; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Chy5G105120 (gene) of Cucumber (hystrix) v1 genome

Gene IDChy5G105120
OrganismCucumis hystrix (Cucumber (hystrix) v1)
DescriptionElf4 domain-containing protein
Genome locationchrH05:18424222..18426931
RNA-Seq ExpressionChy5G105120
SyntenyChy5G105120
Gene Ontology termsGO:0009649 - entrainment of circadian clock (biological process)
GO:0042753 - positive regulation of circadian rhythm (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
InterPro domainsIPR009741 - Protein EARLY FLOWERING 4 domain
IPR040462 - Protein EARLY FLOWERING 4


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0061471.1 protein ELF4-LIKE 3-like [Cucumis melo var. makuwa]2.04e-5895Show/hide
Query:  MEGETLSRGEIDGKMVQRFQKNFVQVQNILEQNRMLINEINQNQESKMAGNVSRNVGLIRELNNNIRRVVDLYADLSTSFTKSIEHGDSAAKPGYKRNRP
        M+GETLSRGEIDGKMVQRFQ NFVQVQNILEQNRMLINEINQNQES+MAG VSRNVGLIRELNNNIRRVVDLYADLSTSFT SIEHGDSAAKPGYKRNRP
Subjt:  MEGETLSRGEIDGKMVQRFQKNFVQVQNILEQNRMLINEINQNQESKMAGNVSRNVGLIRELNNNIRRVVDLYADLSTSFTKSIEHGDSAAKPGYKRNRP

KGN60512.1 hypothetical protein Csa_019281 [Cucumis sativus]2.13e-6098Show/hide
Query:  MEGETLSRGEIDGKMVQRFQKNFVQVQNILEQNRMLINEINQNQESKMAGNVSRNVGLIRELNNNIRRVVDLYADLSTSFTKSIEHGDSAAKPGYKRNRP
        MEGETLSRGEIDGKMVQRFQKNFVQVQNILEQNRMLINEINQNQES+MAGNVSRNVGLIRELNNNIRRVVDLYADLSTSFTKS EHGDSAAKPGYKRNRP
Subjt:  MEGETLSRGEIDGKMVQRFQKNFVQVQNILEQNRMLINEINQNQESKMAGNVSRNVGLIRELNNNIRRVVDLYADLSTSFTKSIEHGDSAAKPGYKRNRP

XP_022946747.1 protein ELF4-LIKE 3-like [Cucurbita moschata]3.02e-4475.23Show/hide
Query:  MEGETLSRG------EIDGKMVQRFQKNFVQVQNILEQNRMLINEINQNQESKMAGNVSRNVGLIRELNNNIRRVVDLYADLSTSFTKSIE---HGDSAA
        MEGETLS G      ++DGKM Q FQKNFVQVQNIL+QNR+LINEINQN ESKM  N++RNVGLIRELNNNIRRVVDLYA LS SFTKS+E    G+SAA
Subjt:  MEGETLSRG------EIDGKMVQRFQKNFVQVQNILEQNRMLINEINQNQESKMAGNVSRNVGLIRELNNNIRRVVDLYADLSTSFTKSIE---HGDSAA

Query:  KPGYKRNRP
        KPG+KRNRP
Subjt:  KPGYKRNRP

XP_023521403.1 protein ELF4-LIKE 3-like isoform X3 [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.74e-4374.31Show/hide
Query:  MEGETLSRG------EIDGKMVQRFQKNFVQVQNILEQNRMLINEINQNQESKMAGNVSRNVGLIRELNNNIRRVVDLYADLSTSFTKSIE---HGDSAA
        MEGETLS G      ++DGKM   FQKNFVQVQNIL+QNR+LINEINQN ESKM  N++RNVGLIRELNNNIRRVVDLYA LS SFTKS+E    G+SAA
Subjt:  MEGETLSRG------EIDGKMVQRFQKNFVQVQNILEQNRMLINEINQNQESKMAGNVSRNVGLIRELNNNIRRVVDLYADLSTSFTKSIE---HGDSAA

Query:  KPGYKRNRP
        KPG+KRNRP
Subjt:  KPGYKRNRP

XP_038890489.1 protein ELF4-LIKE 3-like [Benincasa hispida]1.59e-4879.44Show/hide
Query:  MEGETLSRG-------EIDGKMVQRFQKNFVQVQNILEQNRMLINEINQNQESKMAGNVSRNVGLIRELNNNIRRVVDLYADLSTSFTKSIEHGDSAAKP
        MEGETLS G       E+DGKMVQ FQKNFVQV+NIL+QNR+LINEINQN ESKM  N++RNVGLIRELNNNIRRVVDLYADLSTSFTKSI+ GDSA KP
Subjt:  MEGETLSRG-------EIDGKMVQRFQKNFVQVQNILEQNRMLINEINQNQESKMAGNVSRNVGLIRELNNNIRRVVDLYADLSTSFTKSIEHGDSAAKP

Query:  GYKRNRP
        G+KRNRP
Subjt:  GYKRNRP

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LIL2 Elf4 domain-containing protein2.1e-4598Show/hide
Query:  MEGETLSRGEIDGKMVQRFQKNFVQVQNILEQNRMLINEINQNQESKMAGNVSRNVGLIRELNNNIRRVVDLYADLSTSFTKSIEHGDSAAKPGYKRNRP
        MEGETLSRGEIDGKMVQRFQKNFVQVQNILEQNRMLINEINQNQES+MAGNVSRNVGLIRELNNNIRRVVDLYADLSTSFTKS EHGDSAAKPGYKRNRP
Subjt:  MEGETLSRGEIDGKMVQRFQKNFVQVQNILEQNRMLINEINQNQESKMAGNVSRNVGLIRELNNNIRRVVDLYADLSTSFTKSIEHGDSAAKPGYKRNRP

A0A1U7WX74 protein ELF4-LIKE 3-like2.3e-3173.08Show/hide
Query:  MEGETLSR----GEIDGKMVQRFQKNFVQVQNILEQNRMLINEINQNQESKMAGNVSRNVGLIRELNNNIRRVVDLYADLSTSFTKSIEHGDSAAKPGYK
        MEG+TLS      +IDGK+VQ FQKNFVQVQNIL+QNR+LINEINQNQESK+  N+SRNVGLIRELNNNIRRVVDLYADLSTSFTKS+++       G+K
Subjt:  MEGETLSR----GEIDGKMVQRFQKNFVQVQNILEQNRMLINEINQNQESKMAGNVSRNVGLIRELNNNIRRVVDLYADLSTSFTKSIEHGDSAAKPGYK

Query:  RNRP
        R+RP
Subjt:  RNRP

A0A5D3CFW0 Protein ELF4-LIKE 3-like6.9e-4495Show/hide
Query:  MEGETLSRGEIDGKMVQRFQKNFVQVQNILEQNRMLINEINQNQESKMAGNVSRNVGLIRELNNNIRRVVDLYADLSTSFTKSIEHGDSAAKPGYKRNRP
        M+GETLSRGEIDGKMVQRFQ NFVQVQNILEQNRMLINEINQNQES+MAG VSRNVGLIRELNNNIRRVVDLYADLSTSFT SIEHGDSAAKPGYKRNRP
Subjt:  MEGETLSRGEIDGKMVQRFQKNFVQVQNILEQNRMLINEINQNQESKMAGNVSRNVGLIRELNNNIRRVVDLYADLSTSFTKSIEHGDSAAKPGYKRNRP

A0A6J1G4K6 protein ELF4-LIKE 3-like3.2e-3375.23Show/hide
Query:  MEGETLSRG------EIDGKMVQRFQKNFVQVQNILEQNRMLINEINQNQESKMAGNVSRNVGLIRELNNNIRRVVDLYADLSTSFTKSIE---HGDSAA
        MEGETLS G      ++DGKM Q FQKNFVQVQNIL+QNR+LINEINQN ESKM  N++RNVGLIRELNNNIRRVVDLYA LS SFTKS+E    G+SAA
Subjt:  MEGETLSRG------EIDGKMVQRFQKNFVQVQNILEQNRMLINEINQNQESKMAGNVSRNVGLIRELNNNIRRVVDLYADLSTSFTKSIE---HGDSAA

Query:  KPGYKRNRP
        KPG+KRNRP
Subjt:  KPGYKRNRP

A0A6J1KJ14 protein ELF4-LIKE 3-like3.2e-3375.23Show/hide
Query:  MEGETLSRG------EIDGKMVQRFQKNFVQVQNILEQNRMLINEINQNQESKMAGNVSRNVGLIRELNNNIRRVVDLYADLSTSFTKSIE---HGDSAA
        MEGETLS G      ++DGKM Q FQKNFVQVQNIL+QNR+LINEINQN ESKM  N++RNVGLIRELNNNIRRVVDLYA LS SFTKS+E    G+SAA
Subjt:  MEGETLSRG------EIDGKMVQRFQKNFVQVQNILEQNRMLINEINQNQESKMAGNVSRNVGLIRELNNNIRRVVDLYADLSTSFTKSIE---HGDSAA

Query:  KPGYKRNRP
        KPG+KRNRP
Subjt:  KPGYKRNRP

SwissProt top hitse value%identityAlignment
O04211 Protein EARLY FLOWERING 43.8e-1544.44Show/hide
Query:  ERRNNMEGETLSRGEIDGKMVQRFQKNFVQVQNILEQNRMLINEINQNQESKMAGNVSRNVGLIRELNNNIRRVVDLYADLSTSFTKSIEHGDSAAKPG
        +RR N+  E   +GE D  M +   +NF QVQ++L++NR LI ++N N +S+MA N+S+NV LI+ELN NI +VV++Y+DL+TSF+     G +    G
Subjt:  ERRNNMEGETLSRGEIDGKMVQRFQKNFVQVQNILEQNRMLINEINQNQESKMAGNVSRNVGLIRELNNNIRRVVDLYADLSTSFTKSIEHGDSAAKPG

O80877 Protein ELF4-LIKE 11.6e-1038.54Show/hide
Query:  NNMEGETLSRGEIDGKMVQRFQKNFVQVQNILEQNRMLINEINQNQESKMAGNVSRNVGLIRELNNNIRRVVDLYADLSTSFTKSIEHGDSAAKPG
        N+ E    S    D ++       F + Q  L+QNR LI  +N+N  S++  NVSRNVGLI E+N NI +V+++Y+DLS +F K  +      K G
Subjt:  NNMEGETLSRGEIDGKMVQRFQKNFVQVQNILEQNRMLINEINQNQESKMAGNVSRNVGLIRELNNNIRRVVDLYADLSTSFTKSIEHGDSAAKPG

Q570U6 Protein ELF4-LIKE 41.3e-2359.18Show/hide
Query:  MEGETLS----RGEIDGKMVQRFQKNFVQVQNILEQNRMLINEINQNQESKMAGNVSRNVGLIRELNNNIRRVVDLYADLSTSFTKSIEHGDSAAKPG
        MEG+ LS    R  +DGK++Q FQK+FV VQ+IL+QNR+LINEINQN ESK   N+ RNVGLI+ELNNNIRRV  LY DLS SF +S++        G
Subjt:  MEGETLS----RGEIDGKMVQRFQKNFVQVQNILEQNRMLINEINQNQESKMAGNVSRNVGLIRELNNNIRRVVDLYADLSTSFTKSIEHGDSAAKPG

Q8S8F5 Protein ELF4-LIKE 31.3e-2660.19Show/hide
Query:  MEGETLSR-----GEIDGKMVQRFQKNFVQVQNILEQNRMLINEINQNQESKMAGNVSRNVGLIRELNNNIRRVVDLYADLSTSFTKSIE---HGDSAAK
        MEG+T+SR      ++DGK++Q F+K+FVQVQNIL+ NR+LINEINQN ESK+  N+ RNVGLIRELNNN+RRV  LY DLS +F+KS+E    GDS+  
Subjt:  MEGETLSR-----GEIDGKMVQRFQKNFVQVQNILEQNRMLINEINQNQESKMAGNVSRNVGLIRELNNNIRRVVDLYADLSTSFTKSIE---HGDSAAK

Query:  PGYKRNRP
         G +R RP
Subjt:  PGYKRNRP

Q94BS8 Protein ELF4-LIKE 21.3e-2358Show/hide
Query:  NNMEGETLS----RGEIDGKMVQRFQKNFVQVQNILEQNRMLINEINQNQESKMAGNVSRNVGLIRELNNNIRRVVDLYADLSTSFTKSIEHGDSAAKPG
        + MEG+  S    R ++DGK++Q FQK+FVQVQ+IL+QNR+LINEINQN ESK A ++ RNVGLIRELNNNIR V  LY DLS SF +S++        G
Subjt:  NNMEGETLS----RGEIDGKMVQRFQKNFVQVQNILEQNRMLINEINQNQESKMAGNVSRNVGLIRELNNNIRRVVDLYADLSTSFTKSIEHGDSAAKPG

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G17455.1 ELF4-like 49.2e-2559.18Show/hide
Query:  MEGETLS----RGEIDGKMVQRFQKNFVQVQNILEQNRMLINEINQNQESKMAGNVSRNVGLIRELNNNIRRVVDLYADLSTSFTKSIEHGDSAAKPG
        MEG+ LS    R  +DGK++Q FQK+FV VQ+IL+QNR+LINEINQN ESK   N+ RNVGLI+ELNNNIRRV  LY DLS SF +S++        G
Subjt:  MEGETLS----RGEIDGKMVQRFQKNFVQVQNILEQNRMLINEINQNQESKMAGNVSRNVGLIRELNNNIRRVVDLYADLSTSFTKSIEHGDSAAKPG

AT1G17455.2 ELF4-like 49.2e-2559.18Show/hide
Query:  MEGETLS----RGEIDGKMVQRFQKNFVQVQNILEQNRMLINEINQNQESKMAGNVSRNVGLIRELNNNIRRVVDLYADLSTSFTKSIEHGDSAAKPG
        MEG+ LS    R  +DGK++Q FQK+FV VQ+IL+QNR+LINEINQN ESK   N+ RNVGLI+ELNNNIRRV  LY DLS SF +S++        G
Subjt:  MEGETLS----RGEIDGKMVQRFQKNFVQVQNILEQNRMLINEINQNQESKMAGNVSRNVGLIRELNNNIRRVVDLYADLSTSFTKSIEHGDSAAKPG

AT1G72630.1 ELF4-like 29.2e-2558Show/hide
Query:  NNMEGETLS----RGEIDGKMVQRFQKNFVQVQNILEQNRMLINEINQNQESKMAGNVSRNVGLIRELNNNIRRVVDLYADLSTSFTKSIEHGDSAAKPG
        + MEG+  S    R ++DGK++Q FQK+FVQVQ+IL+QNR+LINEINQN ESK A ++ RNVGLIRELNNNIR V  LY DLS SF +S++        G
Subjt:  NNMEGETLS----RGEIDGKMVQRFQKNFVQVQNILEQNRMLINEINQNQESKMAGNVSRNVGLIRELNNNIRRVVDLYADLSTSFTKSIEHGDSAAKPG

AT2G06255.1 ELF4-like 38.9e-2860.19Show/hide
Query:  MEGETLSR-----GEIDGKMVQRFQKNFVQVQNILEQNRMLINEINQNQESKMAGNVSRNVGLIRELNNNIRRVVDLYADLSTSFTKSIE---HGDSAAK
        MEG+T+SR      ++DGK++Q F+K+FVQVQNIL+ NR+LINEINQN ESK+  N+ RNVGLIRELNNN+RRV  LY DLS +F+KS+E    GDS+  
Subjt:  MEGETLSR-----GEIDGKMVQRFQKNFVQVQNILEQNRMLINEINQNQESKMAGNVSRNVGLIRELNNNIRRVVDLYADLSTSFTKSIE---HGDSAAK

Query:  PGYKRNRP
         G +R RP
Subjt:  PGYKRNRP

AT2G40080.1 Protein of unknown function (DUF1313)2.7e-1644.44Show/hide
Query:  ERRNNMEGETLSRGEIDGKMVQRFQKNFVQVQNILEQNRMLINEINQNQESKMAGNVSRNVGLIRELNNNIRRVVDLYADLSTSFTKSIEHGDSAAKPG
        +RR N+  E   +GE D  M +   +NF QVQ++L++NR LI ++N N +S+MA N+S+NV LI+ELN NI +VV++Y+DL+TSF+     G +    G
Subjt:  ERRNNMEGETLSRGEIDGKMVQRFQKNFVQVQNILEQNRMLINEINQNQESKMAGNVSRNVGLIRELNNNIRRVVDLYADLSTSFTKSIEHGDSAAKPG


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTACTCTGGTTGTTTGCGAGTTGCGAGCCTTCCAGTGATTGAGAGAAGAAATAATATGGAGGGGGAGACATTGTCAAGAGGAGAAATTGATGGGAAAATGGTG
CAGAGATTTCAAAAGAATTTCGTTCAAGTACAGAACATTTTGGAGCAAAACAGAATGTTGATCAATGAAATAAACCAAAATCAGGAGTCGAAAATGGCGGGTAAT
GTGAGCAGAAACGTGGGTCTGATTCGAGAGCTGAACAACAACATCAGAAGAGTTGTTGATTTATATGCTGATCTCTCCACTTCCTTCACCAAATCCATCGAACAT
GGAGACTCCGCGGCCAAGCCTGGCTACAAGCGCAACCGCCCATAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGTACTCTGGTTGTTTGCGAGTTGCGAGCCTTCCAGTGATTGAGAGAAGAAATAATATGGAGGGGGAGACATTGTCAAGAGGAGAAATTGATGGGAAAATGGTG
CAGAGATTTCAAAAGAATTTCGTTCAAGTACAGAACATTTTGGAGCAAAACAGAATGTTGATCAATGAAATAAACCAAAATCAGGAGTCGAAAATGGCGGGTAAT
GTGAGCAGAAACGTGGGTCTGATTCGAGAGCTGAACAACAACATCAGAAGAGTTGTTGATTTATATGCTGATCTCTCCACTTCCTTCACCAAATCCATCGAACAT
GGAGACTCCGCGGCCAAGCCTGGCTACAAGCGCAACCGCCCATAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MYSGCLRVASLPVIERRNNMEGETLSRGEIDGKMVQRFQKNFVQVQNILEQNRMLINEINQNQESKMAGNVSRNVGLIRELNNNIRRVVDLYADLSTSFTKSIEH
GDSAAKPGYKRNRP