; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

ClCG05G018400 (gene) of Watermelon (Charleston Gray) v2.5 genome

Gene IDClCG05G018400
OrganismCitrullus lanatus subsp. vulgaris cv. Charleston Gray (Watermelon (Charleston Gray) v2.5)
Descriptionprotein trichome birefringence-like 36
Genome locationCG_Chr05:30659820..30661203
RNA-Seq ExpressionClCG05G018400
SyntenyClCG05G018400
Gene Ontology termsGO:0005794 - Golgi apparatus (cellular component)
GO:0016413 - O-acetyltransferase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR029962 - Trichome birefringence-like family


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6601220.1 Protein trichome birefringence-like 36, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]7.0e-1976.81Show/hide
Query:  RKIVTYNGPSMAFHALASDMNELDLADFETSIEFPWAPPLVELNKGAENKRVLHLDKIEENAKHWTTVD
        RK VTYNGPSMAFHA+          DFETSIEF WAP LVELNKGAENKRVLHLDKIEENAK+WT VD
Subjt:  RKIVTYNGPSMAFHALASDMNELDLADFETSIEFPWAPPLVELNKGAENKRVLHLDKIEENAKHWTTVD
KAG7032015.1 Protein trichome birefringence-like 36, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]7.0e-1976.81Show/hide
Query:  RKIVTYNGPSMAFHALASDMNELDLADFETSIEFPWAPPLVELNKGAENKRVLHLDKIEENAKHWTTVD
        RK VTYNGPSMAFHA+          DFETSIEF WAP LVELNKGAENKRVLHLDKIEENAK+WT VD
Subjt:  RKIVTYNGPSMAFHALASDMNELDLADFETSIEFPWAPPLVELNKGAENKRVLHLDKIEENAKHWTTVD
XP_022150469.1 protein trichome birefringence-like 36 [Momordica charantia]3.5e-1873.91Show/hide
Query:  RKIVTYNGPSMAFHALASDMNELDLADFETSIEFPWAPPLVELNKGAENKRVLHLDKIEENAKHWTTVD
        RK+VTYNGPSMAFHA+          DFE SIEF WAP LVEL+KGAENKRVLHLDKIEENAKHW  VD
Subjt:  RKIVTYNGPSMAFHALASDMNELDLADFETSIEFPWAPPLVELNKGAENKRVLHLDKIEENAKHWTTVD
XP_022956978.1 protein trichome birefringence-like 36 [Cucurbita moschata]1.6e-1875.36Show/hide
Query:  RKIVTYNGPSMAFHALASDMNELDLADFETSIEFPWAPPLVELNKGAENKRVLHLDKIEENAKHWTTVD
        RK VTYNGPSMAFHA+          DFETSIEF WAP LVELNKGAENKRVLHLD+IEENAK+WT VD
Subjt:  RKIVTYNGPSMAFHALASDMNELDLADFETSIEFPWAPPLVELNKGAENKRVLHLDKIEENAKHWTTVD
XP_022981662.1 protein trichome birefringence-like 36 [Cucurbita maxima]1.6e-1875.36Show/hide
Query:  RKIVTYNGPSMAFHALASDMNELDLADFETSIEFPWAPPLVELNKGAENKRVLHLDKIEENAKHWTTVD
        RK VTYNGPSMAFHA+          DFETSIEF WAP LVELNKGAENKRVLHLD+IEENAK+WT VD
Subjt:  RKIVTYNGPSMAFHALASDMNELDLADFETSIEFPWAPPLVELNKGAENKRVLHLDKIEENAKHWTTVD
TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KUS5 PMR5N domain-containing protein2.9e-1873.91Show/hide
Query:  RKIVTYNGPSMAFHALASDMNELDLADFETSIEFPWAPPLVELNKGAENKRVLHLDKIEENAKHWTTVD
        RK VTYNGPSMAFHA+          DFETSIEF WAP LVELNKG ENKRVLHLD+IEENAK+WT VD
Subjt:  RKIVTYNGPSMAFHALASDMNELDLADFETSIEFPWAPPLVELNKGAENKRVLHLDKIEENAKHWTTVD
A0A5A7SXR5 Protein trichome birefringence-like 364.9e-1873.91Show/hide
Query:  RKIVTYNGPSMAFHALASDMNELDLADFETSIEFPWAPPLVELNKGAENKRVLHLDKIEENAKHWTTVD
        RK VTY+GPSMAFHA+          DFETSIEF WAP LVELNKG ENKRVLHLDKIEENAK+WT VD
Subjt:  RKIVTYNGPSMAFHALASDMNELDLADFETSIEFPWAPPLVELNKGAENKRVLHLDKIEENAKHWTTVD
A0A6J1DA56 protein trichome birefringence-like 361.7e-1873.91Show/hide
Query:  RKIVTYNGPSMAFHALASDMNELDLADFETSIEFPWAPPLVELNKGAENKRVLHLDKIEENAKHWTTVD
        RK+VTYNGPSMAFHA+          DFE SIEF WAP LVEL+KGAENKRVLHLDKIEENAKHW  VD
Subjt:  RKIVTYNGPSMAFHALASDMNELDLADFETSIEFPWAPPLVELNKGAENKRVLHLDKIEENAKHWTTVD
A0A6J1GYV3 protein trichome birefringence-like 367.6e-1975.36Show/hide
Query:  RKIVTYNGPSMAFHALASDMNELDLADFETSIEFPWAPPLVELNKGAENKRVLHLDKIEENAKHWTTVD
        RK VTYNGPSMAFHA+          DFETSIEF WAP LVELNKGAENKRVLHLD+IEENAK+WT VD
Subjt:  RKIVTYNGPSMAFHALASDMNELDLADFETSIEFPWAPPLVELNKGAENKRVLHLDKIEENAKHWTTVD
A0A6J1IUM0 protein trichome birefringence-like 367.6e-1975.36Show/hide
Query:  RKIVTYNGPSMAFHALASDMNELDLADFETSIEFPWAPPLVELNKGAENKRVLHLDKIEENAKHWTTVD
        RK VTYNGPSMAFHA+          DFETSIEF WAP LVELNKGAENKRVLHLD+IEENAK+WT VD
Subjt:  RKIVTYNGPSMAFHALASDMNELDLADFETSIEFPWAPPLVELNKGAENKRVLHLDKIEENAKHWTTVD
SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q940H3 Protein trichome birefringence-like 367.5e-1659.42Show/hide
Query:  RKIVTYNGPSMAFHALASDMNELDLADFETSIEFPWAPPLVELNKGAENKRVLHLDKIEENAKHWTTVD
        RK +TYNGP+M+FH+L          DFETSIEF WAP LVEL +G + KRVLHLD IE+NA++W  VD
Subjt:  RKIVTYNGPSMAFHALASDMNELDLADFETSIEFPWAPPLVELNKGAENKRVLHLDKIEENAKHWTTVD
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G38320.1 TRICHOME BIREFRINGENCE-LIKE 345.2e-0429.58Show/hide
Query:  VTYNGPSMAFHALASDMNELDLADFETSIEFPWAPPLVELNKGAENK-----RVLHLDKIEENAKHWTTVD
        V  N  +M  H   S++      ++  +I++ WAP LVE N           R++ +  IE++A+HWT  D
Subjt:  VTYNGPSMAFHALASDMNELDLADFETSIEFPWAPPLVELNKGAENK-----RVLHLDKIEENAKHWTTVD
AT3G54260.1 TRICHOME BIREFRINGENCE-LIKE 365.3e-1759.42Show/hide
Query:  RKIVTYNGPSMAFHALASDMNELDLADFETSIEFPWAPPLVELNKGAENKRVLHLDKIEENAKHWTTVD
        RK +TYNGP+M+FH+L          DFETSIEF WAP LVEL +G + KRVLHLD IE+NA++W  VD
Subjt:  RKIVTYNGPSMAFHALASDMNELDLADFETSIEFPWAPPLVELNKGAENKRVLHLDKIEENAKHWTTVD

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAGTAGAAAAATAGTGACTTATAATGGTCCTTCCATGGCTTTCCATGCTTTGGCGAGTGATATGAATGAATTGGATCTTGCAGATTTTGAGACTTCAATTGAGTTTCC
ATGGGCACCACCTCTGGTTGAGCTGAACAAAGGAGCTGAAAACAAGAGAGTATTGCATTTGGATAAGATTGAAGAGAATGCCAAGCATTGGACAACAGTTGATACTTGTT
CCGAGGCAGTTGCTCGTGCTTCAGGGAGTATTGAGAAGGATGAGATTTCCAGTATACCTTCAAGACATCACAGCAATGTCGGCACTTCGAAAAGATGGCCACCGCTCCAT
GTACCGGAACAATTTGAGTCAAGAAGGGAAGCAGCACCAGGAAGAGTCACTCTTTTGCCAGCAGGGGTTTGTTTATCTCTTGATCTCACTTCTCAAGTTTCTACAATTAT
ATTGTTAGCTACTGCTTTGTCAATGGGGAGCATTCCTCTTTTTCAGCTTCGAGAGCTCATCGGGACTCAACCCAAAAGCCTTCTCCAAGAGCTCTACTTTGATCCCATAT
CCAAAAACAACAGCTGGAATTTTCATCAGGCCACGATTTTGGCTGTCAAAACTCCCTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGAGTAGAAAAATAGTGACTTATAATGGTCCTTCCATGGCTTTCCATGCTTTGGCGAGTGATATGAATGAATTGGATCTTGCAGATTTTGAGACTTCAATTGAGTTTCC
ATGGGCACCACCTCTGGTTGAGCTGAACAAAGGAGCTGAAAACAAGAGAGTATTGCATTTGGATAAGATTGAAGAGAATGCCAAGCATTGGACAACAGTTGATACTTGTT
CCGAGGCAGTTGCTCGTGCTTCAGGGAGTATTGAGAAGGATGAGATTTCCAGTATACCTTCAAGACATCACAGCAATGTCGGCACTTCGAAAAGATGGCCACCGCTCCAT
GTACCGGAACAATTTGAGTCAAGAAGGGAAGCAGCACCAGGAAGAGTCACTCTTTTGCCAGCAGGGGTTTGTTTATCTCTTGATCTCACTTCTCAAGTTTCTACAATTAT
ATTGTTAGCTACTGCTTTGTCAATGGGGAGCATTCCTCTTTTTCAGCTTCGAGAGCTCATCGGGACTCAACCCAAAAGCCTTCTCCAAGAGCTCTACTTTGATCCCATAT
CCAAAAACAACAGCTGGAATTTTCATCAGGCCACGATTTTGGCTGTCAAAACTCCCTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MSRKIVTYNGPSMAFHALASDMNELDLADFETSIEFPWAPPLVELNKGAENKRVLHLDKIEENAKHWTTVDTCSEAVARASGSIEKDEISSIPSRHHSNVGTSKRWPPLH
VPEQFESRREAAPGRVTLLPAGVCLSLDLTSQVSTIILLATALSMGSIPLFQLRELIGTQPKSLLQELYFDPISKNNSWNFHQATILAVKTP