; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

ClCG01G013260 (gene) of Watermelon (Charleston Gray) v2.5 genome

Gene IDClCG01G013260
OrganismCitrullus lanatus subsp. vulgaris cv. Charleston Gray (Watermelon (Charleston Gray) v2.5)
DescriptionGlutaredoxin
Genome locationCG_Chr01:26430422..26432412
RNA-Seq ExpressionClCG01G013260
SyntenyClCG01G013260
Gene Ontology termsGO:0034599 - cellular response to oxidative stress (biological process)
GO:0005737 - cytoplasm (cellular component)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
GO:0015038 - glutathione disulfide oxidoreductase activity (molecular function)
GO:0097573 - glutathione oxidoreductase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR002109 - Glutaredoxin
IPR011899 - Glutaredoxin, eukaryotic/virial
IPR014025 - Glutaredoxin subgroup
IPR036249 - Thioredoxin-like superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0055240.1 uncharacterized protein E6C27_scaffold80G00820 [Cucumis melo var. makuwa]7.8e-5388.33Show/hide
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NP_001274139.1 glutaredoxin [Cucumis sativus]4.7e-5890.4Show/hide
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XP_008438572.1 PREDICTED: glutaredoxin [Cucumis melo]1.2e-5688.8Show/hide
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XP_022137238.1 glutaredoxin-C1 [Momordica charantia]9.2e-5484.8Show/hide
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XP_038894148.1 glutaredoxin [Benincasa hispida]3.0e-6094.4Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3AWQ0 glutaredoxin5.6e-5788.8Show/hide
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A0A5A7UJ77 Glutaredoxin domain-containing protein3.8e-5388.33Show/hide
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A0A5D3BJ77 Glutaredoxin domain-containing protein3.8e-5388.33Show/hide
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A0A6J1C9R3 glutaredoxin-C14.5e-5484.8Show/hide
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U3RGD2 Glutaredoxin2.3e-5890.4Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O81187 Glutaredoxin3.4e-3565.69Show/hide
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P55143 Glutaredoxin7.4e-3868.63Show/hide
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Q8L8T2 Glutaredoxin-C13.3e-4668.8Show/hide
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        E +++G+L+PLLTEAGAIA NS+QL
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Q9FNE2 Glutaredoxin-C25.3e-3664.49Show/hide
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Q9ZR41 Glutaredoxin4.8e-3766.04Show/hide
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        AIA  S
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G20270.1 Thioredoxin superfamily protein7.1e-2045.95Show/hide
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AT4G28730.1 Glutaredoxin family protein1.0e-1845.74Show/hide
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AT5G40370.1 Glutaredoxin family protein3.8e-3764.49Show/hide
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AT5G40370.2 Glutaredoxin family protein1.4e-3165.93Show/hide
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AT5G63030.1 Thioredoxin superfamily protein2.3e-4768.8Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGGGTCGTGGTTCAGCTCAAACAAATTGAGTAAAGAAGAGCTTGAATTAGCGCTTAACGAAGCCAAGAAGATAATCTCCTCTGACCCTGTTGTTGTTTTCAGTAAGAC
TTATTGTGGGTATTGCTCGAGTGTCAAGGAACTGCTCACACGGCTTGGAGCTAGGTATAAGGTCATTGAATTGAACCAAAAAAGTGATGGAGATAAAATTCAGTCAGCTT
TAGCGGAGTGGACGGGCCAAACCACGGTGCCTAATGTGTTTATAGGAGAAAAGCACATCGGTGGTTGCGATGCGGTTACTGAGAAACACCGCAGAGGTCAGTTGATACCC
CTTCTTACTGAGGCTGGTGCCATTGCCAGTAACTCTGCTCAGCTCTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
GGAGTTCGGACGGCCATGCGAGCTTATTCTTTTACTCTTTCAGCAAGTGAAATTGACATCAAAATTCGTCTCTTTTGACCTTAAAATTGTTCTTCTCTGTTTCCGAATTC
ATAAGGATTTCTTCATAACAAAGCATCCTTGAAACTCTCCCGTTTGATCTTATTAAGCGAGGTCATGGGGTCGTGGTTCAGCTCAAACAAATTGAGTAAAGAAGAGCTTG
AATTAGCGCTTAACGAAGCCAAGAAGATAATCTCCTCTGACCCTGTTGTTGTTTTCAGTAAGACTTATTGTGGGTATTGCTCGAGTGTCAAGGAACTGCTCACACGGCTT
GGAGCTAGGTATAAGGTCATTGAATTGAACCAAAAAAGTGATGGAGATAAAATTCAGTCAGCTTTAGCGGAGTGGACGGGCCAAACCACGGTGCCTAATGTGTTTATAGG
AGAAAAGCACATCGGTGGTTGCGATGCGGTTACTGAGAAACACCGCAGAGGTCAGTTGATACCCCTTCTTACTGAGGCTGGTGCCATTGCCAGTAACTCTGCTCAGCTCT
AAGCTTTGGTTCATTGCTTCACATTCTAATAATGAAGAAAATGTATGTTGGTGGATTTGAGGTGTGGACAAAACAGTTGTGAAAATGTTTTAATGTGGCTTTTTGAATGA
TTTAAAATGTGGAAGCTGAAGAAATAGATAGCTATGATTGAATTCGTGCATTGATAAATATTTGGAACCCAATGATGGATTGTTCTTGGTTCTGCTTACTTAAGCGATAT
CGCACCACGGTTGGCTTAACCCCGAGGGTGATCAAGTGGTTAAAAAGAAAAGTAATTTGTTTGATTTCATGAATTCGAATTTATAGTAGTACGAGGGCCCAATGTTGTAA
GCTCGTTGTCTAAAAGAGTAGAGATAGAGTTATA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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