; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

ClCG04G005365 (gene) of Watermelon (Charleston Gray) v2.5 genome

Gene IDClCG04G005365
OrganismCitrullus lanatus subsp. vulgaris cv. Charleston Gray (Watermelon (Charleston Gray) v2.5)
Descriptiongag_pre-integrs domain-containing protein
Genome locationCG_Chr04:19019757..19020095
RNA-Seq ExpressionClCG04G005365
SyntenyClCG04G005365
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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VFQ76576.1 unnamed protein product [Cuscuta campestris]2.2e-2253.91Show/hide
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VFQ84242.1 unnamed protein product [Cuscuta campestris]9.9e-2354.69Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A3Q7IYG7 gag_pre-integrs domain-containing protein1.3e-2355.47Show/hide
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A0A484KKF0 Uncharacterized protein4.8e-2354.69Show/hide
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A0A484KMK1 Uncharacterized protein4.8e-2354.69Show/hide
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A0A484M5X8 Uncharacterized protein4.8e-2354.69Show/hide
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A0A484MAU4 Uncharacterized protein (Fragment)4.8e-2354.69Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGATGGAGAATTTTTTGTATTGCAAAGATTTGTTTGATCCAATTGAAACAACCACAAAAGCTAATGACACCATTTCTAAACCTGCAAAACTAGAGTTAAGTGGTGGATT
GATATTAGCATTTTCAATCATGTGCCTAAGGAGTATGACCTATGAGTTGTGGAAGATATTGGAAGGTCTTTATGCAAGGAAGATCGCACATAACAAAGCTTCACTAATCA
AGCGACTTGTTGATTTGAAATTGAAAGGTGAGAAGTCTATTTCTGAGCATTTGAGTGACTTTCAAGATATTATTAACAAGCTGACTACTATGAAGATTGATCTTAATGAC
CAATTATAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGATGGAGAATTTTTTGTATTGCAAAGATTTGTTTGATCCAATTGAAACAACCACAAAAGCTAATGACACCATTTCTAAACCTGCAAAACTAGAGTTAAGTGGTGGATT
GATATTAGCATTTTCAATCATGTGCCTAAGGAGTATGACCTATGAGTTGTGGAAGATATTGGAAGGTCTTTATGCAAGGAAGATCGCACATAACAAAGCTTCACTAATCA
AGCGACTTGTTGATTTGAAATTGAAAGGTGAGAAGTCTATTTCTGAGCATTTGAGTGACTTTCAAGATATTATTAACAAGCTGACTACTATGAAGATTGATCTTAATGAC
CAATTATAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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