; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Chy9G165100 (gene) of Cucumber (hystrix) v1 genome

Gene IDChy9G165100
OrganismCucumis hystrix (Cucumber (hystrix) v1)
DescriptionCASP-like protein
Genome locationchrH09:10638310..10638967
RNA-Seq ExpressionChy9G165100
SyntenyChy9G165100
Gene Ontology termsGO:0005886 - plasma membrane (cellular component)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
GO:0051539 - 4 iron, 4 sulfur cluster binding (molecular function)
InterPro domainsIPR006702 - Casparian strip membrane protein domain


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004142832.1 CASP-like protein 4D1 [Cucumis sativus]4.26e-9797.42Show/hide
Query:  MENSSGSRVTSLILRILTFVFLFISFFILITTFQTVRPYKLHFNDYHGFRYMLATIIIGLVFNLLQIAFSLFNIVKNGDGTILFDFFGDKFLSYLLATGA
        MENSSGSR+TSLILRILTFVFLFISFFILITT QTVRPYKLHFNDYHGFRYMLATIIIGLVFNLLQIAFSLFNIVKNGDGTILFDFFGDKFLSYLLATGA
Subjt:  MENSSGSRVTSLILRILTFVFLFISFFILITTFQTVRPYKLHFNDYHGFRYMLATIIIGLVFNLLQIAFSLFNIVKNGDGTILFDFFGDKFLSYLLATGA

Query:  AAGFGVGVDLKKIDPDDLFRTFFDKAYAASTLLLFAFFCSAAVSILSSFALSKRS
        AAGFGVGVDLKK+DPDDLFR FFDKAYAASTLLLFAFFCSAAVSILSSFALSKRS
Subjt:  AAGFGVGVDLKKIDPDDLFRTFFDKAYAASTLLLFAFFCSAAVSILSSFALSKRS

XP_008458890.1 PREDICTED: CASP-like protein 4D1 [Cucumis melo]1.43e-9597.42Show/hide
Query:  MENSSGSRVTSLILRILTFVFLFISFFILITTFQTVRPYKLHFNDYHGFRYMLATIIIGLVFNLLQIAFSLFNIVKNGDGTILFDFFGDKFLSYLLATGA
        MENSSGSRVTSLILRILTFVFLFISFFILITT QTVRPYKLHFN YHGFRYMLATIIIGLVFNLLQIAFSLFNIVKNGDGTILFDFFGDKFLSYLLATGA
Subjt:  MENSSGSRVTSLILRILTFVFLFISFFILITTFQTVRPYKLHFNDYHGFRYMLATIIIGLVFNLLQIAFSLFNIVKNGDGTILFDFFGDKFLSYLLATGA

Query:  AAGFGVGVDLKKIDPDDLFRTFFDKAYAASTLLLFAFFCSAAVSILSSFALSKRS
        AAGFGVGVDLKK DPDDLFRTFFDKAYAAS LLLFAFFCSAAVSILSSFALSKRS
Subjt:  AAGFGVGVDLKKIDPDDLFRTFFDKAYAASTLLLFAFFCSAAVSILSSFALSKRS

XP_022992767.1 CASP-like protein 4D1 [Cucurbita maxima]4.13e-7982.47Show/hide
Query:  MENSSGSRVTSLILRILTFVFLFISFFILITTFQTVRPYKLHFNDYHGFRYMLATIIIGLVFNLLQIAFSLFNIVKNGDGTILFDFFGDKFLSYLLATGA
        MENSSG+RVT LILRILTFVFLFISFF+L+TT QTV   K HFN++H +RY+LATIIIG+VFNLLQIAFSLFNIVK   GTILFDFFGDKFLSYLLATG 
Subjt:  MENSSGSRVTSLILRILTFVFLFISFFILITTFQTVRPYKLHFNDYHGFRYMLATIIIGLVFNLLQIAFSLFNIVKNGDGTILFDFFGDKFLSYLLATGA

Query:  AAGFGVGVDLKKIDPDDLFRTFFDKAYAASTLLLFAFFCSAAVSILSSFALSKR
        AAGFG+ VDL+ +DPDD F TFFDKAYAAS LLLFAFFCSAAVSILSSFALSKR
Subjt:  AAGFGVGVDLKKIDPDDLFRTFFDKAYAASTLLLFAFFCSAAVSILSSFALSKR

XP_023549516.1 CASP-like protein 4D1 [Cucurbita pepo subsp. pepo]8.33e-7981.82Show/hide
Query:  MENSSGSRVTSLILRILTFVFLFISFFILITTFQTVRPYKLHFNDYHGFRYMLATIIIGLVFNLLQIAFSLFNIVKNGDGTILFDFFGDKFLSYLLATGA
        MENSSG+RVT LILRILTFVFLFISFF+L+TT QTV   K HFN++H +RY+LATIIIG+VFNLLQIAFSLFNIVK   GTILFDFFGDKFLSYLLATG 
Subjt:  MENSSGSRVTSLILRILTFVFLFISFFILITTFQTVRPYKLHFNDYHGFRYMLATIIIGLVFNLLQIAFSLFNIVKNGDGTILFDFFGDKFLSYLLATGA

Query:  AAGFGVGVDLKKIDPDDLFRTFFDKAYAASTLLLFAFFCSAAVSILSSFALSKR
        AAGFG+ VDL+ +DPDD F TFFDKAYAAS LLLFAFFCSAAVSI+SSFALSKR
Subjt:  AAGFGVGVDLKKIDPDDLFRTFFDKAYAASTLLLFAFFCSAAVSILSSFALSKR

XP_038877616.1 CASP-like protein 4D1 [Benincasa hispida]4.04e-8689.68Show/hide
Query:  MENSSGSRVTSLILRILTFVFLFISFFILITTFQTVRPYKLHFNDYHGFRYMLATIIIGLVFNLLQIAFSLFNIVKNGDGTILFDFFGDKFLSYLLATGA
        MENSSGSRVTSLILRILTFVFLFISFFILITT QTV+  KLHFN YH FRYMLATIIIG+VFNLLQIAFSLFNIVKNG+ TILFDFFGDKFLSYLL TG 
Subjt:  MENSSGSRVTSLILRILTFVFLFISFFILITTFQTVRPYKLHFNDYHGFRYMLATIIIGLVFNLLQIAFSLFNIVKNGDGTILFDFFGDKFLSYLLATGA

Query:  AAGFGVGVDLKKIDPDDLFRTFFDKAYAASTLLLFAFFCSAAVSILSSFALSKRS
        AAGFG+ VDLKKIDPDD F +FFDKAYAASTLLLFAFFCSAAVSILSSFALSKRS
Subjt:  AAGFGVGVDLKKIDPDDLFRTFFDKAYAASTLLLFAFFCSAAVSILSSFALSKRS

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KU83 CASP-like protein8.3e-7497.42Show/hide
Query:  MENSSGSRVTSLILRILTFVFLFISFFILITTFQTVRPYKLHFNDYHGFRYMLATIIIGLVFNLLQIAFSLFNIVKNGDGTILFDFFGDKFLSYLLATGA
        MENSSGSR+TSLILRILTFVFLFISFFILITT QTVRPYKLHFNDYHGFRYMLATIIIGLVFNLLQIAFSLFNIVKNGDGTILFDFFGDKFLSYLLATGA
Subjt:  MENSSGSRVTSLILRILTFVFLFISFFILITTFQTVRPYKLHFNDYHGFRYMLATIIIGLVFNLLQIAFSLFNIVKNGDGTILFDFFGDKFLSYLLATGA

Query:  AAGFGVGVDLKKIDPDDLFRTFFDKAYAASTLLLFAFFCSAAVSILSSFALSKRS
        AAGFGVGVDLKK+DPDDLFR FFDKAYAASTLLLFAFFCSAAVSILSSFALSKRS
Subjt:  AAGFGVGVDLKKIDPDDLFRTFFDKAYAASTLLLFAFFCSAAVSILSSFALSKRS

A0A1S3C9H1 CASP-like protein1.2e-7297.42Show/hide
Query:  MENSSGSRVTSLILRILTFVFLFISFFILITTFQTVRPYKLHFNDYHGFRYMLATIIIGLVFNLLQIAFSLFNIVKNGDGTILFDFFGDKFLSYLLATGA
        MENSSGSRVTSLILRILTFVFLFISFFILITT QTVRPYKLHFN YHGFRYMLATIIIGLVFNLLQIAFSLFNIVKNGDGTILFDFFGDKFLSYLLATGA
Subjt:  MENSSGSRVTSLILRILTFVFLFISFFILITTFQTVRPYKLHFNDYHGFRYMLATIIIGLVFNLLQIAFSLFNIVKNGDGTILFDFFGDKFLSYLLATGA

Query:  AAGFGVGVDLKKIDPDDLFRTFFDKAYAASTLLLFAFFCSAAVSILSSFALSKRS
        AAGFGVGVDLKK DPDDLFRTFFDKAYAAS LLLFAFFCSAAVSILSSFALSKRS
Subjt:  AAGFGVGVDLKKIDPDDLFRTFFDKAYAASTLLLFAFFCSAAVSILSSFALSKRS

A0A6J1FG26 CASP-like protein4.9e-5881.94Show/hide
Query:  MENSSGSRVTSLILRILTFVFLFISFFILITTFQTVRPYKLHFNDYHGFRYMLATIIIGLVFNLLQIAFSLFNIVKNGDGTILFDFFGDKFLSYLLATGA
        ME SS SRVT L+LRILTFVFLFISFFILITT QTV+  K HFND+H +RY+LATII+ +VFNLLQIAFSLFNIVKN +GTILFDFFGDKFLSYLLAT  
Subjt:  MENSSGSRVTSLILRILTFVFLFISFFILITTFQTVRPYKLHFNDYHGFRYMLATIIIGLVFNLLQIAFSLFNIVKNGDGTILFDFFGDKFLSYLLATGA

Query:  AAGFGVGVDLKKI-DPDDLFRTFFDKAYAASTLLLFAFFCSAAVSILSSFALSKR
        AAGFGV VDL++  DP+DLF TFFDKAYAAS LLLFAFFCSAAVSILSSFALSKR
Subjt:  AAGFGVGVDLKKI-DPDDLFRTFFDKAYAASTLLLFAFFCSAAVSILSSFALSKR

A0A6J1FGY1 CASP-like protein1.3e-5880.52Show/hide
Query:  MENSSGSRVTSLILRILTFVFLFISFFILITTFQTVRPYKLHFNDYHGFRYMLATIIIGLVFNLLQIAFSLFNIVKNGDGTILFDFFGDKFLSYLLATGA
        ME+SSG+RVT LILRILTFVFLFISFF+L+TT QTV   K HFN++H +RY+LATIIIG+VFNLLQIAFSL NIVK   GTILFDFFGDKFLSYLLATG 
Subjt:  MENSSGSRVTSLILRILTFVFLFISFFILITTFQTVRPYKLHFNDYHGFRYMLATIIIGLVFNLLQIAFSLFNIVKNGDGTILFDFFGDKFLSYLLATGA

Query:  AAGFGVGVDLKKIDPDDLFRTFFDKAYAASTLLLFAFFCSAAVSILSSFALSKR
        AAGFG+ VDL+ +DPDD F TFFDKAYAAS LLLFAFFCSAAVSI+SSFALSKR
Subjt:  AAGFGVGVDLKKIDPDDLFRTFFDKAYAASTLLLFAFFCSAAVSILSSFALSKR

A0A6J1JQU5 CASP-like protein3.1e-6082.47Show/hide
Query:  MENSSGSRVTSLILRILTFVFLFISFFILITTFQTVRPYKLHFNDYHGFRYMLATIIIGLVFNLLQIAFSLFNIVKNGDGTILFDFFGDKFLSYLLATGA
        MENSSG+RVT LILRILTFVFLFISFF+L+TT QTV   K HFN++H +RY+LATIIIG+VFNLLQIAFSLFNIVK   GTILFDFFGDKFLSYLLATG 
Subjt:  MENSSGSRVTSLILRILTFVFLFISFFILITTFQTVRPYKLHFNDYHGFRYMLATIIIGLVFNLLQIAFSLFNIVKNGDGTILFDFFGDKFLSYLLATGA

Query:  AAGFGVGVDLKKIDPDDLFRTFFDKAYAASTLLLFAFFCSAAVSILSSFALSKR
        AAGFG+ VDL+ +DPDD F TFFDKAYAAS LLLFAFFCSAAVSILSSFALSKR
Subjt:  AAGFGVGVDLKKIDPDDLFRTFFDKAYAASTLLLFAFFCSAAVSILSSFALSKR

SwissProt top hitse value%identityAlignment
A1XGB4 CASP-like protein PIMP14.3e-2746.71Show/hide
Query:  SLILRILTFVFLFISFFILITTFQTVR----PYKLHFNDYHGFRYMLATIIIGLVFNLLQIAFSLFNIVK----NGDGTILFDFFGDKFLSYLLATGAAA
        SLI+RILT + L ISF ++ T  QTV       K+ F D++ +RY++AT+IIG+ + LLQIAFS+  +       G+G +LFDF+GDKF+SY L TGAAA
Subjt:  SLILRILTFVFLFISFFILITTFQTVR----PYKLHFNDYHGFRYMLATIIIGLVFNLLQIAFSLFNIVK----NGDGTILFDFFGDKFLSYLLATGAAA

Query:  GFGVGVDLKKIDPDDLFRTFFDKAYAASTLLLFAFFCSAAVSILSSFALSKR
         FG+  DLK+++  D +  F + + AA++L L  FF + A SI SS+ L KR
Subjt:  GFGVGVDLKKIDPDDLFRTFFDKAYAASTLLLFAFFCSAAVSILSSFALSKR

B9NBE5 CASP-like protein 4D13.6e-2644.94Show/hide
Query:  SRVTSLILRILTFVFLFISFFILITTFQTVR----PYKLHFNDYHGFRYMLATIIIGLVFNLLQIAFSLFNIVK------NGDGTILFDFFGDKFLSYLL
        SR+T+L LR+LTF FL +S  I+ T   T+      +K+   D++ +RYMLA I  GL + +LQIA +L +I K      +GDG ++FDF+GDK +SY+L
Subjt:  SRVTSLILRILTFVFLFISFFILITTFQTVR----PYKLHFNDYHGFRYMLATIIIGLVFNLLQIAFSLFNIVK------NGDGTILFDFFGDKFLSYLL

Query:  ATGAAAGFGVGVDLKKIDPDDLFRTFFDKAYAASTLLLFAFFCSAAVSILSSFALSKR
        ATGAAA FG   +LK          FF+K YA+++LLL  F C+A +S+ SS+AL K+
Subjt:  ATGAAAGFGVGVDLKKIDPDDLFRTFFDKAYAASTLLLFAFFCSAAVSILSSFALSKR

B9SXY8 CASP-like protein 4D13.2e-3048.45Show/hide
Query:  SSGSRVTSLILRILTFVFLFISFFILITTFQTVR----PYKLHFNDYHGFRYMLATIIIGLVFNLLQIAFSLF-----NIVKNGDGTILFDFFGDKFLSY
        S  SR+ +LILRILTF+FL  S  IL T   T+       K+HF D + +RYMLATI+IGL + +LQIAF+L+     N + +GDG + FDFFGDK +SY
Subjt:  SSGSRVTSLILRILTFVFLFISFFILITTFQTVR----PYKLHFNDYHGFRYMLATIIIGLVFNLLQIAFSLF-----NIVKNGDGTILFDFFGDKFLSY

Query:  LLATGAAAGFGVGVDLKKI-DPDDLFRTFFDKAYAASTLLLFAFFCSAAVSILSSFALSKR
        +L TGAAAGF    D+K +      F  F +K YA+++LLL  F C+A +S+ SS+AL K+
Subjt:  LLATGAAAGFGVGVDLKKI-DPDDLFRTFFDKAYAASTLLLFAFFCSAAVSILSSFALSKR

C6T1Z6 CASP-like protein 4D14.6e-2948.43Show/hide
Query:  NSSGSRVTSLILRILTFVFLFISFFILITTFQT--VRPYKLHFNDYHGFRYMLATIIIGLVFNLLQIAFSLFNIVK-----NGDGTILFDFFGDKFLSYL
        +S+GSR   L+LR+LTFVFL I+  ++    QT      ++ FND + +RYM++TIIIG  +NLLQ+A S+F +V      +GDG  LFDFFGDK +SYL
Subjt:  NSSGSRVTSLILRILTFVFLFISFFILITTFQT--VRPYKLHFNDYHGFRYMLATIIIGLVFNLLQIAFSLFNIVK-----NGDGTILFDFFGDKFLSYL

Query:  LATGAAAGFGVGVDLKKIDPDDLFRTFFDKAYAASTLLLFAFFCSAAVSILSSFALSKR
        L +G+AAGFGV V+L +  P +   +F DKA A+++LLL AF  +A  S  +SFAL K+
Subjt:  LATGAAAGFGVGVDLKKIDPDDLFRTFFDKAYAASTLLLFAFFCSAAVSILSSFALSKR

Q56X75 CASP-like protein 4D21.2e-2445.68Show/hide
Query:  RVTSLILRILTFVFLFISFFILITTFQTV----RPYKLHFNDYHGFRYMLATIIIGLVFNLLQIAFSLFNI---VKNGDGTILFDFFGDKFLSYLLATGA
        +V  L+LR+LT VFL I+  IL T   T+       K HF D + +RYML+  +IGLV+ ++Q+ F++      VKN     L DF+GDK +SYL+ATG+
Subjt:  RVTSLILRILTFVFLFISFFILITTFQTV----RPYKLHFNDYHGFRYMLATIIIGLVFNLLQIAFSLFNI---VKNGDGTILFDFFGDKFLSYLLATGA

Query:  AAGFGVGVDLK-------KIDPDDLFRTFFDKAYAASTLLLFAFFCSAAVSILSSFALSKRS
        AAGFGV  DLK        +D  D    FF K YA+++LLLFAF C A +S+ SSFA++KR+
Subjt:  AAGFGVGVDLK-------KIDPDDLFRTFFDKAYAASTLLLFAFFCSAAVSILSSFALSKRS

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G38480.1 Uncharacterised protein family (UPF0497)2.5e-0631.29Show/hide
Query:  SLILRILTFVFLFISFFILITTFQTVRPYKLHFNDYHGFRYMLATIIIGLVFNLLQIAFSLFNIVKNGD--GTILFDFFGDKFLSYLLATGAAAGFGVGV
        S I R +  +F  I+F I+++       Y  +FNDY  +RY+LA  II  ++   Q  F+ F+  +  D   +IL DF GD+ ++YLL + A++     +
Subjt:  SLILRILTFVFLFISFFILITTFQTVRPYKLHFNDYHGFRYMLATIIIGLVFNLLQIAFSLFNIVKNGD--GTILFDFFGDKFLSYLLATGAAAGFGVGV

Query:  DLKKIDPDDLFRTFFDKAYAASTLLLFAFFCSAAVSILSSFALSKRS
         L  I  +     F D A +A ++ +FAF   A  ++ S + LS  S
Subjt:  DLKKIDPDDLFRTFFDKAYAASTLLLFAFFCSAAVSILSSFALSKRS

AT2G39518.1 Uncharacterised protein family (UPF0497)8.3e-2645.68Show/hide
Query:  RVTSLILRILTFVFLFISFFILITTFQTV----RPYKLHFNDYHGFRYMLATIIIGLVFNLLQIAFSLFNI---VKNGDGTILFDFFGDKFLSYLLATGA
        +V  L+LR+LT VFL I+  IL T   T+       K HF D + +RYML+  +IGLV+ ++Q+ F++      VKN     L DF+GDK +SYL+ATG+
Subjt:  RVTSLILRILTFVFLFISFFILITTFQTV----RPYKLHFNDYHGFRYMLATIIIGLVFNLLQIAFSLFNI---VKNGDGTILFDFFGDKFLSYLLATGA

Query:  AAGFGVGVDLK-------KIDPDDLFRTFFDKAYAASTLLLFAFFCSAAVSILSSFALSKRS
        AAGFGV  DLK        +D  D    FF K YA+++LLLFAF C A +S+ SSFA++KR+
Subjt:  AAGFGVGVDLK-------KIDPDDLFRTFFDKAYAASTLLLFAFFCSAAVSILSSFALSKRS

AT2G39530.1 Uncharacterised protein family (UPF0497)2.7e-2445.62Show/hide
Query:  RVTSLILRILTFVFLFISFFILITTFQTVR----PYKLHFNDYHGFRYMLATIIIGLVFNLLQ--IAFSLFNIVKNGDGTILFDFFGDKFLSYLLATGAA
        R   L+LR+LT  FL I+  ++ T   T+       KL FND + +RYML+  +IGLV+ ++Q  +  S F   K    T  FDF+GDK +SYLLATG+A
Subjt:  RVTSLILRILTFVFLFISFFILITTFQTVR----PYKLHFNDYHGFRYMLATIIIGLVFNLLQ--IAFSLFNIVKNGDGTILFDFFGDKFLSYLLATGAA

Query:  AGFGVGVDLK-------KIDPDDLFRTFFDKAYAASTLLLFAFFCSAAVSILSSFALSKR
        AGFGV  DLK       + D  D    FF K YA+++LLLFAF   A +S+ SS ALSKR
Subjt:  AGFGVGVDLK-------KIDPDDLFRTFFDKAYAASTLLLFAFFCSAAVSILSSFALSKR


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAAAATTCAAGTGGTTCAAGGGTAACTTCTCTTATATTGAGAATACTAACATTTGTTTTTCTTTTCATCTCCTTCTTCATTCTTATCACCACTTTTCAAACTGTTCG
ACCATATAAGCTTCATTTCAATGATTATCATGGTTTTAGGTATATGCTTGCTACGATCATCATCGGACTTGTATTTAACCTTCTGCAAATCGCATTCTCCCTCTTTAACA
TAGTTAAGAATGGCGACGGTACTATATTATTCGATTTCTTTGGCGACAAGTTTTTGTCATACCTTCTAGCAACAGGAGCAGCAGCTGGATTTGGAGTTGGAGTTGATTTG
AAAAAAATAGATCCAGATGATTTGTTTAGAACATTCTTTGATAAGGCCTATGCAGCTTCAACTCTTCTTTTGTTTGCTTTCTTTTGTTCTGCAGCTGTCTCCATTCTCTC
TTCATTTGCACTTTCCAAGAGATCTTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGAAAATTCAAGTGGTTCAAGGGTAACTTCTCTTATATTGAGAATACTAACATTTGTTTTTCTTTTCATCTCCTTCTTCATTCTTATCACCACTTTTCAAACTGTTCG
ACCATATAAGCTTCATTTCAATGATTATCATGGTTTTAGGTATATGCTTGCTACGATCATCATCGGACTTGTATTTAACCTTCTGCAAATCGCATTCTCCCTCTTTAACA
TAGTTAAGAATGGCGACGGTACTATATTATTCGATTTCTTTGGCGACAAGTTTTTGTCATACCTTCTAGCAACAGGAGCAGCAGCTGGATTTGGAGTTGGAGTTGATTTG
AAAAAAATAGATCCAGATGATTTGTTTAGAACATTCTTTGATAAGGCCTATGCAGCTTCAACTCTTCTTTTGTTTGCTTTCTTTTGTTCTGCAGCTGTCTCCATTCTCTC
TTCATTTGCACTTTCCAAGAGATCTTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MENSSGSRVTSLILRILTFVFLFISFFILITTFQTVRPYKLHFNDYHGFRYMLATIIIGLVFNLLQIAFSLFNIVKNGDGTILFDFFGDKFLSYLLATGAAAGFGVGVDL
KKIDPDDLFRTFFDKAYAASTLLLFAFFCSAAVSILSSFALSKRS