; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

ClCG02G024110 (gene) of Watermelon (Charleston Gray) v2.5 genome

Gene IDClCG02G024110
OrganismCitrullus lanatus subsp. vulgaris cv. Charleston Gray (Watermelon (Charleston Gray) v2.5)
DescriptionRibosomal protein L11
Genome locationCG_Chr02:38435296..38435763
RNA-Seq ExpressionClCG02G024110
SyntenyClCG02G024110
Gene Ontology termsGO:0006412 - translation (biological process)
GO:0015934 - large ribosomal subunit (cellular component)
GO:0003735 - structural constituent of ribosome (molecular function)
GO:0070180 - large ribosomal subunit rRNA binding (molecular function)
InterPro domainsIPR000911 - Ribosomal protein L11/L12
IPR006519 - Ribosomal protein L11, bacterial-type
IPR020783 - Ribosomal protein L11, C-terminal
IPR020784 - Ribosomal protein L11, N-terminal
IPR036769 - Ribosomal protein L11, C-terminal domain superfamily
IPR036796 - Ribosomal protein L11/L12, N-terminal domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7034038.1 mrpl19, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]2.3e-7896.77Show/hide
Query:  MATLKEILTRRPVAATIRLTVPAGGARPAPPVGPALGQYRLNLMAFCKDFNARTQKYKADTPMAVTITAFKDNTFEFTVKSPSVTWYLKKAAGIESGSSR
        MATLKEILTRRPVAATIRLTVPAGGARPAPPVGPALGQYRLNLMAFCKDFNARTQKYK DTPMAVTITAFKDNTFEFTVKSPSVTWYLKKAAGIESGSSR
Subjt:  MATLKEILTRRPVAATIRLTVPAGGARPAPPVGPALGQYRLNLMAFCKDFNARTQKYKADTPMAVTITAFKDNTFEFTVKSPSVTWYLKKAAGIESGSSR

Query:  PGHVVATTLSVKHIYEIAKVKQSDPYCQYMPLESICKSIIGTANSMGIKVVKELE
        PGHVVA+TL+VKHIY+IAKVKQSDPYCQYMPLESICKSIIGTANSMGIKVVKEL+
Subjt:  PGHVVATTLSVKHIYEIAKVKQSDPYCQYMPLESICKSIIGTANSMGIKVVKELE

XP_008449842.1 PREDICTED: 54S ribosomal protein L19, mitochondrial [Cucumis melo]3.9e-7896.77Show/hide
Query:  MATLKEILTRRPVAATIRLTVPAGGARPAPPVGPALGQYRLNLMAFCKDFNARTQKYKADTPMAVTITAFKDNTFEFTVKSPSVTWYLKKAAGIESGSSR
        MATLKEILTRRPV+ATIRLTVPAGGARPAPPVGPALGQYRLNLMAFCKDFNARTQKYK DTPMAVTITAFKDNTFEFTVKSPSVTWYLKKAAGIESGSSR
Subjt:  MATLKEILTRRPVAATIRLTVPAGGARPAPPVGPALGQYRLNLMAFCKDFNARTQKYKADTPMAVTITAFKDNTFEFTVKSPSVTWYLKKAAGIESGSSR

Query:  PGHVVATTLSVKHIYEIAKVKQSDPYCQYMPLESICKSIIGTANSMGIKVVKELE
        PGHVVA+TLSVKHIYEIAKVKQSDPYCQYMPLESICKSIIGTANSMGIKV+ ELE
Subjt:  PGHVVATTLSVKHIYEIAKVKQSDPYCQYMPLESICKSIIGTANSMGIKVVKELE

XP_022132985.1 54S ribosomal protein L19, mitochondrial [Momordica charantia]5.1e-7896.13Show/hide
Query:  MATLKEILTRRPVAATIRLTVPAGGARPAPPVGPALGQYRLNLMAFCKDFNARTQKYKADTPMAVTITAFKDNTFEFTVKSPSVTWYLKKAAGIESGSSR
        MATLKEILTRRPV+ATIRLTVPAGGARPAPPVGPALGQYRLNLMAFCKDFNARTQKYK DTPMAVTITAFKDNTFEFTVKSPSVTWYLKKAAGI+SGSSR
Subjt:  MATLKEILTRRPVAATIRLTVPAGGARPAPPVGPALGQYRLNLMAFCKDFNARTQKYKADTPMAVTITAFKDNTFEFTVKSPSVTWYLKKAAGIESGSSR

Query:  PGHVVATTLSVKHIYEIAKVKQSDPYCQYMPLESICKSIIGTANSMGIKVVKELE
        PGHVVA+TLS+KHIYEIAKVKQSDPYCQYMPLESICKSIIGTANSMGIKVVKEL+
Subjt:  PGHVVATTLSVKHIYEIAKVKQSDPYCQYMPLESICKSIIGTANSMGIKVVKELE

XP_023003939.1 54S ribosomal protein L19, mitochondrial-like [Cucurbita maxima]3.0e-7896.77Show/hide
Query:  MATLKEILTRRPVAATIRLTVPAGGARPAPPVGPALGQYRLNLMAFCKDFNARTQKYKADTPMAVTITAFKDNTFEFTVKSPSVTWYLKKAAGIESGSSR
        MATLKEILTRRPVAATIRLTVPAGGARPAPPVGPALGQYRLNLMAFCKDFNARTQKYKADTPMAVTITAFKDNTFEFTVKSPSVTWYLKK+AGIESGSSR
Subjt:  MATLKEILTRRPVAATIRLTVPAGGARPAPPVGPALGQYRLNLMAFCKDFNARTQKYKADTPMAVTITAFKDNTFEFTVKSPSVTWYLKKAAGIESGSSR

Query:  PGHVVATTLSVKHIYEIAKVKQSDPYCQYMPLESICKSIIGTANSMGIKVVKELE
        PGHVVA+TLS+KHIYEIAKVKQSDPYCQYMPLESICKSIIGTANS GIKVVKEL+
Subjt:  PGHVVATTLSVKHIYEIAKVKQSDPYCQYMPLESICKSIIGTANSMGIKVVKELE

XP_038901904.1 54S ribosomal protein L19, mitochondrial [Benincasa hispida]2.1e-7998.71Show/hide
Query:  MATLKEILTRRPVAATIRLTVPAGGARPAPPVGPALGQYRLNLMAFCKDFNARTQKYKADTPMAVTITAFKDNTFEFTVKSPSVTWYLKKAAGIESGSSR
        MATLKEILTRRPVAATIRLTVPAGGARPAPPVGPALGQYRLNLMAFCKDFNARTQKYK DTPMAVTITAFKDNTFEFTVKSPSVTWYLKKAAGIESGSSR
Subjt:  MATLKEILTRRPVAATIRLTVPAGGARPAPPVGPALGQYRLNLMAFCKDFNARTQKYKADTPMAVTITAFKDNTFEFTVKSPSVTWYLKKAAGIESGSSR

Query:  PGHVVATTLSVKHIYEIAKVKQSDPYCQYMPLESICKSIIGTANSMGIKVVKELE
        PGHVVA+TLSVKHIYEIAKVKQSDPYCQYMPLESICKSIIGTANSMGIKVVKELE
Subjt:  PGHVVATTLSVKHIYEIAKVKQSDPYCQYMPLESICKSIIGTANSMGIKVVKELE

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KWT6 Uncharacterized protein2.5e-7896.77Show/hide
Query:  MATLKEILTRRPVAATIRLTVPAGGARPAPPVGPALGQYRLNLMAFCKDFNARTQKYKADTPMAVTITAFKDNTFEFTVKSPSVTWYLKKAAGIESGSSR
        MATLKEILTRRPVAATIRLTVPAGGARPAPPVGPALGQYRLNLMAFCKDFNARTQKYK +TPMAVTITAFKDNTFEFTVKSPSVTWYLKKAAGIESGSSR
Subjt:  MATLKEILTRRPVAATIRLTVPAGGARPAPPVGPALGQYRLNLMAFCKDFNARTQKYKADTPMAVTITAFKDNTFEFTVKSPSVTWYLKKAAGIESGSSR

Query:  PGHVVATTLSVKHIYEIAKVKQSDPYCQYMPLESICKSIIGTANSMGIKVVKELE
        PGHVVA+TLSVKHIYEIAKVKQSDPYCQYMPLESICKSIIGTANSMGIKV+ ELE
Subjt:  PGHVVATTLSVKHIYEIAKVKQSDPYCQYMPLESICKSIIGTANSMGIKVVKELE

A0A1S3BMZ5 54S ribosomal protein L19, mitochondrial1.9e-7896.77Show/hide
Query:  MATLKEILTRRPVAATIRLTVPAGGARPAPPVGPALGQYRLNLMAFCKDFNARTQKYKADTPMAVTITAFKDNTFEFTVKSPSVTWYLKKAAGIESGSSR
        MATLKEILTRRPV+ATIRLTVPAGGARPAPPVGPALGQYRLNLMAFCKDFNARTQKYK DTPMAVTITAFKDNTFEFTVKSPSVTWYLKKAAGIESGSSR
Subjt:  MATLKEILTRRPVAATIRLTVPAGGARPAPPVGPALGQYRLNLMAFCKDFNARTQKYKADTPMAVTITAFKDNTFEFTVKSPSVTWYLKKAAGIESGSSR

Query:  PGHVVATTLSVKHIYEIAKVKQSDPYCQYMPLESICKSIIGTANSMGIKVVKELE
        PGHVVA+TLSVKHIYEIAKVKQSDPYCQYMPLESICKSIIGTANSMGIKV+ ELE
Subjt:  PGHVVATTLSVKHIYEIAKVKQSDPYCQYMPLESICKSIIGTANSMGIKVVKELE

A0A5A7T9U7 54S ribosomal protein L191.9e-7896.77Show/hide
Query:  MATLKEILTRRPVAATIRLTVPAGGARPAPPVGPALGQYRLNLMAFCKDFNARTQKYKADTPMAVTITAFKDNTFEFTVKSPSVTWYLKKAAGIESGSSR
        MATLKEILTRRPV+ATIRLTVPAGGARPAPPVGPALGQYRLNLMAFCKDFNARTQKYK DTPMAVTITAFKDNTFEFTVKSPSVTWYLKKAAGIESGSSR
Subjt:  MATLKEILTRRPVAATIRLTVPAGGARPAPPVGPALGQYRLNLMAFCKDFNARTQKYKADTPMAVTITAFKDNTFEFTVKSPSVTWYLKKAAGIESGSSR

Query:  PGHVVATTLSVKHIYEIAKVKQSDPYCQYMPLESICKSIIGTANSMGIKVVKELE
        PGHVVA+TLSVKHIYEIAKVKQSDPYCQYMPLESICKSIIGTANSMGIKV+ ELE
Subjt:  PGHVVATTLSVKHIYEIAKVKQSDPYCQYMPLESICKSIIGTANSMGIKVVKELE

A0A6J1BU21 54S ribosomal protein L19, mitochondrial2.5e-7896.13Show/hide
Query:  MATLKEILTRRPVAATIRLTVPAGGARPAPPVGPALGQYRLNLMAFCKDFNARTQKYKADTPMAVTITAFKDNTFEFTVKSPSVTWYLKKAAGIESGSSR
        MATLKEILTRRPV+ATIRLTVPAGGARPAPPVGPALGQYRLNLMAFCKDFNARTQKYK DTPMAVTITAFKDNTFEFTVKSPSVTWYLKKAAGI+SGSSR
Subjt:  MATLKEILTRRPVAATIRLTVPAGGARPAPPVGPALGQYRLNLMAFCKDFNARTQKYKADTPMAVTITAFKDNTFEFTVKSPSVTWYLKKAAGIESGSSR

Query:  PGHVVATTLSVKHIYEIAKVKQSDPYCQYMPLESICKSIIGTANSMGIKVVKELE
        PGHVVA+TLS+KHIYEIAKVKQSDPYCQYMPLESICKSIIGTANSMGIKVVKEL+
Subjt:  PGHVVATTLSVKHIYEIAKVKQSDPYCQYMPLESICKSIIGTANSMGIKVVKELE

A0A6J1KUS1 54S ribosomal protein L19, mitochondrial-like1.4e-7896.77Show/hide
Query:  MATLKEILTRRPVAATIRLTVPAGGARPAPPVGPALGQYRLNLMAFCKDFNARTQKYKADTPMAVTITAFKDNTFEFTVKSPSVTWYLKKAAGIESGSSR
        MATLKEILTRRPVAATIRLTVPAGGARPAPPVGPALGQYRLNLMAFCKDFNARTQKYKADTPMAVTITAFKDNTFEFTVKSPSVTWYLKK+AGIESGSSR
Subjt:  MATLKEILTRRPVAATIRLTVPAGGARPAPPVGPALGQYRLNLMAFCKDFNARTQKYKADTPMAVTITAFKDNTFEFTVKSPSVTWYLKKAAGIESGSSR

Query:  PGHVVATTLSVKHIYEIAKVKQSDPYCQYMPLESICKSIIGTANSMGIKVVKELE
        PGHVVA+TLS+KHIYEIAKVKQSDPYCQYMPLESICKSIIGTANS GIKVVKEL+
Subjt:  PGHVVATTLSVKHIYEIAKVKQSDPYCQYMPLESICKSIIGTANSMGIKVVKELE

SwissProt top hitse value%identityAlignment
A7HWQ0 50S ribosomal protein L115.9e-2947.18Show/hide
Query:  RPVAATIRLTVPAGGARPAPPVGPALGQYRLNLMAFCKDFNARTQKYKADTPMAVTITAFKDNTFEFTVKSPSVTWYLKKAAGIESGSSRPGHVVATTLS
        + +   I+L VPAG A P+PP+GPALGQ  LN+M FCK FNA TQK +   P+ V ITAF D +F F +K+P  +++LKKAA + SGS  PG   A T++
Subjt:  RPVAATIRLTVPAGGARPAPPVGPALGQYRLNLMAFCKDFNARTQKYKADTPMAVTITAFKDNTFEFTVKSPSVTWYLKKAAGIESGSSRPGHVVATTLS

Query:  VKHIYEIAKVKQSDPYCQYMPLESICKSIIGTANSMGIKVVK
        V    EIA+ K +D       L+   K I G+A SMG++VV+
Subjt:  VKHIYEIAKVKQSDPYCQYMPLESICKSIIGTANSMGIKVVK

B9KBJ9 50S ribosomal protein L111.3e-2851.06Show/hide
Query:  RPVAATIRLTVPAGGARPAPPVGPALGQYRLNLMAFCKDFNARTQKYKADTPMAVTITAFKDNTFEFTVKSPSVTWYLKKAAGIESGSSRPGHVVATTLS
        + VAA I+L +PAG A PAPPVGPALGQ+ +N+M FCK FNA T   KA   + V IT ++D +F F +K+P  ++ LKKAAGIESGSS P   +   ++
Subjt:  RPVAATIRLTVPAGGARPAPPVGPALGQYRLNLMAFCKDFNARTQKYKADTPMAVTITAFKDNTFEFTVKSPSVTWYLKKAAGIESGSSRPGHVVATTLS

Query:  VKHIYEIAKVKQSDPYCQYMPLESICKSIIGTANSMGIKVV
         K I EIAK+K  D       LE+  + I GTA SMGI+VV
Subjt:  VKHIYEIAKVKQSDPYCQYMPLESICKSIIGTANSMGIKVV

Q07KJ7 50S ribosomal protein L115.9e-2946.43Show/hide
Query:  RPVAATIRLTVPAGGARPAPPVGPALGQYRLNLMAFCKDFNARTQKYKADTPMAVTITAFKDNTFEFTVKSPSVTWYLKKAAGIESGSSRPGHVVATTLS
        + V   ++L VPAG A P+PP+GPALGQ  LN+M FCK+FNA+TQK + +TP+ V IT + D +F F +K+P ++++LK+AA I+SGS  PG  VA  +S
Subjt:  RPVAATIRLTVPAGGARPAPPVGPALGQYRLNLMAFCKDFNARTQKYKADTPMAVTITAFKDNTFEFTVKSPSVTWYLKKAAGIESGSSRPGHVVATTLS

Query:  VKHIYEIAKVKQSDPYCQYMPLESICKSIIGTANSMGIKV
           + EIA+ K  D  C    +ES  + + G+A SMG++V
Subjt:  VKHIYEIAKVKQSDPYCQYMPLESICKSIIGTANSMGIKV

Q9UTK2 54S ribosomal protein L19, mitochondrial2.3e-3351.85Show/hide
Query:  IRLTVPAGGARPAPPVGPALGQYRLNLMAFCKDFNARTQKYKADTPMAVTITAFKDNTFEFTVKSPSVTWYLKKAAGIESGSSRPGHVVATTLSVKHIYE
        I+L VPAG A P PP+GPALG   L  + FCK+FNART  +  +TP+   IT     TF FT+ +P  +W + K   +E GSS P H +   LS+KHIYE
Subjt:  IRLTVPAGGARPAPPVGPALGQYRLNLMAFCKDFNARTQKYKADTPMAVTITAFKDNTFEFTVKSPSVTWYLKKAAGIESGSSRPGHVVATTLSVKHIYE

Query:  IAKVKQSDPYCQYMPLESICKSIIGTANSMGIKVV
        IAK+K +DP  Q + L S+CKS+IGTA SMG+KVV
Subjt:  IAKVKQSDPYCQYMPLESICKSIIGTANSMGIKVV

Q9Y3B7 39S ribosomal protein L11, mitochondrial7.8e-2944.97Show/hide
Query:  LTRRPVAATIRLTVPAGGARPAPPVGPALGQYRLNLMAFCKDFNARTQKYKADTPMAVTITAFKDNTFEFTVKSPSVTWYLKKAAGIESGSSRPGHVVAT
        L +  V   IR  V AG A P PP+GP LGQ  +++  FCK+FN RT+  K   P+   I    D TFE  +  P+V+++LK AAGIE G+ + G  VA 
Subjt:  LTRRPVAATIRLTVPAGGARPAPPVGPALGQYRLNLMAFCKDFNARTQKYKADTPMAVTITAFKDNTFEFTVKSPSVTWYLKKAAGIESGSSRPGHVVAT

Query:  TLSVKHIYEIAKVKQSDP--YCQYMPLESICKSIIGTANSMGIKVVKEL
         +++KH+YEIA++K  D     Q +PL S+ +SIIG+A S+GI+VVK+L
Subjt:  TLSVKHIYEIAKVKQSDP--YCQYMPLESICKSIIGTANSMGIKVVKEL

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G32990.1 plastid ribosomal protein l118.5e-2343.57Show/hide
Query:  RPVAATIRLTVPAGGARPAPPVGPALGQYRLNLMAFCKDFNARTQKYKADTPMAVTITAFKDNTFEFTVKSPSVTWYLKKAAGIESGSSRPGHVVATTLS
        + V   I+L + AG A PAPPVGPALG   +N+MAFCKD+NART   KA   + V IT F D +F F +K+P  +  L KAAG+E GS  P       ++
Subjt:  RPVAATIRLTVPAGGARPAPPVGPALGQYRLNLMAFCKDFNARTQKYKADTPMAVTITAFKDNTFEFTVKSPSVTWYLKKAAGIESGSSRPGHVVATTLS

Query:  VKHIYEIAKVKQSDPYCQYMPLESICKSIIGTANSMGIKV
        +  +  IA  K  D  C    +ES  + I GTA +MGI +
Subjt:  VKHIYEIAKVKQSDPYCQYMPLESICKSIIGTANSMGIKV

AT4G35490.1 mitochondrial ribosomal protein L118.1e-7485.71Show/hide
Query:  ATLKEILTRRPVAATIRLTVPAGGARPAPPVGPALGQYRLNLMAFCKDFNARTQKYKADTPMAVTITAFKDNTFEFTVKSPSVTWYLKKAAGIESGSSRP
        A  KEIL RRPVAATIRLTVPAGGARPAPPVGPALGQYRLNLMAFCKDFNARTQKYK DTPMAVTITAFKDN+FEFTVKSP+V+WY+KKAAG++ GS+RP
Subjt:  ATLKEILTRRPVAATIRLTVPAGGARPAPPVGPALGQYRLNLMAFCKDFNARTQKYKADTPMAVTITAFKDNTFEFTVKSPSVTWYLKKAAGIESGSSRP

Query:  GHVVATTLSVKHIYEIAKVKQSDPYCQYMPLESICKSIIGTANSMGIKVVKELE
        GH+  TTLSV+H+YEIAKVKQ+DP+CQYMPLESICKSIIGTANSMGIK+V++LE
Subjt:  GHVVATTLSVKHIYEIAKVKQSDPYCQYMPLESICKSIIGTANSMGIKVVKELE

AT5G51610.1 Ribosomal protein L11 family protein6.6e-0732.91Show/hide
Query:  DNTFEFTVKSPSVTWYLKKAAGIESGSSRPGHVVATTLSVKHIYEIAKVKQSDPYCQYMPLESICKSIIGTANSMGIKV
        D +F F +K+P  ++ L KAAG++ GS  P  +    +++  + +IA+VK  +  C    + S  ++I GTA +MGI +
Subjt:  DNTFEFTVKSPSVTWYLKKAAGIESGSSRPGHVVATTLSVKHIYEIAKVKQSDPYCQYMPLESICKSIIGTANSMGIKV


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCCACCTTGAAAGAGATTCTAACCAGACGACCCGTGGCTGCCACCATCAGGCTCACCGTCCCTGCCGGTGGAGCTCGCCCTGCGCCACCGGTGGGTCCGGCGCTGGG
TCAATACCGGTTGAATCTGATGGCCTTCTGCAAGGATTTCAATGCCCGGACTCAAAAGTACAAGGCCGACACACCCATGGCCGTCACCATTACGGCTTTCAAGGACAACA
CCTTCGAGTTCACCGTCAAGTCACCGTCAGTCACTTGGTATCTGAAGAAAGCTGCCGGGATCGAATCTGGGAGCAGCCGCCCGGGCCATGTAGTCGCCACCACGCTCTCC
GTCAAGCACATTTATGAGATCGCCAAAGTCAAGCAGTCCGATCCTTATTGCCAGTACATGCCACTCGAATCCATTTGTAAGTCCATTATCGGCACTGCCAATAGCATGGG
AATTAAGGTTGTTAAGGAATTGGAGTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCCACCTTGAAAGAGATTCTAACCAGACGACCCGTGGCTGCCACCATCAGGCTCACCGTCCCTGCCGGTGGAGCTCGCCCTGCGCCACCGGTGGGTCCGGCGCTGGG
TCAATACCGGTTGAATCTGATGGCCTTCTGCAAGGATTTCAATGCCCGGACTCAAAAGTACAAGGCCGACACACCCATGGCCGTCACCATTACGGCTTTCAAGGACAACA
CCTTCGAGTTCACCGTCAAGTCACCGTCAGTCACTTGGTATCTGAAGAAAGCTGCCGGGATCGAATCTGGGAGCAGCCGCCCGGGCCATGTAGTCGCCACCACGCTCTCC
GTCAAGCACATTTATGAGATCGCCAAAGTCAAGCAGTCCGATCCTTATTGCCAGTACATGCCACTCGAATCCATTTGTAAGTCCATTATCGGCACTGCCAATAGCATGGG
AATTAAGGTTGTTAAGGAATTGGAGTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MATLKEILTRRPVAATIRLTVPAGGARPAPPVGPALGQYRLNLMAFCKDFNARTQKYKADTPMAVTITAFKDNTFEFTVKSPSVTWYLKKAAGIESGSSRPGHVVATTLS
VKHIYEIAKVKQSDPYCQYMPLESICKSIIGTANSMGIKVVKELE