; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Chy8G150680 (gene) of Cucumber (hystrix) v1 genome

Gene IDChy8G150680
OrganismCucumis hystrix (Cucumber (hystrix) v1)
DescriptionABC transporter A family member 1
Genome locationchrH08:11349470..11351536
RNA-Seq ExpressionChy8G150680
SyntenyChy8G150680
Gene Ontology termsGO:0055085 - transmembrane transport (biological process)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
GO:0005524 - ATP binding (molecular function)
GO:0016887 - ATPase activity (molecular function)
GO:0140359 - ABC-type transmembrane transporter activity (molecular function)
InterPro domainsIPR026082 - ABC transporter A
IPR027417 - P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0056169.1 ABC transporter A family member 1 isoform X6 [Cucumis melo var. makuwa]2.60e-18098.43Show/hide
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A0A0A0L146 ABC transporter domain-containing protein2.3e-14299.21Show/hide
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A0A1S3CCP1 ABC transporter A family member 1 isoform X65.2e-14298.43Show/hide
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A0A1S3CDK9 ABC transporter A family member 1 isoform X45.2e-14298.43Show/hide
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A0A1S3CEB8 ABC transporter A family member 1 isoform X55.2e-14298.43Show/hide
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A0A5A7URQ4 ABC transporter A family member 1 isoform X65.2e-14298.43Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O94911 ABC-type organic anion transporter ABCA85.8e-1334.93Show/hide
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        + D++    A   +    QS  + E +LS+  L  +   L  E+ +
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Q84M24 ABC transporter A family member 12.1e-10371.76Show/hide
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        CIG  + ITP+  S SEI+LS +M+  I ++LGNE+R+ TLV       V F +QL+EQLFRDG IPLPIF+EWWL  EKFS ++SFI SSF GATF  C
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        NGLS+KYQLP+GE GLSLADAFGH+ERNR +LGIAEYS+SQSTLETIFNHFA+NS
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Q8K448 Cholesterol transporter ABCA51.5e-1332.78Show/hide
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        MW  I R + +  K A +LTTH M EA+A+C R+ IMV G+LRCIG+ QHLK++FG    LE+K  + I + ++    + I+   + FP+ SR      +
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Query:  VCIGAIEPITPENQSVSEITLSRKMLTIIGRWLGNEERIKTLVSSSTAPGVFGEQLTEQLFRDGSIPLPIFSEWWLATEK
            +I       + V  ++ S   L    R    EE      S +T   VF E   EQ   D S      + WW  T++
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Q8LPK0 ABC transporter A family member 87.5e-1346.25Show/hide
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        +WDV+ R    + K A+ILTTHSM EA+ LC RIGI V G L+CIG+P+ LK+R+G    L V   E H +++     +I
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Q8R420 Phospholipid-transporting ATPase ABCA37.5e-1344.44Show/hide
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        +WD ++R   R    A+++T+HSM E +ALCTR+ IMV G+ +C+GSPQHLK++FG+   L+ K      +D
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G41700.1 ATP-binding cassette A11.5e-10471.76Show/hide
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        MWDVISR+STR GKTAVILTTHSMNEAQALCTRIGIMVGGRLRCIGSPQHLKTR+GNHLELEVKP+E+ + +L NFCQ I++  F+ P+  RSLL D+EV
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        CIG  + ITP+  S SEI+LS +M+  I ++LGNE+R+ TLV       V F +QL+EQLFRDG IPLPIF+EWWL  EKFS ++SFI SSF GATF  C
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        NGLS+KYQLP+GE GLSLADAFGH+ERNR +LGIAEYS+SQSTLETIFNHFA+NS
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AT2G41700.2 ATP-binding cassette A11.4e-10270.11Show/hide
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        MWDVISR+STR GKTAVILTTHSMNEAQALCTRIGIMVGGRLRCIGSPQHLKTR+GNHLELE      VKP+E+ + +L NFCQ I++  F+ P+  RSL
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        L D+EVCIG  + ITP+  S SEI+LS +M+  I ++LGNE+R+ TLV       V F +QL+EQLFRDG IPLPIF+EWWL  EKFS ++SFI SSF G
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        ATF  CNGLS+KYQLP+GE GLSLADAFGH+ERNR +LGIAEYS+SQSTLETIFNHFA+NS
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AT3G47760.1 ABC2 homolog 41.0e-1242.5Show/hide
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        +W  I R    +  TA+ILTTHSM EA+ LC R+GI V GRL+C+G+P+ LK R+G    L +     H +D+    Q +
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AT3G47770.1 ABC2 homolog 57.7e-1343.75Show/hide
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        +W VI R    +   A+ILTTHSM EA+ LC R+GI V GRL+CIG+P+ LK R+G    L +     H +D+    Q +
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AT3G47790.1 ABC2 homolog 75.3e-1446.25Show/hide
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        +WDV+ R    + K A+ILTTHSM EA+ LC RIGI V G L+CIG+P+ LK+R+G    L V   E H +++     +I
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTGGGATGTTATATCCCGAATATCTACCAGGAGAGGAAAGACAGCTGTTATCCTCACCACACATAGCATGAATGAAGCACAAGCACTTTGCACTCGTATTGGGATAAT
GGTTGGAGGACGGCTACGCTGCATAGGAAGTCCCCAACACTTGAAAACACGATTTGGAAATCATCTTGAGCTAGAGGTCAAACCTCATGAAATCCACTCAGAGGACCTGT
ATAACTTTTGCCAACATATTCGTGAGGGGTTTTTTGATTTTCCTTCACACTCGAGAAGTTTATTGAATGACATTGAAGTTTGTATCGGAGCTATTGAACCCATCACGCCA
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TCCTGGAGTTTTTGGTGAACAATTAACAGAGCAATTGTTTCGAGATGGCAGCATACCATTGCCTATATTTTCCGAGTGGTGGTTAGCGACAGAGAAGTTCTCAGAGATTA
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TTTGGACACATAGAGAGAAACCGAAAGCAGCTTGGAATTGCCGAATACAGTCTCAGCCAGTCCACGTTAGAGACGATTTTTAATCATTTTGCATCGAATTCTTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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ENQSVSEITLSRKMLTIIGRWLGNEERIKTLVSSSTAPGVFGEQLTEQLFRDGSIPLPIFSEWWLATEKFSEINSFILSSFSGATFHGCNGLSMKYQLPYGEDGLSLADA
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