; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

ClCG04G012755 (gene) of Watermelon (Charleston Gray) v2.5 genome

Gene IDClCG04G012755
OrganismCitrullus lanatus subsp. vulgaris cv. Charleston Gray (Watermelon (Charleston Gray) v2.5)
Descriptionzf-RVT domain-containing protein
Genome locationCG_Chr04:27567165..27599033
RNA-Seq ExpressionClCG04G012755
SyntenyClCG04G012755
Gene Ontology termsGO:0110165 - cellular anatomical structure (cellular component)
GO:0016787 - hydrolase activity (molecular function)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0035739.1 hypothetical protein E6C27_scaffold403G00100 [Cucumis melo var. makuwa]3.6e-1244.05Show/hide
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        W R FS+FN+VW F S+ S +V+Q+L G  L ++P+++W    KA L E+W ERNQR+F +      +    A LN  AWCSL+
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KAA0062564.1 GPI-anchor transamidase isoform X1 [Cucumis melo var. makuwa]1.6e-1538.05Show/hide
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        SCL P    L L        + T    + CW    S+F + W F  +F+ N+ QIL+G +LKE P+L+W N  KA L+++WFE NQR+F+   + W +R 
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        ++A+ N   WC L
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TYK21876.1 hypothetical protein E5676_scaffold494G00090 [Cucumis melo var. makuwa]3.6e-1244.05Show/hide
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        W R FS+FN+VW F S+ S +V+Q+L G  L ++P+++W    KA L E+W ERNQR+F +      +    A LN  AWCSL+
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XP_022153214.1 uncharacterized protein LOC111020765 [Momordica charantia]3.6e-1247.06Show/hide
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        CWN  F  FN+ W F     DNV Q+L GP  L  S + LW N VKA L+ELWFERN R+F+E +  + + F  A+     WCSL
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XP_038903695.1 uncharacterized protein LOC120090219 [Benincasa hispida]7.2e-1346.43Show/hide
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        CWN+    FN+     + F  NV Q+L  P   +S +LLW NAVKA LA+LWFERNQR+F     +  DR E AR    +WC L
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A5A7T2Y0 zf-RVT domain-containing protein1.7e-1244.05Show/hide
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        W R FS+FN+VW F S+ S +V+Q+L G  L ++P+++W    KA L E+W ERNQR+F +      +    A LN  AWCSL+
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A0A5A7V5N8 GPI-anchor transamidase isoform X17.5e-1638.05Show/hide
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        ++A+ N   WC L
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A0A5D3DE60 zf-RVT domain-containing protein1.7e-1244.05Show/hide
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A0A5D3DZQ0 P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases superfamily protein isoform 21.1e-0645.57Show/hide
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        +L  I L+    + CW +  SIF+  WVF ++F  NV Q+L G + K+  Q L  N V+A L +LWFERNQRVF E  L
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A0A6J1DIE2 uncharacterized protein LOC1110207651.7e-1247.06Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTTGACACGGAGGCTTTCCTGTCTAGCTCCATGCCTAACACGCCTGATTCTATCCATGATCACACTGGAGGAGATTGGTTGCTGGAATCGGTCGTTCTCTATTTTTAA
TATTGTATGGGTATTTGGCAGCACCTTCAGCGATAATGTTATGCAGATTCTTATTGGACCAGCTTTAAAGGAGAGCCCTCAATTGCTTTGGGCTAATGCAGTAAAGGCAT
CGCTTGCGGAGCTTTGGTTTGAAAGAAATCAAAGGGTTTTTCAAGAGAGTAAACTTGCATGGTTAGATCGATTCGAAGTAGCTCGATTGAACACTTTTGCCTGGTGCTCT
CTCCAAATCCTTTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
TCTACCAAACATTTTCCCTCTCCACCATAAAAAAAACTCATCCATTCATAACCCAGAATGACCCACGAGCCACAACATCAATAGCAACGTTCCTCCTTCCAAGAAAGCTA
TTTTTTTCCCTAGTATCAAACATTCCACCACCATCATAGGTCTTCCATCTGATGTTGACACGGAGGCTTTCCTGTCTAGCTCCATGCCTAACACGCCTGATTCTATCCAT
GATCACACTGGAGGAGATTGGTTGCTGGAATCGGTCGTTCTCTATTTTTAATATTGTATGGGTATTTGGCAGCACCTTCAGCGATAATGTTATGCAGATTCTTATTGGAC
CAGCTTTAAAGGAGAGCCCTCAATTGCTTTGGGCTAATGCAGTAAAGGCATCGCTTGCGGAGCTTTGGTTTGAAAGAAATCAAAGGGTTTTTCAAGAGAGTAAACTTGCA
TGGTTAGATCGATTCGAAGTAGCTCGATTGAACACTTTTGCCTGGTGCTCTCTCCAAATCCTTTGAAGACTTCTCCACCTCAGATATTTGTCTAAATTGGAGTGCTTTTA
TTTT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MLTRRLSCLAPCLTRLILSMITLEEIGCWNRSFSIFNIVWVFGSTFSDNVMQILIGPALKESPQLLWANAVKASLAELWFERNQRVFQESKLAWLDRFEVARLNTFAWCS
LQIL