLHHELTFL-PMEDWSPNQVSLNGKLFSIESEMFSNI
        M+ MP PLF EYSVDRNHIS +SL    NAL++G+++++++I ++E QN I   FE S PS LPL+ ELTF+ PMEDWSP  V  +GK+FSIESE+F++I
Subjt:  MLFMPHPLFVEYSVDRNHISRISLRCFRNALLEGQSYSSMSIHLQEPQNTILFKFEPSRPSALPLHHELTFL-PMEDWSPNQVSLNGKLFSIESEMFSNI

Query:  LTTFSVYNEVDTILITSRGSQITFSAVPREEIIIREE
        +  FS +NE D ILIT+ GS++TFS  P  E  + EE
Subjt:  LTTFSVYNEVDTILITSRGSQITFSAVPREEIIIREE

XP_031736681.1 uncharacterized protein LOC116402062 [Cucumis sativus]1.41e-8961.99Show/hide
Query:  MFSIKVDNLDPFLDATSLFTEFINDEICLKFSPSTFSMIARYQCPTFFAMLFMPHPLFVEYSVDRNHISRISLRCFRNALLEGQSYSSMSIHLQEPQNTI
        MFSIK+D++DPFLDAT LF E  +DEICLKF PST S+I RY+CP FF  + +P PLFVEYSVDRNHISRISL  F +ALLE Q++++++IHLQE QN I
Subjt:  MFSIKVDNLDPFLDATSLFTEFINDEICLKFSPSTFSMIARYQCPTFFAMLFMPHPLFVEYSVDRNHISRISLRCFRNALLEGQSYSSMSIHLQEPQNTI

Query:  LFKFEPSRPSALPLHHELTFL-PMEDWSPNQVSLNGKLFSIESEMFSNILTTFSVYNEVDTILITSRGSQITFSAVPREEIIIREESGDCLIIGDREVET
        L  FEPS PS LPL+ ELTF+ PMEDWS  QV+ +GK+FSIES++F +I+  FS + E +TILI S GS+++FS +P  E  + EESG CLI GDRE+ET
Subjt:  LFKFEPSRPSALPLHHELTFL-PMEDWSPNQVSLNGKLFSIESEMFSNILTTFSVYNEVDTILITSRGSQITFSAVPREEIIIREESGDCLIIGDREVET

Query:  HMHMPLHPSSLFINCGLQARR
         + MPL PSS F NC LQ++R
Subjt:  HMHMPLHPSSLFINCGLQARR

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KB76 Uncharacterized protein3.9e-4761.49Show/hide
Query:  MFSIKVDNLDPFLDATSLFTEFINDEICLKFSPSTFSMIARYQCPTFFAMLFMPHPLFVEYSVDRNHISRISLRCFRNALLEGQSYSSMSIHLQEPQNTI
        MFSIK+D LDP LDA SLFT+ +ND+ICLKFS STFS+IARYQ P FFAMLF+P PLF EY V R+HI R+SL     AL  GQ+YSS+ IHLQE QN I
Subjt:  MFSIKVDNLDPFLDATSLFTEFINDEICLKFSPSTFSMIARYQCPTFFAMLFMPHPLFVEYSVDRNHISRISLRCFRNALLEGQSYSSMSIHLQEPQNTI

Query:  LFKFEPSRPSALPLHHELTF-LPMEDWSPNQVSLNGKLFSIESEMFSNILTTFSVYNEVDT
           FEPSR S +P+  ++ F +PMEDWS  ++  + K FSIES++F +I+TTF  YNEVDT
Subjt:  LFKFEPSRPSALPLHHELTF-LPMEDWSPNQVSLNGKLFSIESEMFSNILTTFSVYNEVDT

A0A0A0LIE0 Uncharacterized protein1.0e-5870.81Show/hide
Query:  MFSIKVDNLDPFLDATSLFTEFINDEICLKFSPSTFSMIARYQCPTFFAMLFMPHPLFVEYSVDRNHISRISLRCFRNALLEGQSYSSMSIHLQEPQNTI
        MFSIKVDNLDPFLDATSLFTEFINDEICLKFSPSTFSMIARYQCPTFFAMLFMPHPLFVEYSVDRNHISRISLRCFRNALLEGQSYSSMSIHL+EPQNTI
Subjt:  MFSIKVDNLDPFLDATSLFTEFINDEICLKFSPSTFSMIARYQCPTFFAMLFMPHPLFVEYSVDRNHISRISLRCFRNALLEGQSYSSMSIHLQEPQNTI

Query:  LFKFEPSRPSALPLHHELTFLPMEDWSPNQVSLNGKLFSIESEMFSNILTTFSVYNEVDTILITSRGSQITFSAVPREEIIIREE
        LFKFEPS                                                     ILITSRGSQITFSAVPREEIIIREE
Subjt:  LFKFEPSRPSALPLHHELTFLPMEDWSPNQVSLNGKLFSIESEMFSNILTTFSVYNEVDTILITSRGSQITFSAVPREEIIIREE

A0A1S3C8J1 uncharacterized protein LOC1034980104.1e-2835.29Show/hide
Query:  MFSIKVDNLDPFLDATSLFTEFINDEICLKFSPSTFSMIARYQCPTFFAMLFMPHPLFVEYSVDRNHISRISLRCFRNALLEGQSYSSMSIHLQEPQNTI
        MF ++++  +P +DATSL  +   D   +KF+P    +I   + P F A L +   LF  +SVD N  S++SL+ F +A+L+G S+SSM+IHL +  N +
Subjt:  MFSIKVDNLDPFLDATSLFTEFINDEICLKFSPSTFSMIARYQCPTFFAMLFMPHPLFVEYSVDRNHISRISLRCFRNALLEGQSYSSMSIHLQEPQNTI

Query:  LFKFEPSRPSALPLHHELTFLPMEDWSPNQVSLNGKLFSIESEMFSNILTTFSVYNEVDTILITSRGSQITFSAVPREEIIIREESGDCLIIG-DREVET
        + +FE       PLHHEL   P +  +  QV   G  F++ S     I+    ++++ DT+ +T  GSQ+ FS +  +EII+ +E G C I+G + EVET
Subjt:  LFKFEPSRPSALPLHHELTFLPMEDWSPNQVSLNGKLFSIESEMFSNILTTFSVYNEVDTILITSRGSQITFSAVPREEIIIREESGDCLIIG-DREVET

Query:  HMHMPLHPSSLFINCGLQARR
         + + L P   F+N   +A +
Subjt:  HMHMPLHPSSLFINCGLQARR

A0A5A7TVD7 Uncharacterized protein3.2e-3354.74Show/hide
Query:  MLFMPHPLFVEYSVDRNHISRISLRCFRNALLEGQSYSSMSIHLQEPQNTILFKFEPSRPSALPLHHELTF-LPMEDWSPNQVSLNGKLFSIESEMFSNI
        M+ MP PLF EYSVDRNHIS +SL    NAL++G+++++++I ++E QN I   FE S PS LPL+ ELTF +PMEDWSP  V  +GK+FSIESE+F++I
Subjt:  MLFMPHPLFVEYSVDRNHISRISLRCFRNALLEGQSYSSMSIHLQEPQNTILFKFEPSRPSALPLHHELTF-LPMEDWSPNQVSLNGKLFSIESEMFSNI

Query:  LTTFSVYNEVDTILITSRGSQITFSAVPREEIIIREE
        +  FS +NE D ILIT+ GS++TFS  P  E  + EE
Subjt:  LTTFSVYNEVDTILITSRGSQITFSAVPREEIIIREE

A0A5D3DSC2 Uncharacterized protein3.2e-3354.74Show/hide
Query:  MLFMPHPLFVEYSVDRNHISRISLRCFRNALLEGQSYSSMSIHLQEPQNTILFKFEPSRPSALPLHHELTF-LPMEDWSPNQVSLNGKLFSIESEMFSNI
        M+ MP PLF EYSVDRNHIS +SL    NAL++G+++++++I ++E QN I   FE S PS LPL+ ELTF +PMEDWSP  V  +GK+FSIESE+F++I
Subjt:  MLFMPHPLFVEYSVDRNHISRISLRCFRNALLEGQSYSSMSIHLQEPQNTILFKFEPSRPSALPLHHELTF-LPMEDWSPNQVSLNGKLFSIESEMFSNI

Query:  LTTFSVYNEVDTILITSRGSQITFSAVPREEIIIREE
        +  FS +NE D ILIT+ GS++TFS  P  E  + EE
Subjt:  LTTFSVYNEVDTILITSRGSQITFSAVPREEIIIREE

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAAGTACAGTACTTTGTATGTGAAAATTTTAGGGTTCTTGGGGAATGTGGAAGAAGATGCTCCCAATAATCTAACGGAGTTTGGATATAGATTTTACATGAAAAAAAA
AAATTCAGTCCACATTTCCTACCATTTTCACATTACCACCACAATGTTCTCAATCAAGGTTGACAACCTTGATCCTTTTTTAGATGCAACATCTCTATTCACCGAATTTA
TCAACGATGAAATCTGCCTCAAGTTCTCACCGTCGACGTTTTCAATGATTGCTCGATATCAATGCCCGACCTTCTTTGCAATGCTGTTCATGCCACATCCATTATTCGTT
GAGTACTCCGTTGATCGAAATCATATTTCAAGGATTTCTCTCCGATGCTTCCGGAATGCTTTGTTGGAAGGTCAAAGCTATTCCTCAATGAGTATCCATCTTCAAGAGCC
CCAAAATACCATACTCTTTAAATTTGAGCCTTCAAGGCCTTCTGCACTACCATTGCATCATGAATTGACATTCTTGCCCATGGAAGATTGGTCTCCTAACCAAGTTAGCC
TAAATGGAAAACTTTTCTCCATTGAGTCTGAAATGTTTAGCAATATTTTAACAACATTTTCTGTCTACAATGAAGTTGATACAATTTTGATTACTTCAAGAGGTTCACAA
ATCACTTTCTCTGCGGTTCCACGTGAGGAGATAATTATTAGGGAAGAGAGTGGAGATTGTTTGATTATAGGTGATAGAGAAGTTGAAACTCACATGCATATGCCTCTTCA
TCCATCCTCACTTTTCATTAATTGTGGACTTCAAGCTCGAAGG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGAAGTACAGTACTTTGTATGTGAAAATTTTAGGGTTCTTGGGGAATGTGGAAGAAGATGCTCCCAATAATCTAACGGAGTTTGGATATAGATTTTACATGAAAAAAAA
AAATTCAGTCCACATTTCCTACCATTTTCACATTACCACCACAATGTTCTCAATCAAGGTTGACAACCTTGATCCTTTTTTAGATGCAACATCTCTATTCACCGAATTTA
TCAACGATGAAATCTGCCTCAAGTTCTCACCGTCGACGTTTTCAATGATTGCTCGATATCAATGCCCGACCTTCTTTGCAATGCTGTTCATGCCACATCCATTATTCGTT
GAGTACTCCGTTGATCGAAATCATATTTCAAGGATTTCTCTCCGATGCTTCCGGAATGCTTTGTTGGAAGGTCAAAGCTATTCCTCAATGAGTATCCATCTTCAAGAGCC
CCAAAATACCATACTCTTTAAATTTGAGCCTTCAAGGCCTTCTGCACTACCATTGCATCATGAATTGACATTCTTGCCCATGGAAGATTGGTCTCCTAACCAAGTTAGCC
TAAATGGAAAACTTTTCTCCATTGAGTCTGAAATGTTTAGCAATATTTTAACAACATTTTCTGTCTACAATGAAGTTGATACAATTTTGATTACTTCAAGAGGTTCACAA
ATCACTTTCTCTGCGGTTCCACGTGAGGAGATAATTATTAGGGAAGAGAGTGGAGATTGTTTGATTATAGGTGATAGAGAAGTTGAAACTCACATGCATATGCCTCTTCA
TCCATCCTCACTTTTCATTAATTGTGGACTTCAAGCTCGAAGG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MKYSTLYVKILGFLGNVEEDAPNNLTEFGYRFYMKKKNSVHISYHFHITTTMFSIKVDNLDPFLDATSLFTEFINDEICLKFSPSTFSMIARYQCPTFFAMLFMPHPLFV
EYSVDRNHISRISLRCFRNALLEGQSYSSMSIHLQEPQNTILFKFEPSRPSALPLHHELTFLPMEDWSPNQVSLNGKLFSIESEMFSNILTTFSVYNEVDTILITSRGSQ
ITFSAVPREEIIIREESGDCLIIGDREVETHMHMPLHPSSLFINCGLQARR