; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

ClCG04G012190 (gene) of Watermelon (Charleston Gray) v2.5 genome

Gene IDClCG04G012190
OrganismCitrullus lanatus subsp. vulgaris cv. Charleston Gray (Watermelon (Charleston Gray) v2.5)
DescriptionBPL/LPL catalytic domain-containing protein
Genome locationCG_Chr04:27072862..27076822
RNA-Seq ExpressionClCG04G012190
SyntenyClCG04G012190
Gene Ontology termsGO:0006464 - cellular protein modification process (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0005739 - mitochondrion (cellular component)
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GO:0005509 - calcium ion binding (molecular function)
GO:0016874 - ligase activity (molecular function)
GO:0046983 - protein dimerization activity (molecular function)
InterPro domainsIPR004143 - Biotinyl protein ligase (BPL) and lipoyl protein ligase (LPL), catalytic domain


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0036090.1 lipoate-protein ligase LplJ [Cucumis melo var. makuwa]1.1e-14492Show/hide
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XP_038895232.1 lipoate-protein ligase LplJ isoform X1 [Benincasa hispida]1.0e-14593.45Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LSR7 BPL/LPL catalytic domain-containing protein1.3e-14390.91Show/hide
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A0A1S3B7D4 lipoate-protein ligase LplJ5.4e-14592Show/hide
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A0A5A7SYE8 Lipoate-protein ligase LplJ5.4e-14592Show/hide
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A0A6J1GC58 uncharacterized protein LOC1114528204.6e-14491.27Show/hide
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A0A6J1K8Z4 uncharacterized protein LOC1114933563.3e-14290.18Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
A0A0H3JR16 Lipoate--protein ligase 12.8e-0525.44Show/hide
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A6ZPT1 Putative lipoate-protein ligase A8.1e-0524.63Show/hide
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        ++RRF+GGGTV+ D   V  +++ +++     K F + I+ W + L  ++    D + R  D +    K  G+A  I   +  HH + L + ++   + L
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O07608 Lipoate-protein ligase LplJ7.9e-0827.49Show/hide
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           D  S    K F +P++     L      G +  L   ND V   RK  GNAQ  TK R   H + ++D
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O13629 Putative lipoate-protein ligase A3.9e-0726.45Show/hide
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        + Q  D  L ++      RK  G+A  I+++R  HH + L + ++  +  YL+ P
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P47512 Probable lipoate-protein ligase A1.3e-0525.48Show/hide
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         I K R + H + L+D +   +  YL   K     + +   A+     + ++K+Y+P
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G29010.1 Biotin/lipoate A/B protein ligase family1.6e-8858.53Show/hide
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        M++ + +++  PL+NLVRLKG PIL+QL LEERLLR SSDNWCI+NDGT+ PT+VMG+SGKP +LL++  V+ D+IPVI+RFTGGGTVIVD +T+FV+ I
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Query:  LCSLKDYMPRQVFIDKTIEAIETQFATNLKQLKECEYSLTGNYSPTTRMLTEQELETA
        +C +KDY+ R  F++KT++A+  QF      L++ +    G Y  TTR+LT +ELE A
Subjt:  LCSLKDYMPRQVFIDKTIEAIETQFATNLKQLKECEYSLTGNYSPTTRMLTEQELETA


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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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