; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

ChyUNG231120 (gene) of Cucumber (hystrix) v1 genome

Gene IDChyUNG231120
OrganismCucumis hystrix (Cucumber (hystrix) v1)
Descriptionprotein TIFY 5A-like
Genome locationscaffold34_size1410443:792880..793510
RNA-Seq ExpressionChyUNG231120
SyntenyChyUNG231120
Gene Ontology termsGO:0009611 - response to wounding (biological process)
GO:0031347 - regulation of defense response (biological process)
GO:2000022 - regulation of jasmonic acid mediated signaling pathway (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
InterPro domainsIPR018467 - CO/COL/TOC1, conserved site
IPR040390 - TIFY/JAZ family


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7019513.1 Protein TIFY 5A [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]2.08e-3870.59Show/hide
Query:  MEPFSNFNLELCLSPPSSSPSTTTTTLAPASNSTSQHNHITPIGLFTPDLTEIQAKAIIVQATRQMEAERSRWTTCRISSSAERVLMSGGEASPSMRRSL
        ME   N NLELCLSPPSSSPST T T    S STS HNHI P  +  PD TE+QA+AIIV+AT QMEAER R TTC ISS  +RV M  G ASPSMRRSL
Subjt:  MEPFSNFNLELCLSPPSSSPSTTTTTLAPASNSTSQHNHITPIGLFTPDLTEIQAKAIIVQATRQMEAERSRWTTCRISSSAERVLMSGGEASPSMRRSL

Query:  QRFLQKRKLRIQTLSPYAH
        QRFLQKRK RIQTLSPY+H
Subjt:  QRFLQKRKLRIQTLSPYAH

XP_004149668.1 protein TIFY 5A [Cucumis sativus]3.10e-6692.44Show/hide
Query:  MEPFSNFNLELCLSPPSSSPSTTTTTLAPASNSTSQHNHITPIGLFTPDLTEIQAKAIIVQATRQMEAERSRWTTCRISSSAERVLMSGGEASPSMRRSL
        MEP SNFNLELCLSPPSSSPSTTT+TL  ASNSTSQ NHITPIGLFTPDLTEIQAKAIIVQATRQMEAERSRW TCRISSSAERVLM+ GEASPS+RRSL
Subjt:  MEPFSNFNLELCLSPPSSSPSTTTTTLAPASNSTSQHNHITPIGLFTPDLTEIQAKAIIVQATRQMEAERSRWTTCRISSSAERVLMSGGEASPSMRRSL

Query:  QRFLQKRKLRIQTLSPYAH
        QRFLQKRKLRIQTLSPYAH
Subjt:  QRFLQKRKLRIQTLSPYAH

XP_008444384.1 PREDICTED: protein TIFY 5A-like [Cucumis melo]1.64e-5987.6Show/hide
Query:  MEPFSNFNLELCLSPPSSSPSTTTTTL--APASNSTSQHNHITPIGLFTPDLTEIQAKAIIVQATRQMEAERSRWTTCRISSSAERVLMSGGEASPSMRR
        ME F NFNLELCLSPPSSSPSTTTTT   A ASNS+SQHNHITPIG+ TPDLTEIQAKAIIV+ATRQMEAER RWTTCRISSSAERV M  GEASPSMRR
Subjt:  MEPFSNFNLELCLSPPSSSPSTTTTTL--APASNSTSQHNHITPIGLFTPDLTEIQAKAIIVQATRQMEAERSRWTTCRISSSAERVLMSGGEASPSMRR

Query:  SLQRFLQKRKLRIQTLSPYAH
        SLQRFLQKRKLRIQTLSPY H
Subjt:  SLQRFLQKRKLRIQTLSPYAH

XP_022927150.1 protein TIFY 5A-like [Cucurbita moschata]7.93e-3869.75Show/hide
Query:  MEPFSNFNLELCLSPPSSSPSTTTTTLAPASNSTSQHNHITPIGLFTPDLTEIQAKAIIVQATRQMEAERSRWTTCRISSSAERVLMSGGEASPSMRRSL
        ME   N NLELCLSPPSSSPST T      S STS HNHI P  +  PD TE+QA+AIIV+AT QMEAER R TTC ISS  +RV M  G ASPSMRRSL
Subjt:  MEPFSNFNLELCLSPPSSSPSTTTTTLAPASNSTSQHNHITPIGLFTPDLTEIQAKAIIVQATRQMEAERSRWTTCRISSSAERVLMSGGEASPSMRRSL

Query:  QRFLQKRKLRIQTLSPYAH
        QRFLQKRK RIQTLSPY+H
Subjt:  QRFLQKRKLRIQTLSPYAH

XP_023520316.1 protein TIFY 5A-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.03e-3870.59Show/hide
Query:  MEPFSNFNLELCLSPPSSSPSTTTTTLAPASNSTSQHNHITPIGLFTPDLTEIQAKAIIVQATRQMEAERSRWTTCRISSSAERVLMSGGEASPSMRRSL
        ME   N NLELCLSPPSSSPST T T    S STS HNHI P  +  PDLTE+QA+AIIV+AT QME ER R TTC ISS  +RV M  G ASPSMRRSL
Subjt:  MEPFSNFNLELCLSPPSSSPSTTTTTLAPASNSTSQHNHITPIGLFTPDLTEIQAKAIIVQATRQMEAERSRWTTCRISSSAERVLMSGGEASPSMRRSL

Query:  QRFLQKRKLRIQTLSPYAH
        QRFLQKRK RIQTLSPY+H
Subjt:  QRFLQKRKLRIQTLSPYAH

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LX13 Uncharacterized protein4.9e-5092.44Show/hide
Query:  MEPFSNFNLELCLSPPSSSPSTTTTTLAPASNSTSQHNHITPIGLFTPDLTEIQAKAIIVQATRQMEAERSRWTTCRISSSAERVLMSGGEASPSMRRSL
        MEP SNFNLELCLSPPSSSPSTTT+TL  ASNSTSQ NHITPIGLFTPDLTEIQAKAIIVQATRQMEAERSRW TCRISSSAERVLM+ GEASPS+RRSL
Subjt:  MEPFSNFNLELCLSPPSSSPSTTTTTLAPASNSTSQHNHITPIGLFTPDLTEIQAKAIIVQATRQMEAERSRWTTCRISSSAERVLMSGGEASPSMRRSL

Query:  QRFLQKRKLRIQTLSPYAH
        QRFLQKRKLRIQTLSPYAH
Subjt:  QRFLQKRKLRIQTLSPYAH

A0A1S3BA64 protein TIFY 5A-like4.8e-4587.6Show/hide
Query:  MEPFSNFNLELCLSPPSSSPS--TTTTTLAPASNSTSQHNHITPIGLFTPDLTEIQAKAIIVQATRQMEAERSRWTTCRISSSAERVLMSGGEASPSMRR
        ME F NFNLELCLSPPSSSPS  TTTTT A ASNS+SQHNHITPIG+ TPDLTEIQAKAIIV+ATRQMEAER RWTTCRISSSAERV M  GEASPSMRR
Subjt:  MEPFSNFNLELCLSPPSSSPS--TTTTTLAPASNSTSQHNHITPIGLFTPDLTEIQAKAIIVQATRQMEAERSRWTTCRISSSAERVLMSGGEASPSMRR

Query:  SLQRFLQKRKLRIQTLSPYAH
        SLQRFLQKRKLRIQTLSPY H
Subjt:  SLQRFLQKRKLRIQTLSPYAH

A0A6J1CG02 protein TIFY 5A-like1.5e-1453.91Show/hide
Query:  NLELCLSPPSSSPSTTTTTLAPASNSTSQHNHITPI-----GLFTPDLTEIQAKAIIVQATRQMEAERSRWTTCRISSSAERVLMSGGEASPSMRRSLQR
        NLELCLSPP + PS+ T   A  S +TS  +H  P+     G    DLTE+QA+AII+ ATRQME    R TTCR  S+ E+        S SM+RSLQR
Subjt:  NLELCLSPPSSSPSTTTTTLAPASNSTSQHNHITPI-----GLFTPDLTEIQAKAIIVQATRQMEAERSRWTTCRISSSAERVLMSGGEASPSMRRSLQR

Query:  FLQKRKLRIQTLSPY
        FLQKRK RIQTL+PY
Subjt:  FLQKRKLRIQTLSPY

A0A6J1EN30 protein TIFY 5A-like2.4e-2869.75Show/hide
Query:  MEPFSNFNLELCLSPPSSSPSTTTTTLAPASNSTSQHNHITPIGLFTPDLTEIQAKAIIVQATRQMEAERSRWTTCRISSSAERVLMSGGEASPSMRRSL
        ME   N NLELCLSPPSSSPST T      S STS HNHI P  +  PD TE+QA+AIIV+AT QMEAER R TTC ISS  +RV M  G ASPSMRRSL
Subjt:  MEPFSNFNLELCLSPPSSSPSTTTTTLAPASNSTSQHNHITPIGLFTPDLTEIQAKAIIVQATRQMEAERSRWTTCRISSSAERVLMSGGEASPSMRRSL

Query:  QRFLQKRKLRIQTLSPYAH
        QRFLQKRK RIQTLSPY+H
Subjt:  QRFLQKRKLRIQTLSPYAH

A0A6J1KQP6 protein TIFY 5A-like5.8e-2768.91Show/hide
Query:  MEPFSNFNLELCLSPPSSSPSTTTTTLAPASNSTSQHNHITPIGLFTPDLTEIQAKAIIVQATRQMEAERSRWTTCRISSSAERVLMSGGEASPSMRRSL
        ME   N NLELCLSPPSSSPSTT T  A  S STS HNH T + L   DLTE+QA+AIIV+A  QMEAER R TTC IS   E + M  G ASPSMRRSL
Subjt:  MEPFSNFNLELCLSPPSSSPSTTTTTLAPASNSTSQHNHITPIGLFTPDLTEIQAKAIIVQATRQMEAERSRWTTCRISSSAERVLMSGGEASPSMRRSL

Query:  QRFLQKRKLRIQTLSPYAH
        QRFLQKRK RIQTLSPY+H
Subjt:  QRFLQKRKLRIQTLSPYAH

SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q8LBM2 Protein TIFY 5A1.8e-0437.7Show/hide
Query:  NFNLELCLSPPS-SSPSTTTTTLA-------PASNSTSQHNHITPIG--LFTPDLTEIQAKAIIVQATRQMEAERSRWTTCRISSSAERVLMSGGEASPS
        N +LEL L P S  S S+ TT++        P  N  SQ   I   G   F+ D+T +QA++II  A+R+M+ + S   +   + S             S
Subjt:  NFNLELCLSPPS-SSPSTTTTTLA-------PASNSTSQHNHITPIG--LFTPDLTEIQAKAIIVQATRQMEAERSRWTTCRISSSAERVLMSGGEASPS

Query:  MRRSLQRFLQKRKLRIQTLSPY
        M++SLQ FLQKRK+RIQ  SPY
Subjt:  MRRSLQRFLQKRKLRIQTLSPY

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G30135.1 jasmonate-zim-domain protein 81.3e-0537.7Show/hide
Query:  NFNLELCLSPPS-SSPSTTTTTLA-------PASNSTSQHNHITPIG--LFTPDLTEIQAKAIIVQATRQMEAERSRWTTCRISSSAERVLMSGGEASPS
        N +LEL L P S  S S+ TT++        P  N  SQ   I   G   F+ D+T +QA++II  A+R+M+ + S   +   + S             S
Subjt:  NFNLELCLSPPS-SSPSTTTTTLA-------PASNSTSQHNHITPIG--LFTPDLTEIQAKAIIVQATRQMEAERSRWTTCRISSSAERVLMSGGEASPS

Query:  MRRSLQRFLQKRKLRIQTLSPY
        M++SLQ FLQKRK+RIQ  SPY
Subjt:  MRRSLQRFLQKRKLRIQTLSPY


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAGCCCTTCTCCAACTTCAACTTGGAACTTTGTCTCTCTCCTCCCTCTTCCTCTCCTTCCACCACCACTACGACCCTTGCCCCCGCCTCCAACTCAACTTCCCAACA
CAACCATATCACTCCCATCGGTCTCTTCACACCTGATCTTACCGAGATCCAGGCAAAGGCAATAATAGTACAAGCCACGAGACAAATGGAGGCCGAGAGATCCAGATGGA
CGACATGTCGAATTAGTTCATCGGCAGAAAGAGTATTGATGTCGGGCGGGGAAGCTAGCCCCTCCATGAGGAGATCATTGCAGAGGTTTTTACAAAAGAGAAAGCTTCGC
ATCCAAACACTTTCACCCTACGCTCACTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGAGCCCTTCTCCAACTTCAACTTGGAACTTTGTCTCTCTCCTCCCTCTTCCTCTCCTTCCACCACCACTACGACCCTTGCCCCCGCCTCCAACTCAACTTCCCAACA
CAACCATATCACTCCCATCGGTCTCTTCACACCTGATCTTACCGAGATCCAGGCAAAGGCAATAATAGTACAAGCCACGAGACAAATGGAGGCCGAGAGATCCAGATGGA
CGACATGTCGAATTAGTTCATCGGCAGAAAGAGTATTGATGTCGGGCGGGGAAGCTAGCCCCTCCATGAGGAGATCATTGCAGAGGTTTTTACAAAAGAGAAAGCTTCGC
ATCCAAACACTTTCACCCTACGCTCACTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MEPFSNFNLELCLSPPSSSPSTTTTTLAPASNSTSQHNHITPIGLFTPDLTEIQAKAIIVQATRQMEAERSRWTTCRISSSAERVLMSGGEASPSMRRSLQRFLQKRKLR
IQTLSPYAH