; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

ClCG02G005010 (gene) of Watermelon (Charleston Gray) v2.5 genome

Gene IDClCG02G005010
OrganismCitrullus lanatus subsp. vulgaris cv. Charleston Gray (Watermelon (Charleston Gray) v2.5)
DescriptionNADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 8, mitochondrial
Genome locationCG_Chr02:5376459..5380176
RNA-Seq ExpressionClCG02G005010
SyntenyClCG02G005010
Gene Ontology termsGO:0006120 - mitochondrial electron transport, NADH to ubiquinone (biological process)
GO:0032981 - mitochondrial respiratory chain complex I assembly (biological process)
GO:0005747 - mitochondrial respiratory chain complex I (cellular component)
GO:0003954 - NADH dehydrogenase activity (molecular function)
GO:0046872 - metal ion binding (molecular function)
GO:0051539 - 4 iron, 4 sulfur cluster binding (molecular function)
InterPro domainsIPR010226 - NADH-quinone oxidoreductase, chain I
IPR017896 - 4Fe-4S ferredoxin-type, iron-sulphur binding domain
IPR017900 - 4Fe-4S ferredoxin, iron-sulphur binding, conserved site


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7011706.1 hypothetical protein SDJN02_26612 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]2.5e-11692.77Show/hide
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XP_004150417.1 NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 8-B, mitochondrial [Cucumis sativus]1.8e-11492.34Show/hide
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XP_022136046.1 NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 8, mitochondrial [Momordica charantia]3.6e-11592.34Show/hide
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XP_022933976.1 NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 8, mitochondrial [Cucurbita moschata]6.1e-11591.49Show/hide
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XP_038887775.1 NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 8-B, mitochondrial [Benincasa hispida]1.7e-11794.04Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0K5Z9 Uncharacterized protein8.5e-11592.34Show/hide
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A0A5A7T1E5 NADH dehydrogenase (Ubiquinone) iron-sulfur protein 8-B2.5e-11491.91Show/hide
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A0A6J1C2E8 NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 8, mitochondrial1.7e-11592.34Show/hide
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A0A6J1F0I7 NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 8, mitochondrial2.9e-11591.49Show/hide
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A0A6J1I8H7 NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 8, mitochondrial2.9e-11591.49Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O21233 NADH-ubiquinone oxidoreductase subunit 81.1e-7986.34Show/hide
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O24143 NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 8, mitochondrial3.2e-10382.55Show/hide
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P80269 NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 8, mitochondrial5.9e-10582.98Show/hide
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Q42599 NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 8-A, mitochondrial1.6e-10582.55Show/hide
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Q9FX83 NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 8-B, mitochondrial1.1e-10683.4Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G16700.1 Alpha-helical ferredoxin7.7e-10883.4Show/hide
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AT1G79010.1 Alpha-helical ferredoxin1.1e-10682.55Show/hide
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ATCG01090.1 NADPH dehydrogenases9.9e-1534.71Show/hide
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        +     +EF+T    EL Y++
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Sequences Show/hide sequences
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GTACAGTACCAAAAAAGGTTTTGTTTCTGGTTCTCATCATCTTGATAAATTTACTGAAGATGAAGAAAGAGAGCAGCTTGCCAAGGAGATCTCGAAGGATTGGAGTTCTA
TTTTTGAGCGTAGCATAAACACACTATTTCTCACTGAAATGGTTCGGGGTCTGAGTCTGACTCTTAAATACTTCTTTGAGAAAAAAGTCACTATCAATTATCCATTCGAG
AAAGGCCCCCTAAGTCCTCGTTTCCGAGGTGAACATGCCCTCCGACGATATCCAACTGGAGAAGAACGATGCATTGCATGCAAACTTTGTGAAGCTATTTGTCCTGCTCA
AGCAATCACAATCGAAGCTGAGGAACGGGAAGATGGTAGCCGGAGGACCACAAGGTATGACATTGACATGACCAAATGCATCTACTGTGGGTTCTGTCAAGAGGCATGCC
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TCCCAATAAAAATGGGAATGTTATGGTTTCTCATGAAGTTGTAATGTAGGTAAATATGAACATTATCATCAATATATCTTCAATGTTCTTCAGGACTTCACTCTCTGGTA
GTATTGATTTTG
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ETEIAENLRSESLYR