; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

ClCG07G001920 (gene) of Watermelon (Charleston Gray) v2.5 genome

Gene IDClCG07G001920
OrganismCitrullus lanatus subsp. vulgaris cv. Charleston Gray (Watermelon (Charleston Gray) v2.5)
DescriptionCyclin-dependent kinase inhibitor
Genome locationCG_Chr07:2056000..2058056
RNA-Seq ExpressionClCG07G001920
SyntenyClCG07G001920
Gene Ontology termsGO:0045736 - negative regulation of cyclin-dependent protein serine/threonine kinase activity (biological process)
GO:0005654 - nucleoplasm (cellular component)
GO:0004861 - cyclin-dependent protein serine/threonine kinase inhibitor activity (molecular function)
InterPro domainsIPR003175 - Cyclin-dependent kinase inhibitor domain
IPR044275 - Cyclin-dependent kinase inhibitor, plant
IPR044898 - Cyclin-dependent kinase inhibitor domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6606319.1 Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]6.0e-8376.37Show/hide
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TYK29196.1 cyclin-dependent kinase inhibitor 3 [Cucumis melo var. makuwa]1.1e-8176.19Show/hide
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XP_004144379.2 cyclin-dependent kinase inhibitor 3 [Cucumis sativus]1.8e-8276.62Show/hide
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XP_008465466.1 PREDICTED: cyclin-dependent kinase inhibitor 3 [Cucumis melo]2.5e-8175.76Show/hide
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XP_038888693.1 cyclin-dependent kinase inhibitor 3-like [Benincasa hispida]6.6e-10690.48Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LBN0 Cyclin-dependent kinase inhibitor8.5e-8376.62Show/hide
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A0A1S3CNZ1 Cyclin-dependent kinase inhibitor1.2e-8175.76Show/hide
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A0A5A7UBT3 Cyclin-dependent kinase inhibitor 31.2e-8175.76Show/hide
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A0A5D3DZV8 Cyclin-dependent kinase inhibitor 35.5e-8276.19Show/hide
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A0A6J1ETD6 cyclin-dependent kinase inhibitor 3-like7.9e-8174.68Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q283L0 Cyclin-dependent kinase inhibitor 59.5e-1532.07Show/hide
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        +   +     A  E               +VE  F +N L+  G+     T      SL R S    T  ST     S S++ R+E  + +  P++ ++E
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        EFFA  E    + F ++YNF   +D PL GRYEW ++
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Q7XDH8 Cyclin-dependent kinase inhibitor 43.4e-1232.07Show/hide
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Query:  SSTDSLLKRDLANSEKRKLGVGETQSGNVWDVEDCFSENCLEFGGENWGTAGKIHSSLARDSSTNETSNSTRMETISSSTKSRVEMELLKS-FPTANDIE
        ++ D+      A S + ++  G               EN LE       T      SL RD  T  T  ST   + SSS   +V+  +  +  P + ++E
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         FFA EE   ++ FI KYNFD  +D PL GR+EWV++
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Q8GYJ3 Cyclin-dependent kinase inhibitor 41.4e-1032.76Show/hide
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        MGKY +KSK+  A                 IA M+V   S  SS G+ TR AK+LALQ+      L K SS SS   +S+S                   
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         SYLQLRSRRL+ KPPI+     + +K Q   E C GR     S+ DS+     R  + SE    G  +     + + +  F +N  +   E     N  
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        T      SL R      T  S+    I  S  ++ E  L +S    PT  +++EFF+  E   Q+ FI+KYNFD  ++ PL GR+EW +V
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Q9FKB5 Cyclin-dependent kinase inhibitor 31.6e-2542.26Show/hide
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          + D  NS      V   QS N  +  D F    +  G  + G   +   S    +  N   +   M T  SST+S  R   E  +      PT +++E
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        EFFA+ E   QR F++KYNFD  +D+PL GRYEWVQV P
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Q9LRY0 Cyclin-dependent kinase inhibitor 55.0e-1635.62Show/hide
Query:  MGKYFKKSKLTAAIADMEVSPHSSPGLRTR--AAKTLALQRLNKSSSSSSSSSSSSSSSYLQLRSRRLEKPPILRQHQKAQPDGECCRGRLTLECSSTDS
        MGKY KKSK+  A++  + S   + G RTR  AAK LAL RL       S S  + S +YLQLRSRRL K P+L   +K Q        +  L  S    
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Query:  LLKRDLANSEKRKLGVGETQSGNVWDVEDCFSENCLEFGGENWGTAGKIHSSLARDSSTNETSNSTRMETISSSTKSRVEMELLKSFPTANDIEEFFAHE
          K   A+S   K    +T +       +  S +   FG                D   +  S +  M + S S +S              +IE+FFA  
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Query:  ELWHQRTFIQKYNFDFTSDMPLQGRYEWVQVVP
        E   QR FIQKYNFD  SD PL GRYEWV+V+P
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G32710.1 Cyclin-dependent kinase inhibitor family protein1.0e-1132.76Show/hide
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Query:  SSYLQLRSRRLE-KPPIL----RQHQKAQPDGECCRGRLTLECSSTDSLL---KRDLANSEKRKLGVGETQSGNVWDVEDCFSENCLEFGGE-----NWG
         SYLQLRSRRL+ KPPI+     + +K Q   E C GR     S+ DS+     R  + SE    G  +     + + +  F +N  +   E     N  
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Query:  TAGKIHSSLARDSSTNETSNSTRMETISSSTKSRVEMELLKSF---PTANDIEEFFAHEELWHQRTFIQKYNFDFTSDMPLQGRYEWVQV
        T      SL R      T  S+    I  S  ++ E  L +S    PT  +++EFF+  E   Q+ FI+KYNFD  ++ PL GR+EW +V
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AT2G32710.2 Cyclin-dependent kinase inhibitor family protein1.3e-1132.75Show/hide
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Subjt:  MGKYFKKSKLTAA-----------------IADMEV---SPHSSPGLRTRAAKTLALQR------LNKSSSSSSSSSSSSS-------------------

Query:  SSYLQLRSRRLE-KPPIL----RQHQKAQPDGECCRGRLTLECSSTDSLL---KRDLANSEKRKLGVGETQSGNVWDVEDCFSENCLEFGGENW--GTAG
         SYLQLRSRRL+ KPPI+     + +K Q   E C GR     S+ DS+     R  + SE    G  +     + + +  F +N  +   E+    T  
Subjt:  SSYLQLRSRRLE-KPPIL----RQHQKAQPDGECCRGRLTLECSSTDSLL---KRDLANSEKRKLGVGETQSGNVWDVEDCFSENCLEFGGENW--GTAG

Query:  KIHSSLARDSSTNETSNSTRMETISSSTKSRVEMELLKSF---PTANDIEEFFAHEELWHQRTFIQKYNFDFTSDMPLQGRYEWVQV
            SL R      T  S+    I  S  ++ E  L +S    PT  +++EFF+  E   Q+ FI+KYNFD  ++ PL GR+EW +V
Subjt:  KIHSSLARDSSTNETSNSTRMETISSSTKSRVEMELLKSF---PTANDIEEFFAHEELWHQRTFIQKYNFDFTSDMPLQGRYEWVQV

AT3G24810.1 Cyclin-dependent kinase inhibitor family protein3.6e-1735.62Show/hide
Query:  MGKYFKKSKLTAAIADMEVSPHSSPGLRTR--AAKTLALQRLNKSSSSSSSSSSSSSSSYLQLRSRRLEKPPILRQHQKAQPDGECCRGRLTLECSSTDS
        MGKY KKSK+  A++  + S   + G RTR  AAK LAL RL       S S  + S +YLQLRSRRL K P+L   +K Q        +  L  S    
Subjt:  MGKYFKKSKLTAAIADMEVSPHSSPGLRTR--AAKTLALQRLNKSSSSSSSSSSSSSSSYLQLRSRRLEKPPILRQHQKAQPDGECCRGRLTLECSSTDS

Query:  LLKRDLANSEKRKLGVGETQSGNVWDVEDCFSENCLEFGGENWGTAGKIHSSLARDSSTNETSNSTRMETISSSTKSRVEMELLKSFPTANDIEEFFAHE
          K   A+S   K    +T +       +  S +   FG                D   +  S +  M + S S +S              +IE+FFA  
Subjt:  LLKRDLANSEKRKLGVGETQSGNVWDVEDCFSENCLEFGGENWGTAGKIHSSLARDSSTNETSNSTRMETISSSTKSRVEMELLKSFPTANDIEEFFAHE

Query:  ELWHQRTFIQKYNFDFTSDMPLQGRYEWVQVVP
        E   QR FIQKYNFD  SD PL GRYEWV+V+P
Subjt:  ELWHQRTFIQKYNFDFTSDMPLQGRYEWVQVVP

AT5G48820.1 inhibitor/interactor with cyclin-dependent kinase1.1e-2642.26Show/hide
Query:  MGKYFKKSKLTAAIADMEVSPHS--SPGLRTRAAKTLALQRLNKSSSSSSSSSSSSSSSYLQLRSRRLEKPPILRQHQKAQPDGECCRGRLTLECSSTDS
        MGKY KKSK+T  I+ MEVS  +  SPG+RTRAAKTLAL+RLN  SS++ S+  + SS YLQLRSRRLEKP  L + +  QP      G        + S
Subjt:  MGKYFKKSKLTAAIADMEVSPHS--SPGLRTRAAKTLALQRLNKSSSSSSSSSSSSSSSYLQLRSRRLEKPPILRQHQKAQPDGECCRGRLTLECSSTDS

Query:  LLKRDLANSEKRKLGVGETQSGNVWDVEDCFSENCLEFGGENWGTAGKIHSSLARDSSTNETSNSTRMETISSSTKS--RVEMELLKS----FPTANDIE
          + D  NS      V   QS N  +  D F    +  G  + G   +   S    +  N   +   M T  SST+S  R   E  +      PT +++E
Subjt:  LLKRDLANSEKRKLGVGETQSGNVWDVEDCFSENCLEFGGENWGTAGKIHSSLARDSSTNETSNSTRMETISSSTKS--RVEMELLKS----FPTANDIE

Query:  EFFAHEELWHQRTFIQKYNFDFTSDMPLQGRYEWVQVVP
        EFFA+ E   QR F++KYNFD  +D+PL GRYEWVQV P
Subjt:  EFFAHEELWHQRTFIQKYNFDFTSDMPLQGRYEWVQVVP

AT5G48820.2 inhibitor/interactor with cyclin-dependent kinase1.8e-2440Show/hide
Query:  MGKYFKKSKLTAAIADMEVSPHS--SPGLRTRAAKTLALQRLNKSSSSSSSSSSSSSSSYLQLRSRRLEKPPILRQHQKAQPDGECCRGRLTLECSSTDS
        MGKY KKSK+T  I+ MEVS  +  SPG+RTRAAKTLAL+RLN  SS++ S+  + SS YLQLRSRRLEKP  L + +  QP      G        + S
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Query:  LLKRDLANSEKRKLGVGETQSGNVWDVEDCFSENCLEFGGENWGTAGKIHSSL---------------ARDSS-TNETSNSTRMETISSSTKS--RVEME
          + D  NS      V   QS N  +  D F    +  G  + G   +    +                R+S+  N   +   M T  SST+S  R   E
Subjt:  LLKRDLANSEKRKLGVGETQSGNVWDVEDCFSENCLEFGGENWGTAGKIHSSL---------------ARDSS-TNETSNSTRMETISSSTKS--RVEME

Query:  LLKS----FPTANDIEEFFAHEELWHQRTFIQKYNFDFTSDMPLQGRYEWVQVVP
          +      PT +++EEFFA+ E   QR F++KYNFD  +D+PL GRYEWVQV P
Subjt:  LLKS----FPTANDIEEFFAHEELWHQRTFIQKYNFDFTSDMPLQGRYEWVQVVP


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGGAAAGTACTTCAAGAAATCCAAACTTACTGCCGCCATTGCTGATATGGAAGTCTCACCGCACTCCTCTCCGGGACTCCGTACTCGAGCAGCTAAAACCCTTGCCTT
ACAACGCCTCAACAAATCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTACTTGCAGCTTCGGAGCCGCCGGCTTGAAAAGCCGCCGATACTCAGGC
AGCACCAGAAAGCGCAGCCGGACGGCGAGTGTTGTAGAGGTCGCTTGACTCTTGAATGTTCCTCGACGGACTCTCTTTTGAAGCGGGATTTAGCGAACTCGGAGAAGAGG
AAGCTTGGTGTGGGAGAAACACAGAGTGGAAATGTTTGGGATGTAGAGGATTGTTTTAGCGAGAACTGTCTCGAATTCGGAGGTGAAAATTGGGGAACTGCAGGAAAAAT
ACATAGCAGCTTGGCTAGGGATTCAAGCACCAACGAAACATCTAACTCAACAAGGATGGAGACGATTTCAAGTTCAACCAAATCAAGAGTAGAGATGGAGTTGCTAAAAA
GTTTCCCTACCGCAAATGATATAGAGGAGTTCTTTGCACACGAAGAGCTATGGCATCAAAGAACGTTTATTCAGAAGTATAACTTCGACTTCACAAGCGATATGCCTCTC
CAAGGACGATATGAATGGGTGCAAGTGGTTCCTTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGGAAAGTACTTCAAGAAATCCAAACTTACTGCCGCCATTGCTGATATGGAAGTCTCACCGCACTCCTCTCCGGGACTCCGTACTCGAGCAGCTAAAACCCTTGCCTT
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CAAGGACGATATGAATGGGTGCAAGTGGTTCCTTAAGTAGCTATGATCTTATCAAGCTCGGTTTGAAGACGGGCATTCAGGTTTCTGTAGTTACACAAAGTTAGGGCATC
TCATACTAACCAGCTTTTAATCCATCCTTAGTTAGAGACATATGGGGAAATTAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MGKYFKKSKLTAAIADMEVSPHSSPGLRTRAAKTLALQRLNKSSSSSSSSSSSSSSSYLQLRSRRLEKPPILRQHQKAQPDGECCRGRLTLECSSTDSLLKRDLANSEKR
KLGVGETQSGNVWDVEDCFSENCLEFGGENWGTAGKIHSSLARDSSTNETSNSTRMETISSSTKSRVEMELLKSFPTANDIEEFFAHEELWHQRTFIQKYNFDFTSDMPL
QGRYEWVQVVP