; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

ClCG02G012010 (gene) of Watermelon (Charleston Gray) v2.5 genome

Gene IDClCG02G012010
OrganismCitrullus lanatus subsp. vulgaris cv. Charleston Gray (Watermelon (Charleston Gray) v2.5)
DescriptionDUF1279 domain-containing protein
Genome locationCG_Chr02:25245661..25246101
RNA-Seq ExpressionClCG02G012010
SyntenyClCG02G012010
Gene Ontology termsGO:0005739 - mitochondrion (cellular component)
InterPro domainsIPR009688 - Protein FAM210A/B-like domain


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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XP_038902628.1 uncharacterized protein LOC120089278 [Benincasa hispida]3.8e-6797.26Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LJH5 DUF1279 domain-containing protein8.0e-6392.47Show/hide
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A0A1S3C646 uncharacterized protein LOC1034973424.7e-6391.78Show/hide
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A0A5A7TV59 DUF1279 domain-containing protein4.7e-6391.78Show/hide
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A0A6J1G6W3 uncharacterized protein LOC1114513202.3e-6290.2Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G20940.1 Protein of unknown function (DUF1279)1.7e-3357.25Show/hide
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        ALAVLCNKAL PIR+PIT+ALTPPIAR L +R I+++G
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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GCCGTGCTTTGCAACAAGGCGTTGCTGCCTATTCGGATTCCAATAACGATTGCGCTAACGCCGCCGATTGCGAGGCTGCTGGCGAGGCGAGGGATTATGAGAAGTGGTTA
A
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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A
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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AVLCNKALLPIRIPITIALTPPIARLLARRGIMRSG