; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

ClCG02G005260 (gene) of Watermelon (Charleston Gray) v2.5 genome

Gene IDClCG02G005260
OrganismCitrullus lanatus subsp. vulgaris cv. Charleston Gray (Watermelon (Charleston Gray) v2.5)
DescriptionNEDD8-conjugating enzyme Ubc12-like
Genome locationCG_Chr02:5724842..5729102
RNA-Seq ExpressionClCG02G005260
SyntenyClCG02G005260
Gene Ontology termsGO:0045116 - protein neddylation (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0005524 - ATP binding (molecular function)
GO:0019788 - NEDD8 transferase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR000608 - Ubiquitin-conjugating enzyme E2
IPR016135 - Ubiquitin-conjugating enzyme/RWD-like
IPR023313 - Ubiquitin-conjugating enzyme, active site


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0036519.1 NEDD8-conjugating enzyme Ubc12-like [Cucumis melo var. makuwa]1.7e-11285.95Show/hide
Query:  NVSPTAGDSFRTLVRPVSPSQKRDRGTVSRPSCHSQ-----SHVAVSNWFLIMKYSAGTMIKLFKVKEKQREIAANANGKPPVKKQTAGELRLQKDISEL
        ++SP AGDSF      +S S+KRDR  VSRPSCHSQ       + V N     ++S GTMIKLFKVKEKQREIAANANG PPVKKQTAGELRLQKDISEL
Subjt:  NVSPTAGDSFRTLVRPVSPSQKRDRGTVSRPSCHSQ-----SHVAVSNWFLIMKYSAGTMIKLFKVKEKQREIAANANGKPPVKKQTAGELRLQKDISEL

Query:  NLPKTCSISFPNGKDDLMNFEVTIHPDEGYYLGGTFLFSFQVSPVYPHEPPKVKCKTKVYHPNIDLEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPN
        NLPKTCSISFPNGKDDLMNFEVTIHPDEGYYLGGTFLFSFQVSPVYPHEPPKVKCKTKVYHPNIDLEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPN
Subjt:  NLPKTCSISFPNGKDDLMNFEVTIHPDEGYYLGGTFLFSFQVSPVYPHEPPKVKCKTKVYHPNIDLEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPN

Query:  HEDPLNHDAAAVLRDNPKMFESNVRRAMAGGYVGQTYFTRCM
        HEDPLNHDAAAVLRDNPKMFE NVRRAMAGGYVGQTYFTRCM
Subjt:  HEDPLNHDAAAVLRDNPKMFESNVRRAMAGGYVGQTYFTRCM

KAG7022419.1 NEDD8-conjugating enzyme Ubc12 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]1.4e-10396.81Show/hide
Query:  YSAGTMIKLFKVKEKQREIAANANGKPPVKKQTAGELRLQKDISELNLPKTCSISFPNGKDDLMNFEVTIHPDEGYYLGGTFLFSFQVSPVYPHEPPKVK
        Y AGTMIKLFKVKEKQREIA NA+GKPPVKKQTAGELRLQKDISELNLPKTCSISFPNGKD+LMNFEVTIHPDEGYYLGGTFLFSFQVSPVYPHEPPKVK
Subjt:  YSAGTMIKLFKVKEKQREIAANANGKPPVKKQTAGELRLQKDISELNLPKTCSISFPNGKDDLMNFEVTIHPDEGYYLGGTFLFSFQVSPVYPHEPPKVK

Query:  CKTKVYHPNIDLEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFESNVRRAMAGGYVGQTYFTRCM
        CKTKVYHPNIDLEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFESNVRRAMAGGYVG T+FTRCM
Subjt:  CKTKVYHPNIDLEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFESNVRRAMAGGYVGQTYFTRCM

XP_008447054.1 PREDICTED: NEDD8-conjugating enzyme Ubc12-like [Cucumis melo]3.5e-10298.91Show/hide
Query:  MIKLFKVKEKQREIAANANGKPPVKKQTAGELRLQKDISELNLPKTCSISFPNGKDDLMNFEVTIHPDEGYYLGGTFLFSFQVSPVYPHEPPKVKCKTKV
        MIKLFKVKEKQREIAANANG PPVKKQTAGELRLQKDISELNLPKTCSISFPNGKDDLMNFEVTIHPDEGYYLGGTFLFSFQVSPVYPHEPPKVKCKTKV
Subjt:  MIKLFKVKEKQREIAANANGKPPVKKQTAGELRLQKDISELNLPKTCSISFPNGKDDLMNFEVTIHPDEGYYLGGTFLFSFQVSPVYPHEPPKVKCKTKV

Query:  YHPNIDLEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFESNVRRAMAGGYVGQTYFTRCM
        YHPNIDLEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFE NVRRAMAGGYVGQTYFTRCM
Subjt:  YHPNIDLEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFESNVRRAMAGGYVGQTYFTRCM

XP_031744189.1 NEDD8-conjugating enzyme Ubc12 isoform X1 [Cucumis sativus]4.6e-10297.83Show/hide
Query:  TMIKLFKVKEKQREIAANANGKPPVKKQTAGELRLQKDISELNLPKTCSISFPNGKDDLMNFEVTIHPDEGYYLGGTFLFSFQVSPVYPHEPPKVKCKTK
        TMIKLFKVKEKQREIAANANG PPVKKQ+AGELRLQKDISELNLPKTC+ISFPNGKDDLMNFEVTIHPDEGYYLGGTFLFSFQVSPVYPHEPPKVKCKTK
Subjt:  TMIKLFKVKEKQREIAANANGKPPVKKQTAGELRLQKDISELNLPKTCSISFPNGKDDLMNFEVTIHPDEGYYLGGTFLFSFQVSPVYPHEPPKVKCKTK

Query:  VYHPNIDLEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFESNVRRAMAGGYVGQTYFTRCM
        VYHPNIDLEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFE NVRRAMAGGYVGQTYFTRCM
Subjt:  VYHPNIDLEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFESNVRRAMAGGYVGQTYFTRCM

XP_038888942.1 NEDD8-conjugating enzyme Ubc12-like [Benincasa hispida]1.1e-103100Show/hide
Query:  MIKLFKVKEKQREIAANANGKPPVKKQTAGELRLQKDISELNLPKTCSISFPNGKDDLMNFEVTIHPDEGYYLGGTFLFSFQVSPVYPHEPPKVKCKTKV
        MIKLFKVKEKQREIAANANGKPPVKKQTAGELRLQKDISELNLPKTCSISFPNGKDDLMNFEVTIHPDEGYYLGGTFLFSFQVSPVYPHEPPKVKCKTKV
Subjt:  MIKLFKVKEKQREIAANANGKPPVKKQTAGELRLQKDISELNLPKTCSISFPNGKDDLMNFEVTIHPDEGYYLGGTFLFSFQVSPVYPHEPPKVKCKTKV

Query:  YHPNIDLEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFESNVRRAMAGGYVGQTYFTRCM
        YHPNIDLEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFESNVRRAMAGGYVGQTYFTRCM
Subjt:  YHPNIDLEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFESNVRRAMAGGYVGQTYFTRCM

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0K481 UBC core domain-containing protein1.1e-10197.81Show/hide
Query:  MIKLFKVKEKQREIAANANGKPPVKKQTAGELRLQKDISELNLPKTCSISFPNGKDDLMNFEVTIHPDEGYYLGGTFLFSFQVSPVYPHEPPKVKCKTKV
        MIKLFKVKEKQREIAANANG PPVKKQ+AGELRLQKDISELNLPKTC+ISFPNGKDDLMNFEVTIHPDEGYYLGGTFLFSFQVSPVYPHEPPKVKCKTKV
Subjt:  MIKLFKVKEKQREIAANANGKPPVKKQTAGELRLQKDISELNLPKTCSISFPNGKDDLMNFEVTIHPDEGYYLGGTFLFSFQVSPVYPHEPPKVKCKTKV

Query:  YHPNIDLEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFESNVRRAMAGGYVGQTYFTRCM
        YHPNIDLEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFE NVRRAMAGGYVGQTYFTRCM
Subjt:  YHPNIDLEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFESNVRRAMAGGYVGQTYFTRCM

A0A1S3BHD5 NEDD8-conjugating enzyme Ubc12-like1.7e-10298.91Show/hide
Query:  MIKLFKVKEKQREIAANANGKPPVKKQTAGELRLQKDISELNLPKTCSISFPNGKDDLMNFEVTIHPDEGYYLGGTFLFSFQVSPVYPHEPPKVKCKTKV
        MIKLFKVKEKQREIAANANG PPVKKQTAGELRLQKDISELNLPKTCSISFPNGKDDLMNFEVTIHPDEGYYLGGTFLFSFQVSPVYPHEPPKVKCKTKV
Subjt:  MIKLFKVKEKQREIAANANGKPPVKKQTAGELRLQKDISELNLPKTCSISFPNGKDDLMNFEVTIHPDEGYYLGGTFLFSFQVSPVYPHEPPKVKCKTKV

Query:  YHPNIDLEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFESNVRRAMAGGYVGQTYFTRCM
        YHPNIDLEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFE NVRRAMAGGYVGQTYFTRCM
Subjt:  YHPNIDLEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFESNVRRAMAGGYVGQTYFTRCM

A0A5D3CPZ9 NEDD8-conjugating enzyme Ubc12-like8.2e-11385.95Show/hide
Query:  NVSPTAGDSFRTLVRPVSPSQKRDRGTVSRPSCHSQ-----SHVAVSNWFLIMKYSAGTMIKLFKVKEKQREIAANANGKPPVKKQTAGELRLQKDISEL
        ++SP AGDSF      +S S+KRDR  VSRPSCHSQ       + V N     ++S GTMIKLFKVKEKQREIAANANG PPVKKQTAGELRLQKDISEL
Subjt:  NVSPTAGDSFRTLVRPVSPSQKRDRGTVSRPSCHSQ-----SHVAVSNWFLIMKYSAGTMIKLFKVKEKQREIAANANGKPPVKKQTAGELRLQKDISEL

Query:  NLPKTCSISFPNGKDDLMNFEVTIHPDEGYYLGGTFLFSFQVSPVYPHEPPKVKCKTKVYHPNIDLEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPN
        NLPKTCSISFPNGKDDLMNFEVTIHPDEGYYLGGTFLFSFQVSPVYPHEPPKVKCKTKVYHPNIDLEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPN
Subjt:  NLPKTCSISFPNGKDDLMNFEVTIHPDEGYYLGGTFLFSFQVSPVYPHEPPKVKCKTKVYHPNIDLEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPN

Query:  HEDPLNHDAAAVLRDNPKMFESNVRRAMAGGYVGQTYFTRCM
        HEDPLNHDAAAVLRDNPKMFE NVRRAMAGGYVGQTYFTRCM
Subjt:  HEDPLNHDAAAVLRDNPKMFESNVRRAMAGGYVGQTYFTRCM

A0A6J1C2V1 NEDD8-conjugating enzyme Ubc12-like3.8e-10297.81Show/hide
Query:  MIKLFKVKEKQREIAANANGKPPVKKQTAGELRLQKDISELNLPKTCSISFPNGKDDLMNFEVTIHPDEGYYLGGTFLFSFQVSPVYPHEPPKVKCKTKV
        MIKLFKVKEKQREIA NANGKPPVKKQ+AGELRLQKDISELNLPKTCSISFPNGKDDLMNFEVTIHPDEGYYLGGTFLFSFQVSPVYPHEPPKVKCKTKV
Subjt:  MIKLFKVKEKQREIAANANGKPPVKKQTAGELRLQKDISELNLPKTCSISFPNGKDDLMNFEVTIHPDEGYYLGGTFLFSFQVSPVYPHEPPKVKCKTKV

Query:  YHPNIDLEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFESNVRRAMAGGYVGQTYFTRCM
        YHPNIDLEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPK+FESNVRRAMAGGYVGQT+FTRCM
Subjt:  YHPNIDLEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFESNVRRAMAGGYVGQTYFTRCM

A0A6J1JMG9 NEDD8-conjugating enzyme Ubc12-like2.5e-10197.27Show/hide
Query:  MIKLFKVKEKQREIAANANGKPPVKKQTAGELRLQKDISELNLPKTCSISFPNGKDDLMNFEVTIHPDEGYYLGGTFLFSFQVSPVYPHEPPKVKCKTKV
        MIKLFKVKEKQREIA NA+GKPPVKKQTAGELRLQKDISELNLPKTCSISFPNGKD+LMNFEVTIHPDEGYYLGGTFLFSFQVSPVYPHEPPKVKCKTKV
Subjt:  MIKLFKVKEKQREIAANANGKPPVKKQTAGELRLQKDISELNLPKTCSISFPNGKDDLMNFEVTIHPDEGYYLGGTFLFSFQVSPVYPHEPPKVKCKTKV

Query:  YHPNIDLEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFESNVRRAMAGGYVGQTYFTRCM
        YHPNIDLEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFESNVRRAMAGGYVG T+FTRCM
Subjt:  YHPNIDLEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFESNVRRAMAGGYVGQTYFTRCM

SwissProt top hitse value%identityAlignment
A3KN22 NEDD8-conjugating enzyme Ubc122.1e-6563.39Show/hide
Query:  MIKLFKVKEKQREIAANANGKPPVKKQTAGELRLQKDISELNLPKTCSISFPNGKDDLMNFEVTIHPDEGYYLGGTFLFSFQVSPVYPHEPPKVKCKTKV
        MIKLF +K++++E  +    K   KK +A +LR+QKDI+ELNLPKTC ISF +  DDL+NF++ I PDEG+Y  G F+FSF+V   YPH+PPKVKC+T V
Subjt:  MIKLFKVKEKQREIAANANGKPPVKKQTAGELRLQKDISELNLPKTCSISFPNGKDDLMNFEVTIHPDEGYYLGGTFLFSFQVSPVYPHEPPKVKCKTKV

Query:  YHPNIDLEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFESNVRRAMAGGYVGQTYFTRCM
        YHPNIDLEGNVCLNILREDWKPVL IN+IIYGL +LF +PN EDPLN +AA VL++N ++FE NV+R+M GGY+G TYF RC+
Subjt:  YHPNIDLEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFESNVRRAMAGGYVGQTYFTRCM

Q6DCZ9 NEDD8-conjugating enzyme Ubc121.2e-6563.39Show/hide
Query:  MIKLFKVKEKQREIAANANGKPPVKKQTAGELRLQKDISELNLPKTCSISFPNGKDDLMNFEVTIHPDEGYYLGGTFLFSFQVSPVYPHEPPKVKCKTKV
        MIKLF +K++++E  +    K   KK +A +LR+QKDI+ELNLPKTC I F +  DDL+NF++ I PDEG+Y GG F+FSF+V   YPH+PPKVKC+T V
Subjt:  MIKLFKVKEKQREIAANANGKPPVKKQTAGELRLQKDISELNLPKTCSISFPNGKDDLMNFEVTIHPDEGYYLGGTFLFSFQVSPVYPHEPPKVKCKTKV

Query:  YHPNIDLEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFESNVRRAMAGGYVGQTYFTRCM
        YHPNIDLEGNVCLNILREDWKPVL IN+IIYGL +LF +PN EDPLN +AA VL++N ++FE NV+R+M GGY+G TYF RC+
Subjt:  YHPNIDLEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFESNVRRAMAGGYVGQTYFTRCM

Q6P8D9 NEDD8-conjugating enzyme Ubc121.2e-6563.39Show/hide
Query:  MIKLFKVKEKQREIAANANGKPPVKKQTAGELRLQKDISELNLPKTCSISFPNGKDDLMNFEVTIHPDEGYYLGGTFLFSFQVSPVYPHEPPKVKCKTKV
        MIKLF +K++++E  +    K   KK +A +LR+QKDI+ELNLPKTC I F +  DDL+NF++ I PDEG+Y GG F+FSF+V   YPH+PPKVKC+T V
Subjt:  MIKLFKVKEKQREIAANANGKPPVKKQTAGELRLQKDISELNLPKTCSISFPNGKDDLMNFEVTIHPDEGYYLGGTFLFSFQVSPVYPHEPPKVKCKTKV

Query:  YHPNIDLEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFESNVRRAMAGGYVGQTYFTRCM
        YHPNIDLEGNVCLNILREDWKPVL IN+IIYGL +LF +PN EDPLN +AA VL++N ++FE NV+R+M GGY+G TYF RC+
Subjt:  YHPNIDLEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFESNVRRAMAGGYVGQTYFTRCM

Q9SDY5 NEDD8-conjugating enzyme Ubc123.0e-8884.24Show/hide
Query:  MIKLFKVKEKQREIAANA-NGKPPVKKQTAGELRLQKDISELNLPKTCSISFPNGKDDLMNFEVTIHPDEGYYLGGTFLFSFQVSPVYPHEPPKVKCKTK
        MI LFKVKEKQRE A NA  G   VKKQ+AGELRL KDISELNLP +CSISFPNGKDDLMNFEV+I PD+GYY  GTF+F+FQVSPVYPHE PKVKCKTK
Subjt:  MIKLFKVKEKQREIAANA-NGKPPVKKQTAGELRLQKDISELNLPKTCSISFPNGKDDLMNFEVTIHPDEGYYLGGTFLFSFQVSPVYPHEPPKVKCKTK

Query:  VYHPNIDLEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFESNVRRAMAGGYVGQTYFTRCM
        VYHPNIDLEGNVCLNILREDWKPVLNINT+IYGLFHLFT+PN EDPLNHDAAAVLRDNPK+FE+NVRRAM GGYVGQT+F RC+
Subjt:  VYHPNIDLEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFESNVRRAMAGGYVGQTYFTRCM

Q9ZU75 Probable NEDD8-conjugating enzyme Ubc12-like3.1e-8582.16Show/hide
Query:  MIKLFKVKEKQREIAANANGK--PPVKKQTAGELRLQKDISELNLPKTCSISFPNGKDDLMNFEVTIHPDEGYYLGGTFLFSFQVSPVYPHEPPKVKCKT
        MI LFKVKEKQRE + + NG+    VKKQ+AGELRL KDISELNLPK+C ISFPNGK+DLMNFEVTI PDEGYYL G F+FSFQVS +YPHE PKVKCKT
Subjt:  MIKLFKVKEKQREIAANANGK--PPVKKQTAGELRLQKDISELNLPKTCSISFPNGKDDLMNFEVTIHPDEGYYLGGTFLFSFQVSPVYPHEPPKVKCKT

Query:  KVYHPNIDLEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFESNVRRAMAGGYVGQTYFTRCM
        KVYHPNIDLEGNVCLNILREDWKPVLNINT+IYGLFHLFT+PN+EDPLNH+AAAVLRDNPK FE NVRRAM GG VGQT F RCM
Subjt:  KVYHPNIDLEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFESNVRRAMAGGYVGQTYFTRCM

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G18600.1 Ubiquitin-conjugating enzyme family protein2.2e-8682.16Show/hide
Query:  MIKLFKVKEKQREIAANANGK--PPVKKQTAGELRLQKDISELNLPKTCSISFPNGKDDLMNFEVTIHPDEGYYLGGTFLFSFQVSPVYPHEPPKVKCKT
        MI LFKVKEKQRE + + NG+    VKKQ+AGELRL KDISELNLPK+C ISFPNGK+DLMNFEVTI PDEGYYL G F+FSFQVS +YPHE PKVKCKT
Subjt:  MIKLFKVKEKQREIAANANGK--PPVKKQTAGELRLQKDISELNLPKTCSISFPNGKDDLMNFEVTIHPDEGYYLGGTFLFSFQVSPVYPHEPPKVKCKT

Query:  KVYHPNIDLEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFESNVRRAMAGGYVGQTYFTRCM
        KVYHPNIDLEGNVCLNILREDWKPVLNINT+IYGLFHLFT+PN+EDPLNH+AAAVLRDNPK FE NVRRAM GG VGQT F RCM
Subjt:  KVYHPNIDLEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFESNVRRAMAGGYVGQTYFTRCM

AT3G08690.1 ubiquitin-conjugating enzyme 113.2e-2438.52Show/hide
Query:  RLQKDISELNLPKTCSISFPNGKDDLMNFEVTI-HPDEGYYLGGTFLFSFQVSPVYPHEPPKVKCKTKVYHPNIDLEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIY
        R+ K++ +L      + S     +D+ +++ TI  P E  Y GG FL S    P YP +PPKV  KTKVYHPNI+  G++CL+IL+E W P L I+ ++ 
Subjt:  RLQKDISELNLPKTCSISFPNGKDDLMNFEVTI-HPDEGYYLGGTFLFSFQVSPVYPHEPPKVKCKTKVYHPNIDLEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIY

Query:  GLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFESNVR
         +  L T PN +DPL  + A + + +   +ES  R
Subjt:  GLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFESNVR

AT3G08690.2 ubiquitin-conjugating enzyme 113.2e-2438.52Show/hide
Query:  RLQKDISELNLPKTCSISFPNGKDDLMNFEVTI-HPDEGYYLGGTFLFSFQVSPVYPHEPPKVKCKTKVYHPNIDLEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIY
        R+ K++ +L      + S     +D+ +++ TI  P E  Y GG FL S    P YP +PPKV  KTKVYHPNI+  G++CL+IL+E W P L I+ ++ 
Subjt:  RLQKDISELNLPKTCSISFPNGKDDLMNFEVTI-HPDEGYYLGGTFLFSFQVSPVYPHEPPKVKCKTKVYHPNIDLEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIY

Query:  GLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFESNVR
         +  L T PN +DPL  + A + + +   +ES  R
Subjt:  GLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFESNVR

AT4G36800.1 RUB1 conjugating enzyme 12.1e-8984.24Show/hide
Query:  MIKLFKVKEKQREIAANA-NGKPPVKKQTAGELRLQKDISELNLPKTCSISFPNGKDDLMNFEVTIHPDEGYYLGGTFLFSFQVSPVYPHEPPKVKCKTK
        MI LFKVKEKQRE A NA  G   VKKQ+AGELRL KDISELNLP +CSISFPNGKDDLMNFEV+I PD+GYY  GTF+F+FQVSPVYPHE PKVKCKTK
Subjt:  MIKLFKVKEKQREIAANA-NGKPPVKKQTAGELRLQKDISELNLPKTCSISFPNGKDDLMNFEVTIHPDEGYYLGGTFLFSFQVSPVYPHEPPKVKCKTK

Query:  VYHPNIDLEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFESNVRRAMAGGYVGQTYFTRCM
        VYHPNIDLEGNVCLNILREDWKPVLNINT+IYGLFHLFT+PN EDPLNHDAAAVLRDNPK+FE+NVRRAM GGYVGQT+F RC+
Subjt:  VYHPNIDLEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFESNVRRAMAGGYVGQTYFTRCM

AT4G36800.2 RUB1 conjugating enzyme 12.1e-8984.24Show/hide
Query:  MIKLFKVKEKQREIAANA-NGKPPVKKQTAGELRLQKDISELNLPKTCSISFPNGKDDLMNFEVTIHPDEGYYLGGTFLFSFQVSPVYPHEPPKVKCKTK
        MI LFKVKEKQRE A NA  G   VKKQ+AGELRL KDISELNLP +CSISFPNGKDDLMNFEV+I PD+GYY  GTF+F+FQVSPVYPHE PKVKCKTK
Subjt:  MIKLFKVKEKQREIAANA-NGKPPVKKQTAGELRLQKDISELNLPKTCSISFPNGKDDLMNFEVTIHPDEGYYLGGTFLFSFQVSPVYPHEPPKVKCKTK

Query:  VYHPNIDLEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFESNVRRAMAGGYVGQTYFTRCM
        VYHPNIDLEGNVCLNILREDWKPVLNINT+IYGLFHLFT+PN EDPLNHDAAAVLRDNPK+FE+NVRRAM GGYVGQT+F RC+
Subjt:  VYHPNIDLEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFESNVRRAMAGGYVGQTYFTRCM


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAAGCCACAAACGTGAGTCCGACAGCAGGAGATAGCTTCCGTACTCTGGTCCGTCCCGTCTCTCCTTCACAGAAACGGGACAGAGGCACAGTAAGTCGACCGAGCTG
TCACTCACAGAGCCACGTGGCAGTCTCCAATTGGTTTCTCATAATGAAGTACTCTGCAGGAACGATGATTAAGCTTTTTAAAGTGAAGGAAAAGCAGAGAGAGATTGCAG
CGAATGCCAATGGAAAACCTCCTGTCAAGAAGCAAACTGCTGGAGAATTGCGTCTTCAAAAAGATATCAGTGAATTGAACCTACCAAAAACGTGTAGTATATCGTTTCCT
AATGGCAAGGATGACTTGATGAACTTTGAGGTCACTATTCATCCTGATGAAGGATATTATCTAGGTGGTACGTTTCTCTTCTCTTTCCAAGTTTCCCCTGTCTACCCTCA
CGAGCCACCAAAAGTGAAGTGCAAGACAAAGGTGTATCATCCTAATATTGACTTGGAAGGAAATGTTTGTCTCAATATTTTAAGAGAGGACTGGAAGCCCGTTCTGAATA
TCAACACTATAATATACGGATTGTTTCATCTTTTCACGCAACCGAATCATGAAGACCCCCTCAACCATGATGCTGCTGCTGTTTTAAGAGATAACCCGAAGATGTTTGAA
TCCAACGTGAGAAGAGCCATGGCTGGGGGCTATGTGGGACAAACTTACTTCACTCGTTGCATGTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGAAGCCACAAACGTGAGTCCGACAGCAGGAGATAGCTTCCGTACTCTGGTCCGTCCCGTCTCTCCTTCACAGAAACGGGACAGAGGCACAGTAAGTCGACCGAGCTG
TCACTCACAGAGCCACGTGGCAGTCTCCAATTGGTTTCTCATAATGAAGTACTCTGCAGGAACGATGATTAAGCTTTTTAAAGTGAAGGAAAAGCAGAGAGAGATTGCAG
CGAATGCCAATGGAAAACCTCCTGTCAAGAAGCAAACTGCTGGAGAATTGCGTCTTCAAAAAGATATCAGTGAATTGAACCTACCAAAAACGTGTAGTATATCGTTTCCT
AATGGCAAGGATGACTTGATGAACTTTGAGGTCACTATTCATCCTGATGAAGGATATTATCTAGGTGGTACGTTTCTCTTCTCTTTCCAAGTTTCCCCTGTCTACCCTCA
CGAGCCACCAAAAGTGAAGTGCAAGACAAAGGTGTATCATCCTAATATTGACTTGGAAGGAAATGTTTGTCTCAATATTTTAAGAGAGGACTGGAAGCCCGTTCTGAATA
TCAACACTATAATATACGGATTGTTTCATCTTTTCACGCAACCGAATCATGAAGACCCCCTCAACCATGATGCTGCTGCTGTTTTAAGAGATAACCCGAAGATGTTTGAA
TCCAACGTGAGAAGAGCCATGGCTGGGGGCTATGTGGGACAAACTTACTTCACTCGTTGCATGTAGATTCTACATGAATTGTAAAGCACCAGATACATTATTTGAAGCAT
GGGCTCCGCAAGGTCATTGAACTTCTCTGGTAAGGTAATGTCTAATGTGTTGAGGACTGTCTGATCACCGGCGCAACACGAATTCCTTTGTGATGGAGGTAGAACTTTGT
TGTGTTTGAAGTACTGGTTTCAAACGGAAGTTGGACTGGAAACTGAAACTCTTATCTGTGTATGTATTTCCTCTAATTTATCTTGAAAAGACAGGTTGCTCTTTTGCTAT
CAGTTGAAACTATAAGGTATGTTTTTGGAGCCTCCCTTCTTTTCTTTATCAGAGTCTACTACCTGCTATGGATGTAAATTTACTGAATTGTTGAATCACAATGATTTATT
TCCTTATATATTTCGAGTTTGTAAAAATCTCTGTTAGCTTCACATTTTGTCATCATCACAAGATTGGAAAGCTTTTATCATTTTCAACTTTACATGCCTTGGACACTTTA
TCTCAATGTCCATTCTGATTGTGTTGCTTCAATGATTGTGTAATTGAAAAGCCTTTTGGGCTAAGTGACAAGAATCTCAAGAAGCAATTTTGTTAAGTGGTAGGTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MEATNVSPTAGDSFRTLVRPVSPSQKRDRGTVSRPSCHSQSHVAVSNWFLIMKYSAGTMIKLFKVKEKQREIAANANGKPPVKKQTAGELRLQKDISELNLPKTCSISFP
NGKDDLMNFEVTIHPDEGYYLGGTFLFSFQVSPVYPHEPPKVKCKTKVYHPNIDLEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFE
SNVRRAMAGGYVGQTYFTRCM