; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

ClCG01G023050 (gene) of Watermelon (Charleston Gray) v2.5 genome

Gene IDClCG01G023050
OrganismCitrullus lanatus subsp. vulgaris cv. Charleston Gray (Watermelon (Charleston Gray) v2.5)
DescriptionVQ motif-containing protein 4-like
Genome locationCG_Chr01:36476131..36476814
RNA-Seq ExpressionClCG01G023050
SyntenyClCG01G023050
Gene Ontology termsGO:0005634 - nucleus (cellular component)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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XP_008439848.1 PREDICTED: VQ motif-containing protein 4-like [Cucumis melo]7.0e-10086.84Show/hide
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XP_022925670.1 VQ motif-containing protein 4-like, partial [Cucurbita moschata]5.0e-8278.73Show/hide
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XP_023543221.1 VQ motif-containing protein 4-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.5e-8185.43Show/hide
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XP_038882910.1 VQ motif-containing protein 4-like [Benincasa hispida]2.4e-10891.63Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KI33 VQ domain-containing protein1.8e-10187.67Show/hide
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A0A1S3B0C2 VQ motif-containing protein 4-like3.4e-10086.84Show/hide
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A0A5D3CP65 VQ motif-containing protein 4-like3.4e-10086.84Show/hide
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        PRESEP+LLPLFPITSP +PGPP PS+S
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A0A6J1EIU9 VQ motif-containing protein 4-like2.4e-8278.73Show/hide
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        N S T + T +      PPPK +NRS+STNPYPTTFVQA+TSSFKQVVQMLTGSPETAKQ STPDPPSKTHIP IKSIP+R HSNFKLYERRNAL NLQ 
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        INPVFAS   T GFSPRN   HPEI SPSMLDFPSLV+SPVTPLIPDPFGRSQPLNS+ +NNV+ SN GLD EAEA AIREKGFYLHPSP TTPRESEPQ
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        LLPLFPITSP +PGP   S+S
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A0A6J1IR60 VQ motif-containing protein 4-like9.5e-7983Show/hide
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        +NRS+STNPYP TFVQADTSSFKQVVQMLTGSPETAKQ STPD PSKTHIP IKSIP+R HSNFKLYERRNAL NLQ I+PVFAS   T GFSPR    H
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        PEI SPSMLDFPSLV+SPVTPLIPDPFGRSQPLNS+ +NNV+ SN GLD EAEAKAIREKGFYLHPSPATTPRESEPQLLPLFPITSP +PGP P P++S
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O23660 VQ motif-containing protein 134.2e-3144.86Show/hide
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        Y TTF++ D SSFKQVVQ+LTG P+       P  P    IPPIK++  K+Q S+F+L ERRN++ +   INP               + G PEIL+P++
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        L+FP+L LSP TPL+ DPF R    +   ++    S    D++ E ++I+EKGFYL PSP+TTPR++EP+LL LFP+T    P P
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Q5M750 VQ motif-containing protein 49.9e-4953.33Show/hide
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        NS   S+S+ +     +P      RS+S NPYPTTFVQADTSSFKQVVQMLTGS E  K  S+         PDP   PS   IPPIK++P ++ S+   
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          F+LYERRN++ NL+I  +NPVF  +     FSPR     PEILSPS+LDFPSLVLSPVTPLIPDPF RS   N  S N +          AE KA++E
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        +GFYLHPSPATTP + EP+LLPLFP+TSP+  G    S S
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Q9FHZ3 VQ motif-containing protein 339.9e-3341.27Show/hide
Query:  TSTSTTTADGLQSPPPKFIN---------------RSDSTNPYPTTFVQADTSSFKQVVQMLTGS---PETAKQASTPDPPSKTH------IPPIKSIPK
        TS+ ++  + +Q+PPP   +                   +NPYPTTFVQADTS+FKQVVQMLTGS     T K    P P +  +      IPPIK    
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Query:  RQHSNFKLYERRNALHNLQIINPVFASSV------------------STPGFSPRNNHGHPEI-LSPSMLDFPSLVL-SPVTPL--IPDPFGRSQPLNSD
         + ++FKLYERR   +N+   N +  +++                   +P FSPRN+     I LSPSMLDFP L L SPVTPL    DPF +S PL+  
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Query:  SANNVNCSNSGLDEEAEAKAIREKGFYLHPSPATTPRESEPQLLPLFPITSP
        +++             E KAI +KGFYLHPSP +TPR+S+P LLPLFP+ SP
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Q9FNP0 VQ motif-containing protein 313.2e-1537.3Show/hide
Query:  TTFVQADTSSFKQVVQMLTGSPETAKQASTPDPP-SKTHIPPIKSIPKRQHSNFKLYERRNALH-NLQIINPVFASSVSTPGFSPRNNHGHPEILSPSML
        TTFVQ DT++F+++VQ LTG  E    A+TP+    KT      +I KR  S  KL+ERR  +   L+I+ P    S    G +P +  G+  +L+ S +
Subjt:  TTFVQADTSSFKQVVQMLTGSPETAKQASTPDPP-SKTHIPPIKSIPKRQHSNFKLYERRNALH-NLQIINPVFASSVSTPGFSPRNNHGHPEILSPSML

Query:  DFPSLVLSPVTPLIPDPFGRSQPLNSDSANNVNCSNSGLDEEAEAKAIREKGFYLHPSPATTPRESEPQLLPLFPITSPQQPGPP
          PS + S ++ +  +P         DS           + E E KAI+E+ FYLHPSP + P  +EP+LL LFP+TSP   G P
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Q9LDZ1 VQ motif-containing protein 196.2e-3546.35Show/hide
Query:  PNSSFTSTSTTTADGLQSPPPKFINRSDSTNPYPTTFVQADTSSFKQVVQMLTG-----SPETAKQASTPDPPSKTHIPPIKSIPKRQHSNFKLYERR--
        P+SS +S S++  +G  S     I RSD    YPTTFVQAD+SSFKQVVQMLTG     SP++ +  +TP       IPPIK+   ++HS  KLYERR  
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Query:  ----NALHNLQIINPVF--ASSVSTPGFSPRNNHGHPEILSPSMLDFPSLVL-SPVTPLIP-------DPFGRSQPLNSDSANNVNCSNSGLDEEAEAKA
            N L N  +IN +        +P FSPRN     EILSPS LDFP L L SPVTPL         DPF +  PL+                  E + 
Subjt:  ----NALHNLQIINPVF--ASSVSTPGFSPRNNHGHPEILSPSMLDFPSLVL-SPVTPLIP-------DPFGRSQPLNSDSANNVNCSNSGLDEEAEAKA

Query:  IREKGFYLHPSPATTPRESEPQLLPLFPITSPQ
        I +KG+YLH SP +TPR+SEPQLLPLFP+TSP+
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G28280.1 VQ motif-containing protein7.0e-5053.33Show/hide
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        NS   S+S+ +     +P      RS+S NPYPTTFVQADTSSFKQVVQMLTGS E  K  S+         PDP   PS   IPPIK++P ++ S+   
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Query:  --FKLYERRNALHNLQI--INPVFASSVSTPGFSPRNNHGHPEILSPSMLDFPSLVLSPVTPLIPDPFGRSQPLNSDSANNVNCSNSGLDEEAEAKAIRE
          F+LYERRN++ NL+I  +NPVF  +     FSPR     PEILSPS+LDFPSLVLSPVTPLIPDPF RS   N  S N +          AE KA++E
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Query:  KGFYLHPSPATTPRESEPQLLPLFPITSPQQPGPPRPSAS
        +GFYLHPSPATTP + EP+LLPLFP+TSP+  G    S S
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AT1G28280.2 VQ motif-containing protein5.4e-5054.35Show/hide
Query:  NSSFTSTSTTTADGLQSPPPKFINRSDSTNPYPTTFVQADTSSFKQVVQMLTGSPETAKQAST---------PDP---PSKTHIPPIKSIPKRQHSN---
        NS   S+S+ +     +P      RS+S NPYPTTFVQADTSSFKQVVQMLTGS E  K  S+         PDP   PS   IPPIK++P ++ S+   
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          F+LYERRN++ NL+I  +NPVF  +     FSPR     PEILSPS+LDFPSLVLSPVTPLIPDPF RS   N  S N +          AE KA++E
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Query:  KGFYLHPSPATTPRESEPQLLPLFPITSPQ
        +GFYLHPSPATTP + EP+LLPLFP+TSP+
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AT2G33780.1 VQ motif-containing protein3.0e-3244.86Show/hide
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        Y TTF++ D SSFKQVVQ+LTG P+       P  P    IPPIK++  K+Q S+F+L ERRN++ +   INP               + G PEIL+P++
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Query:  LDFPSLVLSPVTPLIPDPFGRSQPLNSDSANNVNCSNSGLDEEAEAKAIREKGFYLHPSPATTPRESEPQLLPLFPITSPQQPGP
        L+FP+L LSP TPL+ DPF R    +   ++    S    D++ E ++I+EKGFYL PSP+TTPR++EP+LL LFP+T    P P
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AT3G15300.1 VQ motif-containing protein4.4e-3646.35Show/hide
Query:  PNSSFTSTSTTTADGLQSPPPKFINRSDSTNPYPTTFVQADTSSFKQVVQMLTG-----SPETAKQASTPDPPSKTHIPPIKSIPKRQHSNFKLYERR--
        P+SS +S S++  +G  S     I RSD    YPTTFVQAD+SSFKQVVQMLTG     SP++ +  +TP       IPPIK+   ++HS  KLYERR  
Subjt:  PNSSFTSTSTTTADGLQSPPPKFINRSDSTNPYPTTFVQADTSSFKQVVQMLTG-----SPETAKQASTPDPPSKTHIPPIKSIPKRQHSNFKLYERR--

Query:  ----NALHNLQIINPVF--ASSVSTPGFSPRNNHGHPEILSPSMLDFPSLVL-SPVTPLIP-------DPFGRSQPLNSDSANNVNCSNSGLDEEAEAKA
            N L N  +IN +        +P FSPRN     EILSPS LDFP L L SPVTPL         DPF +  PL+                  E + 
Subjt:  ----NALHNLQIINPVF--ASSVSTPGFSPRNNHGHPEILSPSMLDFPSLVL-SPVTPLIP-------DPFGRSQPLNSDSANNVNCSNSGLDEEAEAKA

Query:  IREKGFYLHPSPATTPRESEPQLLPLFPITSPQ
        I +KG+YLH SP +TPR+SEPQLLPLFP+TSP+
Subjt:  IREKGFYLHPSPATTPRESEPQLLPLFPITSPQ

AT5G53830.1 VQ motif-containing protein7.1e-3441.27Show/hide
Query:  TSTSTTTADGLQSPPPKFIN---------------RSDSTNPYPTTFVQADTSSFKQVVQMLTGS---PETAKQASTPDPPSKTH------IPPIKSIPK
        TS+ ++  + +Q+PPP   +                   +NPYPTTFVQADTS+FKQVVQMLTGS     T K    P P +  +      IPPIK    
Subjt:  TSTSTTTADGLQSPPPKFIN---------------RSDSTNPYPTTFVQADTSSFKQVVQMLTGS---PETAKQASTPDPPSKTH------IPPIKSIPK

Query:  RQHSNFKLYERRNALHNLQIINPVFASSV------------------STPGFSPRNNHGHPEI-LSPSMLDFPSLVL-SPVTPL--IPDPFGRSQPLNSD
         + ++FKLYERR   +N+   N +  +++                   +P FSPRN+     I LSPSMLDFP L L SPVTPL    DPF +S PL+  
Subjt:  RQHSNFKLYERRNALHNLQIINPVFASSV------------------STPGFSPRNNHGHPEI-LSPSMLDFPSLVL-SPVTPL--IPDPFGRSQPLNSD

Query:  SANNVNCSNSGLDEEAEAKAIREKGFYLHPSPATTPRESEPQLLPLFPITSP
        +++             E KAI +KGFYLHPSP +TPR+S+P LLPLFP+ SP
Subjt:  SANNVNCSNSGLDEEAEAKAIREKGFYLHPSPATTPRESEPQLLPLFPITSP


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAAAATTTCTCATCCAAATTCCTCCTTCACTTCCACTTCAACCACCACCGCCGATGGCCTTCAATCGCCGCCCCCCAAATTCATCAACAGATCCGATTCCACT
AACCCATACCCCACCACTTTCGTCCAAGCCGATACCTCCTCCTTTAAACAAGTTGTTCAAATGCTCACCGGCTCGCCGGAAACCGCCAAGCAAGCTTCCACACCA
GACCCACCTTCCAAAACCCATATCCCTCCTATTAAATCCATTCCCAAACGCCAACACTCCAATTTCAAGCTCTATGAGCGAAGAAATGCTCTTCATAACCTCCAA
ATTATCAACCCTGTTTTTGCCTCCTCTGTTTCTACTCCTGGATTCTCCCCAAGAAATAACCATGGCCACCCTGAAATTCTCTCTCCCAGTATGCTGGATTTCCCG
TCGCTGGTCCTCAGCCCCGTCACGCCGCTCATTCCCGATCCATTTGGCCGATCGCAGCCGTTGAATTCTGACTCGGCGAACAATGTCAATTGTAGTAATTCGGGG
CTGGATGAGGAAGCAGAAGCTAAAGCCATTAGAGAAAAGGGGTTTTATTTACACCCTTCTCCGGCCACCACTCCCAGGGAATCGGAGCCGCAGCTTTTGCCTCTT
TTTCCGATCACTTCTCCTCAACAACCAGGTCCACCTCGCCCTTCTGCTTCTTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGAAAATTTCTCATCCAAATTCCTCCTTCACTTCCACTTCAACCACCACCGCCGATGGCCTTCAATCGCCGCCCCCCAAATTCATCAACAGATCCGATTCCACT
AACCCATACCCCACCACTTTCGTCCAAGCCGATACCTCCTCCTTTAAACAAGTTGTTCAAATGCTCACCGGCTCGCCGGAAACCGCCAAGCAAGCTTCCACACCA
GACCCACCTTCCAAAACCCATATCCCTCCTATTAAATCCATTCCCAAACGCCAACACTCCAATTTCAAGCTCTATGAGCGAAGAAATGCTCTTCATAACCTCCAA
ATTATCAACCCTGTTTTTGCCTCCTCTGTTTCTACTCCTGGATTCTCCCCAAGAAATAACCATGGCCACCCTGAAATTCTCTCTCCCAGTATGCTGGATTTCCCG
TCGCTGGTCCTCAGCCCCGTCACGCCGCTCATTCCCGATCCATTTGGCCGATCGCAGCCGTTGAATTCTGACTCGGCGAACAATGTCAATTGTAGTAATTCGGGG
CTGGATGAGGAAGCAGAAGCTAAAGCCATTAGAGAAAAGGGGTTTTATTTACACCCTTCTCCGGCCACCACTCCCAGGGAATCGGAGCCGCAGCTTTTGCCTCTT
TTTCCGATCACTTCTCCTCAACAACCAGGTCCACCTCGCCCTTCTGCTTCTTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MKISHPNSSFTSTSTTTADGLQSPPPKFINRSDSTNPYPTTFVQADTSSFKQVVQMLTGSPETAKQASTPDPPSKTHIPPIKSIPKRQHSNFKLYERRNALHNLQ
IINPVFASSVSTPGFSPRNNHGHPEILSPSMLDFPSLVLSPVTPLIPDPFGRSQPLNSDSANNVNCSNSGLDEEAEAKAIREKGFYLHPSPATTPRESEPQLLPL
FPITSPQQPGPPRPSAS