; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

ClCG06G013330 (gene) of Watermelon (Charleston Gray) v2.5 genome

Gene IDClCG06G013330
OrganismCitrullus lanatus subsp. vulgaris cv. Charleston Gray (Watermelon (Charleston Gray) v2.5)
DescriptionUnknown protein
Genome locationCG_Chr06:26658180..26659830
RNA-Seq ExpressionClCG06G013330
SyntenyClCG06G013330
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7023388.1 hypothetical protein SDJN02_14413 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]1.4e-12085.97Show/hide
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TYK11828.1 uncharacterized protein E5676_scaffold152G00430 [Cucumis melo var. makuwa]3.3e-12589.96Show/hide
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XP_038879756.1 uncharacterized protein LOC120071507 [Benincasa hispida]2.1e-13293.66Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LU50 Uncharacterized protein1.6e-12086.72Show/hide
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A0A1S3BW36 uncharacterized protein LOC1034942652.9e-12790.33Show/hide
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A0A5A7UVS6 Uncharacterized protein2.9e-12790.33Show/hide
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A0A5D3CL04 Uncharacterized protein1.6e-12589.96Show/hide
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A0A6J1E1L2 uncharacterized protein LOC1114299539.1e-12185.97Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT4G30230.1 unknown protein4.7e-2936.56Show/hide
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        +TN  NP  L      H ++E +++LS  DLPL               KNP  +++E       +LFEF ++   + +++PAE++IF G+L+PLN  +  
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         +          E I R+    R RSESLS +Q          +V+R ++A     R SRSLDYRKL R   ++ SP    + + S K   KP++ +  +
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          S +PRWY++MFGMVKFP E+EL DIKSRQ+RR+   V+FP+  ++        S   +WR L ALSCK   SV  TA
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTTCATGGACGACACCAACGAATCCAATCCCCTAACCTCTCAACGCAATCAACATGAAGACGACGAATCAGACGAATCACTCTCCTTCTCCGATCTTCCGCTCGACAG
AGAAAAATCCGACGGCCACACTCATCCGGAAAGCCTCCGCAAGAATCCACGTAGGTCCTCTTCCGAGCCTCTCGATCTCTTCGAATTCTTTAGCGCTGGATTCATCACCT
CCGAGATTTCTCCGGCAGAGGATTTGATTTTCTGCGGCAGATTGCTTCCTCTCAACGATCATTCTCCGCTTACTACTACGCGGACCGCTGAGAAGAGTTTCTGGAAGGAA
GAGATCATCCGAAAACAGACTGTTTTTCGAAAACGCTCTGAGTCATTGTCTGGATTGCAGAGCTCTGTTTCTCGATCTAACAGTGCGAAATTCAATCTCAAGCGGAATAG
CCGTTCGCTCGATTACCGCAAACTCTATCGCCAAACGAATTCGATTTTCTCGCCGACGGCTGAAATAGATCGCAATTGTTCGATCAAGACCGGATTGAAGCCTGATTCAC
TGAACAAAAAGGCCTCATCGAAGCCGCGGTGGTACTTGTTAATGTTCGGAATGGTGAAGTTTCCGGCGGAGATGGAACTCAGCGACATTAAGAGCAGACAAGTCCGCCGA
AGTTCGTCGGTACTTTTTCCGGCGAATGAGAGTAAAGGTAAATTTCACTGCAATCGGAGCTCCGGCGAGGCGGCTTGGAGGATACTTCGAGCGCTTAGCTGCAAAAATCA
CGCTAGTGTAGATGTAACGGCGTCGTTAACTGCCTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATTATCTCTCTTTCTCTCAATTCCGTGTGTCTATATATCATTTTCGTCGTCACAAATTTGCATAATTCCAAACACACCCTTTTCCTGTATCTTCTTCCTTCCTTAGAATG
TTCATGGACGACACCAACGAATCCAATCCCCTAACCTCTCAACGCAATCAACATGAAGACGACGAATCAGACGAATCACTCTCCTTCTCCGATCTTCCGCTCGACAGAGA
AAAATCCGACGGCCACACTCATCCGGAAAGCCTCCGCAAGAATCCACGTAGGTCCTCTTCCGAGCCTCTCGATCTCTTCGAATTCTTTAGCGCTGGATTCATCACCTCCG
AGATTTCTCCGGCAGAGGATTTGATTTTCTGCGGCAGATTGCTTCCTCTCAACGATCATTCTCCGCTTACTACTACGCGGACCGCTGAGAAGAGTTTCTGGAAGGAAGAG
ATCATCCGAAAACAGACTGTTTTTCGAAAACGCTCTGAGTCATTGTCTGGATTGCAGAGCTCTGTTTCTCGATCTAACAGTGCGAAATTCAATCTCAAGCGGAATAGCCG
TTCGCTCGATTACCGCAAACTCTATCGCCAAACGAATTCGATTTTCTCGCCGACGGCTGAAATAGATCGCAATTGTTCGATCAAGACCGGATTGAAGCCTGATTCACTGA
ACAAAAAGGCCTCATCGAAGCCGCGGTGGTACTTGTTAATGTTCGGAATGGTGAAGTTTCCGGCGGAGATGGAACTCAGCGACATTAAGAGCAGACAAGTCCGCCGAAGT
TCGTCGGTACTTTTTCCGGCGAATGAGAGTAAAGGTAAATTTCACTGCAATCGGAGCTCCGGCGAGGCGGCTTGGAGGATACTTCGAGCGCTTAGCTGCAAAAATCACGC
TAGTGTAGATGTAACGGCGTCGTTAACTGCCTAACGTTTATGTCACGTGGATAGCGCGTGAGTGGCGGTTGCATTTCCCATTTGTTACTATATTGCCCTCGCCGATGCTG
TGATATTCAAGTACCGGGAGAAGGTTAGTTTGGGAATTTGAAATGAAAATGAAAAATATAAATATGCTTCTTCACGTCGAAGGGAGGGTAGTGTACAGTGGCGGAGCGTG
GCTGATGATGATGTTATTTTTAGTTTTTTCTATTTGCATTGATTTTTATTTTTAGTTATTTCATTAAAAAAAAAATGGATTGGTTTAATTAGTTGGTGACATAGAGATGA
ATGAGAATCACGGGAATCCCGACTATCACATATGGAATCATATTTATATTTATTAGAATTTTGTGATATAAAGTTTCTTTTTTTTCTCACTTTTTAAAAATAAAAAATTT
TCTCTTAGAACTAGAAGTTTGGTATTTCTTAGTAAATGCACTTCAGCTTTGAAAACGATCCAACACAGGTTATGGCTTCTCTATTTATTATTCTTTTATTTGTCGTTGGA
TTTAGGTAATAATATTAATATGAATGTTTTTATTTTTGTTCTTAAAATATGATTATTTTCATGTTTGCATCATTGTAGAGTACAGTGGCATGTTATATTCAAGTTGTCCC
CCCCTCTCCACAGCCTTGGTGGATTGTCTTCATCATATATTTTTAATATGTATATTTAAGTAAACTAATTTTGTTTGAATTTTTTTTAGTACAATGGGGATCGAGCTTTC
G
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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EIIRKQTVFRKRSESLSGLQSSVSRSNSAKFNLKRNSRSLDYRKLYRQTNSIFSPTAEIDRNCSIKTGLKPDSLNKKASSKPRWYLLMFGMVKFPAEMELSDIKSRQVRR
SSSVLFPANESKGKFHCNRSSGEAAWRILRALSCKNHASVDVTASLTA