; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

ClCG04G009830 (gene) of Watermelon (Charleston Gray) v2.5 genome

Gene IDClCG04G009830
OrganismCitrullus lanatus subsp. vulgaris cv. Charleston Gray (Watermelon (Charleston Gray) v2.5)
DescriptionRAB6-interacting golgin
Genome locationCG_Chr04:24807116..24810583
RNA-Seq ExpressionClCG04G009830
SyntenyClCG04G009830
Gene Ontology termsGO:0005794 - Golgi apparatus (cellular component)
InterPro domainsIPR007033 - RAB6-interacting golgin


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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XP_022979025.1 uncharacterized protein LOC111478791 [Cucurbita maxima]2.5e-6084.18Show/hide
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XP_023543803.1 uncharacterized protein LOC111803564 [Cucurbita pepo subsp. pepo]2.5e-6084.18Show/hide
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XP_038882826.1 uncharacterized protein LOC120073968 isoform X1 [Benincasa hispida]7.2e-6892.41Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KHE9 RAB6-interacting golgin1.8e-6489.31Show/hide
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A0A1S3CIS0 RAB6-interacting golgin8.1e-6589.31Show/hide
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A0A5A7SM04 RAB6-interacting golgin1.7e-5986.16Show/hide
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A0A6J1EJF7 RAB6-interacting golgin7.8e-6083.54Show/hide
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A0A6J1IS07 RAB6-interacting golgin1.2e-6084.18Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G36410.2 Family of unknown function (DUF662)5.0e-4359.52Show/hide
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AT2G36410.3 Family of unknown function (DUF662)7.3e-4258.93Show/hide
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AT3G09980.1 Family of unknown function (DUF662)9.2e-4563.29Show/hide
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        PLG T QKKE+EYK+AL+ FNEKN EKVQLI++LME+VGESEK+R+K+LEEL +  +S
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AT3G52920.1 Family of unknown function (DUF662)1.7e-4368.49Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTGGAAACAGCCGATTGTAAAAGCAAAAGGAACGAAAGGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAAGCGGCAGCGGCAGCAGCCTACCAAAGGAG
GAAAGCAAAAGAAAGGAAACAGCCCATTCATTCATAGAAGCAGAATCGAAAGGGCGGTGGTTTCAAGAAACTCAACATCAAGACGAGAGAAAGATGCAGAACGAT
CAGAATCCACACCAACTTCAACTAATGTTAGACAATTCTGCAAGTTTGAGTTTCAGTAGCAAAGAAGACGATGACATGTCCAAATCGGCGCTTTCGGCTTTCAGG
GAAAAGGAAGAGGAAATCGACCGGATGAGGACTGAACTTCACAACAAACTTCAAGCTCGCCTCGGCCGAGTCCAGGAAGAATCCAGGCGTTTGGCTTCAATTCGA
GAGGAACTTGAAGCCATAGCGGGGGATCCAATGAGGAAGGAAATTGGACAAATTCGTAAGAAAATTGATGCCCTAAACAAGGAATTAAAGCCTCTTGGACTAACA
TGCCAAAAGAAGGAGAAAGAGTACAAAGATGCCCTTGATGTTTTTAATGAAAAGAACAACGAAAAAGTACAGTTAATATCAAAACTAATGGAGATGGTTGGTGAA
AGTGAAAAGCTGAGGCTAAAGAGGTTGGAAGAATTGAAACAGAAACAGAACTCCCGAAGAAAGCCTTACTTTTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
TTTTTCTCCCTTTTTTGGCCAAAAAGTCCGTGTCCCGTGCTAATTCAATCCAAGGGTCAGAAATTGAAGATGTGGAAACAGCCGATTGTAAAAGCAAAAGGAACG
AAAGGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAAGCGGCAGCGGCAGCAGCCTACCAAAGGAGGAAAGCAAAAGAAAGGAAACAGCCCATTCATTCATA
GAAGCAGAATCGAAAGGGCGGTGGTTTCAAGAAACTCAACATCAAGACGAGAGAAAGATGCAGAACGATCAGAATCCACACCAACTTCAACTAATGTTAGACAAT
TCTGCAAGTTTGAGTTTCAGTAGCAAAGAAGACGATGACATGTCCAAATCGGCGCTTTCGGCTTTCAGGGAAAAGGAAGAGGAAATCGACCGGATGAGGACTGAA
CTTCACAACAAACTTCAAGCTCGCCTCGGCCGAGTCCAGGAAGAATCCAGGCGTTTGGCTTCAATTCGAGAGGAACTTGAAGCCATAGCGGGGGATCCAATGAGG
AAGGAAATTGGACAAATTCGTAAGAAAATTGATGCCCTAAACAAGGAATTAAAGCCTCTTGGACTAACATGCCAAAAGAAGGAGAAAGAGTACAAAGATGCCCTT
GATGTTTTTAATGAAAAGAACAACGAAAAAGTACAGTTAATATCAAAACTAATGGAGATGGTTGGTGAAAGTGAAAAGCTGAGGCTAAAGAGGTTGGAAGAATTG
AAACAGAAACAGAACTCCCGAAGAAAGCCTTACTTTTGATTCAACCTATCCTCTCCCTTTGGTCGAGTGTACTAGATAACCTTTTCAGTCGAGCTACTTCATTCC
TTGTTATTATGAGCGTTAGGTCAATCCCTTCTTGAGCAACCGATTCAATACCAGCTTCTTCGAGAACAGTAAGACGAGTAACTGCTGATTAGTTAGCTGCCAAAC
AACTCTTCCTCGTCAATTACATTGCCTTCTGTAAGAGCTGGCTAGTCTTCTGTTTATAGGGTAGACTTCTGACTATGATAGTCTATCAATAACAATGGAAAAAAA
AAAAGAATTGTCAATGTTAGACTTCATTTAAATAAGGGCATAATGAGAATCGACAGATCTGCAAAATCAAATATAATTTGTTAAAAAAGCATCGCTGTACATTAC
ATTTATTATTATTATTATTAAAGTCTGTTAAAGTTAATC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MWKQPIVKAKGTKGKEKKRKEKKRKSGSGSSLPKEESKRKETAHSFIEAESKGRWFQETQHQDERKMQNDQNPHQLQLMLDNSASLSFSSKEDDDMSKSALSAFR
EKEEEIDRMRTELHNKLQARLGRVQEESRRLASIREELEAIAGDPMRKEIGQIRKKIDALNKELKPLGLTCQKKEKEYKDALDVFNEKNNEKVQLISKLMEMVGE
SEKLRLKRLEELKQKQNSRRKPYF