CuGenDBv2

Gene ID	Chy6G127440
Organism	Cucumis hystrix (Cucumber (hystrix) v1)
Description	Homer protein
Genome location	chrH06:26328871..26331070
RNA-Seq Expression	Chy6G127440
Synteny	Chy6G127440
Gene Ontology terms	GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domains	NA

Homology

Show/hide homology

GenBank top hits

e value

%identity

Alignment

KAG7015805.1 hypothetical protein SDJN02_23443 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]

1.80e-178

86.62

Show/hide

Query:  MAATIKLSILSSSNPIHLPPISTNFLKSHPSSTKICHKRLRFSTPRLKILKCTSESNDQAQNDFSLKNALSSMVGEQVEELLNREENRSLLDGLEKASMR
        M+ATIK S LS SNPIHL  ISTNFLKSHPSS  I HK L FSTPRLKI+KC+SESND+AQN+ +L NALSSMVGEQ+EELLN+EENRSLLDGLEKASMR
Subjt:  MAATIKLSILSSSNPIHLPPISTNFLKSHPSSTKICHKRLRFSTPRLKILKCTSESNDQAQNDFSLKNALSSMVGEQVEELLNREENRSLLDGLEKASMR

Query:  VEIAKKQLAEIEKQELELKRFKDYVRQLENRASEIEECQKEILEARGMIEEAERSLAQSEGGNAIKDGEDGGLDRDEERFESVKAASISAIVGTLAGLPI
        VEIAK+QLAEIEKQELELKRFKDY+ QLE+RASEIEECQKEILEARGMIEEAERSL+QSEGGNA +D EDGG+DRDEER ESVKAASISAIVGTLAGLPI
Subjt:  VEIAKKQLAEIEKQELELKRFKDYVRQLENRASEIEECQKEILEARGMIEEAERSLAQSEGGNAIKDGEDGGLDRDEERFESVKAASISAIVGTLAGLPI

Query:  FLNQVNSTSQLLLPTAITFISCALFGVTFRYTIRRDLDNIQLKTGTSAAFGFVKGLATLDGGVPLELSAESFSSHVIDAAVYVSENLYVFICAAVALDYC
        FLNQV S SQL LP AITFISCALFGVTFRYTIRRDLDNIQLKTGTSAAFGFVKGLATLDGGVPLE +AESFSSHV DAAVYVSENLY+FI AAVAL++C
Subjt:  FLNQVNSTSQLLLPTAITFISCALFGVTFRYTIRRDLDNIQLKTGTSAAFGFVKGLATLDGGVPLELSAESFSSHVIDAAVYVSENLYVFICAAVALDYC

Query:  FKMSLLSPFPIRKS
        FKM LLSPFPIRKS
Subjt:  FKMSLLSPFPIRKS

XP_004146131.1 uncharacterized protein LOC101213449 [Cucumis sativus]

1.75e-209

98.12

Show/hide

Query:  MAATIKLSILSSSNPIHLPPISTNFLKSHPSSTKICHKRLRFSTPRLKILKCTSESNDQAQNDFSLKNALSSMVGEQVEELLNREENRSLLDGLEKASMR
        MAATIKLSILSSSNPIHLPPISTNFLKSHPSSTKICHKRL FSTPRLKILKCTSESNDQAQNDFSLKNALSSMVGEQVEELLNREENRSLLDGLEKASMR
Subjt:  MAATIKLSILSSSNPIHLPPISTNFLKSHPSSTKICHKRLRFSTPRLKILKCTSESNDQAQNDFSLKNALSSMVGEQVEELLNREENRSLLDGLEKASMR

Query:  VEIAKKQLAEIEKQELELKRFKDYVRQLENRASEIEECQKEILEARGMIEEAERSLAQSEGGNAIKDGEDGGLDRDEERFESVKAASISAIVGTLAGLPI
        VEIAKKQLAEIEKQELELKRFKDYV QLENRASEIEECQKEILEARGMIEEAERSLAQSEGGNAI+DGEDGGLDRDEERFESVKAASISAIVGTLAGLPI
Subjt:  VEIAKKQLAEIEKQELELKRFKDYVRQLENRASEIEECQKEILEARGMIEEAERSLAQSEGGNAIKDGEDGGLDRDEERFESVKAASISAIVGTLAGLPI

Query:  FLNQVNSTSQLLLPTAITFISCALFGVTFRYTIRRDLDNIQLKTGTSAAFGFVKGLATLDGGVPLELSAESFSSHVIDAAVYVSENLYVFICAAVALDYC
        FLNQVNSTSQLLLPTAITFISCALFGVTFRYTIRRDLDNIQLKTGT AAFGFVKGLATLDGGVPLELSAESFSSHVIDAAVYVSENLY+FICAAVALDYC
Subjt:  FLNQVNSTSQLLLPTAITFISCALFGVTFRYTIRRDLDNIQLKTGTSAAFGFVKGLATLDGGVPLELSAESFSSHVIDAAVYVSENLYVFICAAVALDYC

Query:  FKMSLLSPFPIRKSTSRVN
        FKMSLLSPFPIRKS SRVN
Subjt:  FKMSLLSPFPIRKSTSRVN

XP_008448570.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103490708 [Cucumis melo]

1.18e-207

97.18

Show/hide

Query:  MAATIKLSILSSSNPIHLPPISTNFLKSHPSSTKICHKRLRFSTPRLKILKCTSESNDQAQNDFSLKNALSSMVGEQVEELLNREENRSLLDGLEKASMR
        MAATIK S LSSSNPIHLPPISTNFLKSHPSSTKICHKRL FSTPRLKILKCTSESNDQAQNDF+LKNALSSMVGEQVEELLNREENRSLLDGLEKASMR
Subjt:  MAATIKLSILSSSNPIHLPPISTNFLKSHPSSTKICHKRLRFSTPRLKILKCTSESNDQAQNDFSLKNALSSMVGEQVEELLNREENRSLLDGLEKASMR

Query:  VEIAKKQLAEIEKQELELKRFKDYVRQLENRASEIEECQKEILEARGMIEEAERSLAQSEGGNAIKDGEDGGLDRDEERFESVKAASISAIVGTLAGLPI
        VEIAKKQLAEIEKQELELKRFKDYV QLENRASEIEECQKEILEARGMIEEAERSLAQSEGGNAI+DGEDGGLDRDEERFESVK ASISAIVGTLAGLPI
Subjt:  VEIAKKQLAEIEKQELELKRFKDYVRQLENRASEIEECQKEILEARGMIEEAERSLAQSEGGNAIKDGEDGGLDRDEERFESVKAASISAIVGTLAGLPI

Query:  FLNQVNSTSQLLLPTAITFISCALFGVTFRYTIRRDLDNIQLKTGTSAAFGFVKGLATLDGGVPLELSAESFSSHVIDAAVYVSENLYVFICAAVALDYC
        FLNQVNSTSQLLLPTAITFISCALFGVTFRYTIRRDLDNIQLKTGTSAAFGFVKGLATLDGGVPLELSAESFSSHVIDAAVYVSENLY+FICAAVALDYC
Subjt:  FLNQVNSTSQLLLPTAITFISCALFGVTFRYTIRRDLDNIQLKTGTSAAFGFVKGLATLDGGVPLELSAESFSSHVIDAAVYVSENLYVFICAAVALDYC

Query:  FKMSLLSPFPIRKSTSRVN
        FKMSLLSPFPIRKS SRVN
Subjt:  FKMSLLSPFPIRKSTSRVN

XP_022923575.1 uncharacterized protein LOC111431219 [Cucurbita moschata]

4.43e-179

86.94

Show/hide

Query:  MAATIKLSILSSSNPIHLPPISTNFLKSHPSSTKICHKRLRFSTPRLKILKCTSESNDQAQNDFSLKNALSSMVGEQVEELLNREENRSLLDGLEKASMR
        M+ATIK S LS SNPIHL  ISTNFLKSHPSS  I HK L FSTPRLKI+KC+SESND+AQN+ +L NALSSMVGEQ+EELLN+EENRSLLDGLEKASMR
Subjt:  MAATIKLSILSSSNPIHLPPISTNFLKSHPSSTKICHKRLRFSTPRLKILKCTSESNDQAQNDFSLKNALSSMVGEQVEELLNREENRSLLDGLEKASMR

Query:  VEIAKKQLAEIEKQELELKRFKDYVRQLENRASEIEECQKEILEARGMIEEAERSLAQSEGGNAIKDGEDGGLDRDEERFESVKAASISAIVGTLAGLPI
        VEIAK+QLAEIEKQELELKRFKDY+ QLE+RASEIEECQKEILEARGMIEEAERSL+QSEGGNA +D EDGG+DRDEER ESVKAASISAIVGTLAGLPI
Subjt:  VEIAKKQLAEIEKQELELKRFKDYVRQLENRASEIEECQKEILEARGMIEEAERSLAQSEGGNAIKDGEDGGLDRDEERFESVKAASISAIVGTLAGLPI

Query:  FLNQVNSTSQLLLPTAITFISCALFGVTFRYTIRRDLDNIQLKTGTSAAFGFVKGLATLDGGVPLELSAESFSSHVIDAAVYVSENLYVFICAAVALDYC
        FLNQV S SQL LPTAITFISCALFGVTFRYTIRRDLDNIQLKTGTSAAFGFVKGLATLDGGVPLE +AESFSSHV DAAVYVSENLY+FI AAVAL++C
Subjt:  FLNQVNSTSQLLLPTAITFISCALFGVTFRYTIRRDLDNIQLKTGTSAAFGFVKGLATLDGGVPLELSAESFSSHVIDAAVYVSENLYVFICAAVALDYC

Query:  FKMSLLSPFPIRKS
        FKM LLSPFPIRKS
Subjt:  FKMSLLSPFPIRKS

XP_038876566.1 uncharacterized protein LOC120068995 [Benincasa hispida]

3.06e-187

89.03

Show/hide

Query:  MAATIKLSILSSSNPIHLPPISTNFLKSHPSSTKICHKRLRFSTPRLKILKCTSESNDQAQNDFSLKNALSSMVGEQVEELLNREENRSLLDGLEKASMR
        M+ATIK   LS SNPIHL  IST FLKSH SST + HKRL FSTPRLKI+KC+S+SND+A+NDF+LKNALSSMVGEQVEELLNREENRSLLDGLEKASMR
Subjt:  MAATIKLSILSSSNPIHLPPISTNFLKSHPSSTKICHKRLRFSTPRLKILKCTSESNDQAQNDFSLKNALSSMVGEQVEELLNREENRSLLDGLEKASMR

Query:  VEIAKKQLAEIEKQELELKRFKDYVRQLENRASEIEECQKEILEARGMIEEAERSLAQSEGGNAIKDGEDGGLDRDEERFESVKAASISAIVGTLAGLPI
        VEIA+KQLAEIEKQELELKRFKDYV QLENRASEIEECQKEILEARGMIEEAERSLAQSEGGNA++DGEDG LDRDEER ESVKAASISAIVGTLAGLPI
Subjt:  VEIAKKQLAEIEKQELELKRFKDYVRQLENRASEIEECQKEILEARGMIEEAERSLAQSEGGNAIKDGEDGGLDRDEERFESVKAASISAIVGTLAGLPI

Query:  FLNQVNSTSQLLLPTAITFISCALFGVTFRYTIRRDLDNIQLKTGTSAAFGFVKGLATLDGGVPLELSAESFSSHVIDAAVYVSENLYVFICAAVALDYC
        FLNQV STS LLLPTAITFISCALFGVTFRYT+RRDLDNIQLKTGT+AAFGFVKGLATLDGGVPLEL+AES SSHV DAAVYVSENLYVFI AAVALDYC
Subjt:  FLNQVNSTSQLLLPTAITFISCALFGVTFRYTIRRDLDNIQLKTGTSAAFGFVKGLATLDGGVPLELSAESFSSHVIDAAVYVSENLYVFICAAVALDYC

Query:  FKMSLLSPFPIRKSTSRVN
        FKM LLSPFPIRKS SRVN
Subjt:  FKMSLLSPFPIRKSTSRVN

TrEMBL top hits

e value

%identity

Alignment

A0A1S3BK07 uncharacterized protein LOC103490708

9.7e-162

97.18

Show/hide

Query:  MAATIKLSILSSSNPIHLPPISTNFLKSHPSSTKICHKRLRFSTPRLKILKCTSESNDQAQNDFSLKNALSSMVGEQVEELLNREENRSLLDGLEKASMR
        MAATIK S LSSSNPIHLPPISTNFLKSHPSSTKICHKRL FSTPRLKILKCTSESNDQAQNDF+LKNALSSMVGEQVEELLNREENRSLLDGLEKASMR
Subjt:  MAATIKLSILSSSNPIHLPPISTNFLKSHPSSTKICHKRLRFSTPRLKILKCTSESNDQAQNDFSLKNALSSMVGEQVEELLNREENRSLLDGLEKASMR

Query:  VEIAKKQLAEIEKQELELKRFKDYVRQLENRASEIEECQKEILEARGMIEEAERSLAQSEGGNAIKDGEDGGLDRDEERFESVKAASISAIVGTLAGLPI
        VEIAKKQLAEIEKQELELKRFKDYV QLENRASEIEECQKEILEARGMIEEAERSLAQSEGGNAI+DGEDGGLDRDEERFESVK ASISAIVGTLAGLPI
Subjt:  VEIAKKQLAEIEKQELELKRFKDYVRQLENRASEIEECQKEILEARGMIEEAERSLAQSEGGNAIKDGEDGGLDRDEERFESVKAASISAIVGTLAGLPI

Query:  FLNQVNSTSQLLLPTAITFISCALFGVTFRYTIRRDLDNIQLKTGTSAAFGFVKGLATLDGGVPLELSAESFSSHVIDAAVYVSENLYVFICAAVALDYC
        FLNQVNSTSQLLLPTAITFISCALFGVTFRYTIRRDLDNIQLKTGTSAAFGFVKGLATLDGGVPLELSAESFSSHVIDAAVYVSENLY+FICAAVALDYC
Subjt:  FLNQVNSTSQLLLPTAITFISCALFGVTFRYTIRRDLDNIQLKTGTSAAFGFVKGLATLDGGVPLELSAESFSSHVIDAAVYVSENLYVFICAAVALDYC

Query:  FKMSLLSPFPIRKSTSRVN
        FKMSLLSPFPIRKS SRVN
Subjt:  FKMSLLSPFPIRKSTSRVN

A0A5A7UAK6 Uncharacterized protein

9.7e-162

97.18

Show/hide

Query:  MAATIKLSILSSSNPIHLPPISTNFLKSHPSSTKICHKRLRFSTPRLKILKCTSESNDQAQNDFSLKNALSSMVGEQVEELLNREENRSLLDGLEKASMR
        MAATIK S LSSSNPIHLPPISTNFLKSHPSSTKICHKRL FSTPRLKILKCTSESNDQAQNDF+LKNALSSMVGEQVEELLNREENRSLLDGLEKASMR
Subjt:  MAATIKLSILSSSNPIHLPPISTNFLKSHPSSTKICHKRLRFSTPRLKILKCTSESNDQAQNDFSLKNALSSMVGEQVEELLNREENRSLLDGLEKASMR

Query:  VEIAKKQLAEIEKQELELKRFKDYVRQLENRASEIEECQKEILEARGMIEEAERSLAQSEGGNAIKDGEDGGLDRDEERFESVKAASISAIVGTLAGLPI
        VEIAKKQLAEIEKQELELKRFKDYV QLENRASEIEECQKEILEARGMIEEAERSLAQSEGGNAI+DGEDGGLDRDEERFESVK ASISAIVGTLAGLPI
Subjt:  VEIAKKQLAEIEKQELELKRFKDYVRQLENRASEIEECQKEILEARGMIEEAERSLAQSEGGNAIKDGEDGGLDRDEERFESVKAASISAIVGTLAGLPI

Query:  FLNQVNSTSQLLLPTAITFISCALFGVTFRYTIRRDLDNIQLKTGTSAAFGFVKGLATLDGGVPLELSAESFSSHVIDAAVYVSENLYVFICAAVALDYC
        FLNQVNSTSQLLLPTAITFISCALFGVTFRYTIRRDLDNIQLKTGTSAAFGFVKGLATLDGGVPLELSAESFSSHVIDAAVYVSENLY+FICAAVALDYC
Subjt:  FLNQVNSTSQLLLPTAITFISCALFGVTFRYTIRRDLDNIQLKTGTSAAFGFVKGLATLDGGVPLELSAESFSSHVIDAAVYVSENLYVFICAAVALDYC

Query:  FKMSLLSPFPIRKSTSRVN
        FKMSLLSPFPIRKS SRVN
Subjt:  FKMSLLSPFPIRKSTSRVN

A0A6J1EC82 uncharacterized protein LOC111431219

8.0e-140

86.94

Show/hide

Query:  MAATIKLSILSSSNPIHLPPISTNFLKSHPSSTKICHKRLRFSTPRLKILKCTSESNDQAQNDFSLKNALSSMVGEQVEELLNREENRSLLDGLEKASMR
        M+ATIK S LS SNPIHL  ISTNFLKSHPSS  I HK L FSTPRLKI+KC+SESND+AQN+ +L NALSSMVGEQ+EELLN+EENRSLLDGLEKASMR
Subjt:  MAATIKLSILSSSNPIHLPPISTNFLKSHPSSTKICHKRLRFSTPRLKILKCTSESNDQAQNDFSLKNALSSMVGEQVEELLNREENRSLLDGLEKASMR

Query:  VEIAKKQLAEIEKQELELKRFKDYVRQLENRASEIEECQKEILEARGMIEEAERSLAQSEGGNAIKDGEDGGLDRDEERFESVKAASISAIVGTLAGLPI
        VEIAK+QLAEIEKQELELKRFKDY+ QLE+RASEIEECQKEILEARGMIEEAERSL+QSEGGNA +D EDGG+DRDEER ESVKAASISAIVGTLAGLPI
Subjt:  VEIAKKQLAEIEKQELELKRFKDYVRQLENRASEIEECQKEILEARGMIEEAERSLAQSEGGNAIKDGEDGGLDRDEERFESVKAASISAIVGTLAGLPI

Query:  FLNQVNSTSQLLLPTAITFISCALFGVTFRYTIRRDLDNIQLKTGTSAAFGFVKGLATLDGGVPLELSAESFSSHVIDAAVYVSENLYVFICAAVALDYC
        FLNQV S SQL LPTAITFISCALFGVTFRYTIRRDLDNIQLKTGTSAAFGFVKGLATLDGGVPLE +AESFSSHV DAAVYVSENLY+FI AAVAL++C
Subjt:  FLNQVNSTSQLLLPTAITFISCALFGVTFRYTIRRDLDNIQLKTGTSAAFGFVKGLATLDGGVPLELSAESFSSHVIDAAVYVSENLYVFICAAVALDYC

Query:  FKMSLLSPFPIRKS
        FKM LLSPFPIRKS
Subjt:  FKMSLLSPFPIRKS

A0A6J1HQG8 uncharacterized protein LOC111465167

1.7e-137

85.67

Show/hide

Query:  MAATIKLSILSSSNPIHLPPISTNFLKSHPSSTKICHKRLRFSTPRLKILKCTSESNDQAQNDFSLKNALSSMVGEQVEELLNREENRSLLDGLEKASMR
        M+ATIK S LS SNPIHL  ISTNFLKSHPSS  I H  L FSTPRLKI+KC+SESND+AQN+ +L NALSSMVGEQ+EELLN+EENRSLLDGLEKASMR
Subjt:  MAATIKLSILSSSNPIHLPPISTNFLKSHPSSTKICHKRLRFSTPRLKILKCTSESNDQAQNDFSLKNALSSMVGEQVEELLNREENRSLLDGLEKASMR

Query:  VEIAKKQLAEIEKQELELKRFKDYVRQLENRASEIEECQKEILEARGMIEEAERSLAQSEGGNAIKDGEDGGLDRDEERFESVKAASISAIVGTLAGLPI
        VEIAK+QLAEIEKQELELKRFKD++ QLE+RASEIEECQKEILEARGMIEEAERSL+QSEGGNA +D EDGG+DRDEER ESVKAASISAIVGTLAGLPI
Subjt:  VEIAKKQLAEIEKQELELKRFKDYVRQLENRASEIEECQKEILEARGMIEEAERSLAQSEGGNAIKDGEDGGLDRDEERFESVKAASISAIVGTLAGLPI

Query:  FLNQVNSTSQLLLPTAITFISCALFGVTFRYTIRRDLDNIQLKTGTSAAFGFVKGLATLDGGVPLELSAESFSSHVIDAAVYVSENLYVFICAAVALDYC
        FLNQV S SQL LP AITFISCALFGVTFRYTIRRDLDNIQLKTGTSAAFGFVKGLATLDGGVPLE +AESFSSHV DAAVYVSENLY+FI AAVAL++C
Subjt:  FLNQVNSTSQLLLPTAITFISCALFGVTFRYTIRRDLDNIQLKTGTSAAFGFVKGLATLDGGVPLELSAESFSSHVIDAAVYVSENLYVFICAAVALDYC

Query:  FKMSLLSPFPIRKS
        FK+ LLSPFPIRKS
Subjt:  FKMSLLSPFPIRKS

E5RDC3 Uncharacterized protein

9.7e-162

97.18

Show/hide

Query:  MAATIKLSILSSSNPIHLPPISTNFLKSHPSSTKICHKRLRFSTPRLKILKCTSESNDQAQNDFSLKNALSSMVGEQVEELLNREENRSLLDGLEKASMR
        MAATIK S LSSSNPIHLPPISTNFLKSHPSSTKICHKRL FSTPRLKILKCTSESNDQAQNDF+LKNALSSMVGEQVEELLNREENRSLLDGLEKASMR
Subjt:  MAATIKLSILSSSNPIHLPPISTNFLKSHPSSTKICHKRLRFSTPRLKILKCTSESNDQAQNDFSLKNALSSMVGEQVEELLNREENRSLLDGLEKASMR

Query:  VEIAKKQLAEIEKQELELKRFKDYVRQLENRASEIEECQKEILEARGMIEEAERSLAQSEGGNAIKDGEDGGLDRDEERFESVKAASISAIVGTLAGLPI
        VEIAKKQLAEIEKQELELKRFKDYV QLENRASEIEECQKEILEARGMIEEAERSLAQSEGGNAI+DGEDGGLDRDEERFESVK ASISAIVGTLAGLPI
Subjt:  VEIAKKQLAEIEKQELELKRFKDYVRQLENRASEIEECQKEILEARGMIEEAERSLAQSEGGNAIKDGEDGGLDRDEERFESVKAASISAIVGTLAGLPI

Query:  FLNQVNSTSQLLLPTAITFISCALFGVTFRYTIRRDLDNIQLKTGTSAAFGFVKGLATLDGGVPLELSAESFSSHVIDAAVYVSENLYVFICAAVALDYC
        FLNQVNSTSQLLLPTAITFISCALFGVTFRYTIRRDLDNIQLKTGTSAAFGFVKGLATLDGGVPLELSAESFSSHVIDAAVYVSENLY+FICAAVALDYC
Subjt:  FLNQVNSTSQLLLPTAITFISCALFGVTFRYTIRRDLDNIQLKTGTSAAFGFVKGLATLDGGVPLELSAESFSSHVIDAAVYVSENLYVFICAAVALDYC

Query:  FKMSLLSPFPIRKSTSRVN
        FKMSLLSPFPIRKS SRVN
Subjt:  FKMSLLSPFPIRKSTSRVN

SwissProt top hits	e value	%identity	Alignment
No hits found

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT4G24090.1 unknown protein

2.9e-73

58.02

Show/hide

Query:  LKCTSESNDQAQND-FSLKNALSSMVGEQVEELLNREENRSLLDGLEKASMRVEIAKKQLAEIEKQELELKRFKDYVRQLENRASEIEECQKEILEARGM
        ++ +SE N    +D   LKN+LS +VG QVEELL+REEN+ LLDGLEKAS+RVEIAK++L +IE+QE+E K  +DY+ QLE+RA+EI ECQ+EI  AR M
Subjt:  LKCTSESNDQAQND-FSLKNALSSMVGEQVEELLNREENRSLLDGLEKASMRVEIAKKQLAEIEKQELELKRFKDYVRQLENRASEIEECQKEILEARGM

Query:  IEEAERSLAQSEGGNAIKDGEDGGLDRDEERFESVKAASISAIVGTLAGLPIFLNQVNSTSQLLLPTAITFISCALFGVTFRYTIRRDLDNIQLKTGTSA
        +EEAERSL+ ++        +   +D+D+ER ES KAA I+A VGT+A LP  L+QV S  QL+LP  I F SCALFGVTFRY +RRDLD+  LK+G  A
Subjt:  IEEAERSLAQSEGGNAIKDGEDGGLDRDEERFESVKAASISAIVGTLAGLPIFLNQVNSTSQLLLPTAITFISCALFGVTFRYTIRRDLDNIQLKTGTSA

Query:  AFGFVKGLATLDGGVPLELSAESFSSHVIDAAVYVSENLYVFICAAVALDYCFKMSLLSPFP
        AFGFVKGL  L  G PLELS ES  SH ID AV VS+++ +F  A++ LD+CFKM LL PFP
Subjt:  AFGFVKGLATLDGGVPLELSAESFSSHVIDAAVYVSENLYVFICAAVALDYCFKMSLLSPFP

Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGGCTGCAACAATCAAACTTTCAATTCTTTCTTCTTCAAATCCAATTCATCTCCCCCCAATCTCCACAAACTTTCTCAAATCCCACCCTTCCTCCACCAAAATC
TGCCACAAACGTTTACGTTTCTCAACACCGCGTCTCAAAATCCTGAAATGTACCTCGGAATCCAACGATCAAGCTCAAAACGATTTCAGTTTGAAGAATGCTCTG
TCCAGCATGGTTGGTGAACAAGTTGAGGAGCTTTTGAATAGGGAAGAGAATAGGAGTTTGCTCGATGGCTTGGAGAAGGCGTCGATGAGAGTTGAAATCGCGAAA
AAACAGCTTGCTGAGATTGAGAAACAGGAACTTGAGCTCAAACGGTTCAAGGATTATGTTAGGCAGCTAGAAAATAGAGCATCCGAGATTGAAGAATGTCAAAAG
GAGATATTGGAGGCAAGAGGAATGATTGAGGAGGCCGAGCGCTCTCTCGCTCAAAGCGAGGGTGGAAATGCTATAAAAGATGGAGAAGATGGAGGACTTGACAGA
GATGAAGAGAGATTTGAGTCTGTAAAAGCAGCCTCCATATCAGCCATTGTTGGCACACTTGCAGGACTGCCAATCTTTCTTAATCAAGTGAACAGCACTTCTCAG
CTTCTACTCCCTACAGCTATCACATTTATTAGCTGTGCCTTGTTTGGAGTTACTTTCCGATACACAATAAGGAGAGACTTGGATAATATTCAACTCAAGACTGGA
ACATCTGCCGCTTTTGGCTTCGTTAAAGGTCTTGCAACACTAGATGGTGGAGTCCCTTTGGAGTTGAGTGCTGAGAGTTTCTCTTCACATGTTATTGATGCAGCT
GTGTATGTATCTGAAAACCTTTACGTATTTATTTGTGCTGCTGTTGCACTAGATTACTGTTTCAAGATGAGTTTATTGAGCCCCTTTCCTATAAGAAAATCAACA
TCAAGGGTTAACTAG

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MAATIKLSILSSSNPIHLPPISTNFLKSHPSSTKICHKRLRFSTPRLKILKCTSESNDQAQNDFSLKNALSSMVGEQVEELLNREENRSLLDGLEKASMRVEIAK
KQLAEIEKQELELKRFKDYVRQLENRASEIEECQKEILEARGMIEEAERSLAQSEGGNAIKDGEDGGLDRDEERFESVKAASISAIVGTLAGLPIFLNQVNSTSQ
LLLPTAITFISCALFGVTFRYTIRRDLDNIQLKTGTSAAFGFVKGLATLDGGVPLELSAESFSSHVIDAAVYVSENLYVFICAAVALDYCFKMSLLSPFPIRKST
SRVN

Chy6G127440 (gene) of Cucumber (hystrix) v1 genome