; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

ClCG05G021990 (gene) of Watermelon (Charleston Gray) v2.5 genome

Gene IDClCG05G021990
OrganismCitrullus lanatus subsp. vulgaris cv. Charleston Gray (Watermelon (Charleston Gray) v2.5)
Description5'-nucleotidase
Genome locationCG_Chr05:33974743..33977289
RNA-Seq ExpressionClCG05G021990
SyntenyClCG05G021990
Gene Ontology termsGO:0009117 - nucleotide metabolic process (biological process)
GO:0016311 - dephosphorylation (biological process)
GO:0005737 - cytoplasm (cellular component)
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GO:0008253 - 5'-nucleotidase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR006434 - Pyrimidine 5'-nucleotidase, eukaryotic
IPR023214 - HAD superfamily
IPR036412 - HAD-like superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6601237.1 Cytosolic 5'-nucleotidase 3, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]9.3e-17591.81Show/hide
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XP_022982686.1 7-methylguanosine phosphate-specific 5'-nucleotidase A [Cucurbita maxima]6.0e-17491.52Show/hide
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XP_038893141.1 7-methylguanosine phosphate-specific 5'-nucleotidase A [Benincasa hispida]1.6e-18294.44Show/hide
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A0A1S3BGK8 5'-nucleotidase1.7e-18292.13Show/hide
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A0A5A7SXP5 5'-nucleotidase1.7e-18292.13Show/hide
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A0A6J1D8T4 5'-nucleotidase5.5e-17390.29Show/hide
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A0A6J1GY58 5'-nucleotidase2.2e-17491.81Show/hide
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A0A6J1J014 5'-nucleotidase2.9e-17491.52Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q2TAG6 7-methylguanosine phosphate-specific 5'-nucleotidase B5.0e-4637.99Show/hide
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Q5ZID6 Cytosolic 5'-nucleotidase 3A1.6e-4438.4Show/hide
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           ++  +N++LLGD  GDL M+DG+ N +  + +G+LND ++  L+ Y +++DIV + D S+
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Q5ZKF6 7-methylguanosine phosphate-specific 5'-nucleotidase5.5e-4536.01Show/hide
Query:  LETSEAVVADSDLLKKKLDAMRFSGPQKLQVIADFDATLTRYWIDGRRGQTSHGLLKQG---NPEYDTKRDELYKYYHPLEYSPTISIEEKTKLMEEWWG
        L+ S   +   + +   + A++  G  KLQVI+DFD TL+R+  +GRR  TSH +L      + +   K  +L  +Y+P+E  P  ++EEK  LM EWW 
Subjt:  LETSEAVVADSDLLKKKLDAMRFSGPQKLQVIADFDATLTRYWIDGRRGQTSHGLLKQG---NPEYDTKRDELYKYYHPLEYSPTISIEEKTKLMEEWWG

Query:  KSHSLLIEGGLTFDAIKQSVATASIAFREGVVELFELLEERDVPVLIFSAGLADIIEEVLRQKLHRSFKNIRIVSNRMVFDDNGCLVSFKGKTIHSLNKN
        ++H LL +  +    I Q V  + +  R+G  ELF+ L +  VP+ IFSAG+ D++EE++RQ  +  + N+ +VSN M FDD+G L  FK   IH+ NKN
Subjt:  KSHSLLIEGGLTFDAIKQSVATASIAFREGVVELFELLEERDVPVLIFSAGLADIIEEVLRQKLHRSFKNIRIVSNRMVFDDNGCLVSFKGKTIHSLNKN

Query:  EHALDMAAPLHDQLGDVDGAIDDSASVRKRTNVLLLGDHIGDLGMSDGL-NYDTRISVGFLNDNIENSLDSYRNAFDIVYLNDASM
           L   A                  +  RT+++LLGD +GDL M+DG+ + +  + +GFLND +E     Y +A+DIV  +D ++
Subjt:  EHALDMAAPLHDQLGDVDGAIDDSASVRKRTNVLLLGDHIGDLGMSDGL-NYDTRISVGFLNDNIENSLDSYRNAFDIVYLNDASM

Q7SYN4 Cytosolic 5'-nucleotidase 39.3e-4535.44Show/hide
Query:  ETSEAVVADSDLLKKKLDAMRFSGPQKLQVIADFDATLTRYWIDGRRGQTSHGLLKQGNPEYDTKRDELY---KYYHPLEYSPTISIEEKTKLMEEWWGK
        E +   + D + +++ +  +   G  KLQ+I DFD TL+R+ ++G+R  + H ++       D  R +L    + Y+P+E  P +++EEK   M EW+ K
Subjt:  ETSEAVVADSDLLKKKLDAMRFSGPQKLQVIADFDATLTRYWIDGRRGQTSHGLLKQGNPEYDTKRDELY---KYYHPLEYSPTISIEEKTKLMEEWWGK

Query:  SHSLLIEGGLTFDAIKQSVATASIAFREGVVELFELLEERDVPVLIFSAGLADIIEEVLRQKLHRSFKNIRIVSNRMVFDDNGCLVSFKGKTIHSLNKNE
        SH+LL+E  L  D + ++V  + ++ +EG  + F+ L +  VPV IFSAGL D++EE++RQ       N+++VSN M FDDNG L  FKG+ IH  NK++
Subjt:  SHSLLIEGGLTFDAIKQSVATASIAFREGVVELFELLEERDVPVLIFSAGLADIIEEVLRQKLHRSFKNIRIVSNRMVFDDNGCLVSFKGKTIHSLNKNE

Query:  HALDMAAPLHDQLGDVDGAIDDSASVRKRTNVLLLGDHIGDLGMSDGL-NYDTRISVGFLNDNIENSLDSYRNAFDIVYLNDASM
         AL        QL D               N++LLGD +GDL M+DG+ N +  + +G+LND +E  L+ Y ++++IV   D ++
Subjt:  HALDMAAPLHDQLGDVDGAIDDSASVRKRTNVLLLGDHIGDLGMSDGL-NYDTRISVGFLNDNIENSLDSYRNAFDIVYLNDASM

Q7ZWS2 7-methylguanosine phosphate-specific 5'-nucleotidase A2.2e-4637.99Show/hide
Query:  DSDLLKKKLDAMRFSGPQKLQVIADFDATLTRYWIDGRRGQTSHGLLKQGNPEYDTKRDE---LYKYYHPLEYSPTISIEEKTKLMEEWWGKSHSLLIEG
        D + L+ K+  ++  G +KLQ+I+DFD TL+R+  +G R  T + ++   N   D  R +   L+  Y+PLE  P  SIEEK  LM EWW K+H L  E 
Subjt:  DSDLLKKKLDAMRFSGPQKLQVIADFDATLTRYWIDGRRGQTSHGLLKQGNPEYDTKRDE---LYKYYHPLEYSPTISIEEKTKLMEEWWGKSHSLLIEG

Query:  GLTFDAIKQSVATASIAFREGVVELFELLEERDVPVLIFSAGLADIIEEVLRQK--LHRSFKNIRIVSNRMVFDDNGCLVSFKGKTIHSLNKNEHALDMA
         +  D + Q V  +    R+G    F  L +R++P+ IFSAG+ D++EE++RQ    H    N ++VSN M FDDNG L  FKG  IH+ NKN   L   
Subjt:  GLTFDAIKQSVATASIAFREGVVELFELLEERDVPVLIFSAGLADIIEEVLRQK--LHRSFKNIRIVSNRMVFDDNGCLVSFKGKTIHSLNKNEHALDMA

Query:  APLHDQLGDVDGAIDDSASVRKRTNVLLLGDHIGDLGMSDGLN-YDTRISVGFLNDNIENSLDSYRNAFDIVYLNDASM
            +              +  RTN+LLLGD +GDL M+DG++  +  I +GFLND +E   + +  ++DIV L D ++
Subjt:  APLHDQLGDVDGAIDDSASVRKRTNVLLLGDHIGDLGMSDGLN-YDTRISVGFLNDNIENSLDSYRNAFDIVYLNDASM

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G38680.1 5'-nucleotidases;magnesium ion binding3.1e-11267.92Show/hide
Query:  TSEAVVADSDLLKKKLDAMRFSGPQKLQVIADFDATLTRYWIDGRRG-QTSHGLLKQGNPEYDTKRDELYKYYHPLEYSPTISIEEKTKLMEEWWGKSHS
        ++  V+A    L  K+  +R +GP K QVIADFDATLTRY ++G RG QTSHGLL+QG+  YD KR  LY +YHPLE SP I I+EKTKLMEEWWGK+H 
Subjt:  TSEAVVADSDLLKKKLDAMRFSGPQKLQVIADFDATLTRYWIDGRRG-QTSHGLLKQGNPEYDTKRDELYKYYHPLEYSPTISIEEKTKLMEEWWGKSHS

Query:  LLIEGGLTFDAIKQSVATASIAFREGVVELFELLEERDVPVLIFSAGLADIIEEVLRQKLHRSFKNIRIVSNRMVFDDNGCLVSFKGKTIHSLNKNEHAL
        LLIEGGLT+DAIK+SVA +SIAFREGV ELFE LE++++PVLIFSAGLAD+IEEVLRQ L R+FKN++IVSNRMVF+D+G LVSFKGK IH LNKNEHAL
Subjt:  LLIEGGLTFDAIKQSVATASIAFREGVVELFELLEERDVPVLIFSAGLADIIEEVLRQKLHRSFKNIRIVSNRMVFDDNGCLVSFKGKTIHSLNKNEHAL

Query:  DMAAPLHDQLG-DVDGAIDDSASVRKRTNVLLLGDHIGDLGMSDGLNYDTRISVGFLNDNIENSLDSYRNAFDIVYLNDASMLGVVKLVHQLF
        DMAAPLHD+LG D+    +++ ++++R NVLL+GDH+GDL MSDGL+Y+TRIS+GFLNDNIE SL+SYR +FD+VYLNDA M G ++LV +LF
Subjt:  DMAAPLHDQLG-DVDGAIDDSASVRKRTNVLLLGDHIGDLGMSDGLNYDTRISVGFLNDNIENSLDSYRNAFDIVYLNDASMLGVVKLVHQLF


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGCTTGAGTTTATTTTAGTAAATTTATGTGTGTGCATAGCGTTAGCAGAAATTCATTTAACATTTTATTTCCAAAAATGGGTTGTTTGCCATTTTGATCCAAATTTTGG
ATCACCGTTCAAATTTTCCGTACCAAAAAGAAAAAGAAAAAGAAAAAGAAATAGCCTATCCCGCGTACCAAAAAAAGAAAGATGCTTGTTCATTGGATTTCAGGCGAACG
CCCAGATGAGTGTTCGAATCCAATTCATTTCAACAATTCCTCTTCGCTTCACTTCCATCTCTAACCTTCCTTCTTCACCATTTTCCACTTCCAGGCTTTGGTTTTCCGGA
TGCCGAAACGTGATTGGGATGGAGGAAAAAGGATTCTTAGAGACTTCTGAGGCAGTTGTCGCCGATTCCGATCTGCTGAAGAAGAAACTGGATGCTATGCGTTTTTCTGG
TCCGCAGAAACTTCAGGTTATTGCTGACTTTGATGCTACGCTAACGAGGTACTGGATTGATGGCCGCCGAGGTCAAACCAGTCATGGTCTTCTAAAGCAGGGTAATCCTG
AATATGATACTAAGAGGGATGAACTTTATAAATATTACCATCCCTTGGAATATTCTCCTACAATTTCTATAGAAGAGAAAACCAAGCTCATGGAAGAATGGTGGGGCAAA
AGCCATTCACTTCTGATTGAAGGAGGTCTTACGTTTGATGCAATAAAACAATCAGTTGCTACTGCCAGCATTGCTTTTAGGGAGGGAGTGGTTGAGCTGTTTGAACTTCT
AGAGGAAAGGGATGTTCCGGTTCTCATATTTTCAGCAGGTCTTGCAGACATTATAGAGGAGGTCCTGAGGCAGAAGCTTCACAGATCTTTTAAGAATATTAGGATCGTTT
CGAATAGAATGGTGTTTGATGATAATGGTTGCCTTGTATCATTTAAGGGCAAGACAATTCATAGTCTAAATAAAAATGAACATGCTCTTGATATGGCTGCTCCTCTTCAT
GACCAACTGGGTGATGTAGACGGGGCAATTGATGACAGTGCTTCAGTAAGAAAAAGGACGAATGTACTTCTTCTTGGTGACCACATTGGTGATTTGGGGATGTCAGACGG
TTTAAACTATGACACTCGGATATCTGTGGGGTTTTTGAATGACAATATCGAGAACTCTCTTGACAGTTATCGCAATGCCTTTGATATTGTTTACCTGAATGATGCATCCA
TGCTGGGAGTGGTTAAACTTGTACATCAGCTCTTTCCCGTTTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGCTTGAGTTTATTTTAGTAAATTTATGTGTGTGCATAGCGTTAGCAGAAATTCATTTAACATTTTATTTCCAAAAATGGGTTGTTTGCCATTTTGATCCAAATTTTGG
ATCACCGTTCAAATTTTCCGTACCAAAAAGAAAAAGAAAAAGAAAAAGAAATAGCCTATCCCGCGTACCAAAAAAAGAAAGATGCTTGTTCATTGGATTTCAGGCGAACG
CCCAGATGAGTGTTCGAATCCAATTCATTTCAACAATTCCTCTTCGCTTCACTTCCATCTCTAACCTTCCTTCTTCACCATTTTCCACTTCCAGGCTTTGGTTTTCCGGA
TGCCGAAACGTGATTGGGATGGAGGAAAAAGGATTCTTAGAGACTTCTGAGGCAGTTGTCGCCGATTCCGATCTGCTGAAGAAGAAACTGGATGCTATGCGTTTTTCTGG
TCCGCAGAAACTTCAGGTTATTGCTGACTTTGATGCTACGCTAACGAGGTACTGGATTGATGGCCGCCGAGGTCAAACCAGTCATGGTCTTCTAAAGCAGGGTAATCCTG
AATATGATACTAAGAGGGATGAACTTTATAAATATTACCATCCCTTGGAATATTCTCCTACAATTTCTATAGAAGAGAAAACCAAGCTCATGGAAGAATGGTGGGGCAAA
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AGAGGAAAGGGATGTTCCGGTTCTCATATTTTCAGCAGGTCTTGCAGACATTATAGAGGAGGTCCTGAGGCAGAAGCTTCACAGATCTTTTAAGAATATTAGGATCGTTT
CGAATAGAATGGTGTTTGATGATAATGGTTGCCTTGTATCATTTAAGGGCAAGACAATTCATAGTCTAAATAAAAATGAACATGCTCTTGATATGGCTGCTCCTCTTCAT
GACCAACTGGGTGATGTAGACGGGGCAATTGATGACAGTGCTTCAGTAAGAAAAAGGACGAATGTACTTCTTCTTGGTGACCACATTGGTGATTTGGGGATGTCAGACGG
TTTAAACTATGACACTCGGATATCTGTGGGGTTTTTGAATGACAATATCGAGAACTCTCTTGACAGTTATCGCAATGCCTTTGATATTGTTTACCTGAATGATGCATCCA
TGCTGGGAGTGGTTAAACTTGTACATCAGCTCTTTCCCGTTTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MLEFILVNLCVCIALAEIHLTFYFQKWVVCHFDPNFGSPFKFSVPKRKRKRKRNSLSRVPKKERCLFIGFQANAQMSVRIQFISTIPLRFTSISNLPSSPFSTSRLWFSG
CRNVIGMEEKGFLETSEAVVADSDLLKKKLDAMRFSGPQKLQVIADFDATLTRYWIDGRRGQTSHGLLKQGNPEYDTKRDELYKYYHPLEYSPTISIEEKTKLMEEWWGK
SHSLLIEGGLTFDAIKQSVATASIAFREGVVELFELLEERDVPVLIFSAGLADIIEEVLRQKLHRSFKNIRIVSNRMVFDDNGCLVSFKGKTIHSLNKNEHALDMAAPLH
DQLGDVDGAIDDSASVRKRTNVLLLGDHIGDLGMSDGLNYDTRISVGFLNDNIENSLDSYRNAFDIVYLNDASMLGVVKLVHQLFPV