; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

ClCG01G003280 (gene) of Watermelon (Charleston Gray) v2.5 genome

Gene IDClCG01G003280
OrganismCitrullus lanatus subsp. vulgaris cv. Charleston Gray (Watermelon (Charleston Gray) v2.5)
Descriptionagamous-like MADS-box protein AGL19
Genome locationCG_Chr01:3354653..3359932
RNA-Seq ExpressionClCG01G003280
SyntenyClCG01G003280
Gene Ontology termsGO:0045944 - positive regulation of transcription by RNA polymerase II (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0000977 - RNA polymerase II regulatory region sequence-specific DNA binding (molecular function)
GO:0003700 - DNA-binding transcription factor activity (molecular function)
GO:0046983 - protein dimerization activity (molecular function)
InterPro domainsIPR002100 - Transcription factor, MADS-box
IPR002487 - Transcription factor, K-box
IPR033896 - MADS MEF2-like
IPR036879 - Transcription factor, MADS-box superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7016937.1 Agamous-like MADS-box protein AGL19, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]1.3e-8786.64Show/hide
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XP_022156217.1 agamous-like MADS-box protein AGL19 [Momordica charantia]3.5e-8886.64Show/hide
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XP_038906882.1 agamous-like MADS-box protein AGL19 [Benincasa hispida]2.3e-10395.87Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3AT26 agamous-like MADS-box protein AGL193.7e-9993.93Show/hide
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A0A6J1DRG2 agamous-like MADS-box protein AGL191.7e-8886.64Show/hide
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A0A6J1E382 agamous-like MADS-box protein AGL19 isoform X23.9e-8585.25Show/hide
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A0A6J1E6F6 agamous-like MADS-box protein AGL19 isoform X12.5e-8786.18Show/hide
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A0A6J1I258 agamous-like MADS-box protein AGL19 isoform X13.2e-8786.18Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O64645 MADS-box protein SOC11.1e-5258.1Show/hide
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O82743 Agamous-like MADS-box protein AGL195.2e-5861.03Show/hide
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Q38838 Agamous-like MADS-box protein AGL145.3e-5559.15Show/hide
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Q9FIS1 MADS-box protein AGL426.3e-4853.85Show/hide
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Q9XJ60 MADS-box transcription factor 504.0e-5056.07Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G45660.1 AGAMOUS-like 207.9e-5458.1Show/hide
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AT4G11880.1 AGAMOUS-like 143.8e-5659.15Show/hide
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AT4G22950.1 AGAMOUS-like 193.7e-5961.03Show/hide
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NGFL