| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| XP_004145851.1 THO complex subunit 4D [Cucumis sativus] | 1.6e-128 | 90.97 | Show/hide |
Query: DVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASANSIRKASFKLMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLYVSNLDYGVT
DVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASA SIRK + MKNVQWQHDLFEDSLRASGISGI+IGTKLYVSNLDYGVT
Subjt: DVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASANSIRKASFKLMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLYVSNLDYGVT
Query: KEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTGVNGRSRRTVVLTPESGRTASS
KEDI+ELFSEIGD+KRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTG NGR+RRTVVLT ESGR A+S
Subjt: KEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTGVNGRSRRTVVLTPESGRTASS
Query: NVGNPFPGPSQRGGLRNALGRGRGGWNRGLGLGGG-GRGRGRGRGRGQGQGKKKPVEKSSDELDKELENYHAEAMQT
NV N FPGPS RGGLRNA GRGRG W+RG+GLGGG G GRGRGRGRG+GQG+KKPVEKSSDELDKELENYHAEAMQT
Subjt: NVGNPFPGPSQRGGLRNALGRGRGGWNRGLGLGGG-GRGRGRGRGRGQGQGKKKPVEKSSDELDKELENYHAEAMQT
|
|
| XP_008457020.1 PREDICTED: THO complex subunit 4D [Cucumis melo] | 5.9e-131 | 92.03 | Show/hide |
Query: DVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASANSIRKASFKLMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLYVSNLDYGVT
DVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASA SIRK + MKNVQWQHDLFEDSLRASGISGI+IGTKLYVSNLDYGVT
Subjt: DVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASANSIRKASFKLMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLYVSNLDYGVT
Query: KEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTGVNGRSRRTVVLTPESGRTASS
KEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTG NGR+RRTVVLTPESGR A+
Subjt: KEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTGVNGRSRRTVVLTPESGRTASS
Query: NVGNPFPGPSQRGGLRNALGRGRGGWNRGLGLGGGGRGRGRGRGRGQGQGKKKPVEKSSDELDKELENYHAEAMQT
NV NPFPGPS RGGLRNA GRGRG W RG+GLGG G GRGRGRGRG+GQG+KKPVEKSSDELDKELENYHAEAMQT
Subjt: NVGNPFPGPSQRGGLRNALGRGRGGWNRGLGLGGGGRGRGRGRGRGQGQGKKKPVEKSSDELDKELENYHAEAMQT
|
|
| XP_022982649.1 THO complex subunit 4D-like [Cucurbita maxima] | 3.5e-123 | 84.8 | Show/hide |
Query: DVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASANSIRKASFKLMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLYVSNLDYGVT
DVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGS+NGGR VVIGSVRRGPLGINAR SA SI K + MKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLYVSNLDYGVT
Subjt: DVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASANSIRKASFKLMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLYVSNLDYGVT
Query: KEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTGVNGRSRRTVVLTPESGRTASS
KEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNA+ PVSARINVTGVNGRSRRTVVLT ESGRT SS
Subjt: KEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTGVNGRSRRTVVLTPESGRTASS
Query: NVGNPFPGPSQRGGLRNALGRGRGGWNRGLGLGG------------GGRGRGRGR--------GRGQGQGKKKPVEKSSDELDKELENYHAEAMQT
N NPFPGPS RGGLR+ GRGRGGW+RGLG GG GGRGRGRGR GRG+GQG+KKPVEKSS ELDKELENYHAEAMQT
Subjt: NVGNPFPGPSQRGGLRNALGRGRGGWNRGLGLGG------------GGRGRGRGR--------GRGQGQGKKKPVEKSSDELDKELENYHAEAMQT
|
|
| XP_023527122.1 THO complex subunit 4D [Cucurbita pepo subsp. pepo] | 2.7e-123 | 87.76 | Show/hide |
Query: DVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASANSIRKASFKLMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLYVSNLDYGVT
DVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGS+NGGR VVIGSVRRGPLGINAR SA SI K + MKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLYVSNLDYGVT
Subjt: DVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASANSIRKASFKLMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLYVSNLDYGVT
Query: KEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTGVNGRSRRTVVLTPESGRTASS
KEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNA+ PVSARINVTGVNGRSRRTVVLT ESGRT SS
Subjt: KEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTGVNGRSRRTVVLTPESGRTASS
Query: NVGNPFPGPSQRGGLRN--ALGRGRGGWNRGL------GLGGGGRGRGR--GRGRGQGQGKKKPVEKSSDELDKELENYHAEAMQT
N NPFPGPS RGGLR+ GRGRGGW+RGL GLGGGGRGRGR G GRG+GQG+KKPVEKSS ELDKELENYHAEAMQT
Subjt: NVGNPFPGPSQRGGLRN--ALGRGRGGWNRGL------GLGGGGRGRGR--GRGRGQGQGKKKPVEKSSDELDKELENYHAEAMQT
|
|
| XP_038896761.1 THO complex subunit 4D-like [Benincasa hispida] | 4.8e-133 | 93.12 | Show/hide |
Query: DVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASANSIRKASFKLMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLYVSNLDYGVT
DVIKK+NREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVV+GSVRRGPLGINARASA SIRK + MKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLYVSNLDYGV+
Subjt: DVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASANSIRKASFKLMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLYVSNLDYGVT
Query: KEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTGVNGRSRRTVVLTPESGRTASS
KEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDG+PMKIEMLGDNAEMPVSARINVTGVNGRSRRTVVLTPESGRTASS
Subjt: KEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTGVNGRSRRTVVLTPESGRTASS
Query: NVGNPFPGPSQRGGLRNALGRGRGGWNRGLGLGGGGRGRGRGRGRGQGQGKKKPVEKSSDELDKELENYHAEAMQT
NV NPFPGPS RGGLRN GRGRGGWNRG G+GGGG GRGRGRGRG+GQG+KKPVEKSSDELDKELENYHAEAMQT
Subjt: NVGNPFPGPSQRGGLRNALGRGRGGWNRGLGLGGGGRGRGRGRGRGQGQGKKKPVEKSSDELDKELENYHAEAMQT
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A1S3C452 THO complex subunit 4D | 2.9e-131 | 92.03 | Show/hide |
Query: DVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASANSIRKASFKLMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLYVSNLDYGVT
DVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASA SIRK + MKNVQWQHDLFEDSLRASGISGI+IGTKLYVSNLDYGVT
Subjt: DVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASANSIRKASFKLMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLYVSNLDYGVT
Query: KEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTGVNGRSRRTVVLTPESGRTASS
KEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTG NGR+RRTVVLTPESGR A+
Subjt: KEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTGVNGRSRRTVVLTPESGRTASS
Query: NVGNPFPGPSQRGGLRNALGRGRGGWNRGLGLGGGGRGRGRGRGRGQGQGKKKPVEKSSDELDKELENYHAEAMQT
NV NPFPGPS RGGLRNA GRGRG W RG+GLGG G GRGRGRGRG+GQG+KKPVEKSSDELDKELENYHAEAMQT
Subjt: NVGNPFPGPSQRGGLRNALGRGRGGWNRGLGLGGGGRGRGRGRGRGQGQGKKKPVEKSSDELDKELENYHAEAMQT
|
|
| A0A5D3BPA9 THO complex subunit 4D | 6.2e-94 | 83.19 | Show/hide |
Query: DVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASANSIRKASFKL---------------------------MKNVQWQHDLFE
DVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASA SIRKASFKL MKNVQWQHDLFE
Subjt: DVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASANSIRKASFKL---------------------------MKNVQWQHDLFE
Query: DSLRASGISGIEIGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEMPVSA
DSLRASGISGI+IGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEMPVSA
Subjt: DSLRASGISGIEIGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEMPVSA
Query: RINVTGVNGRSRRTVVLTPESGRTASSNVGNP
RINVTG NGR+RRTVVLT SG +S VG P
Subjt: RINVTGVNGRSRRTVVLTPESGRTASSNVGNP
|
|
| A0A6J1CP51 THO complex subunit 4D-like | 1.1e-117 | 87.32 | Show/hide |
Query: DVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASANSIRKASFKLMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLYVSNLDYGVT
D+IKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGR VVIGS+RRGPL IN R SA SI K + MKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLYVSNLDYGVT
Subjt: DVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASANSIRKASFKLMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLYVSNLDYGVT
Query: KEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTGVNGRSRRTVVLTPESGRTASS
KEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIE+LGDNAEMPVSARINVTG+NGRSRRTVVLT ESGRT SS
Subjt: KEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTGVNGRSRRTVVLTPESGRTASS
Query: NVGNPFPGPSQRGGLRNALGRGRGGWNRGLGLGGGGRGRGRGRGRGQGQGKKKPVEKSSDELDKELENYHAEAMQT
V N FPGPS RG LR GRGRGGW+RG G GGGRGRGRGRGR G G+KK VEKSSDELDK+LENYHAEAMQT
Subjt: NVGNPFPGPSQRGGLRNALGRGRGGWNRGLGLGGGGRGRGRGRGRGQGQGKKKPVEKSSDELDKELENYHAEAMQT
|
|
| A0A6J1FAB9 THO complex subunit 4D-like | 4.9e-123 | 87.41 | Show/hide |
Query: DVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASANSIRKASFKLMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLYVSNLDYGVT
DVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGS+NGGR VVIGSVRRGPLGINAR SA SI K + MKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLYVSNLDYGVT
Subjt: DVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASANSIRKASFKLMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLYVSNLDYGVT
Query: KEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTGVNGRSRRTVVLTPESGRTASS
KEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNA+ PVSARINVTGVNGRSRRTVVLT ESGRT SS
Subjt: KEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTGVNGRSRRTVVLTPESGRTASS
Query: NVGNPFPGPSQRGGLRN--ALGRGRGGWNRGL------GLGGGGRGRGR--GRGRGQGQGKKKPVEKSSDELDKELENYHAEAMQT
+ NPFPGPS RGGLR+ GRGRGGW+RGL GLGGGGRGRGR G GRG+GQG+KKPVEKSS ELDKELENYHAEAMQT
Subjt: NVGNPFPGPSQRGGLRN--ALGRGRGGWNRGL------GLGGGGRGRGR--GRGRGQGQGKKKPVEKSSDELDKELENYHAEAMQT
|
|
| A0A6J1J564 THO complex subunit 4D-like | 1.7e-123 | 84.8 | Show/hide |
Query: DVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASANSIRKASFKLMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLYVSNLDYGVT
DVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGS+NGGR VVIGSVRRGPLGINAR SA SI K + MKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLYVSNLDYGVT
Subjt: DVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASANSIRKASFKLMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLYVSNLDYGVT
Query: KEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTGVNGRSRRTVVLTPESGRTASS
KEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNA+ PVSARINVTGVNGRSRRTVVLT ESGRT SS
Subjt: KEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTGVNGRSRRTVVLTPESGRTASS
Query: NVGNPFPGPSQRGGLRNALGRGRGGWNRGLGLGG------------GGRGRGRGR--------GRGQGQGKKKPVEKSSDELDKELENYHAEAMQT
N NPFPGPS RGGLR+ GRGRGGW+RGLG GG GGRGRGRGR GRG+GQG+KKPVEKSS ELDKELENYHAEAMQT
Subjt: NVGNPFPGPSQRGGLRNALGRGRGGWNRGLGLGG------------GGRGRGRGR--------GRGQGQGKKKPVEKSSDELDKELENYHAEAMQT
|
|
| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| B5FXN8 THO complex subunit 4 | 1.5e-28 | 38.21 | Show/hide |
Query: DVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGG----RGVVIGSVRRGPL---GINARASANSIRKASFKLMKNV--QWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLY
D+IK N ++ +RG R GRG GG+ GG GV G GP+ + AR + R A + K + +WQHDLF+ A +G+E G KL
Subjt: DVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGG----RGVVIGSVRRGPL---GINARASANSIRKASFKLMKNV--QWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLY
Query: VSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTGVNGRSRRTVVLT
VSNLD+GV+ DI+ELF+E G LK+ A+HYD++GR G+A+V + R++DA A+K+YN V LDG+PM I++ VT RR
Subjt: VSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTGVNGRSRRTVVLT
Query: PESGRTASSNVGNPFPGPSQRGGLRNALGRGRGGWNRGLGLGGGGRGRGRGRGRGQGQGKKKPVEKSSDELDKELENYHA
G T + R LG GG NR G GG RGRGRG GR Q + S++ELD +L+ Y+A
Subjt: PESGRTASSNVGNPFPGPSQRGGLRNALGRGRGGWNRGLGLGGGGRGRGRGRGRGQGQGKKKPVEKSSDELDKELENYHA
|
|
| Q6NQ72 THO complex subunit 4D | 1.8e-66 | 54.11 | Show/hide |
Query: DVIKKNNREKLRARGRAR-RGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASANSIRKASFKLMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLYVSNLDYGV
+++K+ + RG +R RGRG GG GGRG G RRGPL +NAR S+ +I K + ++++ WQ LFED LRA+G SG+E+GT+L+V+NLD GV
Subjt: DVIKKNNREKLRARGRAR-RGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASANSIRKASFKLMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLYVSNLDYGV
Query: TKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDN--AEMPVSAR--INVTGVNGRSRRTVVLTP---
T EDIRELFSEIG+++R+AIHYDKNGRPSG+AEVVY RRSDAF ALK+YNNVLLDG+PM++E+LG N +E P+S R +NVTG+NGR +RTVV+
Subjt: TKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDN--AEMPVSAR--INVTGVNGRSRRTVVLTP---
Query: --------ESGRTASSNVGNPFPGPSQRGGLRNALGRGRGGWNRGLGLGGGGRGRGRGRGRGQGQGKKKPVEKSSDELDKELENYHAEAMQT
GR + V P +Q+GG + GRGG+ R G G GGRGRG GRG G KKPVEKS+ +LDK+LE+YHA+AM T
Subjt: --------ESGRTASSNVGNPFPGPSQRGGLRNALGRGRGGWNRGLGLGGGGRGRGRGRGRGQGQGKKKPVEKSSDELDKELENYHAEAMQT
|
|
| Q8L719 THO complex subunit 4B | 5.0e-40 | 43.05 | Show/hide |
Query: GYSFGYDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASANSIRKASFKLMKNVQWQHDLF--EDSLRAS----------GIS
G D I K+NR+ +RGR G G GG G G RR + AR + S R + + WQ+D+F + S+ A+ G S
Subjt: GYSFGYDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASANSIRKASFKLMKNVQWQHDLF--EDSLRAS----------GIS
Query: GIEIGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTGVNG
IE GTKLY+SNLDYGV+ EDI+ELFSE+GDLKR+ IHYD++GR G+AEVV++RR DA AA+KRYNNV LDGK MKIE++G N P + +
Subjt: GIEIGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTGVNG
Query: RSRRTVVLTPESGRTASSNVGNPFPGPSQRGGLRNALGRGRGGW---NRGLGLGG----GGRG-RGRGRGRGQGQGKKKPVEKSSDELDKELENYHAEAM
P N F G N GRGRGG+ RG G GG GGRG RGRG GRG G G+ + S+++LD EL+ YH EAM
Subjt: RSRRTVVLTPESGRTASSNVGNPFPGPSQRGGLRNALGRGRGGW---NRGLGLGG----GGRG-RGRGRGRGQGQGKKKPVEKSSDELDKELENYHAEAM
Query: QT
+T
Subjt: QT
|
|
| Q8L773 THO complex subunit 4A | 2.5e-39 | 43.75 | Show/hide |
Query: ARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASANSIRKASFKLMKNVQ--WQHDLF----EDSLRASGISGIEIGTKLYVSNLDYGVTKEDIRE
A+ R RG GAG + G G G RR + S R A ++ K + W HD+F ED +GIE GTKLY+SNLDYGV EDI+E
Subjt: ARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASANSIRKASFKLMKNVQ--WQHDLF----EDSLRASGISGIEIGTKLYVSNLDYGVTKEDIRE
Query: LFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTGVNGRSRRTVVLTPESGRTASSNV-GNP
LF+E+G+LKR+ +H+D++GR G+AEVVY+RR DA AA+K+YN+V LDGKPMKIE++G N + + SGR A+ N G P
Subjt: LFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTGVNGRSRRTVVLTPESGRTASSNV-GNP
Query: FPGPSQRGGLRNALGRGRGGWNRGLGLGGGGRGRGRGRGRGQGQGKKKPVEK-SSDELDKELENYHAEAMQT
+ G G+GRGG RG G GGGGRG G GRGR G+G P EK S+++LD +L+ YH+ M+T
Subjt: FPGPSQRGGLRNALGRGRGGWNRGLGLGGGGRGRGRGRGRGQGQGKKKPVEK-SSDELDKELENYHAEAMQT
|
|
| Q94EH8 THO complex subunit 4C | 8.7e-61 | 51.82 | Show/hide |
Query: DVIKKNNREKLRA-----RGRARR-GRGAGGS---FNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAN-SIRKASFKLMKNVQW--QHDLFEDSLRASGISGIEIGT
+++KK+ E+ A +G +R+ GRG GG GGRG G VRRGPL +N R S++ SI K + + +++ W Q+DL+E++LRA G+SG+E+GT
Subjt: DVIKKNNREKLRA-----RGRARR-GRGAGGS---FNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAN-SIRKASFKLMKNVQW--QHDLFEDSLRASGISGIEIGT
Query: KLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAE-MPVSARINVTGVNGRSRRT
+Y++NLD GVT EDIREL++EIG+LKR+AIHYDKNGRPSGSAEVVY RRSDA A+++YNNVLLDG+PMK+E+LG N E PV+AR+NVTG+NGR +R+
Subjt: KLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAE-MPVSARINVTGVNGRSRRT
Query: VVLTPESGRTASSNVGNPFPGPSQRGGLRNALGRGRGGWNRGLGL-----------GGGGRGRGRGRGRGQ-----GQGKKKPVEKSSDELDKELENYHA
V F G RGG R GRG G R L L GG RGRGRG G G+ G+G KKPVEKS+ +LDK+LE+YHA
Subjt: VVLTPESGRTASSNVGNPFPGPSQRGGLRNALGRGRGGWNRGLGL-----------GGGGRGRGRGRGRGQ-----GQGKKKPVEKSSDELDKELENYHA
Query: EAM
EAM
Subjt: EAM
|
|
| Arabidopsis top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| AT1G66260.1 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 6.2e-62 | 51.82 | Show/hide |
Query: DVIKKNNREKLRA-----RGRARR-GRGAGGS---FNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAN-SIRKASFKLMKNVQW--QHDLFEDSLRASGISGIEIGT
+++KK+ E+ A +G +R+ GRG GG GGRG G VRRGPL +N R S++ SI K + + +++ W Q+DL+E++LRA G+SG+E+GT
Subjt: DVIKKNNREKLRA-----RGRARR-GRGAGGS---FNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAN-SIRKASFKLMKNVQW--QHDLFEDSLRASGISGIEIGT
Query: KLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAE-MPVSARINVTGVNGRSRRT
+Y++NLD GVT EDIREL++EIG+LKR+AIHYDKNGRPSGSAEVVY RRSDA A+++YNNVLLDG+PMK+E+LG N E PV+AR+NVTG+NGR +R+
Subjt: KLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAE-MPVSARINVTGVNGRSRRT
Query: VVLTPESGRTASSNVGNPFPGPSQRGGLRNALGRGRGGWNRGLGL-----------GGGGRGRGRGRGRGQ-----GQGKKKPVEKSSDELDKELENYHA
V F G RGG R GRG G R L L GG RGRGRG G G+ G+G KKPVEKS+ +LDK+LE+YHA
Subjt: VVLTPESGRTASSNVGNPFPGPSQRGGLRNALGRGRGGWNRGLGL-----------GGGGRGRGRGRGRGQ-----GQGKKKPVEKSSDELDKELENYHA
Query: EAM
EAM
Subjt: EAM
|
|
| AT1G66260.2 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 6.2e-62 | 51.82 | Show/hide |
Query: DVIKKNNREKLRA-----RGRARR-GRGAGGS---FNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAN-SIRKASFKLMKNVQW--QHDLFEDSLRASGISGIEIGT
+++KK+ E+ A +G +R+ GRG GG GGRG G VRRGPL +N R S++ SI K + + +++ W Q+DL+E++LRA G+SG+E+GT
Subjt: DVIKKNNREKLRA-----RGRARR-GRGAGGS---FNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAN-SIRKASFKLMKNVQW--QHDLFEDSLRASGISGIEIGT
Query: KLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAE-MPVSARINVTGVNGRSRRT
+Y++NLD GVT EDIREL++EIG+LKR+AIHYDKNGRPSGSAEVVY RRSDA A+++YNNVLLDG+PMK+E+LG N E PV+AR+NVTG+NGR +R+
Subjt: KLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAE-MPVSARINVTGVNGRSRRT
Query: VVLTPESGRTASSNVGNPFPGPSQRGGLRNALGRGRGGWNRGLGL-----------GGGGRGRGRGRGRGQ-----GQGKKKPVEKSSDELDKELENYHA
V F G RGG R GRG G R L L GG RGRGRG G G+ G+G KKPVEKS+ +LDK+LE+YHA
Subjt: VVLTPESGRTASSNVGNPFPGPSQRGGLRNALGRGRGGWNRGLGL-----------GGGGRGRGRGRGRGQ-----GQGKKKPVEKSSDELDKELENYHA
Query: EAM
EAM
Subjt: EAM
|
|
| AT5G02530.1 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 3.5e-41 | 43.05 | Show/hide |
Query: GYSFGYDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASANSIRKASFKLMKNVQWQHDLF--EDSLRAS----------GIS
G D I K+NR+ +RGR G G GG G G RR + AR + S R + + WQ+D+F + S+ A+ G S
Subjt: GYSFGYDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASANSIRKASFKLMKNVQWQHDLF--EDSLRAS----------GIS
Query: GIEIGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTGVNG
IE GTKLY+SNLDYGV+ EDI+ELFSE+GDLKR+ IHYD++GR G+AEVV++RR DA AA+KRYNNV LDGK MKIE++G N P + +
Subjt: GIEIGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTGVNG
Query: RSRRTVVLTPESGRTASSNVGNPFPGPSQRGGLRNALGRGRGGW---NRGLGLGG----GGRG-RGRGRGRGQGQGKKKPVEKSSDELDKELENYHAEAM
P N F G N GRGRGG+ RG G GG GGRG RGRG GRG G G+ + S+++LD EL+ YH EAM
Subjt: RSRRTVVLTPESGRTASSNVGNPFPGPSQRGGLRNALGRGRGGW---NRGLGLGG----GGRG-RGRGRGRGQGQGKKKPVEKSSDELDKELENYHAEAM
Query: QT
+T
Subjt: QT
|
|
| AT5G37720.1 ALWAYS EARLY 4 | 1.3e-67 | 54.11 | Show/hide |
Query: DVIKKNNREKLRARGRAR-RGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASANSIRKASFKLMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLYVSNLDYGV
+++K+ + RG +R RGRG GG GGRG G RRGPL +NAR S+ +I K + ++++ WQ LFED LRA+G SG+E+GT+L+V+NLD GV
Subjt: DVIKKNNREKLRARGRAR-RGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASANSIRKASFKLMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLYVSNLDYGV
Query: TKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDN--AEMPVSAR--INVTGVNGRSRRTVVLTP---
T EDIRELFSEIG+++R+AIHYDKNGRPSG+AEVVY RRSDAF ALK+YNNVLLDG+PM++E+LG N +E P+S R +NVTG+NGR +RTVV+
Subjt: TKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDN--AEMPVSAR--INVTGVNGRSRRTVVLTP---
Query: --------ESGRTASSNVGNPFPGPSQRGGLRNALGRGRGGWNRGLGLGGGGRGRGRGRGRGQGQGKKKPVEKSSDELDKELENYHAEAMQT
GR + V P +Q+GG + GRGG+ R G G GGRGRG GRG G KKPVEKS+ +LDK+LE+YHA+AM T
Subjt: --------ESGRTASSNVGNPFPGPSQRGGLRNALGRGRGGWNRGLGLGGGGRGRGRGRGRGQGQGKKKPVEKSSDELDKELENYHAEAMQT
|
|
| AT5G37720.2 ALWAYS EARLY 4 | 1.5e-68 | 55.63 | Show/hide |
Query: DVIKKNNREKLRARGRAR-RGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASANSIRKASFKLMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLYVSNLDYGV
+++K+ + RG +R RGRG GG GGRG G RRGPL +NAR S+ +I K + ++++ WQ LFED LRA+G SG+E+GT+L+V+NLD GV
Subjt: DVIKKNNREKLRARGRAR-RGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASANSIRKASFKLMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLYVSNLDYGV
Query: TKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDN--AEMPVSAR--INVTGVNGRSRRTVVLTPESG
T EDIRELFSEIG+++R+AIHYDKNGRPSG+AEVVY RRSDAF ALK+YNNVLLDG+PM++E+LG N +E P+S R +NVTG+NGR +RTVV+ G
Subjt: TKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDN--AEMPVSAR--INVTGVNGRSRRTVVLTPESG
Query: RTA---SSNVGNPFPGPSQRGGLRNALGRGRGGWNRGLGLGGGGRGRGRGRGRGQGQGKKKPVEKSSDELDKELENYHAEAMQT
R + V P +Q+GG + GRGG+ R G G GGRGRG GRG G KKPVEKS+ +LDK+LE+YHA+AM T
Subjt: RTA---SSNVGNPFPGPSQRGGLRNALGRGRGGWNRGLGLGGGGRGRGRGRGRGQGQGKKKPVEKSSDELDKELENYHAEAMQT
|
|
