; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

ClCG04G007330 (gene) of Watermelon (Charleston Gray) v2.5 genome

Gene IDClCG04G007330
OrganismCitrullus lanatus subsp. vulgaris cv. Charleston Gray (Watermelon (Charleston Gray) v2.5)
DescriptionTubulin beta chain
Genome locationCG_Chr04:22318421..22323217
RNA-Seq ExpressionClCG04G007330
SyntenyClCG04G007330
Gene Ontology termsGO:0000278 - mitotic cell cycle (biological process)
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GO:0003924 - GTPase activity (molecular function)
GO:0003729 - mRNA binding (molecular function)
InterPro domainsIPR037103 - Tubulin/FtsZ-like, C-terminal domain
IPR036525 - Tubulin/FtsZ, GTPase domain superfamily
IPR023123 - Tubulin, C-terminal
IPR018316 - Tubulin/FtsZ, 2-layer sandwich domain
IPR017975 - Tubulin, conserved site
IPR008280 - Tubulin/FtsZ, C-terminal
IPR003008 - Tubulin/FtsZ, GTPase domain
IPR002453 - Beta tubulin
IPR000217 - Tubulin


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
QBA97746.1 tubulin beta chain [Cucurbita pepo]1.8e-24696.61Show/hide
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A0A6J1IPB5 Tubulin beta chain4.5e-24897.06Show/hide
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        EMEFTEAESNMNDLVSEYQQYQDATADEEYYDEEEED EDNV
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
P29501 Tubulin beta-2 chain (Fragment)3.0e-24193.59Show/hide
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P29516 Tubulin beta-8 chain2.3e-24193.64Show/hide
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P37392 Tubulin beta-1 chain5.2e-24193.59Show/hide
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        EMEFTEAESNMNDLVSEYQQYQDATADE+ Y+ E+E+
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Q40106 Tubulin beta-2 chain5.2e-24193.45Show/hide
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        EMEFTEAESNMNDLVSEYQQYQDATADE   EY DEEE   ED
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Q8H7U1 Tubulin beta-2 chain2.3e-24193.64Show/hide
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        EMEFTEAESNMNDLVSEYQQYQDATAD+E  Y++EEE+A+
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G29550.1 tubulin beta-7 chain5.0e-23992.95Show/hide
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AT5G23860.1 tubulin beta 81.7e-24293.64Show/hide
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        EMEFTEAESNMNDLVSEYQQYQDATADEE  Y+ EE++ E
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AT5G23860.2 tubulin beta 81.7e-24293.64Show/hide
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        EMEFTEAESNMNDLVSEYQQYQDATADEE  Y+ EE++ E
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AT5G62690.1 tubulin beta chain 21.1e-24193.85Show/hide
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AT5G62700.1 tubulin beta chain 31.1e-24193.85Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
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