; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

ClCG01G009070 (gene) of Watermelon (Charleston Gray) v2.5 genome

Gene IDClCG01G009070
OrganismCitrullus lanatus subsp. vulgaris cv. Charleston Gray (Watermelon (Charleston Gray) v2.5)
DescriptionTLC domain-containing protein
Genome locationCG_Chr01:11381920..11388016
RNA-Seq ExpressionClCG01G009070
SyntenyClCG01G009070
Gene Ontology termsGO:0055088 - lipid homeostasis (biological process)
GO:0005783 - endoplasmic reticulum (cellular component)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsIPR006634 - TRAM/LAG1/CLN8 homology domain


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6573446.1 TLC domain-containing protein 4-B, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]6.0e-14696.36Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0M188 TLC domain-containing protein5.4e-14596.72Show/hide
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A0A1S4E2B6 transmembrane protein 56-like9.9e-14798.18Show/hide
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A0A5D3E1H6 Transmembrane protein 56-like9.9e-14798.18Show/hide
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A0A6J1GTT4 transmembrane protein 564.2e-14595.64Show/hide
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A0A6J1K6A0 transmembrane protein 56-like3.2e-14596.36Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q550S9 TLC domain-containing protein 4 B1.5e-1125.42Show/hide
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        L C L++      L +++   + K+ +G  + +R+EW NR +ST++AI  S +S+Y +++++   +   +      +S +S FI      YF+ D  +  
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        +    +I + + F  P +  ++NL W   I K + K
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Q5XIY2 TLC domain-containing protein 4-B1.5e-1123.75Show/hide
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           + ++G + +V HH  +  A  Y +  G    +    LISE++TP +N RW+ +     R+   ++ NGI +   + + RI +    +  V+ + Y  
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          +   +   + + +  V L ++N++W  KI +G  K I+
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Q6PGS5 TLC domain-containing protein 4-B7.3e-1427.91Show/hide
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        L+  Q++EWN+R +S+ HA+ +    LY + + D  +     G        +    + ++ GY ++DL LI++ +  +G   +V HH L+ L   Y V  
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        GEG L  +    LI+E +TP +N RW+ +  G  K S   ++NG+++  ++ + RI +    +  V+  +  +      +G    + + +V L +MN+MW
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          KI KG  K +  R
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Q8CGF5 TLC domain-containing protein 41.5e-1427.44Show/hide
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        Y  L+  +++EWN+R +ST H++ + I  LY  F+ +        G  T+ +  ++T     + GY ++DL +I++ +  +G   +++HH  +GL   Y 
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        V +     Y     L++E+++P +N RW+ +     K S A +INGI++   + + RI+     ++ +Y  Y  +  I+   +   +      +L +MN+
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        MW  KI KG +K IS
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Q96MV1 TLC domain-containing protein 47.3e-1428.76Show/hide
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        FY  SY    K+          +++EWN+R +ST H++ + I  LY F+F     +D    G       +L+   + I+ GY ++DL +I+  +  +G  
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         +++HH  S  A    + +G         L++E+++P +N RW+ +     K S A +INGI++   + + RI  +L  Y F +     +  I++ V+  
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        L       VL +MN+MW  KI KG +K IS  R
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G31300.1 TRAM, LAG1 and CLN8 (TLC) lipid-sensing domain containing protein2.2e-11473.06Show/hide
Query:  SLKTVMAIKSYQSQADALVKNYLLADRFVPYTSVLGGMLACKLIYDLTQLVSNFYIKSYLGLTKIQRVEWNNRGMSTIHAIYISIMSLYFVFWSDLFSDQ
        SL+T+ AIKSY  QA  LVKNYLLAD F+PYTSVL G+  CK++YDL   +SN + K+Y+ LTKIQR+EWNNRG+ST+HAI+IS MSLYFVFWSDLFSD+
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Query:  RHAGLVTFQSSTLSTFILGISVGYFLADLGLIVWLYPSLGGMEYVVHHSLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGMKRSCAYLI
         H  LV F+SS LS+  LGIS+GYFLADLG+I W YPSLGG+EY+VHHSLSG+AVAYS+FSGEGQLYTYMVLISEITTPEIN+RWYLDTAGMK+S AY++
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Query:  NGIVIFFAWLVARILLFGYTFYHVYLHYDQVIKMHVIGYLLVFGVPTVLGMMNLMWFGKIVKGLMKTISKR
        NG+ IF AWLVARILLF Y FYHVYLHY+QV++MH+ GY+LVFGVP  LG+MNL+WFGKIV+G+ KT++KR
Subjt:  NGIVIFFAWLVARILLFGYTFYHVYLHYDQVIKMHVIGYLLVFGVPTVLGMMNLMWFGKIVKGLMKTISKR

AT1G31300.2 TRAM, LAG1 and CLN8 (TLC) lipid-sensing domain containing protein2.2e-11473.06Show/hide
Query:  SLKTVMAIKSYQSQADALVKNYLLADRFVPYTSVLGGMLACKLIYDLTQLVSNFYIKSYLGLTKIQRVEWNNRGMSTIHAIYISIMSLYFVFWSDLFSDQ
        SL+T+ AIKSY  QA  LVKNYLLAD F+PYTSVL G+  CK++YDL   +SN + K+Y+ LTKIQR+EWNNRG+ST+HAI+IS MSLYFVFWSDLFSD+
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Query:  RHAGLVTFQSSTLSTFILGISVGYFLADLGLIVWLYPSLGGMEYVVHHSLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGMKRSCAYLI
         H  LV F+SS LS+  LGIS+GYFLADLG+I W YPSLGG+EY+VHHSLSG+AVAYS+FSGEGQLYTYMVLISEITTPEIN+RWYLDTAGMK+S AY++
Subjt:  RHAGLVTFQSSTLSTFILGISVGYFLADLGLIVWLYPSLGGMEYVVHHSLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGMKRSCAYLI

Query:  NGIVIFFAWLVARILLFGYTFYHVYLHYDQVIKMHVIGYLLVFGVPTVLGMMNLMWFGKIVKGLMKTISKR
        NG+ IF AWLVARILLF Y FYHVYLHY+QV++MH+ GY+LVFGVP  LG+MNL+WFGKIV+G+ KT++KR
Subjt:  NGIVIFFAWLVARILLFGYTFYHVYLHYDQVIKMHVIGYLLVFGVPTVLGMMNLMWFGKIVKGLMKTISKR

AT4G10360.1 TRAM, LAG1 and CLN8 (TLC) lipid-sensing domain containing protein1.6e-6449.17Show/hide
Query:  SVLGGMLACKLIYDLTQLVSNFYIKSYLGLTKIQRVEWNNRGMSTIHAIYISIMSLYFVFWSDLFSDQRHAGLVTFQSSTLSTFILGISVGYFLADLGLI
        S+  G L CK++YDLT+ +S      Y  L    R+EWNNRG ST HA++ S+ S+YF+  SD F +  H   V   ++ LS  ++GIS+GYFLADL +I
Subjt:  SVLGGMLACKLIYDLTQLVSNFYIKSYLGLTKIQRVEWNNRGMSTIHAIYISIMSLYFVFWSDLFSDQRHAGLVTFQSSTLSTFILGISVGYFLADLGLI

Query:  VWLYPSLGGMEYVVHHSLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGMKRSCAYLINGIVIFFAWLVARILLFGYTFYHVYLHYDQVI
         W +P+LGG+EYV HH LS  A+  SV SG+ Q Y ++VL+SE TTP +N+RWYLD +G K S AY +NGI +F  WLVAR+LLF + F H+YLH+ QV 
Subjt:  VWLYPSLGGMEYVVHHSLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGMKRSCAYLINGIVIFFAWLVARILLFGYTFYHVYLHYDQVI

Query:  KMHVIGYLLVFGVPTVLGMMNLMWFGKIVKGLMKTISKRR
        ++  +G+  +  +P  L +MNL+WF KI KGL+KT+SK +
Subjt:  KMHVIGYLLVFGVPTVLGMMNLMWFGKIVKGLMKTISKRR

AT4G19645.1 TRAM, LAG1 and CLN8 (TLC) lipid-sensing domain containing protein5.3e-10871.64Show/hide
Query:  MAIKSYQSQADALVKNYLLADRFVPYTSVLGGMLACKLIYDLTQLVSNFYIKSYLGLTKIQRVEWNNRGMSTIHAIYISIMSLYFVFWSDLFSDQRHAGL
        M IKSYQ+QA+  V++YLLAD F+PYTSVL G+  CKL+YDLT+L S+ ++KSY  LTKI+R+EWNNRG+ST+HAI+IS M+LYF F+SDLFSDQR    
Subjt:  MAIKSYQSQADALVKNYLLADRFVPYTSVLGGMLACKLIYDLTQLVSNFYIKSYLGLTKIQRVEWNNRGMSTIHAIYISIMSLYFVFWSDLFSDQRHAGL

Query:  VT-FQSSTLSTFILGISVGYFLADLGLIVWLYPSLGGMEYVVHHSLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGMKRSCAYLINGIV
        +T F++S LSTF LG+SVGYFLADLG+I WLYPSLGG EY++HH LSG AVAYS+FSGE QLYTYMVLISE+TTPEIN+RWYLD AG+KRS AYL+NG+ 
Subjt:  VT-FQSSTLSTFILGISVGYFLADLGLIVWLYPSLGGMEYVVHHSLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGMKRSCAYLINGIV

Query:  IFFAWLVARILLFGYTFYHVYLHYDQVIKMHVIGYLLVFGVPTVLGMMNLMWFGKIVKGLMKTISKRR
        IFFAWL ARILLF Y FYHVY HYDQVI+MH  GYLLVF VP  L +MNL+WFGKIVKGL KT+ KR+
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AT4G19645.2 TRAM, LAG1 and CLN8 (TLC) lipid-sensing domain containing protein5.3e-10871.64Show/hide
Query:  MAIKSYQSQADALVKNYLLADRFVPYTSVLGGMLACKLIYDLTQLVSNFYIKSYLGLTKIQRVEWNNRGMSTIHAIYISIMSLYFVFWSDLFSDQRHAGL
        M IKSYQ+QA+  V++YLLAD F+PYTSVL G+  CKL+YDLT+L S+ ++KSY  LTKI+R+EWNNRG+ST+HAI+IS M+LYF F+SDLFSDQR    
Subjt:  MAIKSYQSQADALVKNYLLADRFVPYTSVLGGMLACKLIYDLTQLVSNFYIKSYLGLTKIQRVEWNNRGMSTIHAIYISIMSLYFVFWSDLFSDQRHAGL

Query:  VT-FQSSTLSTFILGISVGYFLADLGLIVWLYPSLGGMEYVVHHSLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGMKRSCAYLINGIV
        +T F++S LSTF LG+SVGYFLADLG+I WLYPSLGG EY++HH LSG AVAYS+FSGE QLYTYMVLISE+TTPEIN+RWYLD AG+KRS AYL+NG+ 
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Query:  IFFAWLVARILLFGYTFYHVYLHYDQVIKMHVIGYLLVFGVPTVLGMMNLMWFGKIVKGLMKTISKRR
        IFFAWL ARILLF Y FYHVY HYDQVI+MH  GYLLVF VP  L +MNL+WFGKIVKGL KT+ KR+
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCAATGTCTTTGAAGACTGTAATGGCTATTAAATCTTACCAAAGTCAAGCTGATGCATTAGTAAAGAACTATTTATTAGCAGACCGTTTTGTCCCATACACTTCTGT
CCTTGGAGGCATGCTTGCTTGTAAATTGATTTATGATCTTACTCAATTAGTTAGCAATTTTTACATCAAGAGTTATCTGGGTCTTACAAAAATCCAACGAGTCGAGTGGA
ATAACCGCGGCATGTCCACTATTCATGCAATCTATATCTCAATTATGTCATTGTACTTCGTTTTCTGGTCAGATCTCTTCTCTGACCAGCGTCATGCTGGCCTTGTTACC
TTCCAAAGTTCAACGTTGTCTACTTTCATATTGGGGATTTCAGTTGGGTACTTCTTGGCAGATCTTGGATTGATTGTTTGGCTGTATCCTTCCTTAGGTGGGATGGAGTA
TGTTGTCCACCACTCTCTTTCCGGACTAGCAGTAGCATACTCTGTTTTTTCTGGAGAAGGCCAACTCTATACTTATATGGTCCTCATTTCGGAGATTACAACTCCTGAGA
TTAATATGAGATGGTATCTTGATACAGCTGGTATGAAGAGGTCCTGCGCATATTTGATTAATGGCATTGTAATATTTTTTGCATGGCTGGTTGCTCGCATATTGCTATTT
GGTTACACATTCTATCATGTTTACCTGCACTATGATCAGGTAATTAAGATGCATGTAATCGGATATCTTTTGGTATTTGGAGTGCCAACAGTGCTAGGTATGATGAACTT
GATGTGGTTCGGAAAGATCGTCAAGGGATTAATGAAAACTATATCAAAGAGGCGATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
TGCACATTGAAGAATGTAATAAATAAAAGAGAGATTAAAAAAAAGAAAAAAAGAAAGGAAAAATCATGGGCTAAGGCGCGAAGCTATCATATTCCTTCGGTTAGTACTAC
AGAAAGGATTGGATAGAATGCAATTGAATCCACAAGAACAAGAGGATCCCATCTCTGGAAACTCAAATCCATTGCTAATTAGCAAAACCCACTTGCATTTCGCATTACCC
AATTCCCCATACGCTATTATAATTTCTAATTTCTCTTCATCATGCCTTGATTTACCCCTTTTAGATTGTTGCGTTGCGGTTGAAGATTCCTAACGCTTCACATTGATTGA
ACCTCACGGTTCTTTTGTACCGGTCGGTTGTTGCATTTCCTTTACAGATTATCTTATATTGTTTTCTTCCCATTTTCTTATCTTTGAAAAAGAGAAAAACCCCCCCTTCT
GCATCTCCTCGTGATCTGGGGTCTTCATCTATTATGAGGGATAACAATATGGAGGGAGGGAGCAAATAGTTAATTCAGTCTGAGGTACTGCGATCTGCCGAATGTTATGT
AGTCAAACAACACAATGGCAATGTCTTTGAAGACTGTAATGGCTATTAAATCTTACCAAAGTCAAGCTGATGCATTAGTAAAGAACTATTTATTAGCAGACCGTTTTGTC
CCATACACTTCTGTCCTTGGAGGCATGCTTGCTTGTAAATTGATTTATGATCTTACTCAATTAGTTAGCAATTTTTACATCAAGAGTTATCTGGGTCTTACAAAAATCCA
ACGAGTCGAGTGGAATAACCGCGGCATGTCCACTATTCATGCAATCTATATCTCAATTATGTCATTGTACTTCGTTTTCTGGTCAGATCTCTTCTCTGACCAGCGTCATG
CTGGCCTTGTTACCTTCCAAAGTTCAACGTTGTCTACTTTCATATTGGGGATTTCAGTTGGGTACTTCTTGGCAGATCTTGGATTGATTGTTTGGCTGTATCCTTCCTTA
GGTGGGATGGAGTATGTTGTCCACCACTCTCTTTCCGGACTAGCAGTAGCATACTCTGTTTTTTCTGGAGAAGGCCAACTCTATACTTATATGGTCCTCATTTCGGAGAT
TACAACTCCTGAGATTAATATGAGATGGTATCTTGATACAGCTGGTATGAAGAGGTCCTGCGCATATTTGATTAATGGCATTGTAATATTTTTTGCATGGCTGGTTGCTC
GCATATTGCTATTTGGTTACACATTCTATCATGTTTACCTGCACTATGATCAGGTAATTAAGATGCATGTAATCGGATATCTTTTGGTATTTGGAGTGCCAACAGTGCTA
GGTATGATGAACTTGATGTGGTTCGGAAAGATCGTCAAGGGATTAATGAAAACTATATCAAAGAGGCGATGAGAAATGTCTTCCAGTCGATATCTCTTCCTCTTCAGTCT
CTTGGTCTACATCTACACAATGGGTTGAGGAGAACAAGGAATTTGATGGTATGTAGTGTGTTGTAAATGGTTCAAAATAACTTAAACTTATTGACATTTAGTGTCTTTTT
CGTCTTGTCAGATTTGTGTACCAATCC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAMSLKTVMAIKSYQSQADALVKNYLLADRFVPYTSVLGGMLACKLIYDLTQLVSNFYIKSYLGLTKIQRVEWNNRGMSTIHAIYISIMSLYFVFWSDLFSDQRHAGLVT
FQSSTLSTFILGISVGYFLADLGLIVWLYPSLGGMEYVVHHSLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGMKRSCAYLINGIVIFFAWLVARILLF
GYTFYHVYLHYDQVIKMHVIGYLLVFGVPTVLGMMNLMWFGKIVKGLMKTISKRR