; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

ClCG02G011390 (gene) of Watermelon (Charleston Gray) v2.5 genome

Gene IDClCG02G011390
OrganismCitrullus lanatus subsp. vulgaris cv. Charleston Gray (Watermelon (Charleston Gray) v2.5)
DescriptionBasic helix-loop-helix transcription factor
Genome locationCG_Chr02:23899468..23902878
RNA-Seq ExpressionClCG02G011390
SyntenyClCG02G011390
Gene Ontology termsGO:0006355 - regulation of transcription, DNA-templated (biological process)
GO:0055072 - iron ion homeostasis (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0003700 - DNA-binding transcription factor activity (molecular function)
GO:0046983 - protein dimerization activity (molecular function)
InterPro domainsIPR011598 - Myc-type, basic helix-loop-helix (bHLH) domain
IPR036638 - Helix-loop-helix DNA-binding domain superfamily
IPR044579 - Transcription factor bHLH11/121


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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XP_008457649.1 PREDICTED: transcription factor bHLH121 isoform X2 [Cucumis melo]1.5e-11085.28Show/hide
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XP_038902535.1 transcription factor bHLH121 [Benincasa hispida]1.7e-13873.68Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LPK4 BHLH domain-containing protein2.1e-14273.35Show/hide
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A0A1S3C6M9 transcription factor bHLH121 isoform X11.7e-14474.23Show/hide
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A0A1S3C798 transcription factor bHLH121 isoform X27.3e-11185.28Show/hide
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A0A6J1CXG2 transcription factor bHLH121-like isoform X22.0e-10063.24Show/hide
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A0A6J1CXY9 transcription factor bHLH121-like isoform X16.0e-11364.42Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q10KL8 Protein IRON-RELATED TRANSCRIPTION FACTOR 35.4e-1841.3Show/hide
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Q69V10 Transcription factor BHLH0628.6e-1636.03Show/hide
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        D  A +++ K++REKL+R + N+ F ELGN+L+PDR  N KA +L +T ++LKDL SQV  L+ E+++L  ESH +A E+++L ++  +L ++I  L  +
Subjt:  DSAAARKVQKADREKLRRGRLNEQFVELGNILDPDRPKNDKATILMDTIQLLKDLTSQVNKLKTEHATLIEESHELAQEKSDLREEKPLLTSDIENLNAQ

Query:  YQQKLRATYPWA-VMDHSVVMAPAPFPFPVPMQMPP
         + ++     W+ V     +  P P     P+Q  P
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Q8W2F2 Transcription factor bHLH111.2e-2539.34Show/hide
Query:  QKADREKLRRGRLNEQFVELGNILDPDRPKNDKATILMDTIQLLKDLTSQVNKLKTEHATLIEESHELAQEKSDLREEKPLLTSDIENLNAQYQQKLRAT
        QKA+REKLRR +L EQF+ELGN LDP+RPK+DKA++L DTIQ+LKD+ +QV++LK E+ TL +ES EL QEKS+LREEK  L SDIE LNAQYQ +++  
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         PW                 VP      PF                   I    S+F+PY    N LTEQQ+         S + +D   +Q+S+ K   
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             +     + +   ++V   LELK   SS + QD S     GK +K +  +  SSS+  S S ++ D+S
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Q9FH37 Transcription factor ILR34.0e-1336.16Show/hide
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        KA REK RR RLN++F+ELG IL+P + PK DKA IL+D ++++  L  +  KLK  +++L ++  EL  EK++LR+EK  L ++ E L    +Q+L+A 
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                  + AP P  FP P  MP   F       P    GN    +I+ P      ++PP S+   Q     PP
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Q9LT23 Transcription factor bHLH1213.7e-7559.17Show/hide
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        +ARK QKA REKLRR +LNE FVELGN+LDP+RPKNDKATIL DT+QLLK+LTS+VNKLK+E+  L +ES EL QEK+DLREEK  L SDIENLN QYQQ
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G19860.1 basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein2.6e-7659.17Show/hide
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AT3G19860.2 basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein2.6e-7659.17Show/hide
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AT4G36060.1 basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein8.5e-2739.34Show/hide
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AT4G36060.2 basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein8.5e-2739.34Show/hide
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Query:  YPWAVMDHSVVMAPAPFPFPVPMQMPPGPFPLHPSLQPYTFFGNPDPRVIANPCSTFVPY-IPPNSLTEQQSPQNAPPFIQSGNRSDNFSEQNSRSK---
         PW                 VP      PF                   I    S+F+PY    N LTEQQ+         S + +D   +Q+S+ K   
Subjt:  YPWAVMDHSVVMAPAPFPFPVPMQMPPGPFPLHPSLQPYTFFGNPDPRVIANPCSTFVPY-IPPNSLTEQQSPQNAPPFIQSGNRSDNFSEQNSRSK---

Query:  ----FSVESKIEKSVDSNEVATYLELKTPGSS-SDQDSSFECSNGKNRKENNLSEESSSSRCSSSCSLGDNS
             +     + +   ++V   LELK   SS + QD S     GK +K +  +  SSS+  S S ++ D+S
Subjt:  ----FSVESKIEKSVDSNEVATYLELKTPGSS-SDQDSSFECSNGKNRKENNLSEESSSSRCSSSCSLGDNS

AT5G54680.1 basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein2.8e-1436.16Show/hide
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        KA REK RR RLN++F+ELG IL+P + PK DKA IL+D ++++  L  +  KLK  +++L ++  EL  EK++LR+EK  L ++ E L    +Q+L+A 
Subjt:  KADREKLRRGRLNEQFVELGNILDP-DRPKNDKATILMDTIQLLKDLTSQVNKLKTEHATLIEESHELAQEKSDLREEKPLLTSDIENLNAQYQQKLRAT

Query:  YPWAVMDHSVVMAPAPFPFPVPMQMPPGPFPLHPSLQPYTFFGNPDPRVIANPCSTFVPYIPPNSLTEQQSPQNAPP
                  + AP P  FP P  MP   F       P    GN    +I+ P      ++PP S+   Q     PP
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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TCGGTTGTCATGGCCCCTGCCCCCTTTCCATTTCCAGTGCCAATGCAAATGCCTCCAGGGCCATTTCCCTTGCATCCATCCTTGCAACCTTATACATTCTTTGGAAATCC
GGATCCCAGGGTAATTGCAAACCCTTGTTCCACCTTCGTCCCATACATACCTCCAAATTCCTTGACCGAGCAACAGTCCCCCCAAAATGCACCACCTTTCATTCAGTCAG
GCAATCGGTCTGATAACTTCAGTGAGCAAAATTCCAGGAGCAAGTTCTCAGTTGAAAGCAAGATTGAGAAAAGTGTAGATTCCAATGAAGTTGCAACTTACCTGGAGTTG
AAAACTCCTGGATCTTCCTCAGATCAGGATTCATCGTTTGAATGTTCAAACGGTAAGAACAGAAAGGAAAATAATCTATCAGAAGAGAGTTCGTCAAGTAGATGTTCTTC
ATCTTGTAGTTTAGGGGATAATTCGTCTAGTAGCACGCCAAATGGACGAAAATCTACTGATATATGTGGAAACCCATAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGATCAACTAATTCAACGCGACGATCTTGTTCAGAATCCGGCCACACCCTCCACCTCCATTGTACCATGCATTGAACTTCCAGGCCACCCAATTCGTTCTCAATCCAA
CTCCAAGTCTGTACAAGTATCCGCCATTTCAATCTGGTTTTGTTTTCCGGTGTTATTAATTCCTTGTTTAAGAACGATTTTGTTTCTCTGTGAAACTATGGCAATGGCTT
TTATTCCGAAAATTTGGACTTTAGAGGAAAACTTACTGGCTTCGTATGGATTATATGTTTTCCGCTGCCAAAGGTTTGATGGGGAATTCAAGGATTCTGCAGCTGCTAGA
AAAGTTCAGAAGGCTGACAGAGAGAAATTAAGAAGGGGTCGTTTGAACGAACAATTTGTCGAGCTGGGAAATATTTTAGATCCCGATAGGCCCAAAAATGACAAAGCAAC
GATTTTAATGGATACAATTCAATTGCTGAAGGATCTGACATCTCAAGTGAACAAATTGAAAACTGAACATGCTACTTTGATAGAAGAATCACACGAGCTAGCCCAGGAAA
AGAGTGATCTGAGAGAAGAGAAGCCGTTGCTTACATCTGATATTGAGAATCTTAATGCTCAGTATCAGCAGAAACTCAGGGCTACATACCCTTGGGCTGTCATGGATCAC
TCGGTTGTCATGGCCCCTGCCCCCTTTCCATTTCCAGTGCCAATGCAAATGCCTCCAGGGCCATTTCCCTTGCATCCATCCTTGCAACCTTATACATTCTTTGGAAATCC
GGATCCCAGGGTAATTGCAAACCCTTGTTCCACCTTCGTCCCATACATACCTCCAAATTCCTTGACCGAGCAACAGTCCCCCCAAAATGCACCACCTTTCATTCAGTCAG
GCAATCGGTCTGATAACTTCAGTGAGCAAAATTCCAGGAGCAAGTTCTCAGTTGAAAGCAAGATTGAGAAAAGTGTAGATTCCAATGAAGTTGCAACTTACCTGGAGTTG
AAAACTCCTGGATCTTCCTCAGATCAGGATTCATCGTTTGAATGTTCAAACGGTAAGAACAGAAAGGAAAATAATCTATCAGAAGAGAGTTCGTCAAGTAGATGTTCTTC
ATCTTGTAGTTTAGGGGATAATTCGTCTAGTAGCACGCCAAATGGACGAAAATCTACTGATATATGTGGAAACCCATAAAAGTTGCAGATTCACCTAAATTGGTCCCTGA
ATTTTATTTTTGATGGTCTATAACTTTCTCAAGAACTTCTTAGTGCTTATCTAGTTGTCTGCAACTGAGGTGGATCATCTTCAATGCAACGTAAAGGGCCGTCACAAAAT
TAATGGTATTTTGAGATTGTGAACTAGTATTTTTACCTTACCTCCTTTGTGAAGCCTTTAAAGTTGCGGCAACTATTTAATCCATCTCCATCTTATCTACCTGGACATGG
CTGTGCAAGTGCAATGCAAGCAATAAGGTTTTGGGCCTAGGGTTTGTTTTGCTGCAAAAATCCCACACTGAGAAATTAGCTAAAGCATTCTACAGATGGTTGGTCCATTC
CTTTAAATACTTTTCGTTTCCTTATGCTAAATCTCCAGGTTATGTCATTGTTGATGTCTGACAGACAATGTGACAGATATTTTCGTTTAAAAAATCATGTGGAAATGACT
CTGAGAGCATGTAGATGTGAAGTATAGATACATGATATTTTGAGAAATTATGTTGAAATTTTGAATCAAGAGACGCTACTTGTCGGTCTCATGCCTGATCGAAATGGGAG
CAATCGCATCATCATTGGCAGTAAGACCAAGAAGGTGAAATGATTATGAGGAACGAACGCAAGGTCTTGAATGCTGAAAGAGATGGTGGGGGAGAGGCCATTAATGCTGA
TATTATCCAGAAAAAGGTCTTGAATGAAAGGTGGAAAAGCATCCATATTATGAGTGCCCCAAAAACAGATTGCTTTCCTTGCTGCTTGGGAAAATCTAGATATGTTTAAA
CTTGTTCACATGACATTGGTGAAGTAGAAAAGTGTCTTGAGCCCTCTACTTGATGGTCTTCAAAGGTTGTGCCAGTTACGATTGAACTAAATTTACTTTGACTTCTTAGT
CTAATTCAGTTGGAGCAATCCACTT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MDQLIQRDDLVQNPATPSTSIVPCIELPGHPIRSQSNSKSVQVSAISIWFCFPVLLIPCLRTILFLCETMAMAFIPKIWTLEENLLASYGLYVFRCQRFDGEFKDSAAAR
KVQKADREKLRRGRLNEQFVELGNILDPDRPKNDKATILMDTIQLLKDLTSQVNKLKTEHATLIEESHELAQEKSDLREEKPLLTSDIENLNAQYQQKLRATYPWAVMDH
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KTPGSSSDQDSSFECSNGKNRKENNLSEESSSSRCSSSCSLGDNSSSSTPNGRKSTDICGNP