; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

ClCG05G013110 (gene) of Watermelon (Charleston Gray) v2.5 genome

Gene IDClCG05G013110
OrganismCitrullus lanatus subsp. vulgaris cv. Charleston Gray (Watermelon (Charleston Gray) v2.5)
DescriptionCell wall protein DAN4-like
Genome locationCG_Chr05:18329490..18329723
RNA-Seq ExpressionClCG05G013110
SyntenyClCG05G013110
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0056279.1 cell wall protein DAN4-like [Cucumis melo var. makuwa]2.6e-0667.14Show/hide
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KAA0056285.1 cell wall protein DAN4-like [Cucumis melo var. makuwa]2.6e-0660Show/hide
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XP_038887448.1 putative protein TPRXL [Benincasa hispida]2.3e-0761.33Show/hide
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XP_038887469.1 classical arabinogalactan protein 6-like [Benincasa hispida]1.8e-0760.81Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0L8Q5 Uncharacterized protein3.1e-0560.56Show/hide
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A0A1S3BPQ2 cell wall protein DAN4-like1.8e-0562.32Show/hide
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A0A5A7UM65 Cell wall protein DAN4-like3.6e-0661.97Show/hide
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A0A5D3C1H7 Cell wall protein DAN4-like1.3e-0660Show/hide
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A0A5D3C1I1 Cell wall protein DAN4-like1.3e-0667.14Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGTTTTGGCAAGCTTGCCGAATTCCTCTCCCTCGTCTCCATCTTCACTCGATGCAACTCCCACGACCTCGCCAAATCTCTCTACCTATGCTCCGTCAATCTCTGTGGC
TCCGACATTCTTACCGGATTCCACTAGTTTTAATGCTCAATCACCAACGACCGAGACAACTTCGACCAGTTCTCCCTCTGCTGAGACTTCTCGCTTGTTTAGAAATGGTT
TTTTTGGTCGATAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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