CuGenDBv2

Gene ID	ClCG05G022140
Organism	Citrullus lanatus subsp. vulgaris cv. Charleston Gray (Watermelon (Charleston Gray) v2.5)
Description	DNA repair REX1-B protein
Genome location	CG_Chr05:34129741..34132032
RNA-Seq Expression	ClCG05G022140
Synteny	ClCG05G022140
Gene Ontology terms	NA
InterPro domains	IPR039491 - Required for excision 1-B domain-containing protein

Homology

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GenBank top hits

e value

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XP_004135056.1 uncharacterized protein LOC101210078 [Cucumis sativus]

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XP_022945518.1 uncharacterized protein C19orf60 homolog [Cucurbita moschata]

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XP_023541138.1 uncharacterized protein C19orf60 homolog [Cucurbita pepo subsp. pepo]

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XP_038892275.1 uncharacterized protein LOC120081463 [Benincasa hispida]

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TrEMBL top hits

e value

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A0A0A0KUN3 Uncharacterized protein

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A0A1S3BGI9 uncharacterized protein LOC103489347

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A0A5D3CFT2 Uncharacterized protein

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A0A6J1G147 uncharacterized protein C19orf60 homolog

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A0A6J1HYI6 uncharacterized protein C19orf60 homolog

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SwissProt top hits	e value	%identity	Alignment
No hits found

Arabidopsis top hits

e value

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AT5G04910.1 unknown protein

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        IT EFS CSKQV ++ES F +P+  R +LA LL  +Q QEKQKLHL                                                      
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Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

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ATGGAAGATTTTAAGAAGAAGCTCTCTCTGGATGAACAAATGGAGGAAGACCAAAGAACCGATACTACCGATTCCTCCGATTCCTCCAACACTCTCAGTTTGCTCCGCAA
GTTTCTTGAAATCCAGCAGCGTAGAGCGGAAGCTTATGCCAAGCTTAAAAGAATCCGATGGTTAAAGTTATATTCGGATGGAATTTTGTTAATTCGCAGGGGGTTCGATG
AGTATATGACTTCAGGAAGGGAGATATCTTACCAACAGCTATGCAGTGAGATCACTATGGAATTCAGTAATTGCTCCAAACAAGTTATTGACATTGAATCGAACTTCCGG
AGTCCAGATCATAACAGGCTTGAGCTAGCCAACCTTCTTAGATCTGTTCAAGAACAAGAAAAGCAGAAATTGCACCTGGTATATGCCACGTCCAGAAAGTTCTCTAGAAA
GTTTTGGATTTATTTTGTTGCAGCATCCTTTCCTCATCTGCATAGATTAAGTTTGGAGAGTAATTATGTAAAGCATCACTCCAAAGTCGAACCTCTCCTTAATTCTAGTG
ACTTGAAAACTCAATGTTGTAAATTTTCAGTTAACTACCTAAGATCTTCAGTAGTGACAGCTCAAATTCAGTTATTGAAGAAGGCTGGTCGCCCATCAGAGCGCTTGGTG
AGCCATGAGAATTGCAGATTCAATGCACCTCGAGAGCACGAGTGTGTGCATGTCCATGAGATAACTGAGGCTTCTGGTACTGAGGAAGCAGAAGCAGATGCCGATTATGA
CAATGCTCTAAAGGAAGCAATCAAAGGTGTGCAGGATGCTGTGACGACCATAATTGAGCACATGGAGGAAGTGAGATATGAGATTGCAGCTCTTGAAGATAAGTAA

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MEDFKKKLSLDEQMEEDQRTDTTDSSDSSNTLSLLRKFLEIQQRRAEAYAKLKRIRWLKLYSDGILLIRRGFDEYMTSGREISYQQLCSEITMEFSNCSKQVIDIESNFR
SPDHNRLELANLLRSVQEQEKQKLHLVYATSRKFSRKFWIYFVAASFPHLHRLSLESNYVKHHSKVEPLLNSSDLKTQCCKFSVNYLRSSVVTAQIQLLKKAGRPSERLV
SHENCRFNAPREHECVHVHEITEASGTEEAEADADYDNALKEAIKGVQDAVTTIIEHMEEVRYEIAALEDK

ClCG05G022140 (gene) of Watermelon (Charleston Gray) v2.5 genome