; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

ClCG04G012260 (gene) of Watermelon (Charleston Gray) v2.5 genome

Gene IDClCG04G012260
OrganismCitrullus lanatus subsp. vulgaris cv. Charleston Gray (Watermelon (Charleston Gray) v2.5)
DescriptionMini zinc finger
Genome locationCG_Chr04:27145117..27145425
RNA-Seq ExpressionClCG04G012260
SyntenyClCG04G012260
Gene Ontology termsGO:0006355 - regulation of transcription, DNA-templated (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0000976 - transcription regulatory region sequence-specific DNA binding (molecular function)
GO:0003700 - DNA-binding transcription factor activity (molecular function)
InterPro domainsIPR006456 - ZF-HD homeobox protein, Cys/His-rich dimerisation domain


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
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A0A1S3B557 mini zinc finger protein 16.5e-4392.31Show/hide
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A0A5A7SZK7 Mini zinc finger protein 16.5e-4392.31Show/hide
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A0A5D3BJJ4 Mini zinc finger protein 16.5e-4392.31Show/hide
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A0A6J1K9G7 mini zinc finger protein 14.1e-3780.39Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
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Q0J5F8 Mini zinc finger protein 41.5e-2072.88Show/hide
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Q2Q493 Mini zinc finger protein 37.4e-2865.35Show/hide
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Q9CA51 Mini zinc finger protein 12.5e-3169.61Show/hide
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Q9LJW5 Mini zinc finger protein 24.8e-2761.76Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
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AT1G18835.1 mini zinc finger5.2e-2965.35Show/hide
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AT1G74660.1 mini zinc finger 11.7e-3269.61Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
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