; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

ClCG01G002890 (gene) of Watermelon (Charleston Gray) v2.5 genome

Gene IDClCG01G002890
OrganismCitrullus lanatus subsp. vulgaris cv. Charleston Gray (Watermelon (Charleston Gray) v2.5)
DescriptionProtein LURP-one-related 4
Genome locationCG_Chr01:2940675..2941735
RNA-Seq ExpressionClCG01G002890
SyntenyClCG01G002890
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR007612 - LURP-one-related
IPR025659 - Tubby-like, C-terminal
IPR038595 - LURP-one-related superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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A0A0A0KNY3 Uncharacterized protein2.1e-10194.2Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q67XV7 Protein LURP-one-related 31.3e-2838.21Show/hide
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         E  + P F  +K     S +++ +     V  ++  L +++G    R   I     N +  AE KRK +   G+  G DV  L   S++E  + MAL  
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G53870.1 Protein of unknown function (DUF567)9.4e-3038.21Show/hide
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AT1G53870.2 Protein of unknown function (DUF567)1.1e-2538.42Show/hide
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AT1G63410.1 Protein of unknown function (DUF567)1.3e-3947.26Show/hide
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          S +      ++ RS  R  +  V  E N   E F +++ D K AF+II+I+G ++A+ K K S NGI LG+DVL+L    +++ SL++ LVT+ G ++
Subjt:  ERSKKPSFGVKKLYRSGSRKRNQSV-CEINVGFERFSLVKMDGKLAFRIININGEVVAEAKRKVSWNGILLGDDVLSLNANSQIERSLIMALVTVYGLIR

Query:  R
        +
Subjt:  R

AT3G14260.1 Protein of unknown function (DUF567)7.9e-3744.71Show/hide
Query:  MAKVYPQTAPSPSSSPSSSSLCSETEIETFTIWMKSLIYHTNGCTVFDSNGDIVYRVDNYDRKCSREVFLMDLRGKVLFTIRKKKFSILGGWEGYR----
        M K++P    S +   +SS   + TE E+FTIWMKSL+++TNGCTVFDS G+I+YRVDNY+ K  REV+LMDL G VLFT+R++KF +   WEGYR    
Subjt:  MAKVYPQTAPSPSSSPSSSSLCSETEIETFTIWMKSLIYHTNGCTVFDSNGDIVYRVDNYDRKCSREVFLMDLRGKVLFTIRKKKFSILGGWEGYR----

Query:  WIESERSKKPSFGVKKLYRSGSRKRNQSVCEINVGFER------FSLVKMDGKLAFRIININGEVVAEAKRKVSWNGILLGDDVLSLNANSQIERSLIMA
         +ES  +K   F VK        K + S   +N G  R      + +V     LA  I +  G+++AE KRK S NG+ LGDDVL++   SQ++ S I+ 
Subjt:  WIESERSKKPSFGVKKLYRSGSRKRNQSVCEINVGFER------FSLVKMDGKLAFRIININGEVVAEAKRKVSWNGILLGDDVLSLNANSQIERSLIMA

Query:  LVTVYGLI
        LV  + LI
Subjt:  LVTVYGLI


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCCAAAGTGTACCCTCAAACAGCGCCGTCGCCGTCGTCATCTCCGTCGTCTTCATCGCTCTGTTCCGAAACCGAAATCGAAACCTTCACCATTTGGATGAAA
TCTCTGATTTACCACACAAATGGCTGCACCGTCTTCGATTCCAATGGCGACATCGTCTACAGAGTCGATAACTACGACAGAAAATGCAGTCGCGAAGTATTTCTC
ATGGATCTCAGAGGCAAAGTTCTCTTCACCATCAGGAAAAAGAAATTCTCGATTCTTGGAGGATGGGAAGGATACCGATGGATCGAATCGGAGAGAAGTAAGAAG
CCTAGTTTTGGAGTGAAGAAATTGTACAGATCAGGATCGAGGAAGAGAAATCAATCGGTATGTGAAATAAATGTGGGATTTGAGAGATTTTCATTGGTGAAAATG
GATGGGAAACTGGCTTTCAGAATAATCAACATCAATGGAGAAGTAGTTGCAGAGGCGAAGAGAAAAGTTTCATGGAACGGGATTTTGTTGGGAGATGATGTGTTG
AGTTTAAATGCAAATTCTCAGATTGAAAGATCTTTAATTATGGCTTTGGTCACTGTTTATGGCTTAATCCGTCGCCAAATGTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
TTTCTCATTTCTACCTTCTTCATCAAACTTTCAATTTTCAAACCTTATTTTCTCTCTTCCATCTCAATGGCCAAAGTGTACCCTCAAACAGCGCCGTCGCCGTCG
TCATCTCCGTCGTCTTCATCGCTCTGTTCCGAAACCGAAATCGAAACCTTCACCATTTGGATGAAATCTCTGATTTACCACACAAATGGCTGCACCGTCTTCGAT
TCCAATGGCGACATCGTCTACAGAGTCGATAACTACGACAGAAAATGCAGTCGCGAAGTATTTCTCATGGATCTCAGAGGCAAAGTTCTCTTCACCATCAGGAAA
AAGAAATTCTCGATTCTTGGAGGATGGGAAGGATACCGATGGATCGAATCGGAGAGAAGTAAGAAGCCTAGTTTTGGAGTGAAGAAATTGTACAGATCAGGATCG
AGGAAGAGAAATCAATCGGTATGTGAAATAAATGTGGGATTTGAGAGATTTTCATTGGTGAAAATGGATGGGAAACTGGCTTTCAGAATAATCAACATCAATGGA
GAAGTAGTTGCAGAGGCGAAGAGAAAAGTTTCATGGAACGGGATTTTGTTGGGAGATGATGTGTTGAGTTTAAATGCAAATTCTCAGATTGAAAGATCTTTAATT
ATGGCTTTGGTCACTGTTTATGGCTTAATCCGTCGCCAAATGTAAATTAAAAAGAAAAGAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAGTTTATACAAATTTTTGTTTTTGTTT
TTTGTTGAGGATTTTCCCTGATGTGCATAGAACTTTACAGATTTTGGTTTCTTGTAAAGGATTAATGTAGAAGTTACGAACGAATACATATATCAATTTCATTCA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAKVYPQTAPSPSSSPSSSSLCSETEIETFTIWMKSLIYHTNGCTVFDSNGDIVYRVDNYDRKCSREVFLMDLRGKVLFTIRKKKFSILGGWEGYRWIESERSKK
PSFGVKKLYRSGSRKRNQSVCEINVGFERFSLVKMDGKLAFRIININGEVVAEAKRKVSWNGILLGDDVLSLNANSQIERSLIMALVTVYGLIRRQM